More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene P9211_02471 on replicon NC_009976
Organism: Prochlorococcus marinus str. MIT 9211



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009976  P9211_02471  chorismate synthase  100 
 
 		 363 aa  741    Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23791  chorismate synthase  79.56 
 
 		 362 aa  585  1e-166  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0240204 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2040  chorismate synthase  78.85 
 
 		 364 aa  573  1.0000000000000001e-162  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0304  chorismate synthase  78.3 
 
 		 366 aa  573  1.0000000000000001e-162  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.21806  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02461  chorismate synthase  72.93 
 
 		 365 aa  562  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02451  chorismate synthase  72.93 
 
 		 365 aa  561  1.0000000000000001e-159  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.642724  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1593  chorismate synthase  75.77 
 
 		 361 aa  558  1e-158  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.040702  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0226  chorismate synthase  72.25 
 
 		 365 aa  560  1e-158  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03041  chorismate synthase  76.32 
 
 		 361 aa  560  1e-158  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.418255  normal  1 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02561  chorismate synthase  71.7 
 
 		 364 aa  554  1e-157  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.46541  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0212  chorismate synthase  70.17 
 
 		 362 aa  515  1.0000000000000001e-145  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.468689 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1664  chorismate synthase  67.96 
 
 		 362 aa  503  1e-141  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1637  chorismate synthase  67.96 
 
 		 362 aa  503  1e-141  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0589  chorismate synthase  69.36 
 
 		 362 aa  503  1e-141  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0835  chorismate synthase  69.36 
 
 		 362 aa  489  1e-137  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1361  chorismate synthase  65.93 
 
 		 362 aa  486  1e-136  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.565895  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2355  chorismate synthase  66.3 
 
 		 362 aa  483  1e-135  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2866  chorismate synthase  67.41 
 
 		 370 aa  483  1e-135  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29930  predicted protein  63.26 
 
 		 458 aa  463  1e-129  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43429  chorismate synthase  62.74 
 
 		 442 aa  453  1.0000000000000001e-126  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0435185  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4112  chorismate synthase  59.62 
 
 		 363 aa  449  1e-125  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356503  normal  0.0141233 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1623  chorismate synthase  60.33 
 
 		 363 aa  443  1e-123  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0369  chorismate synthase  54.49 
 
 		 360 aa  408  1e-113  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1897  chorismate synthase  58.29 
 
 		 361 aa  405  1.0000000000000001e-112  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4064  chorismate synthase  55.06 
 
 		 359 aa  397  1e-109  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000000659407  hitchhiker  0.000000405427 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3438  chorismate synthase  56.3 
 
 		 360 aa  397  1e-109  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000199375 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5072  chorismate synthase  55.65 
 
 		 359 aa  395  1e-109  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0823  chorismate synthase  55.74 
 
 		 360 aa  394  1e-108  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1510  chorismate synthase  56.63 
 
 		 362 aa  384  1e-105  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2149  chorismate synthase  51.99 
 
 		 355 aa  377  1e-103  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0529344  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1952  chorismate synthase  52.68 
 
 		 358 aa  372  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009047  PICST_90939  Chorismate synthase  55.31 
 
 		 377 aa  374  1e-102  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.352684 
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11018  chorismate synthase  51.83 
 
 		 354 aa  374  1e-102  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.659111  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4576  chorismate synthase  51.7 
 
 		 352 aa  374  1e-102  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.348099  n/a   
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05731  chorismate synthase (Eurofung)  52.85 
 
 		 410 aa  370  1e-101  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.430078  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3830  chorismate synthase  51.83 
 
 		 358 aa  370  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.929225 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3801  chorismate synthase  52.39 
 
 		 364 aa  370  1e-101  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209902  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02650  chorismate synthase, putative  51.2 
 
 		 421 aa  362  6e-99  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1438  chorismate synthase  51.69 
 
 		 365 aa  344  1e-93  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1702  chorismate synthase  49.07 
 
 		 384 aa  344  1e-93  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0161  chorismate synthase  49.86 
 
 		 373 aa  343  2e-93  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.900075  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4081  chorismate synthase  50.14 
 
 		 356 aa  339  5e-92  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03114  chorismate synthase  48.18 
 
 		 384 aa  333  4e-90  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002863  chorismate synthase  47.9 
 
 		 361 aa  331  1e-89  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02755  chorismate synthase  46.78 
 
 		 365 aa  329  6e-89  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0341392  n/a   
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1972  chorismate synthase  46.78 
 
 		 363 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1640  chorismate synthase  46.78 
 
 		 363 aa  328  1.0000000000000001e-88  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503125 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1012  chorismate synthase  48.59 
 
 		 366 aa  327  1.0000000000000001e-88  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4138  chorismate synthase  47.11 
 
 		 370 aa  325  8.000000000000001e-88  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0341634 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2168  chorismate synthase  46.5 
 
 		 361 aa  325  1e-87  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3150  chorismate synthase  46.56 
 
