68 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Oant_2297 on replicon NC_009667
Organism: Ochrobactrum anthropi ATCC 49188



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009667  Oant_2297  phage-related tail fibre protein-like protein  100 
 
 
525 aa  1013    Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.364157  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2380  Phage-related tail fibre protein-like  70.31 
 
 
590 aa  447  1.0000000000000001e-124  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.335162  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4480  tail collar domain-containing protein  48.28 
 
 
492 aa  83.6  0.000000000000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  normal  0.648631 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_1384  Phage-related tail fibre protein-like protein  35.57 
 
 
504 aa  77.8  0.0000000000005  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.44271  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3191  Phage-related tail fibre protein-like protein  35.33 
 
 
697 aa  76.3  0.000000000001  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2345  hypothetical protein  36.18 
 
 
479 aa  73.6  0.000000000007  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4536  tail fiber domain-containing protein  30.67 
 
 
552 aa  73.6  0.000000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.371688 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4027  Tail Collar domain protein  33.77 
 
 
646 aa  73.2  0.00000000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4537  gp19  30.67 
 
 
493 aa  72.8  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4029  Phage-related tail fibre protein-like protein  33.77 
 
 
419 aa  72.4  0.00000000002  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2214  hypothetical protein  32.64 
 
 
382 aa  71.2  0.00000000004  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_1823  Tail Collar domain protein  32.45 
 
 
401 aa  71.2  0.00000000004  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.112044  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3650  Phage-related tail fibre protein-like protein  34.69 
 
 
251 aa  69.7  0.0000000001  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4452  tail fiber domain protein  30 
 
 
581 aa  70.1  0.0000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_2656  tail fiber repeat 2 protein  32.67 
 
 
660 aa  68.9  0.0000000002  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_3484  phage tail collar domain-containing protein  33.55 
 
 
340 aa  69.3  0.0000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0918027  normal  0.0437256 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3816  Tail Collar domain protein  31.79 
 
 
498 aa  67.8  0.0000000005  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4042  Phage-related tail fibre protein-like protein  30.14 
 
 
714 aa  67.4  0.0000000006  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.332758  hitchhiker  0.00000000000267654 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1424  hypothetical protein  50 
 
 
479 aa  66.2  0.000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.718743  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0764  hypothetical protein  30.6 
 
 
399 aa  66.2  0.000000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4025  Tail Collar domain protein  31.79 
 
 
371 aa  65.1  0.000000003  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_3398  tail fiber protein H, putative  32.88 
 
 
689 aa  65.1  0.000000003  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.87622  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_1427  hypothetical protein  41.77 
 
 
299 aa  63.9  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00000465775  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4816  hypothetical protein  41.77 
 
 
317 aa  63.9  0.000000006  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3033  tail fiber domain-containing protein  33.77 
 
 
561 aa  63.9  0.000000008  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000290271 
 
 
-
 
NC_012892  B21_00851  hypothetical protein  33.11 
 
 
540 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A0940  tail fiber domain-containing protein  33.11 
 
 
583 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4031  Tail Collar domain protein  29.8 
 
 
485 aa  63.2  0.00000001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2761  Phage-related tail fibre protein-like protein  33.11 
 
 
473 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000146367 
 
 
-
 
CP001509  ECD_00845  hypothetical protein  33.11 
 
 
540 aa  63.2  0.00000001  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_3818  Tail Collar domain protein  31.13 
 
 
557 aa  61.6  0.00000004  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_6581  hypothetical protein  32.04 
 
 
466 aa  60.8  0.00000006  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0791  hypothetical protein  31.88 
 
 
232 aa  60.5  0.00000007  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal  0.749366 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3035  phage Tail Collar domain protein  30.07 
 
 
399 aa  60.1  0.00000009  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00110884 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_3306  phage tail collar domain-containing protein  30.61 
 
 
483 aa  58.5  0.0000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  0.377169  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2850  tail fiber domain protein  32.45 
 
 
588 aa  58.5  0.0000003  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_0865  tail fiber repeat 2-containing protein  30.77 
 
 
554 aa  57.8  0.0000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.0127303 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4341  putative phage tail fiber protein  32.28 
 
 
673 aa  57.4  0.0000006  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.0213021 
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1305  tail fiber protein, putative  29.87 
 
 
505 aa  55.5  0.000003  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000211042 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_1143  Phage tail Collar  28.78 
 
 
817 aa  54.7  0.000004  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.514331  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_08050  putative tail fiber protein  29.73 
 
 
691 aa  54.7  0.000005  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  hitchhiker  0.0000000383442  hitchhiker  0.000557531 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1289  putative variable tail fibre protein  29.17 
 
 
242 aa  53.9  0.000007  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.314975 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1427  hypothetical protein  34.21 
 
 
476 aa  53.1  0.00001  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_5675  hypothetical protein  39.19 
 
 
1065 aa  53.1  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_4024  Phage-related tail fibre protein-like protein  32.45 
 
 
452 aa  53.1  0.00001  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_37440  Phage P2 tail fiber gpH-like protein  28.67 
 
 
299 aa  53.1  0.00001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_1994  hypothetical protein  42.59 
 
 
544 aa  53.1  0.00001  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1182  hypothetical protein  36.84 
 
 
640 aa  52.4  0.00002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.964915  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc1921  putative tail fiber-related protein  29.14 
 
 
554 aa  51.6  0.00003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.526816 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1619  tail fiber-related protein  29.38 
 
 
205 aa  51.2  0.00004  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0820088  n/a   
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1941  gpH  30.07 
 
 
570 aa  51.6  0.00004  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1722  hypothetical protein  34.44 
 
 
372 aa  51.2  0.00005  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.39818 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3078  hypothetical protein  39.44 
 
 
358 aa  51.2  0.00005  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal  0.183188 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2082  hypothetical protein  39.13 
 
 
261 aa  50.4  0.00007  Escherichia coli HS  Bacteria  hitchhiker  0.00446645  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0920  hypothetical protein  35.94 
 
 
238 aa  50.4  0.00008  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1413  hypothetical protein  41.67 
 
 
360 aa  50.1  0.00009  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.328656  normal  0.0564528 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3393  tail fiber protein, putative  28.38 
 
 
519 aa  49.7  0.0001  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2767  hypothetical protein  36.07 
 
 
455 aa  48.9  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3522  hypothetical protein  32.89 
 
 
336 aa  48.5  0.0003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.136391  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1691  hypothetical protein  43.55 
 
 
360 aa  48.1  0.0004  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.10741  normal  0.517365 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1417  hypothetical protein  43.55 
 
 
360 aa  48.1  0.0004  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.237583  normal  0.104082 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_3457  hypothetical protein  32 
 
 
611 aa  47.8  0.0005  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.801555  normal  0.385071 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1121  hypothetical protein  42.67 
 
 
243 aa  47  0.0009  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.666751  normal  0.104737 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_0512  hypothetical protein  37.5 
 
 
278 aa  46.6  0.001  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR0509  hypothetical protein  37.5 
 
 
278 aa  46.6  0.001  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4381  gp19  26.77 
 
 
580 aa  45.8  0.002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0427744  hitchhiker  0.000225609 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2243  hypothetical protein  43.24 
 
 
466 aa  43.5  0.009  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  normal  0.707685 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1095  hypothetical protein  32.31 
 
 
341 aa  43.5  0.01  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>