More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Dd1591_3982 on replicon NC_012912
Organism: Dickeya zeae Ech1591



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012912  Dd1591_3982  protein of unknown function DUF214  100 
 
 
406 aa  796    Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3734  hypothetical protein  65.49 
 
 
412 aa  503  1e-141  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.637974  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_4027  protein of unknown function DUF214  54.05 
 
 
404 aa  407  1.0000000000000001e-112  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_0893  hypothetical protein  52.76 
 
 
389 aa  345  1e-93  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_60780  ABC transporter permease  49.24 
 
 
397 aa  340  2.9999999999999998e-92  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5233  ABC transporter permease  48.99 
 
 
397 aa  329  6e-89  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4095  hypothetical protein  37 
 
 
406 aa  218  1e-55  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.591324  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2472  protein of unknown function DUF214  37.75 
 
 
393 aa  212  9e-54  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.462522  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_5199  putative permease of ABC transporter  36.07 
 
 
423 aa  211  2e-53  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0520248  normal  0.0790722 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2989  hypothetical protein  31.59 
 
 
397 aa  209  9e-53  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0037  export ABC transporter permease protein  32.64 
 
 
397 aa  202  7e-51  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_0746  protein of unknown function DUF214  34.24 
 
 
407 aa  201  1.9999999999999998e-50  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2849  hypothetical protein  31.33 
 
 
397 aa  196  9e-49  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0200  hypothetical protein  34.99 
 
 
391 aa  188  1e-46  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0839  protein of unknown function DUF214  32.33 
 
 
405 aa  178  2e-43  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2826  hypothetical protein  29.9 
 
 
405 aa  171  3e-41  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4044  protein of unknown function DUF214  32.32 
 
 
405 aa  169  7e-41  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2862  hypothetical protein  31.07 
 
 
405 aa  168  2e-40  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.732652  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0367  ABC-type transport system, permease component  33 
 
 
405 aa  168  2e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_4002  protein of unknown function DUF214  32.06 
 
 
405 aa  168  2e-40  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3129  protein of unknown function DUF214  31.89 
 
 
406 aa  167  5e-40  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4939  protein of unknown function DUF214  29.85 
 
 
406 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.485903  normal  0.767822 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3722  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  35.77 
 
 
661 aa  160  3e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.197836  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0412  hypothetical protein  33.42 
 
 
394 aa  160  4e-38  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00341518 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1060  protein of unknown function DUF214  33.75 
 
 
410 aa  160  5e-38  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1062  ABC transporter  31.17 
 
 
409 aa  159  9e-38  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.978594  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0924  protein of unknown function DUF214  31.38 
 
 
405 aa  158  1e-37  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_08461  putative ABC transporter  28.54 
 
 
409 aa  159  1e-37  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.825972  hitchhiker  0.00227994 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0738  protein of unknown function DUF214  28.47 
 
 
408 aa  158  2e-37  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_3166  protein of unknown function DUF214  32.54 
 
 
409 aa  157  2e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.289213  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0080  ABC transporter permease  29.66 
 
 
407 aa  157  4e-37  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2970  hypothetical protein  33.81 
 
 
409 aa  156  5.0000000000000005e-37  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1627  ABC transporter-related protein  31.79 
 
 
658 aa  156  5.0000000000000005e-37  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3058  protein of unknown function DUF214  32.61 
 
 
409 aa  156  6e-37  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.270087  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1721  protein of unknown function DUF214  31.74 
 
 
406 aa  155  1e-36  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1903  hypothetical protein  31.14 
 
 
419 aa  155  1e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.92523  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3645  hypothetical protein  30.48 
 
 
402 aa  154  2e-36  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.52542 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0887  putative ABC transporter  27.57 
 
 
398 aa  154  2e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.110262  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4500  protein of unknown function DUF214  31.05 
 
 
403 aa  154  2e-36  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0742  protein of unknown function DUF214  33.33 
 
 
387 aa  154  2.9999999999999998e-36  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.0302807  normal 
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2736  ABC transporter permease protein  30.56 
 
 
418 aa  154  2.9999999999999998e-36  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.176846  normal 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15441  putative ABC transporter  31.08 
 
 
409 aa  154  4e-36  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.422429 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1841  hypothetical protein  31.3 
 
 
437 aa  154  4e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.521944  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1437  ABC transporter  30.27 
 
 
409 aa  153  5e-36  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.51547  normal  0.142373 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2312  protein of unknown function DUF214  31.13 
 
 
402 aa  152  7e-36  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2823  hypothetical protein  31.13 
 
 
402 aa  152  7e-36  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.517251  normal  0.306546 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1616  transmembrane ATP-binding ABC transporter protein  29.52 
 
 
651 aa  152  8.999999999999999e-36  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.0879367  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1127  hypothetical protein  30.34 
 
 
409 aa  152  1e-35  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1452  hypothetical protein  32.93 
 
 
410 aa  151  2e-35  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_2159  macrolide ABC efflux protein  31.61 
 
 
656 aa  151  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.103755  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_09461  putative ABC transporter  27.57 
 
