More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene PA14_27900 on replicon NC_008463
Organism: Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008463  PA14_27900  putative transcriptional regulator  100 
 
 		 239 aa  481  1e-135  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_2355  putative transcriptional regulator  97.07 
 
 		 239 aa  468  1.0000000000000001e-131  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02688  transcriptional regulator  54.04 
 
 		 242 aa  231  7.000000000000001e-60  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.953186  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_2986  GntR family transcriptional regulator  48.25 
 
 		 238 aa  204  8e-52  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.351777  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1876  transcriptional regulator  46.36 
 
 		 238 aa  182  5.0000000000000004e-45  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_21970  transcriptional regulator  45.91 
 
 		 238 aa  178  4.999999999999999e-44  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000000109552 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_0745  transcriptional regulator, GntR family  42.22 
 
 		 235 aa  175  6e-43  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0151  GntR family transcriptional regulator  42.54 
 
 		 237 aa  173  1.9999999999999998e-42  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1333  GntR family transcriptional regulator  45.89 
 
 		 238 aa  172  5e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.415136  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000763  2-aminoethylphosphonate uptake and metabolism regulator  38.67 
 
 		 233 aa  170  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0542  putative repressor protein PhnR  39.56 
 
 		 234 aa  170  2e-41  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  0.706261  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000660  transcriptional regulator  38.7 
 
 		 242 aa  170  2e-41  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0724  transcriptional regulator, GntR family  41.33 
 
 		 235 aa  169  4e-41  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_04882  histidine utilization repressor  38.22 
 
 		 234 aa  169  5e-41  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4489  GntR family transcriptional regulator  41.18 
 
 		 236 aa  164  1.0000000000000001e-39  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.666836  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_1607  transcriptional regulator GntR  39.66 
 
 		 253 aa  160  1e-38  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.281055 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4235  transcriptional regulator  41.99 
 
 		 238 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_49630  transcriptional regulator  41.99 
 
 		 238 aa  160  2e-38  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0128402  normal  1 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0490  transcriptional regulator protein  40.17 
 
 		 239 aa  158  8e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B0469  transcriptional regulator protein  40.17 
 
 		 239 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0532  transcriptional regulator protein  40.17 
 
 		 239 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.603923  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0477  transcriptional regulator protein  40.17 
 
 		 239 aa  157  1e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.489197  normal  0.580276 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0471  2-aminoethylphosphonate transport, repressor  40.17 
 
 		 239 aa  157  2e-37  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.481476  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1687  GntR family transcriptional regulator  40.87 
 
 		 237 aa  156  3e-37  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.282091  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2743  transcriptional regulator, GntR family protein  35.96 
 
 		 263 aa  153  2e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1727  GntR family transcriptional regulator  40.89 
 
 		 237 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00877685 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_3992  GntR family transcriptional regulator  40.89 
 
 		 237 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.204883  normal  0.364758 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3877  transcriptional regulator, GntR family  40.17 
 
 		 239 aa  146  3e-34  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.211891  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1319  GntR family transcriptional regulator  39.9 
 
 		 237 aa  141  9.999999999999999e-33  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.966684 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1276  GntR family transcriptional regulator  40.89 
 
 		 237 aa  134  9.999999999999999e-31  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.471351  normal  0.413626 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2652  regulatory protein GntR, HTH  38.38 
 
 		 256 aa  131  1.0000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2122  transcriptional regulator, GntR family  35.91 
 
 		 244 aa  124  2e-27  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_3531  GntR family transcriptional regulator  36.74 
 
 		 252 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.405596  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_3536  GntR family transcriptional regulator  36.74 
 
 		 252 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.482817 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3604  GntR family transcriptional regulator  36.74 
 
 		 252 aa  123  3e-27  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.890109  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3927  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  35.81 
 
 		 242 aa  122  5e-27  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.341956  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_4145  GntR family transcriptional regulator  31.36 
 
 		 247 aa  112  8.000000000000001e-24  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004311  BRA1179  GntR family transcriptional regulator  29.57 
 
 		 244 aa  110  2.0000000000000002e-23  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.330166  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0433  transcriptional regulator, GntR family  33.5 
 
 		 238 aa  110  2.0000000000000002e-23  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.0535711  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1636  transcriptional regulator, GntR family  37.07 
 
 		 231 aa  108  7.000000000000001e-23  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.496751  normal  0.709152 
 
 
-
 
NC_008532  STER_0913  transcription regulator GntR family  27.31 
 
 		 232 aa  108  9.000000000000001e-23  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.0175976  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1903  GntR family transcriptional regulator  29.6 
 
 		 239 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.629939  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2215  transcriptional regulator, GntR family  34.2 
 
 		 270 aa  107  2e-22  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.587929  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1638  GntR family transcriptional regulator  28.95 
 
 		 239 aa  106  3e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0630  GntR family transcriptional regulator  33.17 
 
 		 255 aa  105  7e-22  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22940  transcriptional regulator, GntR family  29.87 
 
 		 252 aa  104  1e-21  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2575  phophonate C-P lyase system transcriptional regulator PhnF, GntR family  33.18 
 
 		 243 aa  103  2e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_3882  GntR family transcriptional regulator  27.88 
 
 		 243 aa  102  5e-21  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.207693  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1419  GntR family transcriptional regulator  30.97 
 
