104 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_3565 on replicon NC_009668
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009668  Oant_3565  carbohydrate kinase FGGY  100 
 
 
453 aa  925    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011366  Rleg2_5814  carbohydrate kinase FGGY  60.31 
 
 
459 aa  531  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal  0.0596745 
 
 
-
 
NC_012858  Rleg_6715  carbohydrate kinase FGGY  59.24 
 
 
459 aa  533  1e-150  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.877599 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6271  sugar kinase  57.44 
 
 
468 aa  493  9.999999999999999e-139  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.918776  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0230  carbohydrate kinase FGGY  51.75 
 
 
463 aa  425  1e-118  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.499564  normal  0.221506 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_2429  carbohydrate kinase  50.35 
 
 
461 aa  396  1e-109  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.850932  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_2599  carbohydrate kinase, FGGY  48.9 
 
 
456 aa  390  1e-107  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal  0.632693 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1051  carbohydrate kinase, FGGY  41.71 
 
 
475 aa  254  3e-66  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2207  carbohydrate kinase FGGY  38.18 
 
 
483 aa  240  2.9999999999999997e-62  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    normal  0.610278 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_2184  putative carbohydrate kinase  38.52 
 
 
515 aa  216  9e-55  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3634  carbohydrate kinase FGGY  32.59 
 
 
482 aa  213  3.9999999999999995e-54  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.206417  normal 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2124  carbohydrate kinase, FGGY  34.23 
 
 
493 aa  210  5e-53  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.0277297  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4213  carbohydrate kinase, FGGY  28.29 
 
 
453 aa  144  3e-33  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.212692  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_4893  carbohydrate kinase FGGY  28.35 
 
 
447 aa  129  8.000000000000001e-29  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3882  carbohydrate kinase FGGY  25.88 
 
 
467 aa  128  2.0000000000000002e-28  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4923  carbohydrate kinase FGGY  29 
 
 
460 aa  126  9e-28  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  hitchhiker  0.00560113  normal  0.28252 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_1805  Sugar (pentulose and hexulose) kinase-like protein  28.79 
 
 
474 aa  123  7e-27  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1830  L-fuculokinase  26.33 
 
 
474 aa  75.1  0.000000000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.0433946  normal 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1449  L-fuculokinase  22.76 
 
 
485 aa  70.1  0.00000000008  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3139  L-fuculokinase  25.82 
 
 
472 aa  67  0.0000000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal  0.88968 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3302  L-fuculokinase  25.82 
 
 
472 aa  66.6  0.0000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3202  L-fuculokinase  25.82 
 
 
472 aa  66.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3187  L-fuculokinase  25.82 
 
 
472 aa  66.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3122  L-fuculokinase  26.45 
 
 
472 aa  66.2  0.000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  0.0220886  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0441  carbohydrate kinase FGGY  26.48 
 
 
505 aa  64.3  0.000000004  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2947  L-fuculokinase  24 
 
 
472 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0145106  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3108  L-fuculokinase  24 
 
 
472 aa  62.8  0.00000001  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000765282  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_19510  xylulokinase  22.19 
 
 
501 aa  62.4  0.00000001  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02654  L-fuculokinase  23.64 
 
 
482 aa  60.5  0.00000006  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0885  L-fuculokinase  23.64 
 
 
472 aa  60.5  0.00000006  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0909  L-fuculokinase  23.64 
 
 
472 aa  60.5  0.00000006  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4067  L-fuculokinase  23.64 
 
 
482 aa  60.5  0.00000006  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.0791397  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_02615  hypothetical protein  23.64 
 
 
482 aa  60.5  0.00000006  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2975  carbohydrate kinase FGGY  24.42 
 
 
523 aa  58.9  0.0000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2944  L-fuculokinase  23.27 
 
 
472 aa  58.9  0.0000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.124367  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3952  L-xylulose/3-keto-L-gulonate kinase  23.61 
 
 
498 aa  58.2  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C3997  L-xylulose/3-keto-L-gulonate kinase  23.61 
 
 
498 aa  57.4  0.0000006  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.970359 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2898  xylulokinase  25.1 
 
 
481 aa  55.5  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0204645  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1655  carbohydrate kinase, FGGY  28.4 
 
 
549 aa  55.8  0.000002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.0424957  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2989  carbohydrate kinase, FGGY  26.97 
 
 
473 aa  55.1  0.000003  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2718  carbohydrate kinase FGGY  26.53 
 
 
515 aa  54.7  0.000003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2471  carbohydrate kinase FGGY  29.03 
 
 
509 aa  54.3  0.000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0101197  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A3872  L-xylulose/3-keto-L-gulonate kinase  23.61 
 
 
498 aa  54.7  0.000004  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3485  rhamnulokinase  27.38 
 
 
490 aa  53.5  0.000007  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4059  L-xylulose/3-keto-L-gulonate kinase  22.95 
 
 
498 aa  53.5  0.000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.822702  normal 
 
 
-
 
CP001509  ECD_03432  L-xylulose kinase  24.92 
 
 
498 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0130  carbohydrate kinase FGGY  24.92 
 
 
498 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1866  carbohydrate kinase FGGY  32.37 
 
 
520 aa  52.8  0.00001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A3784  cryptic L-xylulose kinase  24.92 
 
