210 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_3478 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_3478  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  100 
 
 		 217 aa  450  1.0000000000000001e-126  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3529  hydrolase  31.25 
 
 		 220 aa  115  3.9999999999999997e-25  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.188374  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_1672  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  33.49 
 
 		 217 aa  105  8e-22  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.10706  normal  0.0227644 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0956  putative phosphatase  31.5 
 
 		 224 aa  87  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_1758  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.92 
 
 		 234 aa  73.2  0.000000000003  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  0.0639278  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0072  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  28.99 
 
 		 230 aa  70.1  0.00000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0786  HAD-superfamily hydrolase  27.84 
 
 		 210 aa  69.3  0.00000000004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0590  HAD family hydrolase  26.98 
 
 		 219 aa  68.9  0.00000000005  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0419315 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1697  HAD family hydrolase  27.54 
 
 		 231 aa  68.6  0.00000000007  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.0993915 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2300  HAD family hydrolase  26.29 
 
 		 215 aa  67.8  0.0000000001  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.00000000835779  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25590  putative hydrolase  28.28 
 
 		 230 aa  65.1  0.0000000008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.080664  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0422  hydrolase  29.27 
 
 		 215 aa  64.7  0.000000001  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.442888  hitchhiker  0.00630531 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1874  HAD family hydrolase  26 
 
 		 216 aa  64.3  0.000000001  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.785736  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1462  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  24.37 
 
 		 330 aa  64.3  0.000000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2187  putative hydrolase  27.14 
 
 		 230 aa  64.7  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0143931  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1562  putative hydrolase  27.46 
 
 		 218 aa  63.5  0.000000002  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.320439  normal  0.240105 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1518  HAD family hydrolase  24.42 
 
 		 226 aa  63.2  0.000000003  Pseudomonas putida W619  Bacteria  hitchhiker  0.0020263  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_5280  HAD family hydrolase  25 
 
 		 228 aa  62.8  0.000000004  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.94241  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2213  hypothetical protein  22.07 
 
 		 219 aa  62.8  0.000000004  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0658  haloacid dehalogenase-like hydrolase  28.57 
 
 		 222 aa  62.8  0.000000004  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.40238 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0352  hydrolase  28.92 
 
 		 215 aa  62.4  0.000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1594  HAD family hydrolase  26.11 
 
 		 234 aa  62  0.000000006  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.109016  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1483  HAD family hydrolase  23.56 
 
 		 224 aa  61.6  0.000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.0762089  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2920  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.24 
 
 		 219 aa  61.2  0.00000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  hitchhiker  0.00300829  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2438  HAD family hydrolase  24.87 
 
 		 219 aa  60.1  0.00000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.625372  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0364  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  26.84 
 
 		 229 aa  60.8  0.00000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.946559  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1778  HAD family hydrolase  23.88 
 
 		 222 aa  60.5  0.00000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0979226  decreased coverage  0.0000822361 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1438  hypothetical protein  26.86 
 
 		 210 aa  59.7  0.00000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.148513  normal  0.0550333 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3254  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  29.86 
 
 		 224 aa  59.3  0.00000004  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_14840  HAD-superfamily hydrolase  24.39 
 
 		 220 aa  59.3  0.00000005  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.770171  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2240  HAD family hydrolase  22.86 
 
 		 214 aa  58.9  0.00000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.279618  normal  0.937061 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1492  HAD family hydrolase  24.64 
 
 		 217 aa  58.2  0.00000008  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.210059  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2241  hypothetical protein  21.6 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000001  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1064  putative haloacid dehalogenase-like hydrolase  24.29 
 
 		 219 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.259823  normal  1 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0989  HAD family hydrolase  27.32 
 
 		 222 aa  57.8  0.0000001  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0993  HAD family hydrolase  27.72 
 
 		 222 aa  58.2  0.0000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2641  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.66 
 
 		 222 aa  57  0.0000002  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A2273  HAD family hydrolase  24.02 
 
 		 219 aa  57.4  0.0000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.768763  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1709  haloacid dehalogenase-like hydrolase  26.83 
 
 		 222 aa  56.6  0.0000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.0748768  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1175  HAD family hydrolase  24.62 
 
 		 222 aa  57  0.0000002  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.341694  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3288  HAD family hydrolase  27.66 
 
 		 222 aa  57  0.0000002  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_2916  haloacid dehalogenase-like hydrolase  26.34 
 
 		 237 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0271792  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3084  HAD family hydrolase  23.59 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_2800  HAD superfamily hydrolase  26.34 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  hitchhiker  0.00584417  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_2861  HAD superfamily hydrolase  26.34 
 
 		 219 aa  56.6  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.0565933  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0820  HAD family hydrolase  22.97 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.362734  normal  1 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2034  HAD family hydrolase  23.81 
 
 		 216 aa  56.2  0.0000004  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  0.645104  normal  0.0672621 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1722  HAD family hydrolase  24.76 
 
 		 228 aa  55.8  0.0000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1944  pyrophosphatase PpaX  23.79 
 
 		 214 aa  55.8  0.0000005  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.74 
 
 		 218 aa  55.8  0.0000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.282448  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3658  HAD family hydrolase  24.1 
 
 		 219 aa  55.5  0.0000006  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_2218  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA  25.26 
 