 		 247 aa  102  6e-21  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3582  GntR family transcriptional regulator  29.47 
 
 		 235 aa  102  7e-21  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  0.243305 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2142  transcriptional regulator, GntR family  29.81 
 
 		 260 aa  101  9e-21  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000412  transcriptional regulator of succinyl CoA synthetase operon  27.85 
 
 		 235 aa  100  1e-20  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2059  transcription regulator, GntR family  31.11 
 
 		 228 aa  101  1e-20  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2752  GntR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 225 aa  100  2e-20  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.792581  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6505  transcriptional regulator, GntR family  33.82 
 
 		 278 aa  100  3e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.381857  normal  0.213544 
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1063  transcriptional regulator, GntR family  32.67 
 
 		 242 aa  99.4  4e-20  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  normal  0.188898  normal  1 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4120  GntR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 248 aa  99  5e-20  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS3963  GntR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 243 aa  99.4  5e-20  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.691414  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3794  GntR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 243 aa  99.4  5e-20  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3809  GntR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 243 aa  99.4  5e-20  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.467203  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2332  GntR family transcriptional regulator  34.8 
 
 		 231 aa  99.4  5e-20  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.777636 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4272  GntR family transcriptional regulator  26.92 
 
 		 243 aa  99.4  5e-20  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1424  putative transcriptional regulator, GntR family  32.43 
 
 		 246 aa  98.2  1e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.07575  normal  0.0454978 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0178  GntR family transcriptional regulator  29.78 
 
 		 260 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.516335 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1234  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  30.67 
 
 		 272 aa  97.8  1e-19  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.550496  normal  0.0276711 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2213  GntR family transcriptional regulator  30.74 
 
 		 264 aa  98.2  1e-19  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.042368  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0189  GntR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 260 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0198  GntR family transcriptional regulator  29.33 
 
 		 260 aa  97.4  2e-19  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_1950  transcriptional regulator, GntR family  30.6 
 
 		 256 aa  96.7  3e-19  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00000832464 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0781  GntR family transcriptional regulator  34.27 
 
 		 266 aa  96.3  4e-19  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_9090  putative transcriptional regulator, GntR family  33.04 
 
 		 240 aa  96.3  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG0968  GntR family transcriptional regulator  25.99 
 
 		 232 aa  95.9  5e-19  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_34880  GntR family transcriptional regulator  29.61 
 
 		 249 aa  95.5  7e-19  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000127927  normal  0.954426 
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1526  GntR family transcriptional regulator  26.75 
 
 		 235 aa  95.5  7e-19  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.059282  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0406  transcriptional regulator, GntR family  27.96 
 
 		 243 aa  95.1  9e-19  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2908  transcriptional regulator, GntR family  29.52 
 
 		 254 aa  94.4  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.270645  normal  1 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2757  transcriptional regulator, GntR family  27.39 
 
 		 245 aa  94.7  1e-18  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2963  GntR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 241 aa  94.4  1e-18  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_2648  transcriptional regulator, GntR family  29.96 
 
 		 254 aa  94.4  1e-18  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2646  GntR family transcriptional regulator  26.34 
 
 		 241 aa  94.7  1e-18  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1664  GntR family transcriptional regulator  36.1 
 
 		 240 aa  94.7  1e-18  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  decreased coverage  0.00697714  normal  0.132461 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2288  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  31.86 
 
 		 263 aa  94.7  1e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.718754  normal  0.252794 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2215  transcriptional regulator, GntR family  28.29 
 
 		 247 aa  94.4  2e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4032  transcriptional regulator, GntR family  31.86 
 
 		 246 aa  93.2  3e-18  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.495604  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1299  GntR family transcriptional regulator  27.16 
 
 		 258 aa  93.6  3e-18  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0859375 
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6106  GntR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 256 aa  93.2  3e-18  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.744386  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1971  GntR family transcriptional regulator  27.73 
 
 		 256 aa  93.2  3e-18  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03225  predicted DNA-binding transcriptional regulator  25.32 
 
 		 243 aa  92.8  4e-18  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4392  GntR family transcriptional regulator  30.17 
 
 		 257 aa  92.8  4e-18  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.599846 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0338  transcriptional regulator, GntR family  25.32 
 
 		 243 aa  92.8  4e-18  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3844  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  25.32 
 
 		 243 aa  92.8  4e-18  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010678  Rpic_4094  transcriptional regulator, GntR family  31.68 
 
 		 261 aa  92.8  4e-18  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03177  hypothetical protein  25.32 
 
 		 243 aa  92.8  4e-18  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012857  Rpic12D_4206  transcriptional regulator, GntR family  31.68 
 
 		 261 aa  92.8  4e-18  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7203  transcriptional regulator, GntR family  32.44 
 
 		 253 aa  92.8  4e-18  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.277726  normal  1 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0338  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  25.32 
 
 		 243 aa  92.8  4e-18  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  1  normal  0.456013 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3570  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  25.32 
 
 		 243 aa  92.8  4e-18  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3752  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  25.32 
 
 		 243 aa  92.8  4e-18  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4687  DNA-binding transcriptional regulator FrlR  25.32 
 
 		 265 aa  92.8  4e-18  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5574  UbiC transcription regulator-associated domain-containing protein  31.05 
 
 		 255 aa  92.8  4e-18  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.701747  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>