More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene OEOE_0632 on replicon NC_008528
Organism: Oenococcus oeni PSU-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008528  OEOE_0632  spermidine/putrescine ABC transporter permease protein  100 
 
 		 268 aa  534  1e-151  Oenococcus oeni PSU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00665545  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_0193  spermidine/putrescine ABC transporter permease protein  70.23 
 
 		 276 aa  345  4e-94  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009513  Lreu_1644  ornithine carbamoyltransferase  67.82 
 
 		 272 aa  339  2.9999999999999998e-92  Lactobacillus reuteri DSM 20016  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0325  Ornithine carbamoyltransferase  64.29 
 
 		 268 aa  320  9.999999999999999e-87  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  hitchhiker  0.000489255  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1494  spermidine/putrescine ABC transporter permease protein  60.31 
 
 		 259 aa  310  2e-83  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  normal  0.968283  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_1286  spermidine/putrescine ABC transporter permease protein  61.48 
 
 		 266 aa  307  1.0000000000000001e-82  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  normal  0.0741739  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1227  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  61.96 
 
 		 269 aa  306  3e-82  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  unclonable  0.000000000377122  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1290  spermidine/putrescine ABC transporter permease protein  62.4 
 
 		 265 aa  303  3.0000000000000004e-81  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  0.0230868  normal  1 
 
 
-
 
NC_004116  SAG1109  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  64.45 
 
 		 258 aa  301  8.000000000000001e-81  Streptococcus agalactiae 2603V/R  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1533  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  62.7 
 
 		 267 aa  300  2e-80  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0688  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein PotC  53.88 
 
 		 270 aa  264  8.999999999999999e-70  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1183  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 		 269 aa  246  3e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.000422774  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1161  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  50 
 
 		 269 aa  246  3e-64  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.135086  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_1937  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein (potC)-like protein  47.51 
 
 		 266 aa  211  9e-54  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2225  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein PotC  47.51 
 
 		 266 aa  210  2e-53  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_0748  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  43.24 
 
 		 264 aa  199  3e-50  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  0.0148885  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2582  Ornithine carbamoyltransferase  42.69 
 
 		 263 aa  197  2.0000000000000003e-49  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.000000818626  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0891  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  42.29 
 
 		 273 aa  194  9e-49  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0152419  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2866  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  38.61 
 
 		 257 aa  187  2e-46  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_3672  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  38 
 
 		 256 aa  185  9e-46  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_1958  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  39.92 
 
 		 266 aa  183  2.0000000000000003e-45  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_2299  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.98 
 
 		 268 aa  180  2e-44  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1847  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  36.69 
 
 		 254 aa  176  3e-43  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.0489966  n/a   
 
 
-
 
NC_011728  BbuZS7_0660  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component domain protein  41.49 
 
 		 263 aa  173  2.9999999999999996e-42  Borrelia burgdorferi ZS7  Bacteria  normal  0.683929  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_17620  polyamine transport protein PotC  40.81 
 
 		 256 aa  170  2e-41  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_1532  polyamine transport protein PotC  40.36 
 
 		 256 aa  169  4e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0895  ornithine carbamoyltransferase  40.27 
 
 		 270 aa  168  9e-41  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_2838  ornithine carbamoyltransferase  37.27 
 
 		 286 aa  167  2e-40  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.000365648  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1009  ornithine carbamoyltransferase  39.48 
 
 		 266 aa  166  2.9999999999999998e-40  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  38.59 
 
 		 267 aa  166  4e-40  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4005  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  37.65 
 
 		 266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000000178374 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1339  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  37.65 
 
 		 266 aa  164  1.0000000000000001e-39  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1203  ornithine carbamoyltransferase  35.94 
 
 		 266 aa  164  2.0000000000000002e-39  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I1582  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  37.75 
 
 		 256 aa  163  2.0000000000000002e-39  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.147817  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0372  ornithine carbamoyltransferase  43.5 
 
