More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9301_08631 on replicon NC_009091
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9301



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009091  P9301_08631  putative endonuclease  100 
 
 		 217 aa  448  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_08661  putative endonuclease  93.2 
 
 		 217 aa  404  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.659896  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0810  putative endonuclease  93.69 
 
 		 217 aa  405  1.0000000000000001e-112  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  0.0256487  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_07791  putative endonuclease  82.03 
 
 		 217 aa  380  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_08421  putative endonuclease  71.76 
 
 		 217 aa  325  4.0000000000000003e-88  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.884282  hitchhiker  0.00457853 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0210  putative endonuclease  71.3 
 
 		 217 aa  321  5e-87  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_09581  putative endonuclease  65.74 
 
 		 217 aa  298  3e-80  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.136749  hitchhiker  0.00149205 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_1009  endonuclease III/Nth  61.57 
 
 		 217 aa  295  5e-79  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.544458  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1489  endonuclease III  58.99 
 
 		 217 aa  293  2e-78  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.220134  normal  0.323214 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_17641  putative endonuclease  65.55 
 
 		 217 aa  291  7e-78  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.96532 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1930  endonuclease III  58.33 
 
 		 216 aa  284  9e-76  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.491388  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2604  endonuclease III  61.72 
 
 		 227 aa  279  2e-74  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.324373  normal  1 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_09263  endonuclease III/Nth  59.8 
 
 		 218 aa  258  5.0000000000000005e-68  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.208041  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_2438  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  60.29 
 
 		 218 aa  255  4e-67  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  decreased coverage  0.00334229  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02735  Endonuclease III/Nth  58.74 
 
 		 237 aa  252  3e-66  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2465  endonuclease III  55.02 
 
 		 220 aa  251  5.000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.341333 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0549  endonuclease III  56.37 
 
 		 212 aa  246  1e-64  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  0.0850765 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2158  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  55.98 
 
 		 209 aa  246  2e-64  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1412  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  52.24 
 
 		 231 aa  216  2e-55  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.869538 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3568  endonuclease III  46.46 
 
 		 214 aa  178  5.999999999999999e-44  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_4320  endonuclease III  46.04 
 
 		 212 aa  177  1e-43  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_1092  endonuclease III  46.04 
 
 		 212 aa  176  2e-43  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4149  endonuclease III  44.55 
 
 		 212 aa  176  3e-43  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1133  endonuclease III  47.12 
 
 		 335 aa  174  6e-43  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.875992  normal  0.620108 
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3238  endonuclease III  46.31 
 
 		 213 aa  174  6e-43  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.27706  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1121  endonuclease III  45.54 
 
 		 212 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3888  endonuclease III/Nth  43.56 
 
 		 212 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  0.324947 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1634  endonuclease III  44.55 
 
 		 212 aa  174  9.999999999999999e-43  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0932  endonuclease III  43.78 
 
 		 212 aa  173  1.9999999999999998e-42  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.577405  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2991  endonuclease III  45.69 
 
 		 233 aa  173  1.9999999999999998e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_1316  endonuclease III  44.72 
 
 		 252 aa  172  2.9999999999999996e-42  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_1398  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  45.05 
 
 		 212 aa  172  3.9999999999999995e-42  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  0.320797 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_18880  endonuclease III  44.55 
 
 		 212 aa  171  6.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.00491393  normal  0.0304533 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0346  endonuclease III  45.7 
 
 		 261 aa  170  2e-41  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.0360921  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_4513  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  44.55 
 
 		 212 aa  169  4e-41  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00739094 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3023  endonuclease III  49.12 
 
 		 214 aa  168  4e-41  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.296739  normal  0.295544 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0851  endonuclease III  42.86 
 
 		 219 aa  168  6e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.0611639  normal  0.050138 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_0995  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  42.86 
 
 		 219 aa  168  6e-41  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00575071  normal  0.104115 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0492  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase, endonuclease III  42.5 
 
 		 218 aa  168  6e-41  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  0.0222024 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1314  endonuclease III  43.56 
 
 		 230 aa  168  6e-41  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.0570319  normal  0.296572 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2899  endonuclease III  43.94 
 
 		 213 aa  166  2e-40  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.786495  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3486  endonuclease III  43.9 
 
 		 287 aa  166  2e-40  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.607527  normal  0.202788 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1735  endonuclease III  40 
 
 		 215 aa  166  2.9999999999999998e-40  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.61574  normal  0.277364 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2331  endonuclease III  43.65 
 
 		 211 aa  165  4e-40  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2745  endonuclease III  43.12 
 
 		 222 aa  165  4e-40  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  0.637576 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2319  endonuclease III  43.46 
 
 		 211 aa  165  5e-40  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2019  endonuclease III  43.46 
 
 		 211 aa  165  5e-40  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.734703  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE2534  endonuclease III  45.92 
 
 		 210 aa  165  5.9999999999999996e-40  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  0.0635036  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_4758  endonuclease III  43.27 
 
 		 248 aa  164  9e-40  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.0812049  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1155  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  43.32 
 
 		 210 aa  164  1.0000000000000001e-39  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2451  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  47.37 
 
