138 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PHATRDRAFT_50825 on replicon NC_011672
Organism: Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011672  PHATRDRAFT_50825  predicted protein  100 
 
 		 451 aa  919    Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009042  PICST_29898  transcriptional regulator  62.53 
 
 		 484 aa  570  1e-161  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  0.287738  normal  0.530711 
 
 
-
 
NC_009374  OSTLU_43499  predicted protein  59.73 
 
 		 462 aa  567  1e-160  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
BN001308  ANIA_00327  RuvB-like helicase 2 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BGK3]  58.57 
 
 		 468 aa  552  1e-156  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA06840  conserved hypothetical protein  59.06 
 
 		 463 aa  546  1e-154  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  0.247034  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0862  TIP49-like  41.67 
 
 		 441 aa  331  1e-89  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009358  OSTLU_31398  predicted protein  40.09 
 
 		 455 aa  331  2e-89  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  0.556143  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0715  TIP49 domain-containing protein  39.24 
 
 		 451 aa  326  7e-88  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006670  CNA00990  RVB1, putative  39.74 
 
 		 484 aa  323  5e-87  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1694  TIP49-like protein  37.72 
 
 		 451 aa  322  7e-87  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  1  normal  0.252738 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0616  TBP-interacting protein TIP49  38.31 
 
 		 450 aa  321  1.9999999999999998e-86  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1220  TIP49 domain protein  38.17 
 
 		 448 aa  319  5e-86  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.478544  n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2236  TIP49-like protein  38.48 
 
 		 450 aa  319  6e-86  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  1  normal  0.385068 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_0904  TIP49-like protein  36.8 
 
 		 456 aa  319  7.999999999999999e-86  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  0.0175331  normal  1 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0596  TBP-interacting protein TIP49  41.52 
 
 		 452 aa  316  6e-85  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  1  normal  0.739423 
 
 
-
 
BN001307  ANIA_01971  RuvB-like helicase 1 (EC 3.6.1.-) [Source:UniProtKB/Swiss-Prot;Acc:Q5BBV9]  38.91 
 
 		 458 aa  315  9.999999999999999e-85  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  hitchhiker  0.000052606  hitchhiker  0.00951448 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0253  TIP49 domain protein  42.24 
 
 		 452 aa  314  2.9999999999999996e-84  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.632673  n/a   
 
 
-
 
NC_011674  PHATRDRAFT_19568  predicted protein  39.04 
 
 		 485 aa  309  8e-83  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.921701  n/a   
 
 
-
 
NC_009068  PICST_37582  RUVB-like protein  39.2 
 
 		 459 aa  299  6e-80  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.262753 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0528  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.71 
 
 		 642 aa  53.5  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0544  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.71 
 
 		 642 aa  53.5  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0534  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.71 
 
 		 642 aa  53.5  0.000007  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.977578  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0528  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.71 
 
 		 642 aa  53.5  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.152577  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0588  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.71 
 
 		 642 aa  53.5  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1019  DNA polymerase III subunits gamma and tau  36.61 
 
 		 664 aa  52.8  0.00001  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  0.176808  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00421  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.71 
 
 		 643 aa  52  0.00002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  decreased coverage  0.00199359  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3140  DNA polymerase III, subunits gamma and tau  35.71 
 
 		 643 aa  52  0.00002  Escherichia coli DH1  Bacteria  decreased coverage  0.0000034955  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00426  hypothetical protein  35.71 
 
 		 643 aa  52  0.00002  Escherichia coli BL21  Bacteria  decreased coverage  0.00196297  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0561  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.71 
 
 		 643 aa  52  0.00002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  decreased coverage  0.00151458  normal  1 
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002885  DNA polymerase III subunits gamma and tau  25.58 
 
 		 701 aa  52  0.00002  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.00493528  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0547  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.71 
 
 		 643 aa  52  0.00002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.014697  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0507  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.71 
 
