More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_1623 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010571  Oter_1623  chorismate synthase  100 
 
 		 363 aa  740    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_02461  chorismate synthase  60 
 
 		 365 aa  457  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_0226  chorismate synthase  59.34 
 
 		 365 aa  459  9.999999999999999e-129  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1361  chorismate synthase  64.25 
 
 		 362 aa  456  1e-127  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.565895  normal  1 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_02451  chorismate synthase  59.72 
 
 		 365 aa  454  1e-127  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.642724  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4112  chorismate synthase  63.19 
 
 		 363 aa  451  1.0000000000000001e-126  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.356503  normal  0.0141233 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_1637  chorismate synthase  61.88 
 
 		 362 aa  450  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_02561  chorismate synthase  58.24 
 
 		 364 aa  449  1e-125  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  0.46541  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0589  chorismate synthase  62.4 
 
 		 362 aa  449  1e-125  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_1664  chorismate synthase  61.88 
 
 		 362 aa  450  1e-125  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_2355  chorismate synthase  63.16 
 
 		 362 aa  450  1e-125  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23791  chorismate synthase  62.15 
 
 		 362 aa  445  1.0000000000000001e-124  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  0.0240204 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_2040  chorismate synthase  64.01 
 
 		 364 aa  447  1.0000000000000001e-124  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_0304  chorismate synthase  63.93 
 
 		 366 aa  446  1.0000000000000001e-124  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.21806  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_0212  chorismate synthase  63.81 
 
 		 362 aa  447  1.0000000000000001e-124  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.468689 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2866  chorismate synthase  62.26 
 
 		 370 aa  447  1.0000000000000001e-124  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.122087 
 
 
-
 
NC_009976  P9211_02471  chorismate synthase  60.33 
 
 		 363 aa  443  1e-123  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1593  chorismate synthase  60.45 
 
 		 361 aa  437  1e-121  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.040702  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_03041  chorismate synthase  61 
 
 		 361 aa  437  1e-121  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  0.418255  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0835  chorismate synthase  61.28 
 
 		 362 aa  434  1e-120  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0369  chorismate synthase  57.14 
 
 		 360 aa  430  1e-119  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011670  PHATRDRAFT_43429  chorismate synthase  60.71 
 
 		 442 aa  427  1e-118  Phaeodactylum tricornutum CCAP 1055/1  Eukaryota  normal  0.0435185  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_2149  chorismate synthase  58 
 
 		 355 aa  419  1e-116  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.0529344  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0823  chorismate synthase  59.27 
 
 		 360 aa  415  9.999999999999999e-116  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1438  chorismate synthase  57.22 
 
 		 365 aa  416  9.999999999999999e-116  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3438  chorismate synthase  59.05 
 
 		 360 aa  412  1e-114  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000199375 
 
 
-
 
NC_009356  OSTLU_29930  predicted protein  60.28 
 
 		 458 aa  412  1e-114  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1897  chorismate synthase  58.1 
 
 		 361 aa  412  1e-114  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5072  chorismate synthase  55.08 
 
 		 359 aa  410  1e-113  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_1510  chorismate synthase  57.54 
 
 		 362 aa  407  1.0000000000000001e-112  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.832102 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4064  chorismate synthase  54.93 
 
 		 359 aa  406  1.0000000000000001e-112  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  unclonable  0.000000000000659407  hitchhiker  0.000000405427 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3801  chorismate synthase  56.74 
 
 		 364 aa  404  1.0000000000000001e-112  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.209902  normal  0.33378 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4576  chorismate synthase  55.43 
 
 		 352 aa  406  1.0000000000000001e-112  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.348099  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_11018  chorismate synthase  54.42 
 
 		 354 aa  402  1e-111  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.659111  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0161  chorismate synthase  54.95 
 
 		 373 aa  395  1e-109  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.900075  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1952  chorismate synthase  55.9 
 
 		 358 aa  394  1e-108  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3830  chorismate synthase  54.78 
 
 		 358 aa  392  1e-108  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.929225 
 
 
-
 
BN001305  ANIA_05731  chorismate synthase (Eurofung)  54.15 
 
 		 410 aa  390  1e-107  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.430078  normal  1 
 
 
-
 
NC_006693  CNH02650  chorismate synthase, putative  54.4 
 
 		 421 aa  385  1e-106  Cryptococcus neoformans var. neoformans JEC21  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009047  PICST_90939  Chorismate synthase  57.22 
 
 		 377 aa  386  1e-106  Scheffersomyces stipitis CBS 6054  Eukaryota  normal  1  normal  0.352684 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1012  chorismate synthase  52.11 
 
 		 366 aa  381  1e-104  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1640  chorismate synthase  52.68 
 
 		 363 aa  377  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000503125 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_3132  chorismate synthase  54.34 
 
 		 357 aa  375  1e-103  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0111802  normal  0.087423 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1972  chorismate synthase  52.68 
 
 		 363 aa  377  1e-103  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1814  chorismate synthase  53.5 
 
 		 367 aa  368  1e-101  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2168  chorismate synthase  50.14 
 
 		 361 aa  367  1e-100  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2466  chorismate synthase  51.55 
 
 		 361 aa  365  1e-100  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.358807  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1541  chorismate synthase  48.45 
 
 		 366 aa  364  1e-99  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_03114  chorismate synthase  50.14 
 