 
410 aa  150  3e-35  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1472  ABC transporter permease protein  31.53 
 
 
417 aa  150  3e-35  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.932359  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0269  hypothetical protein  32.68 
 
 
414 aa  150  4e-35  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.831572  hitchhiker  0.00091516 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1967  protein of unknown function DUF214  30.58 
 
 
405 aa  150  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1994  protein of unknown function DUF214  30.58 
 
 
405 aa  150  4e-35  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.0259708 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_09481  putative ABC transporter  27.57 
 
 
410 aa  150  4e-35  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_0390  protein of unknown function DUF214  27.39 
 
 
406 aa  149  6e-35  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0127  protein of unknown function DUF214  30.86 
 
 
452 aa  149  7e-35  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1969  ABC transporter  31.96 
 
 
657 aa  149  9e-35  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.598112  normal  0.988518 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_3607  protein of unknown function DUF214  32.56 
 
 
403 aa  148  2.0000000000000003e-34  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.123498  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1143  ABC transporter related  30.12 
 
 
653 aa  147  2.0000000000000003e-34  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.229831  normal  0.618242 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2971  hypothetical protein  30.77 
 
 
412 aa  148  2.0000000000000003e-34  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_3534  ABC transporter related  33.51 
 
 
654 aa  147  3e-34  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.639834 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2458  hypothetical protein  29.59 
 
 
394 aa  147  3e-34  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1856  hypothetical protein  31.69 
 
 
657 aa  146  7.0000000000000006e-34  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.804501  normal  0.550352 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1042  protein of unknown function DUF214  30.71 
 
 
404 aa  146  7.0000000000000006e-34  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2201  protein of unknown function DUF214  31.08 
 
 
409 aa  146  8.000000000000001e-34  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1676  protein of unknown function DUF214  31.64 
 
 
415 aa  145  1e-33  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.860477  normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2026  protein of unknown function DUF214  31.41 
 
 
409 aa  145  1e-33  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000000157118 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_2043  hypothetical protein  28.68 
 
 
403 aa  145  1e-33  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0904  hypothetical protein  30.5 
 
 
411 aa  145  1e-33  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.0627404  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1870  protein of unknown function DUF214  32.82 
 
 
398 aa  145  1e-33  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_0780  protein of unknown function DUF214  29.9 
 
 
401 aa  145  1e-33  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  unclonable  0.0000178318  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3550  hypothetical protein  29.4 
 
 
402 aa  145  1e-33  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_09961  putative ABC transporter  27.32 
 
 
409 aa  145  1e-33  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0813  hypothetical protein  28.61 
 
 
402 aa  145  2e-33  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3036  hypothetical protein  30.12 
 
 
409 aa  145  2e-33  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.000134447  normal 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0770  ABC transporter related  27.4 
 
 
656 aa  144  2e-33  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.920342  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2926  hypothetical protein  29.85 
 
 
394 aa  144  3e-33  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.019889  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3466  hypothetical protein  30.95 
 
 
399 aa  144  3e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1340  ABC transporter related  30.99 
 
 
644 aa  144  3e-33  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0266  hypothetical protein  31.71 
 
 
414 aa  144  4e-33  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.17241  normal  0.0445989 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1708  protein of unknown function DUF214  29.35 
 
 
400 aa  144  4e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.490219  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1894  protein of unknown function DUF214  29.85 
 
 
400 aa  143  5e-33  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0975856  normal  0.516393 
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1412  hypothetical protein  29.52 
 
 
400 aa  143  6e-33  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0456  protein of unknown function DUF214  32.6 
 
 
412 aa  143  6e-33  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4210  efflux ABC transporter ATP-binding protein  32.23 
 
 
654 aa  143  7e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.875938  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2353  hypothetical protein  32.15 
 
 
408 aa  142  8e-33  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0317292  normal  0.0674472 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3235  hypothetical protein  34.24 
 
 
408 aa  142  9e-33  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1552  protein of unknown function DUF214  27.52 
 
 
397 aa  141  1.9999999999999998e-32  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00448084  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0294  putative ABC transporter  29.03 
 
 
409 aa  140  3e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_09661  putative ABC transporter  29.03 
 
 
409 aa  140  3e-32  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.326291  normal  0.359789 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2440  protein of unknown function DUF214  30.75 
 
 
416 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.652514  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6962  hypothetical protein  31.14 
 
 
410 aa  139  1e-31  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0549352  normal  0.280239 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1724  protein of unknown function DUF214  30.2 
 
 
406 aa  138  2e-31  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  unclonable  0.0000000472644  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1100  ABC transporter related  31.97 
 
 
653 aa  138  2e-31  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.177727  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0817  ABC-type transport system, permease component  27.85 
 
 
400 aa  138  2e-31  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0496  ATPase  30.71 
 
 
670 aa  137  2e-31  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4848  hypothetical protein  29.9 
 
 
413 aa  138  2e-31  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.0956312  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1258  ABC transporter related  29.2 
 
 
652 aa  138  2e-31  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>