More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oter_0263 on replicon NC_010571
Organism: Opitutus terrae PB90-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010571  Oter_0263  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  100 
 
 
501 aa  1004    Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3856  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.49 
 
 
378 aa  157  6e-37  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.215089 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1802  GAF sensor signal transduction histidine kinase  41.32 
 
 
456 aa  143  7e-33  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0838  GAF sensor signal transduction histidine kinase  35.66 
 
 
461 aa  140  3.9999999999999997e-32  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1190  histidine kinase  35.98 
 
 
646 aa  137  3.0000000000000003e-31  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_5276  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.1 
 
 
579 aa  137  5e-31  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.606728  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1131  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  39.08 
 
 
500 aa  135  1.9999999999999998e-30  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1253  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  34.96 
 
 
584 aa  134  3e-30  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0095  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  37.76 
 
 
582 aa  133  7.999999999999999e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3684  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.07 
 
 
580 aa  131  2.0000000000000002e-29  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.896547  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1027  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.65 
 
 
473 aa  127  6e-28  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0726  histidine kinase  35.93 
 
 
570 aa  126  7e-28  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.408803  normal 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3287  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  30.52 
 
 
584 aa  126  1e-27  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.847642  normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_1996  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.46 
 
 
584 aa  126  1e-27  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.0327436  normal  0.170409 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0141  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  34.77 
 
 
365 aa  125  1e-27  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.733195 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4666  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  38.27 
 
 
578 aa  125  2e-27  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2667  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.51 
 
 
737 aa  125  2e-27  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.149434  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_0579  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.86 
 
 
487 aa  125  2e-27  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.721447  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_0711  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.73 
 
 
581 aa  124  4e-27  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3819  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.32 
 
 
1297 aa  122  9.999999999999999e-27  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.11644  normal 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_2117  histidine kinase  34.14 
 
 
631 aa  122  1.9999999999999998e-26  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.0208634 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_4375  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.77 
 
 
550 aa  122  1.9999999999999998e-26  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0194  ATPase domain-containing protein  37.24 
 
 
549 aa  122  1.9999999999999998e-26  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.357239  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1864  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.83 
 
 
460 aa  121  3e-26  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.793429  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1437  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.23 
 
 
640 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1284  histidine kinase  31.91 
 
 
560 aa  121  3.9999999999999996e-26  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.0983353  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2070  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.08 
 
 
613 aa  120  3.9999999999999996e-26  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1119  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  26.3 
 
 
502 aa  120  6e-26  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.092302  normal 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1924  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.74 
 
 
901 aa  120  7e-26  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0613  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.29 
 
 
641 aa  120  7.999999999999999e-26  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_1845  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.72 
 
 
878 aa  119  9.999999999999999e-26  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.187428  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0932  multi-sensor signal transduction histidine kinase  33.33 
 
 
827 aa  119  9.999999999999999e-26  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.202098 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2394  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  33.73 
 
 
593 aa  119  9.999999999999999e-26  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000984  signal transduction histidine kinase  29.1 
 
 
631 aa  119  1.9999999999999998e-25  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1904  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.32 
 
 
932 aa  119  1.9999999999999998e-25  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.636099  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1371  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.08 
 
 
639 aa  117  3.9999999999999997e-25  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1160  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.52 
 
 
829 aa  117  3.9999999999999997e-25  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.380489 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0099  signal transduction histidine kinase-like protein  33.71 
 
 
938 aa  117  5e-25  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal  0.878773 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_1556  multi-sensor hybrid histidine kinase  34.84 
 
 
1021 aa  117  5e-25  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5514  multi-sensor signal transduction histidine kinase  37.25 
 
 
1010 aa  117  6.9999999999999995e-25  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B1311  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32 
 
 
776 aa  116  7.999999999999999e-25  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.103963 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_0047  histidine kinase  33.94 
 
 
508 aa  116  1.0000000000000001e-24  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_3537  multi-sensor signal transduction histidine kinase  29.58 
 
 
609 aa  116  1.0000000000000001e-24  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1564  histidine kinase  30.66 
 
 
531 aa  115  1.0000000000000001e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1703  histidine kinase  32.46 
 
 
1346 aa  116  1.0000000000000001e-24  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3084  histidine kinase  31.75 
 
 
496 aa  115  2.0000000000000002e-24  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.0000309277  hitchhiker  0.00206907 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5296  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.34 
 
 
776 aa  115  2.0000000000000002e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3142  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.16 
 
 
1352 aa  115  2.0000000000000002e-24  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2694  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.08 
 
 
589 aa  114  3e-24  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  normal  0.87998 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0186  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.93 
 
 
657 aa  114  4.0000000000000004e-24  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00908915 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0548  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  30.08 
 
 
639 aa  114  4.0000000000000004e-24  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.271418  normal 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1277  multi-sensor hybrid histidine kinase  27.93 
 
 
969 aa  114  5e-24  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2045  histidine kinase  29.21 
 