 		 247 aa  164  1.0000000000000001e-39  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.452204  normal  0.144793 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1499  endonuclease III  41 
 
 		 219 aa  163  1.0000000000000001e-39  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0789  endonuclease III  42.13 
 
 		 212 aa  163  2.0000000000000002e-39  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.584526  n/a   
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0235  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  47.4 
 
 		 212 aa  162  2.0000000000000002e-39  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.784957  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_19210  endonuclease III/Nth  43.46 
 
 		 212 aa  163  2.0000000000000002e-39  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.24401  n/a   
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00782  endonuclease III  41.95 
 
 		 236 aa  162  2.0000000000000002e-39  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.0572206  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0510  endonuclease III  42.78 
 
 		 223 aa  163  2.0000000000000002e-39  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2633  endonuclease III  40.8 
 
 		 225 aa  163  2.0000000000000002e-39  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.232895  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3741  endonuclease III  43.43 
 
 		 260 aa  163  2.0000000000000002e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_5048  endonuclease III  42.51 
 
 		 236 aa  163  2.0000000000000002e-39  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.232344 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1169  endonuclease III/Nth  40.5 
 
 		 236 aa  162  4.0000000000000004e-39  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0970  endonuclease III  43.23 
 
 		 214 aa  162  4.0000000000000004e-39  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  0.99745  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1836  endonuclease III  42.93 
 
 		 213 aa  162  4.0000000000000004e-39  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.194851  normal  0.186741 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0724  endonuclease III  43.28 
 
 		 213 aa  162  5.0000000000000005e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.155914  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A0153  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  45.21 
 
 		 237 aa  161  7e-39  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0381  endonuclease III  44.26 
 
 		 258 aa  161  8.000000000000001e-39  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01603  DNA glycosylase and apyrimidinic (AP) lyase (endonuclease III)  42.41 
 
 		 211 aa  161  9e-39  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.00133572  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2008  endonuclease III  42.41 
 
 		 211 aa  161  9e-39  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.00632932  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1996  endonuclease III  42.41 
 
 		 211 aa  161  9e-39  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0209025  normal  0.0823674 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1842  endonuclease III  42.41 
 
 		 211 aa  161  9e-39  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.0000000960215  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1822  endonuclease III  42.41 
 
 		 211 aa  161  9e-39  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.692656  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1709  endonuclease III  42.41 
 
 		 211 aa  161  9e-39  Escherichia coli HS  Bacteria  decreased coverage  0.00510464  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3441  endonuclease III  42.36 
 
 		 260 aa  160  9e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1566  endonuclease III  42.41 
 
 		 211 aa  161  9e-39  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.263059  normal  1 
 
 
-
 
NC_012892  B21_01593  hypothetical protein  42.41 
 
 		 211 aa  161  9e-39  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.0014654  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0463  endonuclease III  41.41 
 
 		 226 aa  160  1e-38  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.0687351  normal  1 
 
 
-
 
NC_006348  BMA1931  endonuclease III  42.19 
 
 		 214 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.514789  n/a   
 
 
-
 
NC_008836  BMA10229_A0843  endonuclease III  42.19 
 
 		 214 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.667209  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_1183  endonuclease III  42.19 
 
 		 214 aa  160  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.123601  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0532  endonuclease III  42.41 
 
 		 213 aa  160  1e-38  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000213835  n/a   
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_1336  endonuclease III  42.19 
 
 		 214 aa  160  1e-38  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.70217  n/a   
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2297  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  41.71 
 
 		 212 aa  160  1e-38  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3842  endonuclease III  43.63 
 
 		 254 aa  160  1e-38  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.561189  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1030  endonuclease III  45.03 
 
 		 210 aa  160  1e-38  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000273588  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1539  endonuclease III  42.64 
 
 		 211 aa  160  1e-38  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_1175  endonuclease III  42.19 
 
 		 214 aa  160  1e-38  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008785  BMASAVP1_A1022  endonuclease III  42.19 
 
 		 214 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  0.99743  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02970  endonuclease III  41.23 
 
 		 217 aa  160  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0339  endonuclease III  44.09 
 
 		 256 aa  160  1e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0201  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  44.62 
 
 		 274 aa  160  1e-38  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009080  BMA10247_0305  endonuclease III  42.19 
 
 		 214 aa  160  1e-38  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.77155  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002943  endonuclease III  43.46 
 
 		 213 aa  160  1e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00243051  n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1065  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  43.46 
 
 		 211 aa  160  1e-38  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0698164  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_0809  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase / endonuclease III  43.82 
 
 		 211 aa  160  1e-38  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.631495 
 
 
-
 
NC_004310  BR0166  endonuclease III  45.08 
 
 		 248 aa  159  2e-38  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0203  endonuclease III / DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  42.93 
 
 		 218 aa  160  2e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.419558  normal  1 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A1889  endonuclease III  42.41 
 
 		 211 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1046  DNA-(apurinic or apyrimidinic site) lyase  42.02 
 
 		 214 aa  160  2e-38  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A1563  endonuclease III  42.41 
 
 		 211 aa  160  2e-38  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0700228  normal  0.157438 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0586  endonuclease III  43.56 
 
 		 270 aa  159  2e-38  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.130432  normal  0.224481 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>