More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0995 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008528  OEOE_0995  DNA primase  100 
 
 		 610 aa  1252    Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.0027576  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_0742  DNA primase  34.47 
 
 		 621 aa  362  2e-98  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  hitchhiker  0.00012137  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1034  DNA primase  36.49 
 
 		 598 aa  311  2e-83  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1114  DNA primase  36.46 
 
 		 606 aa  305  1.0000000000000001e-81  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  unclonable  0.0000000152449  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2415  DNA primase  35.89 
 
 		 601 aa  299  1e-79  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000695065  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4145  DNA primase  35.9 
 
 		 600 aa  291  2e-77  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00903359  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4410  DNA primase  36.36 
 
 		 598 aa  290  4e-77  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000156307  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4033  DNA primase  36.13 
 
 		 598 aa  290  5.0000000000000004e-77  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.0023967  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4427  DNA primase  36.13 
 
 		 598 aa  289  1e-76  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000000994887  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS4195  DNA primase  36.13 
 
 		 598 aa  289  1e-76  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0980784  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4043  DNA primase  36.13 
 
 		 598 aa  289  1e-76  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4516  DNA primase  36.13 
 
 		 598 aa  289  1e-76  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00440133  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0826  DNA primase  36.13 
 
 		 598 aa  289  1e-76  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.00000125124  decreased coverage  1.52163e-21 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4315  DNA primase  36.13 
 
 		 598 aa  289  1e-76  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    decreased coverage  1.07467e-58 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4374  DNA primase  35.66 
 
 		 571 aa  286  5.999999999999999e-76  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  decreased coverage  0.0000215576  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3020  DNA primase  36.6 
 
 		 598 aa  285  1.0000000000000001e-75  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0245497  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1978  DNA primase  30.64 
 
 		 601 aa  285  2.0000000000000002e-75  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1214  DNA primase  33.03 
 
 		 626 aa  270  7e-71  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.008506  normal  0.015083 
 
 
-
 
NC_007512  Plut_1589  DNA primase  35.42 
 
 		 633 aa  267  4e-70  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  0.567407  normal  0.0206676 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_0602  DNA primase  32.95 
 
 		 636 aa  266  8e-70  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004116  SAG1427  DNA primase  35.31 
 
 		 602 aa  261  2e-68  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  0.0410677  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1449  DNA primase  35.32 
 
 		 603 aa  262  2e-68  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2463  Fis family transcriptional regulator  37.39 
 
 		 604 aa  257  4e-67  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_12410  DNA primase  32.96 
 
 		 599 aa  256  7e-67  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.936355  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A0045  DNA primase  32.51 
 
 		 609 aa  256  9e-67  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000233993  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0896  DNA primase  30.35 
 
 		 600 aa  255  2.0000000000000002e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1154  DNA primase  34.43 
 
 		 575 aa  254  4.0000000000000004e-66  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.000263916  normal  0.0506591 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A2058  DNA primase  33.11 
 
 		 592 aa  253  8.000000000000001e-66  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.507155  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1073  DNA primase  34.43 
 
 		 573 aa  253  8.000000000000001e-66  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  0.096623  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_00849  DNA primase  33.64 
 
 		 586 aa  252  1e-65  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0586  DNA primase  35.42 
 
 		 632 aa  251  2e-65  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  0.284459  normal  0.746825 
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I2696  DNA primase  33.78 
 
 		 586 aa  250  6e-65  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  hitchhiker  0.00323272  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0728  DNA primase  34.42 
 
 		 631 aa  249  8e-65  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0552  DNA primase  31.55 
 
 		 590 aa  249  1e-64  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1654  DNA primase  34.73 
 
 		 605 aa  249  1e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  decreased coverage  0.000285307  n/a   
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0548  DNA primase  31.67 
 
 		 660 aa  249  1e-64  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  decreased coverage  0.00859761  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1292  DNA primase  31.57 
 
 		 694 aa  249  1e-64  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.320597 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1620  DNA primase  34.73 
 
 		 605 aa  249  1e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0393306  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0527  DNA primase  31.9 
 
 		 588 aa  248  2e-64  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00124146  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_15911  DNA primase  31.07 
 
 		 684 aa  248  2e-64  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0959  DNA primase  33.7 
 
 		 576 aa  248  2e-64  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  hitchhiker  0.0000094448  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001623  DNA primase  32.56 
 
 		 588 aa  249  2e-64  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  hitchhiker  0.00199304  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3790  DNA primase  31.18 
 
 		 582 aa  248  3e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1313  DNA primase  37.17 
 
 		 595 aa  247  4.9999999999999997e-64  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000743307  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0997  DNA primase  34.47 
 
 		 601 aa  247  4.9999999999999997e-64  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.941593  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1128  DNA primase  35.05 
 
 		 598 aa  246  9e-64  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0012752  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3790  DNA primase  34.72 
 
 		 640 aa  245  1.9999999999999999e-63  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_1175  DNA primase  31.46 
 
 		 682 aa  245  1.9999999999999999e-63  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  decreased coverage  0.00198747  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_492  DNA primase  31.33 
 
 		 590 aa  245  1.9999999999999999e-63  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.0123236  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3695  DNA primase  31.24 
 
 		 583 aa  244  3e-63  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_0549  DNA primase  33.86 
 
 		 584 aa  244  3e-63  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00237945  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_6392  DNA primase  30.91 
 