 
906 aa  114  5e-24  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.189516  normal  0.433786 
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1949  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  26.19 
 
 
623 aa  114  5e-24  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_2891  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.69 
 
 
615 aa  113  8.000000000000001e-24  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.031526 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_1295  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.5 
 
 
1223 aa  113  9e-24  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.0981526  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2332  multi-sensor signal transduction histidine kinase  28.33 
 
 
600 aa  113  9e-24  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2995  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.78 
 
 
1002 aa  112  1.0000000000000001e-23  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.175208  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1318  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  36.95 
 
 
408 aa  112  1.0000000000000001e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_2640  histidine kinase  30.11 
 
 
397 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.976353  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_1871  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  34.06 
 
 
842 aa  112  1.0000000000000001e-23  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.464371  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1024  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  28.4 
 
 
631 aa  113  1.0000000000000001e-23  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.963931  n/a   
 
 
-
 
NC_008528  OEOE_0106  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  24.8 
 
 
633 aa  112  1.0000000000000001e-23  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2030  histidine kinase  32.75 
 
 
927 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal  0.182465 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_3058  phage head-tail adaptor, putative  32.92 
 
 
580 aa  111  2.0000000000000002e-23  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  decreased coverage  0.00943131  normal  0.0427518 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0140  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  28.42 
 
 
620 aa  112  2.0000000000000002e-23  Methanococcus vannielii SB  Archaea  hitchhiker  0.000754265  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2374  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31.9 
 
 
709 aa  112  2.0000000000000002e-23  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_2675  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.21 
 
 
708 aa  112  2.0000000000000002e-23  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.877  normal  0.897929 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0037  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  31.75 
 
 
387 aa  111  2.0000000000000002e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3321  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  35.48 
 
 
973 aa  111  2.0000000000000002e-23  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4313  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.28 
 
 
965 aa  111  2.0000000000000002e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal  0.975749 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1430  multi-sensor signal transduction histidine kinase  30.28 
 
 
737 aa  112  2.0000000000000002e-23  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal  0.224344 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0334  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  35.12 
 
 
492 aa  112  2.0000000000000002e-23  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.091816  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_03078  sensor histidine kinase  33.76 
 
 
678 aa  111  3e-23  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4539  response regulator receiver:ATP-binding region, ATPase-like:histidine kinase A, N-terminal  35 
 
 
1152 aa  111  3e-23  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.329946  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1175  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.4 
 
 
359 aa  111  3e-23  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.169908 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1180  hybrid sensory histidine kinase BarA  29.82 
 
 
929 aa  111  3e-23  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.175711  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3771  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.18 
 
 
1391 aa  111  3e-23  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1928  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  32.51 
 
 
920 aa  111  3e-23  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2683  multi-sensor signal transduction histidine kinase  31 
 
 
546 aa  111  4.0000000000000004e-23  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000116014 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1520  multi-sensor signal transduction histidine kinase  32.26 
 
 
634 aa  110  4.0000000000000004e-23  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.125308  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0645  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  32.17 
 
 
467 aa  111  4.0000000000000004e-23  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_2551  ATP-binding region ATPase domain protein  29.92 
 
 
398 aa  110  5e-23  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1507  periplasmic sensor signal transduction histidine kinase  31.18 
 
 
896 aa  110  5e-23  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.808684  normal 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_3671  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  31.15 
 
 
595 aa  110  5e-23  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4463  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.33 
 
 
839 aa  110  6e-23  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4418  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  29.29 
 
 
587 aa  110  6e-23  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008688  Pden_5112  integral membrane sensor signal transduction histidine kinase  33.46 
 
 
901 aa  110  6e-23  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0602  histidine kinase  30.57 
 
 
843 aa  110  6e-23  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1101  sensory box histidine kinase  33.94 
 
 
537 aa  110  7.000000000000001e-23  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4311  PAS/PAC sensor signal transduction histidine kinase  30.25 
 
 
1291 aa  110  7.000000000000001e-23  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2520  hybrid sensory histidine kinase in two-component regulatory system with EvgA  30.66 
 
 
1127 aa  110  8.000000000000001e-23  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5380  multi-sensor signal transduction histidine kinase  36.02 
 
 
625 aa  109  9.000000000000001e-23  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  decreased coverage  0.00714338  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1287  Hpt sensor hybrid histidine kinase  30.62 
 
 
1197 aa  109  1e-22  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0175  histidine kinase  32.38 
 
 
231 aa  109  1e-22  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4701  multi-sensor hybrid histidine kinase  32.44 
 
 
1274 aa  109  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0613664  normal  0.609464 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4779  multi-sensor hybrid histidine kinase  30.34 
 
 
1195 aa  109  1e-22  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.133558  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2507  hybrid sensory histidine kinase in two-component regulatory system with EvgA  30.62 
 
 
1197 aa  109  1e-22  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0203632  n/a   
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2390  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  31.02 
 
 
618 aa  109  1e-22  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.868312  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0839  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.91 
 
 
1207 aa  109  1e-22  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>