More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PG1525 on replicon NC_002950
Organism: Porphyromonas gingivalis W83



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_002950  PG1525  isochorismate synthase, putative  100 
 
 
368 aa  751    Porphyromonas gingivalis W83  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000376794 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1774  isochorismate synthase  36.13 
 
 
359 aa  189  5.999999999999999e-47  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  hitchhiker  0.00644261  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4718  isochorismate synthase  34.07 
 
 
356 aa  177  2e-43  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09908  possible isochorismate synthase  32.9 
 
 
366 aa  169  5e-41  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.0924812  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_5138  Chorismate binding-like protein  41.43 
 
 
415 aa  153  4e-36  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_1758  isochorismate synthase  32.65 
 
 
405 aa  144  2e-33  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  normal  0.0818016 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0770  Chorismate binding-like protein  38.72 
 
 
438 aa  142  9e-33  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.324885  normal 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0469  isochorismate synthase  33.71 
 
 
386 aa  123  5e-27  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  decreased coverage  0.0000000527427  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3494  menaquinone-specific isochorismate synthase  31.45 
 
 
464 aa  121  1.9999999999999998e-26  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0194086  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0219  isochorismate synthase  35.04 
 
 
482 aa  117  3e-25  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0140875  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4698  isochorismate synthase  30.82 
 
 
464 aa  116  5e-25  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00246668  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0251  menaquinone-specific isochorismate synthase  29.91 
 
 
464 aa  115  1.0000000000000001e-24  Bacillus cereus G9842  Bacteria  decreased coverage  0.000000139379  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5016  menaquinone-specific isochorismate synthase  30.21 
 
 
464 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000376583  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4611  menaquinone-specific isochorismate synthase  30.21 
 
 
464 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0347123  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4987  menaquinone-specific isochorismate synthase  29.88 
 
 
464 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  decreased coverage  0.00107234  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4998  menaquinone-specific isochorismate synthase  30.21 
 
 
464 aa  115  2.0000000000000002e-24  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.0061781  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4751  menaquinone-specific isochorismate synthase  29.91 
 
 
464 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.424984  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5112  menaquinone-specific isochorismate synthase  29.91 
 
 
464 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00381916  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4969  menaquinone-specific isochorismate synthase  29.91 
 
 
464 aa  114  4.0000000000000004e-24  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4589  menaquinone-specific isochorismate synthase  29.91 
 
 
464 aa  113  5e-24  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000229188  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1784  isochorismate synthase  35.21 
 
 
451 aa  113  5e-24  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0581  isochorismate synthase  34.72 
 
 
466 aa  113  6e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1802  isochorismate synthase  30.93 
 
 
395 aa  113  7.000000000000001e-24  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1690  isochorismate synthases  35.83 
 
 
394 aa  112  7.000000000000001e-24  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0026  isochorismate synthase  35.13 
 
 
455 aa  110  3e-23  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.828763 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_1701  isochorismate synthase  31.87 
 
 
482 aa  110  3e-23  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A2334  isochorismate synthase DhbC  30.43 
 
 
399 aa  109  6e-23  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.187517  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3570  isochorismate synthase  31.77 
 
 
554 aa  108  1e-22  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0774  menaquinone-specific isochorismate synthase  34.63 
 
 
379 aa  108  2e-22  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0567  isochorismate synthase  33.09 
 
 
461 aa  108  2e-22  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0332  isochorismate synthase  32.65 
 
 
473 aa  107  3e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.0246955  normal  0.0588972 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4216  isochorismate synthase  35.04 
 
 
486 aa  107  3e-22  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.192209  normal  0.410479 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2422  isochorismate synthase  32.34 
 
 
468 aa  107  4e-22  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_2144  isochorismate synthase DhbC  29.59 
 
 
399 aa  105  1e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2018  isochorismate synthase  31.07 
 
 
425 aa  105  1e-21  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.577572 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_2074  isochorismate synthase  32.34 
 
 
471 aa  105  2e-21  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.49442  normal  0.464953 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0648  isochorismate synthase EntC  29.12 
 
 
391 aa  104  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.36468  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0691  isochorismate synthase EntC  29.12 
 
 
391 aa  103  3e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal  0.0702055 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_2387  isochorismate synthase DhbC  29.33 
 
 
399 aa  104  3e-21  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2800  isochorismate synthase  30.04 
 
 
460 aa  103  3e-21  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2991  isochorismate synthase DhbC  29.73 
 
 
399 aa  103  3e-21  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal  0.635388 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4713  menaquinone-specific isochorismate synthase, putative  31.56 
 
 
452 aa  103  4e-21  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0707  isochorismate synthase EntC  29.12 
 
 
391 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0634  isochorismate synthase EntC  29.12 
 
 
391 aa  103  4e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_0355  isochorismate synthases  32.02 
 
 
432 aa  103  4e-21  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.065089  normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1755  isochorismate synthase DhbC  32.17 
 
 
403 aa  103  4e-21  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  hitchhiker  0.000357241  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK2128  isochorismate synthase DhbC  29.29 
 
 
399 aa  103  5e-21  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.848661  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01428  isochorismate synthase  27.65 
 
 
435 aa  103  5e-21  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0560  isochorismate synthase  28.09 
 