 
498 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_0134  carbohydrate kinase FGGY  24.92 
 
 
498 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3888  L-xylulose/3-keto-L-gulonate kinase  23.28 
 
 
498 aa  53.1  0.00001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_03383  hypothetical protein  24.92 
 
 
498 aa  53.1  0.00001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3903  cryptic L-xylulose kinase  24.59 
 
 
498 aa  52.4  0.00002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  0.783257  normal 
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5161  carbohydrate kinase FGGY  31.11 
 
 
509 aa  51.6  0.00003  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  0.398593  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3695  carbohydrate kinase FGGY  28.74 
 
 
502 aa  51.6  0.00003  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_3892  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  28.74 
 
 
505 aa  51.6  0.00003  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0425  carbohydrate kinase, FGGY  26.24 
 
 
472 aa  51.2  0.00003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.935774  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2470  carbohydrate kinase FGGY  24.54 
 
 
515 aa  51.2  0.00004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.805247  normal 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4077  cryptic L-xylulose kinase  28.31 
 
 
498 aa  51.2  0.00004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6710  carbohydrate kinase FGGY  26.22 
 
 
488 aa  51.2  0.00004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0883509  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3626  carbohydrate kinase FGGY  25.29 
 
 
506 aa  50.8  0.00005  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  hitchhiker  0.00668313  normal  0.0617096 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2596  carbohydrate kinase, FGGY  30.43 
 
 
520 aa  50.1  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal  0.184923 
 
 
-
 
NC_008309  HS_0770  L-xylulose kinase  29.52 
 
 
484 aa  50.1  0.00009  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0048654  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3453  carbohydrate kinase FGGY  26.02 
 
 
480 aa  49.3  0.0001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal  0.236484 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_3072  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  33.53 
 
 
556 aa  49.7  0.0001  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.317516  normal  0.334528 
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0307  carbohydrate kinase  31.4 
 
 
641 aa  48.5  0.0002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_1049  L-fuculokinase  23.95 
 
 
500 aa  48.9  0.0002  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3304  carbohydrate kinase, FGGY  27.84 
 
 
499 aa  48.5  0.0002  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3270  cryptic L-xylulose kinase  23.43 
 
 
498 aa  48.5  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A0932  cryptic L-xylulose kinase  23.43 
 
 
498 aa  48.5  0.0002  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.613284  normal  0.355082 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3403  carbohydrate kinase FGGY  23.43 
 
 
498 aa  48.5  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2687  xylulokinase  24.21 
 
 
499 aa  49.3  0.0002  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0437  carbohydrate kinase FGGY  26.06 
 
 
498 aa  48.9  0.0002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  hitchhiker  0.0000361421  n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2196  carbohydrate kinase FGGY  24.6 
 
 
510 aa  49.3  0.0002  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0833  carbohydrate kinase, FGGY  25.94 
 
 
498 aa  48.1  0.0003  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.0632303  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0103  carbohydrate kinase FGGY  25.21 
 
 
508 aa  48.1  0.0003  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2858  Carbohydrate kinase, FGGY  26.49 
 
 
516 aa  48.1  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.879929 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3065  xylulokinase  22.57 
 
 
472 aa  48.1  0.0003  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  normal  0.760339 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_3047  carbohydrate kinase FGGY  26.24 
 
 
468 aa  48.5  0.0003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4812  Carbohydrate kinase, FGGY-like protein  27.61 
 
 
528 aa  47.8  0.0004  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3079  carbohydrate kinase FGGY  30.3 
 
 
511 aa  47.8  0.0004  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.264898  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2086  carbohydrate kinase FGGY  25.23 
 
 
506 aa  47  0.0007  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0420  rhamnulokinase  25.27 
 
 
496 aa  46.6  0.0009  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.354453  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1144  xylulose kinase  31.4 
 
 
537 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2920  carbohydrate kinase  31.4 
 
 
537 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.375466  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2764  carbohydrate kinase  31.4 
 
 
537 aa  46.2  0.001  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6328  xylulokinase  23.12 
 
 
492 aa  45.8  0.001  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2453  carbohydrate kinase, FGGY  24.63 
 
 
495 aa  45.4  0.002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6505  xylulokinase  23.25 
 
 
492 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6739  xylulokinase  23.25 
 
 
492 aa  45.4  0.002  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0801458  normal  0.563999 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1622  carbohydrate kinase, FGGY  26.49 
 
 
499 aa  45.8  0.002  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6033  xylulokinase  23.37 
 
 
492 aa  45.4  0.002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.629819  normal  0.638126 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_4826  carbohydrate kinase, FGGY family  22.89 
 
 
502 aa  45.1  0.002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0920  xylulokinase  26.04 
 
 
518 aa  45.4  0.002  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_29650  pentulose/hexulose kinase  24.37 
 
 
518 aa  45.4  0.002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27320  xylulokinase  26.33 
 
 
495 aa  45.1  0.003  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.342678  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3921  FGGY-family pentulose kinase  29.46 
 
 
528 aa  44.7  0.003  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3770  carbohydrate kinase  22.68 
 
 
502 aa  44.7  0.004  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2732  carbohydrate kinase, FGGY  23.77 
 
 
485 aa  44.3  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4551  carbohydrate kinase, FGGY  26.48 
 
 
508 aa  44.3  0.005  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>