More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_3694 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_3694  transport system permease protein  100 
 
 
325 aa  606  9.999999999999999e-173  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.326225  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_3203  transport system permease protein  38.6 
 
 
350 aa  227  2e-58  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0463  hemin permease  41.39 
 
 
351 aa  214  1.9999999999999998e-54  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1895  transport system permease protein  34.58 
 
 
336 aa  206  3e-52  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00113354  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1214  transport system permease protein  40.62 
 
 
342 aa  204  1e-51  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1377  hypothetical protein  37.72 
 
 
315 aa  203  4e-51  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.0000118421  hitchhiker  0.00624005 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2385  FecCD-family membrane transport protein  44.91 
 
 
367 aa  202  6e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.567541  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0986  transport system permease protein  40.91 
 
 
315 aa  202  6e-51  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.991097  normal  0.212421 
 
 
-
 
NC_008709  Ping_3342  iron(III) dicitrate transport system permease protein FecD  44.8 
 
 
345 aa  202  7e-51  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4371  transport system permease protein  43.17 
 
 
358 aa  200  3e-50  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_3566  transport system permease protein  43.17 
 
 
354 aa  197  1.0000000000000001e-49  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_00180  transport system permease protein  35.8 
 
 
337 aa  194  1e-48  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000507964  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3306  transport system permease protein  40.54 
 
 
354 aa  193  3e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.205104  hitchhiker  0.000395648 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0603  transport system permease protein  40.94 
 
 
316 aa  192  7e-48  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.39796  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5521  transport system permease protein  44.26 
 
 
341 aa  192  9e-48  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal  0.136897 
 
 
-
 
NC_011313  VSAL_II1075  putative iron transporter, membrane component  41.61 
 
 
347 aa  191  1e-47  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.803098  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0259  transport system permease protein  38.22 
 
 
321 aa  190  2.9999999999999997e-47  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.950369  normal  0.398114 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1420  transport system permease protein  39.16 
 
 
361 aa  188  1e-46  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1316  transport system permease protein  41.05 
 
 
338 aa  187  2e-46  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0583  transport system permease protein  34.85 
 
 
331 aa  186  7e-46  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  0.777741  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2017  transport system permease protein  39.22 
 
 
369 aa  184  2.0000000000000003e-45  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0557  transport system permease protein  37.98 
 
 
355 aa  183  3e-45  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2100  transport system permease protein  39.37 
 
 
334 aa  183  4.0000000000000006e-45  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1738  transport system permease protein  37.34 
 
 
330 aa  181  1e-44  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.922017  normal  0.205881 
 
 
-
 
NC_007410  Ava_B0152  transport system permease protein  41.73 
 
 
351 aa  181  1e-44  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2065  transport system permease protein  44.14 
 
 
332 aa  182  1e-44  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE1179  iron compound ABC transporter, permease protein  37.17 
 
 
325 aa  181  2e-44  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  hitchhiker  0.00674105  n/a   
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0456  hemin ABC transporter, permease protein  40.14 
 
 
366 aa  180  2e-44  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  0.288239  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1943  transport system permease protein  40.64 
 
 
338 aa  180  2.9999999999999997e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_4384  transport system permease protein  48.79 
 
 
331 aa  180  2.9999999999999997e-44  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.122979 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2493  corrinoid ABC transporter permease  42.47 
 
 
373 aa  179  7e-44  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_0076  transport system permease protein  40.48 
 
 
452 aa  178  1e-43  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0297  transport system permease protein  34.7 
 
 
330 aa  177  1e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.256229  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1933  transport system permease protein  34.39 
 
 
330 aa  177  2e-43  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4241  transport system permease protein  42.12 
 
 
381 aa  177  3e-43  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal  0.2131 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4501  iron compound ABC transporter, permease protein  36.59 
 
 
342 aa  177  3e-43  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4112  iron compound ABC transporter, permease  36.59 
 
 
345 aa  176  4e-43  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1173  iron ABC transporter, permease protein  35.07 
 
 
356 aa  176  4e-43  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1942  transport system permease protein  39.93 
 
 
347 aa  176  4e-43  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.543931  normal  0.0358565 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4487  iron compound ABC transporter, permease protein  36.09 
 
 
342 aa  176  7e-43  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3606  transport system permease protein  42.45 
 
 
367 aa  175  8e-43  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.438147  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0256  transport system permease protein  34.97 
 
 
329 aa  175  9.999999999999999e-43  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000493486  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2792  corrinoid ABC transporter permease  44.33 
 
 
362 aa  175  9.999999999999999e-43  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.525724  normal 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4152  transport system permease protein  43.08 
 
 
349 aa  175  9.999999999999999e-43  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.0212216  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1594  transport system permease protein  37.23 
 
 
344 aa  174  9.999999999999999e-43  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.511685  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1392  transport system permease protein  41.64 
 
 
340 aa  174  1.9999999999999998e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.748601  normal  0.0461748 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2123  transport system permease protein  40.07 
 
 
366 aa  174  1.9999999999999998e-42  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.24416  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0749  iron compound ABC transporter, permease protein  37.22 
 
 
342 aa  174  1.9999999999999998e-42  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_0408  transport system permease protein  36.5 
 
 
348 aa  174  1.9999999999999998e-42  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.586002  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0415  transport system permease protein  37.72 
 
 
357 aa  174  1.9999999999999998e-42  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.920967 
 
