More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3734 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_3734  hypothetical protein  100 
 
 		 412 aa  814    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.637974  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3982  protein of unknown function DUF214  65.49 
 
 		 406 aa  466  9.999999999999999e-131  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4027  protein of unknown function DUF214  58.19 
 
 		 404 aa  426  1e-118  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0893  hypothetical protein  52.39 
 
 		 389 aa  357  1.9999999999999998e-97  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60780  ABC transporter permease  50.63 
 
 		 397 aa  346  5e-94  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5233  ABC transporter permease  50.38 
 
 		 397 aa  333  3e-90  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4095  hypothetical protein  37.19 
 
 		 406 aa  224  1e-57  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.591324  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2989  hypothetical protein  33.86 
 
 		 397 aa  218  2e-55  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0037  export ABC transporter permease protein  32.74 
 
 		 397 aa  215  9.999999999999999e-55  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5199  putative permease of ABC transporter  35.51 
 
 		 423 aa  212  1e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0520248  normal  0.0790722 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0746  protein of unknown function DUF214  35.82 
 
 		 407 aa  208  1e-52  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2472  protein of unknown function DUF214  36.57 
 
 		 393 aa  206  8e-52  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.462522  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2849  hypothetical protein  33.86 
 
 		 397 aa  204  3e-51  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  31.38 
 
 		 405 aa  171  3e-41  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4500  protein of unknown function DUF214  32.32 
 
 		 403 aa  169  6e-41  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  29.49 
 
 		 405 aa  169  8e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0813  hypothetical protein  32.36 
 
 		 402 aa  169  9e-41  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  30.85 
 
 		 406 aa  169  9e-41  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  29.4 
 
 		 398 aa  168  2e-40  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09481  putative ABC transporter  29.65 
 
 		 410 aa  167  2e-40  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  30.99 
 
 		 391 aa  166  6.9999999999999995e-40  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1376  ABC transporter related  33.42 
 
 		 643 aa  166  9e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.726226  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3722  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  34.55 
 
 		 661 aa  164  2.0000000000000002e-39  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.197836  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09461  putative ABC transporter  29.15 
 
 		 410 aa  163  4.0000000000000004e-39  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  31.39 
 
 		 405 aa  162  8.000000000000001e-39  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4044  protein of unknown function DUF214  31.22 
 
 		 405 aa  162  1e-38  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  31.46 
 
 		 399 aa  160  4e-38  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4002  protein of unknown function DUF214  30.96 
 
 		 405 aa  160  4e-38  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  30.59 
 
 		 658 aa  159  6e-38  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3166  protein of unknown function DUF214  31.87 
 
 		 409 aa  159  7e-38  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3058  protein of unknown function DUF214  31.87 
 
 		 409 aa  159  7e-38  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  29.72 
 
 		 400 aa  159  9e-38  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  30.77 
 
 		 409 aa  159  9e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  31.43 
 
 		 644 aa  158  2e-37  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4734  protein of unknown function DUF214  32.49 
 
 		 405 aa  157  3e-37  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.0670299 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1616  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  31.3 
 
 		 651 aa  157  4e-37  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0879367  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1060  protein of unknown function DUF214  31.66 
 
 		 410 aa  156  6e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0412  hypothetical protein  33.59 
 
 		 394 aa  156  6e-37  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  30.77 
 
 		 400 aa  156  8e-37  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1437  ABC transporter  29.93 
 
 		 409 aa  155  1e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51547  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2970  hypothetical protein  31.63 
 
 		 409 aa  155  1e-36  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  27.75 
 
 		 409 aa  154  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  30.15 
 
 		 406 aa  154  2.9999999999999998e-36  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  30.24 
 
 		 405 aa  154  4e-36  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  30.2 
 
 		 401 aa  152  8e-36  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  28.75 
 
 		 406 aa  152  8.999999999999999e-36  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09961  putative ABC transporter  27.96 
 
 		 409 aa  150  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_3709  hypothetical protein  31.57 
 
 		 403 aa  150  4e-35  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0173811 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10590  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  31.25 
 
 		 385 aa  150  4e-35  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2862  hypothetical protein  28.64 
 
 		 405 aa  150  6e-35  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732652  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  28 
 
 		 406 aa  149  7e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  29.26 
 
 		 407 aa  149  8e-35  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1258  ABC transporter related  31.76 
 
 		 652 aa  149  9e-35  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1604  hypothetical protein  31.85 
 
