125 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_4195 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_4195  hydrolase  100 
 
 
234 aa  467  1.0000000000000001e-131  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.953926  normal 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0497  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  38.05 
 
 
230 aa  146  3e-34  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0503  hydrolase  36.28 
 
 
230 aa  133  3e-30  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2672  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  39.45 
 
 
232 aa  132  3.9999999999999996e-30  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.188866 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1353  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  38.94 
 
 
233 aa  132  6.999999999999999e-30  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2687  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  40.26 
 
 
228 aa  131  9e-30  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal  0.113023 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0418  HAD superfamily hydrolase  36.61 
 
 
230 aa  130  2.0000000000000002e-29  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0873  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  39.07 
 
 
227 aa  126  3e-28  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0460  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  34.93 
 
 
230 aa  125  4.0000000000000003e-28  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_0707  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  40.53 
 
 
231 aa  123  2e-27  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.61417  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1987  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  34.51 
 
 
230 aa  123  3e-27  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_0706  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  40.09 
 
 
231 aa  122  4e-27  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.524016  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0717  hydrolase  40.62 
 
 
234 aa  121  9.999999999999999e-27  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.032007  hitchhiker  0.00793283 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3192  hydrolase  37.72 
 
 
272 aa  120  1.9999999999999998e-26  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.063397  hitchhiker  0.00469081 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_0672  haloacid dehalogenase-like hydrolase  39.09 
 
 
231 aa  117  9.999999999999999e-26  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0506  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  33.18 
 
 
233 aa  118  9.999999999999999e-26  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  0.374858  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5846  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  40.52 
 
 
229 aa  114  2.0000000000000002e-24  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.0126424  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_3983  hydrolase  38.5 
 
 
230 aa  110  2.0000000000000002e-23  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  0.583874  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1678  HAD superfamily hydrolase  32.89 
 
 
233 aa  107  2e-22  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3764  hydrolase  37.83 
 
 
232 aa  103  2e-21  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0254156  unclonable  0.0000121762 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7316  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  35.87 
 
 
229 aa  101  1e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.000529142  hitchhiker  0.000000108756 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1120  hydrolase  39.57 
 
 
231 aa  100  2e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.546359  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5572  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  36.04 
 
 
238 aa  98.2  8e-20  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  hitchhiker  0.00524465  normal  0.993212 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2888  haloacid dehalogenase-like hydrolase  34.35 
 
 
239 aa  96.7  3e-19  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.061028  normal  0.661007 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1000  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  36.65 
 
 
246 aa  96.3  4e-19  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30410  predicted phosphatase  40.09 
 
 
237 aa  96.3  4e-19  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.990761  normal  0.161888 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8751  hypothetical protein  35.59 
 
 
229 aa  90.5  2e-17  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0948  haloacid dehalogenase-like hydrolase  34.5 
 
 
233 aa  88.2  1e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000642365  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1510  phosphoglycolate phosphatase  34.5 
 
 
249 aa  87.4  2e-16  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.117992  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4015  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  32.65 
 
 
249 aa  87.4  2e-16  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0787  haloacid dehalogenase domain-containing protein hydrolase  29.74 
 
 
246 aa  87  2e-16  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0431  hydrolase  30.69 
 
 
284 aa  81.3  0.00000000000001  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_2521  HAD family hydrolase  32.88 
 
 
233 aa  80.1  0.00000000000002  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal  0.343798 
 
 
-
 
NC_009361  OSTLU_16273  predicted protein  33.19 
 
 
250 aa  79.3  0.00000000000005  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  normal  0.948108 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_0854  HAD family hydrolase  32.26 
 
 
221 aa  73.9  0.000000000002  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.249022  decreased coverage  0.000200034 
 
 
-
 
BN001303  ANIA_04620  conserved hypothetical protein  26.64 
 
 
487 aa  70.1  0.00000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.311368 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1313  HAD family hydrolase  29.52 
 
 
232 aa  65.5  0.0000000008  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.95229 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_8965  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  28.7 
 
 
224 aa  64.7  0.000000001  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0545563  normal  0.651642 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0625  HAD family hydrolase  29.41 
 
 
221 aa  63.5  0.000000003  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1439  putative phosphoglycolate phosphatase  26.16 
 
 
238 aa  63.5  0.000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.608138  normal  0.0945263 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0292  HAD family hydrolase  30.1 
 
 
222 aa  62.4  0.000000006  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.402537  normal  0.982934 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0590  HAD family hydrolase  31.34 
 
 
219 aa  61.6  0.000000009  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0419315 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4762  HAD family hydrolase  27.67 
 
 
242 aa  61.2  0.00000001  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.698376  hitchhiker  0.00269567 
 
 
-
 
NC_004310  BR1002  HAD superfamily hydrolase  25.11 
 
 
221 aa  59.7  0.00000003  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0968  HAD superfamily hydrolase  25.11 
 
 
221 aa  59.7  0.00000003  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_1437  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.57 
 
 
213 aa  60.1  0.00000003  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000111508  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2768  HAD family hydrolase  31.3 
 
 
237 aa  59.3  0.00000005  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.654297  normal  0.45248 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_2262  hydrolase  28.1 
 
 
223 aa  58.9  0.00000007  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0484  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  27.49 
 
