More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PCC8801_0475 on replicon NC_011726
Organism: Cyanothece sp. PCC 8801



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011726  PCC8801_0475  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 234 aa  478  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0489  two component transcriptional regulator, winged helix family  100 
 
 		 234 aa  478  1e-134  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.210896  normal  0.371413 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2845  two component transcriptional regulator, winged helix family  81.2 
 
 		 234 aa  399  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1944  two component transcriptional regulator  72.65 
 
 		 238 aa  352  2e-96  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1085  two component transcriptional regulator, winged helix family  69.79 
 
 		 235 aa  336  1.9999999999999998e-91  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.224574  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2782  two component transcriptional regulator  54.08 
 
 		 231 aa  238  5e-62  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.92379  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0353  two component transcriptional regulator  49.13 
 
 		 230 aa  212  3.9999999999999995e-54  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.683455 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3302  two component transcriptional regulator, winged helix family  50 
 
 		 231 aa  210  2e-53  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000343135 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2983  two component transcriptional regulator  51.09 
 
 		 228 aa  209  4e-53  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1349  two component transcriptional regulator, winged helix family  49.13 
 
 		 237 aa  206  2e-52  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  1  normal  0.421984 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_11690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  48.92 
 
 		 236 aa  205  5e-52  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.52451  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2709  two component transcriptional regulator, winged helix family  47.64 
 
 		 236 aa  205  6e-52  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  decreased coverage  0.0011921  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0070  two component transcriptional regulator  46.12 
 
 		 229 aa  204  7e-52  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  0.834843 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0951  response regulator receiver protein  48.05 
 
 		 239 aa  203  2e-51  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.0000000111905  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00330  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  47.86 
 
 		 240 aa  202  3e-51  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  decreased coverage  0.00972196  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0258  two component transcriptional regulator, winged helix family  48.48 
 
 		 236 aa  202  4e-51  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.606292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2566  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.83 
 
 		 229 aa  201  8e-51  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.000356007  hitchhiker  0.00345607 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2193  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.21 
 
 		 237 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0620475  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2286  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.29 
 
 		 231 aa  200  1.9999999999999998e-50  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000000000188753  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1100  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.32 
 
 		 236 aa  199  1.9999999999999998e-50  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  unclonable  0.0000000182155 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0499  winged helix family two component transcriptional regulator  45.45 
 
 		 229 aa  199  3e-50  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0093  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.29 
 
 		 232 aa  199  3.9999999999999996e-50  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0997  two component transcriptional regulator  48.05 
 
 		 230 aa  199  3.9999999999999996e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.679101  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0255  DNA-binding response regulator  46.72 
 
 		 237 aa  198  6e-50  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0258  response regulator  45.06 
 
 		 237 aa  198  6e-50  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3394  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.12 
 
 		 230 aa  198  7e-50  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.103692  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_03750  PhoP-like protein  44.78 
 
 		 226 aa  197  7.999999999999999e-50  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.181369  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0264  two component transcriptional regulator  43.83 
 
 		 238 aa  197  1.0000000000000001e-49  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.392693  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0243  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.35 
 
 		 235 aa  197  1.0000000000000001e-49  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.0646165  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4998  DNA-binding response regulator  45.41 
 
 		 237 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.709524  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS0273  DNA-binding response regulator  46.29 
 
 		 237 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.484752  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3818  two component transcriptional regulator  46.75 
 
 		 230 aa  196  2.0000000000000003e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.386967  normal  0.165932 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0316  DNA-binding response regulator  45.41 
 
 		 237 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0287  DNA-binding response regulator  46.29 
 
 		 237 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.42222  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0317  DNA-binding response regulator  46.29 
 
 		 237 aa  196  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4046  response regulator receiver  43.04 
 
 		 225 aa  196  2.0000000000000003e-49  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0804  two component transcriptional regulator  47.19 
 
 		 236 aa  196  4.0000000000000005e-49  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.324741  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0088  two component transcriptional regulator  43.16 
 
 		 228 aa  194  1e-48  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0700  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.35 
 
 		 226 aa  194  1e-48  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.768939  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0721  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.06 
 
 		 233 aa  193  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.811558  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2910  response regulator receiver  44.35 
 
 		 230 aa  193  2e-48  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0378  two component transcriptional regulator  43.64 
 
 		 234 aa  193  2e-48  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1367  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.83 
 
 		 230 aa  192  3e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000177207  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0623  DNA-binding response regulator  44.4 
 
 		 231 aa  192  3e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  hitchhiker  0.000212568  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2922  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.16 
 
 		 230 aa  192  3e-48  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.221617  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1155  two component transcriptional regulator  44.83 
 
 		 231 aa  192  4e-48  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000430064  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1673  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.12 
 
 		 233 aa  192  4e-48  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2892  two component transcriptional regulator  43.48 
 
 		 227 aa  192  4e-48  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.0239565 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1456  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.4 
 
 		 223 aa  192  4e-48  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.000183373  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2106  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.02 
 