 		 227 aa  55.5  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1872  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  25.26 
 
 		 227 aa  55.5  0.0000007  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.117122  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2232  pyrophosphatase PpaX  22.33 
 
 		 214 aa  55.1  0.0000008  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1621  HAD family hydrolase  24.24 
 
 		 231 aa  55.1  0.0000008  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0638141  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1192  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  25.25 
 
 		 232 aa  54.7  0.000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.998223  normal  0.137923 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1907  HAD superfamily hydrolase  22.12 
 
 		 224 aa  53.9  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  unclonable  0.00000027861 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02338  putative phosphoglycolate phosphatase, contains a phosphatase-like domain  22.11 
 
 		 234 aa  53.5  0.000002  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0463297  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1752  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.17 
 
 		 216 aa  54.3  0.000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2984  pyrophosphatase PpaX  24.19 
 
 		 215 aa  54.3  0.000002  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4445  phosphoglycolate phosphatase  28.65 
 
 		 234 aa  53.9  0.000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0670358  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1595  HAD family hydrolase  26.21 
 
 		 219 aa  54.3  0.000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  hitchhiker  0.00389314  normal  0.0112895 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0595  HAD family hydrolase  25.59 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0609  HAD family hydrolase  25.59 
 
 		 215 aa  53.5  0.000002  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1623  phosphoglycolate phosphatase  27.04 
 
 		 222 aa  53.1  0.000003  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1042  putative phosphoglycolate phosphatase protein  24.27 
 
 		 219 aa  53.1  0.000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.0803838  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0384  HAD family hydrolase  27.78 
 
 		 222 aa  53.1  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000045535  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7580  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  25.89 
 
 		 224 aa  53.1  0.000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4225  phosphatase-like  26.34 
 
 		 219 aa  53.1  0.000003  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.559723  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2007  HAD family hydrolase  24.15 
 
 		 222 aa  53.5  0.000003  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0937  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.5 
 
 		 219 aa  53.1  0.000003  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.171636 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2878  phosphoglycolate phosphatase  26.44 
 
 		 226 aa  53.1  0.000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_2632  HAD family hydrolase  24.26 
 
 		 216 aa  53.1  0.000003  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.861911  hitchhiker  0.000131082 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3807  HAD family hydrolase  22.12 
 
 		 224 aa  53.1  0.000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.118188  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_2291  HAD family hydrolase  22.39 
 
 		 218 aa  52.8  0.000004  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.265516  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0633  HAD family hydrolase  26.34 
 
 		 219 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.32289  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1113  HAD family hydrolase  26.34 
 
 		 219 aa  52.8  0.000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.970841  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1987  HAD family hydrolase  24.24 
 
 		 215 aa  52.8  0.000004  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0143235  normal  0.0109237 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4786  HAD family hydrolase  25.51 
 
 		 225 aa  52.8  0.000004  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.480444 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5694  Haloacid dehalogenase domain-containing protein hydrolase  26.67 
 
 		 211 aa  52.4  0.000005  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.556645  normal  1 
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_0907  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  23.59 
 
 		 219 aa  52.4  0.000005  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  0.0464753  normal  0.0304334 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0211  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  20.75 
 
 		 213 aa  52.4  0.000005  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.531728  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0972  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  23.59 
 
 		 219 aa  52  0.000006  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  0.0569787 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1296  phosphoglycolate phosphatase  24.34 
 
 		 233 aa  52.4  0.000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0205291  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3168  pyrophosphatase PpaX  25.53 
 
 		 222 aa  52.4  0.000006  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0868  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  22.22 
 
 		 227 aa  51.6  0.000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000353752  normal  0.072442 
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1056  putative periplasmic protein  26.19 
 
 		 207 aa  52  0.000008  Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  0.0228325  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_0877  phosphoglycolate phosphatase  23.16 
 
 		 227 aa  51.6  0.000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.336164  normal  0.0645651 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_2191  HAD family hydrolase  24.14 
 
 		 219 aa  51.6  0.000008  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0671825 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1452  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  25.39 
 
 		 231 aa  51.6  0.00001  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  0.546355 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1711  HAD-superfamily hydrolase subfamily IA, variant 1  30.22 
 
 		 219 aa  50.8  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0940062  normal  0.274415 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0391  HAD family hydrolase  25.27 
 
 		 229 aa  51.2  0.00001  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_4626  HAD family hydrolase  24.15 
 
 		 213 aa  51.2  0.00001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.317625  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3122  HAD family hydrolase  24.6 
 
 		 214 aa  51.2  0.00001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0398  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.61 
 
 		 226 aa  50.8  0.00002  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2613  phosphoglycolate phosphatase  23 
 
 		 273 aa  50.1  0.00002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.0917169  normal  0.0942866 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1071  HAD family hydrolase  25.85 
 
 		 219 aa  50.1  0.00002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.357132  normal  0.149129 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0178  HAD family hydrolase  20.3 
 
 		 230 aa  50.1  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.000756614  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1621  TatD-related deoxyribonuclease  20.73 
 
 		 214 aa  50.1  0.00003  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.0243824  normal  1 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2285  phosphatases  22.68 
 
 		 221 aa  49.7  0.00004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.812545  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>