More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_45170 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_45170  putative oxidoreductase  100 
 
 		 396 aa  801    Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.381756  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_1678  FAD dependent oxidoreductase  62.37 
 
 		 464 aa  470  1.0000000000000001e-131  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2696  FAD dependent oxidoreductase  53.92 
 
 		 465 aa  397  1e-109  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.0111401  hitchhiker  0.00176531 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7847  oxidoreductase, FAD-binding protein  39.51 
 
 		 472 aa  268  2e-70  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3539  FAD dependent oxidoreductase  37.3 
 
 		 470 aa  230  4e-59  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.229098  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3930  FAD dependent oxidoreductase  36.46 
 
 		 461 aa  229  9e-59  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.130124  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3534  FAD dependent oxidoreductase  37.47 
 
 		 473 aa  228  2e-58  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.0951864  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3607  FAD dependent oxidoreductase  37.47 
 
 		 473 aa  228  2e-58  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2649  FAD dependent oxidoreductase  38.24 
 
 		 465 aa  224  2e-57  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1021  FAD dependent oxidoreductase  32.48 
 
 		 500 aa  219  7.999999999999999e-56  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0683  FAD dependent oxidoreductase  32.28 
 
 		 496 aa  205  1e-51  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.302039  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0930  FAD dependent oxidoreductase  31.63 
 
 		 479 aa  204  2e-51  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.0776869  n/a   
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1244  FAD dependent oxidoreductase  28.93 
 
 		 479 aa  203  5e-51  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0320  FAD dependent oxidoreductase  30.48 
 
 		 485 aa  202  9.999999999999999e-51  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1628  FAD dependent oxidoreductase  29.97 
 
 		 478 aa  199  7e-50  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.855011  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1532  FAD dependent oxidoreductase  32.43 
 
 		 493 aa  196  5.000000000000001e-49  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_0411  oxidoreductase, FAD-binding  30.83 
 
 		 473 aa  195  1e-48  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  0.0546468  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_08100  glycerol-3-phosphate dehydrogenase  30.81 
 
 		 503 aa  193  6e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.242125  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0620  FAD dependent oxidoreductase  28.01 
 
 		 478 aa  189  5e-47  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0021  FAD dependent oxidoreductase  29.47 
 
 		 484 aa  189  5.999999999999999e-47  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.0147629  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1362  FAD dependent oxidoreductase  31.43 
 
 		 479 aa  189  5.999999999999999e-47  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1552  FAD dependent oxidoreductase  33 
 
 		 494 aa  187  2e-46  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.374477  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1324  FAD dependent oxidoreductase  31.17 
 
 		 479 aa  187  3e-46  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  hitchhiker  0.00260762  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0697  FAD dependent oxidoreductase  29.25 
 
 		 480 aa  182  8.000000000000001e-45  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1490  FAD dependent oxidoreductase  27.89 
 
 		 473 aa  181  2.9999999999999997e-44  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1237  FAD dependent oxidoreductase  34.29 
 
 		 965 aa  177  3e-43  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.18893  normal  0.393596 
 
 
-
 
NC_011695  PHATRDRAFT_50137  predicted protein  30.47 
 
 		 437 aa  172  6.999999999999999e-42  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.563801  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2643  oxidoreductase, FAD-dependent  28 
 
 		 489 aa  171  2e-41  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.292986  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2875  FAD-dependent oxidoreductase  28.42 
 
 		 476 aa  171  2e-41  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2558  BFD/(2Fe-2S)-binding domain-containing protein  28.17 
 
 		 476 aa  167  4e-40  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_0293  FAD dependent oxidoreductase  26.57 
 
 		 491 aa  164  3e-39  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000524606  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_06270  predicted dehydrogenase  30.73 
 
 		 511 aa  162  9e-39  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0283  FAD dependent oxidoreductase  28.09 
 
 		 475 aa  157  2e-37  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3394  FAD dependent oxidoreductase  27.57 
 