 
-
 
NC_009456  VC0395_0323  putative hemin ABC transporter, permease protein  39.63 
 
 
343 aa  174  1.9999999999999998e-42  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00139931  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0561  transport system permease protein  35.94 
 
 
346 aa  174  1.9999999999999998e-42  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2874  transport system permease protein  37.93 
 
 
360 aa  173  2.9999999999999996e-42  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3271  transport system permease protein  39.37 
 
 
370 aa  173  2.9999999999999996e-42  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  decreased coverage  0.00536194 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0881  corrinoid ABC transporter permease  40.27 
 
 
380 aa  173  3.9999999999999995e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_589  ABC-type cobalamin/Fe3+ siderophore transport system, permease component  40.57 
 
 
363 aa  173  3.9999999999999995e-42  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0262833  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1761  hemin transport system permease protein HmuU  35.24 
 
 
326 aa  173  3.9999999999999995e-42  Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4449  iron compound ABC transporter, permease protein  36.39 
 
 
342 aa  173  5e-42  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4264  iron compound ABC transporter permease  36.59 
 
 
345 aa  172  5e-42  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4101  iron compound ABC transporter, permease  36.59 
 
 
345 aa  172  5e-42  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_1731  vtamin B12-transporter permease  38.52 
 
 
351 aa  172  5e-42  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.334132 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1491  transport system permease protein  36.81 
 
 
348 aa  172  5.999999999999999e-42  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  0.105364  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0621  transport system permease protein  40.57 
 
 
363 aa  172  5.999999999999999e-42  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  0.050627  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3843  transport system permease protein  43.2 
 
 
349 aa  172  5.999999999999999e-42  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.19753  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4215  transport system permease protein  36.48 
 
 
342 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0551  transport system permease protein  37.9 
 
 
332 aa  172  6.999999999999999e-42  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4596  iron compound ABC transporter permease protein  36.59 
 
 
342 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2512  transport system permease protein  41.89 
 
 
326 aa  172  6.999999999999999e-42  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4448  iron compound ABC transporter, permease protein  36.59 
 
 
342 aa  172  6.999999999999999e-42  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0125  transport system permease protein  40.6 
 
 
356 aa  172  7.999999999999999e-42  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0132273  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09840  ABC-type Fe3+-siderophore transport system, permease component  44.77 
 
 
390 aa  172  9e-42  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.125008  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_2600  transport system permease protein  36.86 
 
 
346 aa  171  1e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.630419  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4897  transport system permease protein  42.11 
 
 
345 aa  171  1e-41  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0357516  normal  0.012026 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2340  transport system permease protein  39.51 
 
 
371 aa  171  1e-41  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0647  hemin transport system permease HmuU  40.29 
 
 
334 aa  171  2e-41  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  normal  0.466649 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2061  transport system permease protein  36.62 
 
 
337 aa  170  2e-41  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0286946  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3892  transport system permease protein  40.29 
 
 
334 aa  171  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3804  hemin ABC transporter, permease protein HmuU  40.29 
 
 
334 aa  171  2e-41  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0372  transport system permease protein  42.39 
 
 
346 aa  171  2e-41  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  0.314263  normal  0.28598 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0671  cell wall anchor domain-containing protein  31.43 
 
 
334 aa  170  3e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0686  cell wall anchor domain-containing protein  31.43 
 
 
334 aa  170  3e-41  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5101  transport system permease protein  38.41 
 
 
346 aa  169  4e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  decreased coverage  0.00326561  normal  0.03131 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5389  transport system permease protein  38.8 
 
 
346 aa  169  5e-41  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.0238432  normal  0.284357 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2080  transport system permease protein  37.81 
 
 
368 aa  169  5e-41  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3915  transport system permease protein  39.43 
 
 
332 aa  169  6e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.383173  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_4300  transport system permease protein  44.6 
 
 
349 aa  169  6e-41  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A2261  iron(III) ABC transporter, permease protein  35.45 
 
 
343 aa  169  7e-41  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.618819 
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0650  hemin transport system permease protein HmuU  33.64 
 
 
327 aa  169  9e-41  Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  0.150325  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0732  transport system permease protein  42.07 
 
 
341 aa  168  1e-40  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.807924 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0966  transport system permease protein  38.68 
 
 
369 aa  167  2e-40  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1831  transport system permease protein  43.1 
 
 
376 aa  167  2e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0429  transport system permease protein  37.54 
 
 
348 aa  167  2e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1266  transport system permease protein  38.85 
 
 
344 aa  167  2e-40  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.594883  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1473  transport system permease protein  34.04 
 
 
359 aa  167  2.9999999999999998e-40  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.766975  normal  0.204191 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3536  transport system permease protein  37.97 
 
 
368 aa  166  2.9999999999999998e-40  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.764032  normal  0.443076 
 
 
-
 
NC_002936  DET0651  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  40.21 
 
 
334 aa  166  4e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0685  ABC-type cobalamin/Fe3+-siderophores transport systems, permease component  40.21 
 
 
334 aa  166  4e-40  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3257  iron ABC transporter, permease protein, putative  36.14 
 
 
336 aa  166  5e-40  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.0747445  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3095  transport system permease protein  35.83 
 
 
340 aa  166  5e-40  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.838837  normal  0.544286 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1070  transport system permease protein  38.36 
 
 
342 aa  166  6.9999999999999995e-40  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>