 		 643 aa  52  0.00002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  decreased coverage  0.000331221  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3146  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.71 
 
 		 643 aa  52  0.00002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  decreased coverage  0.0000202258  normal  0.0671233 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0513  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.71 
 
 		 643 aa  52  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.0325277  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0402  DNA polymerase III subunits gamma and tau  35.71 
 
 		 643 aa  52  0.00002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.0412407  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3235  DNA polymerase III subunits gamma and tau  34.82 
 
 		 690 aa  49.3  0.0001  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  decreased coverage  0.00193084  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_0950  DNA polymerase III subunits gamma and tau  34.82 
 
 		 642 aa  49.7  0.0001  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.194828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1135  DNA polymerase III subunits gamma and tau  33.93 
 
 		 650 aa  49.3  0.0001  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.239786  unclonable  0.0000000363353 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0925  ATPase central domain-containing protein  35.62 
 
 		 371 aa  49.7  0.0001  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3039  DNA polymerase III subunits gamma and tau  33.04 
 
 		 678 aa  48.9  0.0002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1021  ATPase central domain-containing protein  34.25 
 
 		 371 aa  47.8  0.0004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3059  DNA polymerase III subunits gamma and tau  33.93 
 
 		 658 aa  47.4  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2889  DNA polymerase III subunits gamma and tau  33.93 
 
 		 658 aa  47.4  0.0005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.381742  normal  0.068134 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3198  DNA polymerase III subunits gamma and tau  33.93 
 
 		 658 aa  47.4  0.0005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.344651  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2182  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.36 
 
 		 621 aa  47.4  0.0006  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.863514  normal  0.57475 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1076  DNA polymerase III subunits gamma and tau  33.93 
 
 		 685 aa  47  0.0007  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.0258766  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1229  cell division protein  47.06 
 
 		 646 aa  47  0.0007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000211886  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7802  cell division protein  35.53 
 
 		 630 aa  46.6  0.0008  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.120789  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3248  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.33 
 
 		 616 aa  45.8  0.001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2106  AAA ATPase  34.25 
 
 		 371 aa  46.2  0.001  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1017  ATP-dependent metalloprotease FtsH  34.62 
 
 		 633 aa  46.2  0.001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.33311  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03087  DNA polymerase III subunits gamma and tau  24.81 
 
 		 736 aa  46.2  0.001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0270  ATPase central domain-containing protein  37.5 
 
 		 385 aa  46.2  0.001  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.022175 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0851  cell division protein FtsH  53.19 
 
 		 637 aa  45.8  0.002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  decreased coverage  0.00696414  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1012  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.66 
 
 		 616 aa  45.4  0.002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2671  DNA polymerase III, gamma and tau subunits  30.97 
 
 		 556 aa  45.1  0.002  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2678  FtsH-2 peptidase  36.89 
 
 		 694 aa  45.1  0.002  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0572  DNA polymerase III subunits gamma and tau  31.86 
 
 		 692 aa  45.4  0.002  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000382536  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5357  cell division protein ftsH (ATP-dependent zinc-metallo protease)  53.33 
 
 		 615 aa  45.4  0.002  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0232294 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1140  ATPase central domain-containing protein  34.33 
 
 		 372 aa  45.1  0.002  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0391  ATP-dependent metalloprotease FtsH  37.14 
 
 		 608 aa  45.1  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.000322193  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4718  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.25 
 
 		 637 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.518421  normal  0.0121069 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0470  cell division protein FtsH  38.67 
 
 		 658 aa  44.7  0.003  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0085  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.57 
 
 		 619 aa  45.1  0.003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0128077  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1903  peptidase M41, FtsH  53.19 
 
 		 629 aa  45.1  0.003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  0.89968  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0946  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.14 
 
 		 584 aa  45.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.344786  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_333  ATP-dependent metalloprotease, cell division protein  35.14 
 