 		 443 aa  149  9e-35  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2159  macrolide ABC efflux protein  30.75 
 
 		 656 aa  148  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103755  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1994  protein of unknown function DUF214  30.36 
 
 		 405 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0259708 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1967  protein of unknown function DUF214  30.36 
 
 		 405 aa  149  1.0000000000000001e-34  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2440  protein of unknown function DUF214  32.42 
 
 		 416 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.652514  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1870  protein of unknown function DUF214  33.25 
 
 		 398 aa  147  3e-34  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  27.82 
 
 		 656 aa  146  6e-34  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0294  putative ABC transporter  29.57 
 
 		 409 aa  146  9e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2043  hypothetical protein  29.07 
 
 		 403 aa  145  9e-34  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09661  putative ABC transporter  29.57 
 
 		 409 aa  146  9e-34  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.326291  normal  0.359789 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  29.8 
 
 		 409 aa  145  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  32.29 
 
 		 653 aa  145  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal  1 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2458  hypothetical protein  28.42 
 
 		 394 aa  144  2e-33  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1127  hypothetical protein  29.98 
 
 		 409 aa  144  3e-33  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3463  hypothetical protein  30.75 
 
 		 402 aa  144  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1472  ABC transporter permease protein  31.94 
 
 		 417 aa  144  3e-33  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.932359  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  31.2 
 
 		 402 aa  143  4e-33  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0127  protein of unknown function DUF214  28.1 
 
 		 452 aa  143  4e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010644  Emin_1180  hypothetical protein  28.83 
 
 		 412 aa  144  4e-33  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  29.1 
 
 		 653 aa  144  4e-33  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  31.2 
 
 		 402 aa  143  4e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3534  ABC transporter related  31.65 
 
 		 654 aa  143  5e-33  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.639834 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2026  protein of unknown function DUF214  30.83 
 
 		 409 aa  143  5e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000157118 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1082  hypothetical protein  28.38 
 
 		 456 aa  143  6e-33  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.699767  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2041  ABC transporter, ATPase subunit  31.43 
 
 		 645 aa  142  9.999999999999999e-33  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.568421  normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0738  protein of unknown function DUF214  28.28 
 
 		 408 aa  142  9.999999999999999e-33  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3916  hypothetical protein  29.48 
 
 		 402 aa  141  1.9999999999999998e-32  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1676  protein of unknown function DUF214  31.71 
 
 		 415 aa  142  1.9999999999999998e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal  1 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2971  hypothetical protein  29.31 
 
 		 412 aa  141  1.9999999999999998e-32  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3709  ABC transporter permease protein  30.3 
 
 		 404 aa  141  1.9999999999999998e-32  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0742  protein of unknown function DUF214  31.76 
 
 		 387 aa  141  3e-32  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0302807  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  29.18 
 
 		 657 aa  140  3e-32  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3607  protein of unknown function DUF214  30.89 
 
 		 403 aa  140  3e-32  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.123498  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  31.13 
 
 		 654 aa  140  3.9999999999999997e-32  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02560  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  29.97 
 
 		 406 aa  140  3.9999999999999997e-32  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000006972  n/a   
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0622  ABC transporter related  27.32 
 
 		 657 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  hitchhiker  0.00774379  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3645  hypothetical protein  28.31 
 
 		 402 aa  140  6e-32  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.52542 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2201  protein of unknown function DUF214  30.73 
 
 		 409 aa  139  6e-32  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0584  hypothetical protein  29.02 
 
 		 404 aa  139  7.999999999999999e-32  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.585945  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3524  ABC transporter related  33.25 
 
 		 671 aa  139  7.999999999999999e-32  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0569  hypothetical protein  29.02 
 
 		 404 aa  139  1e-31  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.883342  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6962  hypothetical protein  32.16 
 
 		 410 aa  139  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0549352  normal  0.280239 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2588  protein of unknown function DUF214  28.57 
 
 		 400 aa  139  1e-31  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  decreased coverage  0.0000000760178  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_02570  ABC-type antimicrobial peptide transport system, permease component  26.68 
 
 		 417 aa  138  1e-31  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000000358315  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1944  ABC transporter related  29.44 
 
 		 657 aa  137  3.0000000000000003e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.819386  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1841  hypothetical protein  31.59 
 
 		 437 aa  137  4e-31  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.521944  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0266  hypothetical protein  31.58 
 
 		 414 aa  137  4e-31  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17241  normal  0.0445989 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>