 		 576 aa  145  9e-34  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.513559  n/a   
 
 
-
 
NC_011682  PHATRDRAFT_38067  predicted protein  29.58 
 
 		 698 aa  117  3.9999999999999997e-25  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  decreased coverage  0.00714206  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0134  oxidoreductase, FAD-dependent  25.86 
 
 		 508 aa  112  1.0000000000000001e-23  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  decreased coverage  0.00168414  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1375  FAD dependent oxidoreductase  28.64 
 
 		 461 aa  105  2e-21  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.575431  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0530  FAD dependent oxidoreductase  29.87 
 
 		 375 aa  101  2e-20  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2365  FAD dependent oxidoreductase  31.39 
 
 		 409 aa  96.3  8e-19  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000000683607  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0219  glycerol-3-phosphate dehydrogenase, putative  22.1 
 
 		 387 aa  90.1  7e-17  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1640  FAD dependent oxidoreductase  29.58 
 
 		 366 aa  88.2  2e-16  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0430  FAD dependent oxidoreductase  31.56 
 
 		 370 aa  88.2  2e-16  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0217  oxidoreductase, FAD-binding family protein  32.78 
 
 		 373 aa  86.7  6e-16  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.655071  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_1646  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  27.48 
 
 		 371 aa  85.9  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.515375  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A2124  oxidoreductase, FAD-binding family protein  32.29 
 
 		 373 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.646813  n/a   
 
 
-
 
NC_006348  BMA3297  oxidoreductase, FAD-binding family protein  32.29 
 
 		 373 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0434  oxidoreductase, FAD-binding family protein  32.29 
 
 		 373 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.0953783  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0239  FAD-dependent oxidoreductase  32.29 
 
 		 373 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.202342  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0708  FAD dependent oxidoreductase  26.43 
 
 		 362 aa  84.7  0.000000000000002  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.440314  n/a   
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_3382  oxidoreductase, FAD-binding family protein  32.29 
 
 		 373 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_0251  FAD-dependent oxidoreductase  32.29 
 
 		 373 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.627616  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A2964  oxidoreductase, FAD-binding family protein  32.29 
 
 		 373 aa  85.1  0.000000000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2781  hydroxyglutarate oxidase  25 
 
 		 416 aa  84.7  0.000000000000003  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.312002  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1081  FAD dependent oxidoreductase  28.32 
 
 		 367 aa  84.7  0.000000000000003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0868948  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_67970  hypothetical protein  30.56 
 
 		 368 aa  83.6  0.000000000000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.224569  normal  0.014096 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2873  hydroxyglutarate oxidase  24.63 
 
 		 416 aa  83.2  0.000000000000007  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_2910  hydroxyglutarate oxidase  25.4 
 
 		 416 aa  82.4  0.00000000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  0.5601 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1107  hydroxyglutarate oxidase  27.91 
 
 		 404 aa  82  0.00000000000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1140  FAD dependent oxidoreductase  31.23 
 
 		 368 aa  82.4  0.00000000000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0603157  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_5882  hypothetical protein  30.9 
 
 		 368 aa  82  0.00000000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_2136  FAD dependent oxidoreductase  27.33 
 
 		 371 aa  82.4  0.00000000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.471962  normal  0.0129365 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_21030  hydroxyglutarate oxidase  30.54 
 
 		 398 aa  81.6  0.00000000000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  hitchhiker  0.00231927  normal  0.19129 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_2152  FAD dependent oxidoreductase  26.97 
 
 		 367 aa  80.9  0.00000000000004  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.841388  n/a   
 
 
-
 
NC_011675  PHATRDRAFT_41947  predicted protein  25.93 
 
 		 383 aa  80.5  0.00000000000005  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.856013  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1916  FAD dependent oxidoreductase  29.93 
 
 		 371 aa  80.1  0.00000000000006  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0872909 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2706  FAD dependent oxidoreductase  26.79 
 