 
218 aa  57  0.0000002  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0323  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.96 
 
 
233 aa  57.4  0.0000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal  0.0341719 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1144  HAD family hydrolase  27.65 
 
 
213 aa  56.6  0.0000004  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0280  HAD family hydrolase  29.96 
 
 
233 aa  56.2  0.0000005  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1780  HAD family hydrolase  30.47 
 
 
225 aa  55.8  0.0000006  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.587654  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2482  phosphatase  26.48 
 
 
245 aa  54.3  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0384  HAD family hydrolase  27.78 
 
 
222 aa  53.9  0.000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000045535  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0356  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.63 
 
 
233 aa  54.3  0.000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1874  HAD family hydrolase  33.33 
 
 
216 aa  53.1  0.000003  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.785736  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2060  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  29.91 
 
 
225 aa  53.1  0.000003  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.750609  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2152  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  30.21 
 
 
225 aa  53.5  0.000003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6369  HAD family hydrolase  30.53 
 
 
219 aa  53.1  0.000004  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.23133  normal  0.167912 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_2240  HAD family hydrolase  27.69 
 
 
214 aa  52.4  0.000006  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.279618  normal  0.937061 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3726  Haloacid dehalogenase domain protein hydrolase  27.07 
 
 
255 aa  52.4  0.000006  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.151121  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0791  HAD family hydrolase  28.5 
 
 
220 aa  52  0.000007  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.226537  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0868  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  24.89 
 
 
227 aa  52.4  0.000007  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  hitchhiker  0.00000353752  normal  0.072442 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1883  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.57 
 
 
217 aa  52  0.000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  decreased coverage  0.00501827  normal  0.0218555 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_7122  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.77 
 
 
219 aa  51.2  0.00001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0072  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 3  27.73 
 
 
230 aa  50.4  0.00002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0316  phosphoglycolate phosphatase  27.88 
 
 
226 aa  50.8  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  normal  0.547041 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1760  HAD family hydrolase  28.29 
 
 
260 aa  50.1  0.00003  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.960773  normal  0.487326 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1410  phosphoglycolate phosphatase  26.96 
 
 
225 aa  49.7  0.00004  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1778  HAD family hydrolase  28.71 
 
 
222 aa  49.3  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0979226  decreased coverage  0.0000822361 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1018  HAD family hydrolase  26.07 
 
 
221 aa  48.9  0.00007  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal  0.76802 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4954  pyrophosphatase PpaX  23.87 
 
 
215 aa  48.5  0.00008  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2641  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.51 
 
 
222 aa  48.5  0.00009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2658  haloacid dehalogenase-like hydrolase  27.15 
 
 
236 aa  48.5  0.0001  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3288  HAD family hydrolase  28.51 
 
 
222 aa  48.5  0.0001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2984  pyrophosphatase PpaX  24.2 
 
 
215 aa  48.1  0.0001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.417941  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2085  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  28.84 
 
 
217 aa  48.1  0.0001  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.0330594  normal  0.304125 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0268  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  26.06 
 
 
192 aa  47.8  0.0002  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  0.423006  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5916  HAD family hydrolase  26.57 
 
 
218 aa  47  0.0002  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0345843  normal  0.0351614 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2085  HAD family hydrolase  25 
 
 
223 aa  47.8  0.0002  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3671  haloacid dehalogenase-like hydrolase  26.37 
 
 
231 aa  47  0.0003  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3168  pyrophosphatase PpaX  25.11 
 
 
222 aa  47  0.0003  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2434  HAD-superfamily hydrolase, subfamily IA, variant 1  29.41 
 
 
218 aa  47  0.0003  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.282448  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4292  HAD family hydrolase  36.03 
 
 
196 aa  46.2  0.0004  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0734  HAD family hydrolase  26.83 
 
 
241 aa  46.2  0.0004  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.879574  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2411  hydrolase  29.51 
 
 
238 aa  46.2  0.0004  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.683271 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_32916  predicted protein  32.08 
 
 
252 aa  46.6  0.0004  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_25590  putative hydrolase  31.58 
 
 
230 aa  45.4  0.0008  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.080664  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_14830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  27.19 
 
 
219 aa  44.7  0.001  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  normal  0.187107 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0033  HAD family hydrolase  26.39 
 
 
228 aa  45.1  0.001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.144848  normal 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_1492  HAD family hydrolase  26.67 
 
 
217 aa  45.1  0.001  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.210059  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5280  pyrophosphatase PpaX  24 
 
 
216 aa  44.3  0.001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_4659  HAD-superfamily hydrolase  35.29 
 
 
184 aa  44.3  0.002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0680  HAD family hydrolase  25 
 
 
227 aa  44.3  0.002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal  0.0123656 
 
 
-
 
NC_002939  GSU0694  HAD family hydrolase  29.87 
 
 
214 aa  43.5  0.003  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3839  HAD-superfamily hydrolase  27.01 
 
 
220 aa  43.5  0.003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0865807  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3084  HAD family hydrolase  27.4 
 
 
219 aa  43.5  0.003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_3998  phosphoglycolate phosphatase  26.75 
 
 
226 aa  43.1  0.003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.739792  normal  0.543367 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_10830  haloacid dehalogenase superfamily enzyme, subfamily IA  25.47 
 
 
296 aa  43.5  0.003  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>