67 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PC1_0759 on replicon NC_012917
Organism: Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_012917  PC1_0759  TonB family protein  100 
 
 		 314 aa  643    Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_3288  TonB family protein  44.75 
 
 		 194 aa  152  1e-35  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.634309  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1864  transport protein TonB  47.67 
 
 		 240 aa  86.3  7e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.680203  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1591  transport protein TonB  47.67 
 
 		 242 aa  85.9  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.796983 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B1409  transport protein TonB  47.67 
 
 		 242 aa  85.9  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.382523  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A1870  transport protein TonB  47.67 
 
 		 242 aa  85.5  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.875088 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C1927  transport protein TonB  47.67 
 
 		 240 aa  85.5  9e-16  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00664696 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_1944  transport protein TonB  52.78 
 
 		 238 aa  83.6  0.000000000000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1946  transport protein TonB  41.59 
 
 		 256 aa  83.2  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.940635  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A2147  transport protein TonB  41.59 
 
 		 252 aa  83.2  0.000000000000005  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.380081  normal  0.047468 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2055  transport protein TonB  41.59 
 
 		 256 aa  83.2  0.000000000000005  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_2287  transport protein TonB  48.05 
 
 		 264 aa  81.3  0.00000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.807872  normal  0.797915 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1421  transport protein TonB  48.24 
 
 		 239 aa  81.3  0.00000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.117229  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1880  transport protein TonB  48.24 
 
 		 243 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000508248 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2375  transport protein TonB  48.24 
 
 		 244 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.131569  hitchhiker  0.00000150062 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2396  TonB family protein  48.24 
 
 		 244 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.010558  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1410  transport protein TonB  48.24 
 
 		 239 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.981029  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1361  transport protein TonB  48.24 
 
 		 239 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.0000400843  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1739  transport protein TonB  48.24 
 
 		 239 aa  80.5  0.00000000000003  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.00000184106  hitchhiker  0.00504823 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01236  hypothetical protein  48.24 
 
 		 239 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01226  membrane spanning protein in TonB-ExbB-ExbD complex  48.24 
 
 		 239 aa  80.9  0.00000000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2185  transport protein TonB  45.83 
 
 		 249 aa  79.7  0.00000000000006  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.150473  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2295  transport protein TonB  41 
 
 		 251 aa  76.6  0.0000000000005  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1995  transport protein TonB  44.16 
 
 		 252 aa  75.5  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2682  transport protein TonB  42.86 
 
 		 248 aa  73.9  0.000000000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.258362  hitchhiker  0.00112593 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_72970  TonB protein  35.45 
 
 		 342 aa  58.5  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.953349  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1274  TonB domain protein  35.29 
 
 		 108 aa  56.6  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.164675  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E0941  putative membrane protein, energy transducer  35.29 
 
 		 108 aa  56.6  0.0000005  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_6333  TonB protein  36.11 
 
 		 305 aa  55.8  0.0000009  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.981899  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0245  TonB family protein  29.44 
 
 		 203 aa  55.5  0.000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2995  TonB family protein  45 
 
 		 417 aa  55.5  0.000001  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_4564  TonB2 protein, putative  36.25 
 
 		 203 aa  55.1  0.000002  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0186  TonB family protein  37.5 
 
 		 203 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_4148  TonB family protein  37.5 
 
 		 203 aa  54.3  0.000003  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3957  TonB family protein  37.5 
 
 		 203 aa  53.1  0.000005  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1735  TonB family protein  28.47 
 
 		 228 aa  52.4  0.00001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.298977  n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3832  TonB family protein  36.25 
 
 		 203 aa  52.4  0.00001  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2219  TonB family protein  37.74 
 
 		 115 aa  51.6  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0449939 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_3759  TonB family protein  36.25 
 
 		 203 aa  51.6  0.00002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1461  TonB family protein  28.48 
 
 		 225 aa  51.6  0.00002  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0845  TonB domain-containing protein  37.04 
 
 		 259 aa  51.6  0.00002  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  0.286568  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1657  TonB family protein  26.92 
 
 		 237 aa  50.8  0.00003  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.107478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3342  antirepressor regulating drug resistance protein  38.46 
 
 		 403 aa  50.4  0.00003  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1150  tonB2 protein  32.22 
 
 		 206 aa  50.1  0.00005  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.595511  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2922  TonB family protein  43.4 
 
 		 458 aa  50.1  0.00005  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  0.947626 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0610  TonB-like protein  33.85 
 
 		 217 aa  50.1  0.00005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00121909  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3705  tonB protein  31.17 
 
 		 277 aa  49.3  0.00008  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.252589  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2614  TonB-like periplasmic protein  35.19 
 
 		 209 aa  49.3  0.00008  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.496859  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2615  antirepressor regulating drug resistance signal transduction N-terminal membrane component-like  44.9 
 
 		 467 aa  49.3  0.00009  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II0901  TonB3 protein  29.59 
 
 		 207 aa  48.9  0.0001  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.686601  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2159  TonB family protein  24.7 
 
 		 277 aa  48.1  0.0002  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_3209  TonB family protein  37.04 
 
 		 397 aa  48.1  0.0002  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.909373  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2863  TonB family protein  33.33 
 
 		 390 aa  48.5  0.0002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_3457  TonB2 protein, putative  28.43 
 
 		 202 aa  48.1  0.0002  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1435  TonB family protein  26.17 
 
 		 292 aa  46.2  0.0006  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3972  putative TonB protein  33.33 
 
 		 223 aa  46.2  0.0006  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2946  TonB-like protein  34.18 
 
 		 242 aa  45.8  0.001  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3868  TonB family protein  35.19 
 
 		 334 aa  44.7  0.002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.983758  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_0573  TonB-like protein  34.09 
 
 		 93 aa  44.3  0.003  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3539  TonB family protein  30.91 
 
 		 219 aa  44.3  0.003  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1499  TonB protein  30.19 
 
 		 371 aa  44.3  0.003  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0453  TonB-like protein  28.95 
 
 		 289 aa  43.9  0.004  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.000000000832201  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2144  TonB family protein  37.68 
 
 		 296 aa  43.5  0.004  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3584  TonB family protein  32.2 
 
 		 405 aa  43.5  0.004  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4192  TonB family protein  28.89 
 
 		 273 aa  43.9  0.004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0079  TonB family protein  31.51 
 
 		 148 aa  42.7  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.416956 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1890  TonB family protein  33.33 
 
 		 391 aa  42.7  0.008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>