 		 373 aa  322  4e-87  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1947  chorismate synthase  49.44 
 
 		 354 aa  322  7e-87  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1226  chorismate synthase  46.54 
 
 		 366 aa  322  8e-87  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0161922 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2470  chorismate synthase  47.27 
 
 		 361 aa  321  1.9999999999999998e-86  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0547  chorismate synthase  48.02 
 
 		 365 aa  320  1.9999999999999998e-86  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1568  chorismate synthase  45.4 
 
 		 364 aa  320  1.9999999999999998e-86  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1814  chorismate synthase  47.9 
 
 		 367 aa  320  3e-86  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0770  chorismate synthase  46.17 
 
 		 366 aa  319  3.9999999999999996e-86  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.742046  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2623  chorismate synthase  47.22 
 
 		 366 aa  319  5e-86  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2159  chorismate synthase  46.22 
 
 		 365 aa  318  7e-86  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1525  chorismate synthase  44.85 
 
 		 385 aa  317  1e-85  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0632175 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1541  chorismate synthase  45.1 
 
 		 366 aa  318  1e-85  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1740  chorismate synthase  45.66 
 
 		 368 aa  317  2e-85  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.544591 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1212  chorismate synthase  45.88 
 
 		 361 aa  317  2e-85  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.535517 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1789  chorismate synthase  45.13 
 
 		 366 aa  317  3e-85  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.681987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2091  chorismate synthase  43.92 
 
 		 371 aa  317  3e-85  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1018  chorismate synthase  44.82 
 
 		 362 aa  316  4e-85  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2797  chorismate synthase  45.71 
 
 		 368 aa  316  5e-85  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2466  chorismate synthase  45.1 
 
 		 361 aa  315  7e-85  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.358807  n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2251  chorismate synthase  45.81 
 
 		 352 aa  314  9.999999999999999e-85  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006369  lpl2222  chorismate synthase  45.53 
 
 		 352 aa  314  9.999999999999999e-85  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008309  HS_1205  chorismate synthase  48.07 
 
 		 360 aa  314  9.999999999999999e-85  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.0521105  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_1394  chorismate synthase  45.6 
 
 		 362 aa  313  2.9999999999999996e-84  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.187693  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1699  chorismate synthase  49.3 
 
 		 361 aa  312  4.999999999999999e-84  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0041  chorismate synthase  50.57 
 
 		 351 aa  312  4.999999999999999e-84  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  hitchhiker  0.0022126  normal  0.467855 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3132  chorismate synthase  46.54 
 
 		 357 aa  312  6.999999999999999e-84  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0111802  normal  0.087423 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1360  chorismate synthase  43.73 
 
 		 366 aa  312  6.999999999999999e-84  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767963  normal  0.499065 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2090  chorismate synthase  47.47 
 
 		 354 aa  312  6.999999999999999e-84  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0281395  normal  0.0647066 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2938  chorismate synthase  45.38 
 
 		 369 aa  311  7.999999999999999e-84  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1381  chorismate synthase  44.57 
 
 		 366 aa  311  7.999999999999999e-84  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.674702 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0858  chorismate synthase  44.57 
 
 		 366 aa  311  9e-84  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  5.52804e-17  unclonable  0.0000000936669 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1538  chorismate synthase  44.85 
 
 		 366 aa  311  9e-84  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2244  chorismate synthase  45.1 
 
 		 365 aa  311  9e-84  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1142  chorismate synthase  44.78 
 
 		 362 aa  311  1e-83  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.579597  normal  0.271094 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2667  chorismate synthase  45.1 
 
 		 364 aa  311  1e-83  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1341  chorismate synthase  44.57 
 
 		 366 aa  311  1e-83  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2767  chorismate synthase  43.45 
 
 		 366 aa  311  1e-83  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3093  chorismate synthase  49.4 
 
 		 367 aa  310  2e-83  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.000000101466  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0397  chorismate synthase  43.96 
 
 		 364 aa  311  2e-83  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.209987  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1537  chorismate synthase  44.82 
 
 		 364 aa  310  2e-83  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0659  chorismate synthase  47.22 
 
 		 358 aa  310  2e-83  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.463158  normal  0.312815 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0978  chorismate synthase  44.01 
 
 		 366 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1460  chorismate synthase  44.01 
 
 		 366 aa  310  2e-83  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1607  chorismate synthase  45.1 
 
 		 364 aa  310  2.9999999999999997e-83  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.131097  normal  0.360545 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2846  chorismate synthase  45.1 
 
 		 364 aa  309  4e-83  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000803726 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2769  chorismate synthase  45.1 
 
 		 364 aa  309  4e-83  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.116753  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4605  chorismate synthase  44.01 
 
 		 366 aa  309  4e-83  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0590951  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2752  chorismate synthase  45.1 
 
 		 364 aa  309  4e-83  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.200726  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2451  chorismate synthase  45.1 
 
 		 364 aa  309  4e-83  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1241  chorismate synthase  43.84 
 
 		 366 aa  309  5e-83  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>