 		 499 aa  44.7  0.003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  unclonable  0.00000000228185  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2884  ATP-dependent metalloprotease FtsH  33.66 
 
 		 623 aa  45.1  0.003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.402765  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09311  cell division protein FtsH4  36.14 
 
 		 584 aa  45.1  0.003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.679797  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0514  AAA ATPase central domain protein  43.75 
 
 		 657 aa  45.1  0.003  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.33501  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0370  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.14 
 
 		 604 aa  45.1  0.003  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  unclonable  0.000000686263  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4584  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.25 
 
 		 634 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.794949  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4719  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.67 
 
 		 634 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0714  ATP-dependent metalloprotease FtsH  38.67 
 
 		 634 aa  44.7  0.003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.87442  normal  0.0617842 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0660  ATP-dependent metalloprotease FtsH  32.32 
 
 		 620 aa  44.7  0.003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.464509  normal  0.415833 
 
 
-
 
NC_006055  Mfl403  recombination factor protein RarA  30.43 
 
 		 410 aa  44.7  0.004  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_0772  membrane protease FtsH catalytic subunit  38.67 
 
 		 635 aa  44.7  0.004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  hitchhiker  0.000087079  normal  0.0618887 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0725  FtsH peptidase  33.77 
 
 		 612 aa  44.3  0.004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1210  ATP-dependent protease ATP-binding subunit ClpX  36.26 
 
 		 421 aa  44.7  0.004  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  0.581087 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1129  ATP-dependent protease ATP-binding subunit ClpX  36.26 
 
 		 421 aa  44.7  0.004  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.621402  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1984  ATP-dependent metalloprotease FtsH  36.49 
 
 		 659 aa  44.3  0.004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.614445 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2482  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35 
 
 		 622 aa  44.7  0.004  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1322  ATP-dependent metalloprotease FtsH  50 
 
 		 598 aa  44.3  0.005  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.358408  normal  0.0936427 
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1717  ATP-dependent metalloprotease FtsH  35.14 
 
 		 662 aa  43.9  0.005  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_0438  membrane protease FtsH catalytic subunit  39.44 
 
 		 673 aa  44.3  0.005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000747191  normal  1 
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1538  Holliday junction DNA helicase RuvB  39.29 
 
 		 313 aa  44.3  0.005  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0672252  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0018  DNA polymerase III subunits gamma and tau  31.25 
 
 		 562 aa  43.9  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0519893  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6365  recombination factor protein RarA  40 
 
 		 437 aa  44.3  0.005  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.191179  normal  0.184602 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0020  DNA polymerase III subunits gamma and tau  31.25 
 
 		 562 aa  43.9  0.006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.327732  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0613  AAA family ATPase, CDC48 subfamily protein  30.3 
 
 		 721 aa  43.9  0.006  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.71313  n/a   
 
 
-
 
NC_009045  PICST_32083  AAA ATPase  55 
 
 		 832 aa  43.9  0.006  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.190339 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1660  ATPase central domain-containing protein  32.88 
 
 		 371 aa  43.9  0.006  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1089  Holliday junction DNA helicase RuvB  28.24 
 
 		 334 aa  43.9  0.006  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1983  recombination factor protein RarA  41.54 
 
 		 438 aa  43.9  0.006  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0169  Holliday junction DNA helicase RuvB  36.07 
 
 		 324 aa  43.9  0.006  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0100  ATP-dependent metalloprotease FtsH  31.48 
 
 		 686 aa  43.9  0.006  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1809  cell division protein FtsH  55.81 
 
 		 614 aa  43.5  0.007  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0346889  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1152  peptidase M41, FtsH  48 
 
 		 599 aa  43.9  0.007  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0007  peptidase M41, FtsH  35.71 
 
 		 699 aa  43.9  0.007  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_15080  Holliday junction DNA helicase subunit RuvB  39.34 
 
 		 374 aa  43.9  0.007  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.400622  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>