 
398 aa  103  6e-21  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2205  isochorismate synthase DhbC  29.59 
 
 
399 aa  103  6e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2369  isochorismate synthase DhbC  29.59 
 
 
399 aa  103  6e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0753  isochorismate synthase EntC  29.12 
 
 
391 aa  103  6e-21  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.279295  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A2469  isochorismate synthase DhbC  29.57 
 
 
399 aa  102  7e-21  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000172117  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2595  isochorismate synthase  34.11 
 
 
469 aa  102  9e-21  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_4256  isochorismate synthase  31.18 
 
 
452 aa  102  9e-21  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4311  isochorismate synthase  31.18 
 
 
452 aa  102  9e-21  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.240135  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004033  menaquinone-specific isochorismate synthase  29.96 
 
 
435 aa  102  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0814  isochorismate synthase  33.9 
 
 
451 aa  102  1e-20  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0088  isochorismate synthase  31.16 
 
 
452 aa  102  1e-20  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0462  isochorismate synthase  28.82 
 
 
398 aa  101  2e-20  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1487  isochorismate synthase  34.43 
 
 
445 aa  101  3e-20  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.674496  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_2399  isochorismate synthase DhbC  29.19 
 
 
399 aa  100  4e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.0854812  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3961  isochorismate synthases  31.18 
 
 
452 aa  100  4e-20  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.338247  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4515  isochorismate synthase  33.7 
 
 
401 aa  100  5e-20  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.589784  normal  0.140007 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3982  isochorismate synthase  34.94 
 
 
377 aa  100  6e-20  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal  0.571386 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1648  aminodeoxychorismate synthase, subunit I  28.97 
 
 
460 aa  100  6e-20  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00594975  normal  0.216228 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2870  para-aminobenzoate synthase, component I  28.91 
 
 
468 aa  99.8  7e-20  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_4451  isochorismate synthase  30.82 
 
 
452 aa  99.8  7e-20  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3868  isochorismate synthases  31.18 
 
 
452 aa  99.8  7e-20  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.172754  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_2176  isochorismate synthase DhbC  29.75 
 
 
399 aa  99.4  9e-20  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  decreased coverage  0.00216926  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_00560  isochorismate synthase  28.87 
 
 
391 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_00549  hypothetical protein  28.87 
 
 
391 aa  98.6  1e-19  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_4089  isochorismate synthase  32.11 
 
 
452 aa  99  1e-19  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_3033  isochorismate synthase  31.11 
 
 
391 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.652174  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_0678  isochorismate synthase, entC  31.11 
 
 
391 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.131945  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0495  isochorismate synthase, entC  31.11 
 
 
391 aa  98.6  2e-19  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_3051  isochorismate synthase  31.11 
 
 
391 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0644  isochorismate synthase  31.11 
 
 
391 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1125  isochorismate synthase  29.57 
 
 
391 aa  98.2  2e-19  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.822234 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_0613  isochorismate synthase  29.18 
 
 
391 aa  98.6  2e-19  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_4071  isochorismate synthases  31.44 
 
 
452 aa  98.2  2e-19  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.381607  normal 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_0130  menaquinone-specific isochorismate synthase, putative  34.55 
 
 
452 aa  98.6  2e-19  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.331361  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0130  isochorismate synthase  28.71 
 
 
414 aa  97.4  3e-19  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  hitchhiker  0.0000366524  normal 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3400  isochorismate synthase; RBL00457  29.37 
 
 
421 aa  97.4  3e-19  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  normal  0.925382 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0613  isochorismate synthase, entC  30.25 
 
 
391 aa  97.4  3e-19  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.900668  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3649  isochorismate synthase  32.32 
 
 
485 aa  97.1  4e-19  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.787898  normal 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3204  isochorismate synthase  29.81 
 
 
442 aa  97.4  4e-19  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009370  OSTLU_37751  predicted protein  33.86 
 
 
259 aa  97.1  5e-19  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  hitchhiker  0.00284979 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_3873  isochorismate synthase  30.34 
 
 
452 aa  96.7  6e-19  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.971486  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01398  hypothetical protein  32.02 
 
 
406 aa  96.3  7e-19  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0228  anthranilate synthase  30.74 
 
 
515 aa  96.7  7e-19  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1877  isochorismate synthase  29.52 
 
 
475 aa  95.9  1e-18  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1547  isochorismate synthase  31.6 
 
 
492 aa  95.9  1e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.471874  normal  0.556355 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3913  isochorismate synthases  32.51 
 
 
460 aa  95.5  1e-18  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.348383  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2088  isochorismate synthases  29.66 
 
 
477 aa  95.9  1e-18  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.000640643  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3421  isochorismate synthase  28.16 
 
 
402 aa  95.1  2e-18  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  hitchhiker  0.00440407  normal  0.516304 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0302  vibriobactin-specific isochorismate synthase  28.88 
 
 
395 aa  95.1  2e-18  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1872  isochorismate synthase  34.05 
 
 
393 aa  94.7  2e-18  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.290402  n/a   
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_14050  isochorismate synthase family protein  32.34 
 
 
418 aa  94.7  2e-18  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1520  isochorismate synthase  31.6 
 
 
492 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>