 		 238 aa  192  5e-48  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4322  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.91 
 
 		 231 aa  191  9e-48  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1220  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.48 
 
 		 233 aa  191  9e-48  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00991602 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2675  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.45 
 
 		 234 aa  191  9e-48  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.661044  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0266  two component transcriptional regulator  44.21 
 
 		 237 aa  191  1e-47  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.262207  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8215  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.22 
 
 		 226 aa  191  1e-47  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1077  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.19 
 
 		 235 aa  190  1e-47  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0312  response regulator receiver  45.61 
 
 		 233 aa  190  1e-47  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0102436  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02690  response regulator with CheY-like receiver domain protein and winged-helix DNA-binding domain protein  43.78 
 
 		 229 aa  189  2e-47  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0200  two component transcriptional regulator, winged helix family  43.16 
 
 		 242 aa  189  2e-47  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  0.0955644  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0114  two component transcriptional regulator  48.7 
 
 		 229 aa  189  2.9999999999999997e-47  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.994086  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0724  two component transcriptional regulator  43.59 
 
 		 226 aa  189  4e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0766  two component transcriptional regulator  43.97 
 
 		 231 aa  188  5e-47  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.585906  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1058  DNA-binding response regulator  45.06 
 
 		 227 aa  188  5.999999999999999e-47  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  decreased coverage  0.000187393  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0850  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.02 
 
 		 226 aa  188  7e-47  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1028  two component transcriptional regulator, winged helix family  46.96 
 
 		 237 aa  188  7e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1176  two component transcriptional regulator  44.4 
 
 		 229 aa  188  7e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.149936 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1011  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.42 
 
 		 231 aa  187  8e-47  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1285  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.07 
 
 		 234 aa  188  8e-47  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.477652  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2306  two component transcriptional regulator  45.7 
 
 		 225 aa  187  9e-47  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_1441  two component transcriptional regulator  45.65 
 
 		 247 aa  187  9e-47  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.167327  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1394  two component transcriptional regulator  43.53 
 
 		 236 aa  187  9e-47  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  decreased coverage  0.00000024965  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1490  two component transcriptional regulator  43.22 
 
 		 239 aa  187  1e-46  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  unclonable  0.000000000120928  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3782  response regulator receiver  41.35 
 
 		 297 aa  187  1e-46  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6145  two component transcriptional regulator  43.72 
 
 		 228 aa  187  1e-46  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.788201 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2570  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.54 
 
 		 239 aa  186  2e-46  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0411  two component transcriptional regulator  45.49 
 
 		 230 aa  186  2e-46  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0961  response regulator receiver protein  43.04 
 
 		 229 aa  186  2e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2333  two component transcriptional regulator  42.67 
 
 		 232 aa  186  2e-46  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0707  two component transcriptional regulator  42.44 
 
 		 232 aa  187  2e-46  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4602  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.17 
 
 		 226 aa  186  3e-46  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0393  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.41 
 
 		 227 aa  186  3e-46  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.202895 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1012  two component transcriptional regulator  43.75 
 
 		 257 aa  186  3e-46  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.658807  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1271  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.49 
 
 		 225 aa  186  3e-46  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0661  two component transcriptional regulator  40.77 
 
 		 228 aa  186  3e-46  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_0609  DNA-binding response regulator  43.53 
 
 		 231 aa  186  3e-46  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  hitchhiker  0.0000282114  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0674  two component transcriptional regulator  40.77 
 
 		 228 aa  186  3e-46  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.850641 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0654  two component transcriptional regulator  40.77 
 
 		 228 aa  186  3e-46  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.682961 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1419  two component transcriptional regulator  43.4 
 
 		 231 aa  185  4e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0720218  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0937  two component transcriptional regulator  45.69 
 
 		 227 aa  185  4e-46  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.834094  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5259  two component transcriptional regulator  43.22 
 
 		 235 aa  185  4e-46  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.000559572  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0785  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.87 
 
 		 235 aa  185  5e-46  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2625  two component transcriptional regulator, winged helix family  44.16 
 
 		 237 aa  185  5e-46  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  decreased coverage  0.00000254862  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_4006  two component transcriptional regulator  43.22 
 
 		 235 aa  185  5e-46  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.010356  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2952  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.37 
 
 		 225 aa  185  5e-46  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_926  two-component system, OmpR family, response regulator  45.06 
 
 		 227 aa  185  5e-46  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.00200634  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6749  two component transcriptional regulator, winged helix family  42.74 
 
 		 226 aa  185  5e-46  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.290774  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4050  two component transcriptional regulator, winged helix family  45.45 
 
 		 227 aa  185  5e-46  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00552008  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0135  DNA-binding response regulator  44.87 
 
 		 230 aa  185  6e-46  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS2385  DNA-binding response regulator  42.49 
 
 		 231 aa  185  6e-46  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.534853  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_2561  DNA-binding response regulator  42.49 
 
 		 231 aa  185  6e-46  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.630654  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>