 		 384 aa  363  2e-99  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1987  chorismate synthase  52.66 
 
 		 366 aa  363  3e-99  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1657  chorismate synthase  52.66 
 
 		 366 aa  363  3e-99  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.112196  normal  0.0287757 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_1568  chorismate synthase  50.98 
 
 		 364 aa  362  5.0000000000000005e-99  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1699  chorismate synthase  52.39 
 
 		 361 aa  362  7.0000000000000005e-99  Vibrio cholerae O395  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2938  chorismate synthase  51.27 
 
 		 369 aa  361  1e-98  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2091  chorismate synthase  49.86 
 
 		 371 aa  361  1e-98  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_02755  chorismate synthase  49.01 
 
 		 365 aa  361  1e-98  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  0.0341392  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_1569  chorismate synthase  51.82 
 
 		 366 aa  359  3e-98  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.453683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1538  chorismate synthase  50.42 
 
 		 366 aa  359  4e-98  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002863  chorismate synthase  49.3 
 
 		 361 aa  359  5e-98  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1241  chorismate synthase  50 
 
 		 366 aa  358  6e-98  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4081  chorismate synthase  52.51 
 
 		 356 aa  358  9e-98  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1226  chorismate synthase  50.28 
 
 		 366 aa  358  9e-98  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.0161922 
 
 
-
 
NC_008752  Aave_2995  chorismate synthase  49.58 
 
 		 365 aa  358  9.999999999999999e-98  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  0.212385 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1537  chorismate synthase  49.86 
 
 		 364 aa  357  1.9999999999999998e-97  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2580  chorismate synthase  49.72 
 
 		 365 aa  355  6.999999999999999e-97  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  1  normal  0.03113 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0858  chorismate synthase  51.26 
 
 		 366 aa  355  7.999999999999999e-97  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  hitchhiker  5.52804e-17  unclonable  0.0000000936669 
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2159  chorismate synthase  50.14 
 
 		 365 aa  355  7.999999999999999e-97  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A1360  chorismate synthase  50.98 
 
 		 366 aa  355  8.999999999999999e-97  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.767963  normal  0.499065 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_1525  chorismate synthase  48.75 
 
 		 385 aa  354  1e-96  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.0632175 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1381  chorismate synthase  50.7 
 
 		 366 aa  355  1e-96  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.674702 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1438  chorismate synthase  50.42 
 
 		 366 aa  354  1e-96  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0978  chorismate synthase  50.42 
 
 		 366 aa  354  1e-96  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2667  chorismate synthase  49.3 
 
 		 364 aa  354  1e-96  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1460  chorismate synthase  50.42 
 
 		 366 aa  354  1e-96  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_1018  chorismate synthase  49.86 
 
 		 362 aa  354  2e-96  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3161  chorismate synthase  50.14 
 
 		 364 aa  353  2e-96  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_3150  chorismate synthase  49.58 
 
 		 373 aa  353  2.9999999999999997e-96  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2811  chorismate synthase  50.98 
 
 		 361 aa  353  2.9999999999999997e-96  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.655428  n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4605  chorismate synthase  50.98 
 
 		 366 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0590951  normal  1 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_1789  chorismate synthase  50.14 
 
 		 366 aa  353  2.9999999999999997e-96  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.681987  normal  1 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_4957  chorismate synthase  49.02 
 
 		 389 aa  352  5e-96  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2767  chorismate synthase  50.42 
 
 		 366 aa  352  5.9999999999999994e-96  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3619  chorismate synthase  51.25 
 
 		 361 aa  352  5.9999999999999994e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  decreased coverage  0.00000281464  normal  0.087707 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1607  chorismate synthase  49.3 
 
 		 364 aa  352  7e-96  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.131097  normal  0.360545 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4138  chorismate synthase  50.69 
 
 		 370 aa  352  7e-96  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  0.0341634 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_2470  chorismate synthase  49.59 
 
 		 361 aa  352  7e-96  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_2769  chorismate synthase  49.3 
 
 		 364 aa  352  8e-96  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.116753  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_2846  chorismate synthase  49.3 
 
 		 364 aa  352  8e-96  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0000803726 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1341  chorismate synthase  50.14 
 
 		 366 aa  352  8e-96  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_2752  chorismate synthase  49.3 
 
 		 364 aa  352  8e-96  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.200726  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3074  chorismate synthase  50 
 
 		 376 aa  351  8.999999999999999e-96  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1702  chorismate synthase  48.93 
 
 		 384 aa  351  1e-95  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0770  chorismate synthase  48.4 
 
 		 366 aa  351  1e-95  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.742046  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_2137  chorismate synthase  53.24 
 
 		 361 aa  350  3e-95  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.146002  normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1740  chorismate synthase  50.14 
 
 		 368 aa  349  5e-95  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.544591 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_2451  chorismate synthase  49.01 
 
 		 364 aa  348  6e-95  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1296  chorismate synthase  50.42 
 
 		 334 aa  348  6e-95  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.576188  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1658  chorismate synthase  49.02 
 
 		 366 aa  348  9e-95  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_006368  lpp2251  chorismate synthase  48.88 
 
 		 352 aa  347  1e-94  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_1453  chorismate synthase  50.14 
 
 		 361 aa  347  1e-94  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  0.71846  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>