 		 364 aa  79.7  0.00000000000008  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.0337061  normal  0.0586265 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3902  hydroxyglutarate oxidase  27.65 
 
 		 422 aa  79.3  0.0000000000001  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2451  FAD dependent oxidoreductase  30.07 
 
 		 367 aa  79.3  0.0000000000001  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.130562  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4660  hydroxyglutarate oxidase  24.48 
 
 		 399 aa  78.6  0.0000000000002  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3133  FAD dependent oxidoreductase  25.82 
 
 		 407 aa  79  0.0000000000002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.270891  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2518  FAD dependent oxidoreductase  28.71 
 
 		 374 aa  78.6  0.0000000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.355851  normal  0.0110864 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1023  FAD dependent oxidoreductase  27.19 
 
 		 422 aa  77  0.0000000000005  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0387  FAD dependent oxidoreductase  28.37 
 
 		 368 aa  77  0.0000000000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1259  FAD dependent oxidoreductase  31.32 
 
 		 368 aa  76.6  0.0000000000006  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2156  FAD dependent oxidoreductase  27.8 
 
 		 399 aa  76.6  0.0000000000007  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0724716  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3780  FAD dependent oxidoreductase  30.67 
 
 		 403 aa  76.3  0.0000000000009  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02516  predicted enzyme  26.73 
 
 		 422 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02480  hypothetical protein  26.73 
 
 		 422 aa  75.5  0.000000000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2780  hydroxyglutarate oxidase  26.73 
 
 		 422 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.582782 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1046  hydroxyglutarate oxidase  26.73 
 
 		 422 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2795  hydroxyglutarate oxidase  26.73 
 
 		 422 aa  75.9  0.000000000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2648  FAD dependent oxidoreductase  29.08 
 
 		 376 aa  75.1  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.142643  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1940  hydroxyglutarate oxidase  28.86 
 
 		 402 aa  75.5  0.000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4934  FAD dependent oxidoreductase  30.56 
 
 		 372 aa  75.1  0.000000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.2077  normal  0.974431 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3221  hydroxyglutarate oxidase  26.73 
 
 		 422 aa  75.1  0.000000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1914  hydroxyglutarate oxidase  28.86 
 
 		 402 aa  74.7  0.000000000003  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1021  sn-glycerol-3-phosphate dehydrogenase subunit A  24.82 
 
 		 552 aa  74.3  0.000000000003  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06715  hydroxyglutarate oxidase  25.56 
 
 		 410 aa  73.9  0.000000000005  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2940  hydroxyglutarate oxidase  26.73 
 
 		 422 aa  73.6  0.000000000005  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5628  FAD dependent oxidoreductase  26.64 
 
 		 398 aa  73.6  0.000000000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  hitchhiker  0.00384749  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B2446  putative glycine oxidase  23.58 
 
 		 391 aa  73.6  0.000000000006  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.602268  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0798  hydroxyglutarate oxidase  26.5 
 
 		 400 aa  73.2  0.000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3777  FAD dependent oxidoreductase  28.37 
 
 		 371 aa  73.2  0.000000000008  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.986155 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2390  hydroxyglutarate oxidase  27.75 
 
 		 396 aa  72.8  0.000000000009  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0316475  normal  0.147851 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3537  FAD dependent oxidoreductase  27.57 
 
 		 401 aa  72.8  0.000000000009  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.994551  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000810  hypothetical protein YgaF  25.11 
 
 		 408 aa  72.4  0.00000000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_3067  FAD dependent oxidoreductase  28.96 
 
 		 369 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.41507 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2434  FAD dependent oxidoreductase  28.96 
 
 		 369 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_3048  FAD dependent oxidoreductase  28.96 
 
 		 369 aa  72.4  0.00000000001  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3992  2-hydroxyglutarate dehydrogenase  28.06 
 
 		 366 aa  72.8  0.00000000001  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.475329  normal  0.0131881 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>