 		 605 aa  244  5e-63  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2153  DNA primase  31.09 
 
 		 613 aa  243  6e-63  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008255  CHU_0927  DNA primase  33.49 
 
 		 653 aa  243  7e-63  Cytophaga hutchinsonii ATCC 33406  Bacteria  normal  0.584516  normal  0.012532 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_0784  DNA primase  33.64 
 
 		 584 aa  242  1e-62  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00105379  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3037  DNA primase  34.99 
 
 		 599 aa  243  1e-62  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.735679 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0587  DNA primase  34.9 
 
 		 642 aa  243  1e-62  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.356346  normal  0.0328717 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0622  DNA primase  34.9 
 
 		 641 aa  241  2e-62  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.156261 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0631  DNA primase  35.33 
 
 		 630 aa  241  2e-62  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4048  DNA primase  30.56 
 
 		 587 aa  242  2e-62  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  0.211802  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1136  DNA primase  31.83 
 
 		 544 aa  241  2.9999999999999997e-62  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  hitchhiker  0.0000106361  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2995  DNA primase  33.88 
 
 		 575 aa  241  2.9999999999999997e-62  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  0.0193814  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0538  DNA primase  27.98 
 
 		 652 aa  240  5e-62  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0611  DNA primase  34.63 
 
 		 641 aa  240  5e-62  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.753185  normal  0.102101 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1964  DNA primase  33.64 
 
 		 632 aa  240  5.999999999999999e-62  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.985881  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2517  DNA primase  31.1 
 
 		 617 aa  239  1e-61  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.986794  normal  0.570872 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2989  DNA primase  32.94 
 
 		 574 aa  238  2e-61  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  hitchhiker  0.00884135  normal  1 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3086  DNA primase  32.94 
 
 		 574 aa  238  2e-61  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.000597352  hitchhiker  0.000480435 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3686  DNA primase  33.41 
 
 		 636 aa  237  4e-61  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_0570  DNA primase  33.33 
 
 		 637 aa  237  4e-61  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1286  DNA primase  32.71 
 
 		 574 aa  237  5.0000000000000005e-61  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0271  DNA primase  34.27 
 
 		 675 aa  237  5.0000000000000005e-61  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  0.59752  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1145  DNA primase  32.94 
 
 		 574 aa  237  5.0000000000000005e-61  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.0000553498  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3836  DNA primase  34.72 
 
 		 646 aa  236  6e-61  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.0564656  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3785  DNA primase  34.72 
 
 		 646 aa  236  6e-61  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_07051  DNA primase  33.07 
 
 		 679 aa  236  7e-61  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  1  normal  0.0886385 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3168  DNA primase  32.94 
 
 		 574 aa  236  7e-61  Shewanella baltica OS223  Bacteria  hitchhiker  0.00053583  normal  0.343709 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2907  DNA primase  32.86 
 
 		 574 aa  236  7e-61  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.000550507  normal  0.062671 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1222  DNA primase  32.94 
 
 		 574 aa  236  9e-61  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0573251  normal  0.615941 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1105  DNA primase  32.24 
 
 		 574 aa  236  9e-61  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  hitchhiker  0.0000782839  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0419  DNA primase  33.25 
 
 		 660 aa  236  1.0000000000000001e-60  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.26647  normal  1 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4335  DNA primase  32.79 
 
 		 585 aa  236  1.0000000000000001e-60  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0735  DNA primase  35.44 
 
 		 675 aa  236  1.0000000000000001e-60  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.898255 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1189  DNA primase  32.71 
 
 		 574 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.0497692  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1224  DNA primase  32.92 
 
 		 564 aa  235  2.0000000000000002e-60  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.533717  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_2833  DNA primase  31.29 
 
 		 574 aa  235  2.0000000000000002e-60  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.0310817  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1239  DNA primase  34.97 
 
 		 639 aa  234  2.0000000000000002e-60  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007963  Csal_0975  DNA primase  32.13 
 
 		 613 aa  234  3e-60  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0719  DNA primase  32.33 
 
 		 663 aa  234  4.0000000000000004e-60  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1835  DNA primase  31.96 
 
 		 623 aa  233  6e-60  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1727  DNA primase  36.72 
 
 		 611 aa  233  6e-60  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0491  DNA primase  37.22 
 
 		 599 aa  233  6e-60  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.34781  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4027  DNA primase  31.95 
 
 		 663 aa  233  9e-60  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.570104  normal  1 
 
 
-
 
CP001509  ECD_02936  DNA primase  32.62 
 
 		 581 aa  232  1e-59  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  hitchhiker  0.000331105  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_0634  DNA primase  32.62 
 
 		 581 aa  232  1e-59  Escherichia coli DH1  Bacteria  unclonable  0.000000000000261356  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02886  hypothetical protein  32.62 
 
 		 581 aa  232  1e-59  Escherichia coli BL21  Bacteria  hitchhiker  0.000360854  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_3530  DNA primase  32.62 
 
 		 581 aa  232  1e-59  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000000506976  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_3359  DNA primase  32.62 
 
 		 581 aa  232  1e-59  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  unclonable  0.00000000492318  normal  1 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1971  DNA primase  31.83 
 
 		 583 aa  233  1e-59  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  0.0427766  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E3500  DNA primase  32.39 
 
 		 581 aa  233  1e-59  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  hitchhiker  0.00000000565097  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>