 		 261 aa  163  3e-39  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_3144  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.94 
 
 		 262 aa  162  7e-39  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.058701  normal  1 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1644  ornithine carbamoyltransferase  35.79 
 
 		 285 aa  161  1e-38  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.574087 
 
 
-
 
NC_002977  MCA0870  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  40.42 
 
 		 270 aa  161  1e-38  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.41546  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1400  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  37.25 
 
 		 266 aa  161  1e-38  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1201  spermidine/putrescine ABC transporter permease  37.25 
 
 		 266 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.440242  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1179  spermidine/putrescine ABC transporter, permease  37.25 
 
 		 266 aa  161  1e-38  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1181  spermidine/putrescine ABC transporter, permease  37.25 
 
 		 266 aa  161  1e-38  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.0752832  n/a   
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02287  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  37.4 
 
 		 256 aa  161  1e-38  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1377  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  37.25 
 
 		 266 aa  161  1e-38  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000768374 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1299  spermidine/putrescine ABC transporter permease  37.25 
 
 		 266 aa  161  1e-38  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1063  ornithine carbamoyltransferase  36.9 
 
 		 293 aa  161  1e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1097  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.17 
 
 		 271 aa  160  2e-38  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.0724945  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_003483  spermidine putrescine ABC transporter permease component PotC  37.4 
 
 		 256 aa  160  3e-38  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  decreased coverage  0.000000553951  n/a   
 
 
-
 
NC_007954  Sden_3028  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  34.72 
 
 		 269 aa  158  9e-38  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  0.458756  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3189  Ornithine carbamoyltransferase  36.43 
 
 		 271 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.72371  normal  0.0258065 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1111  ornithine carbamoyltransferase  36.43 
 
 		 271 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS155  Bacteria  hitchhiker  0.00240175  n/a   
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1202  ornithine carbamoyltransferase  36.43 
 
 		 271 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.0144626  normal  1 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2915  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.43 
 
 		 271 aa  157  2e-37  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.024318  normal  0.589307 
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1169  ornithine carbamoyltransferase  36.43 
 
 		 271 aa  157  2e-37  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.017225  n/a   
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_3094  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.43 
 
 		 271 aa  157  2e-37  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.051909  normal  1 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1451  ornithine carbamoyltransferase  38.91 
 
 		 256 aa  156  3e-37  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1567  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.02 
 
 		 261 aa  156  3e-37  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.260601  normal  1 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1273  polyamine ABC transporter, permease protein  36.06 
 
 		 271 aa  156  4e-37  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_2639  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.21 
 
 		 271 aa  156  4e-37  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  0.0166478  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2997  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  36.06 
 
 		 271 aa  155  6e-37  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.0208351  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_0976  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  33.83 
 
 		 275 aa  155  7e-37  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1405  ornithine carbamoyltransferase  38.91 
 
 		 256 aa  155  7e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.386311  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0237  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  38.04 
 
 		 276 aa  155  7e-37  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_1345  Ornithine carbamoyltransferase  34.36 
 
 		 280 aa  155  9e-37  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.593277  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1803  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  36.86 
 
 		 257 aa  154  1e-36  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_5055  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  36.29 
 
 		 264 aa  154  1e-36  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  0.429894 
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1063  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  35.83 
 
 		 258 aa  153  2e-36  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  hitchhiker  0.0000694719  normal  1 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_04230  putative permease of ABC transporter  36.51 
 
 		 262 aa  154  2e-36  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0949  ornithine carbamoyltransferase  35.07 
 
 		 271 aa  153  2.9999999999999998e-36  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4397  binding-protein-dependent transport systems inner membrane protein  34.41 
 
 		 260 aa  153  2.9999999999999998e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.814917  normal  0.279187 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1134  ornithine carbamoyltransferase  33.21 
 
 		 275 aa  152  4e-36  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0980  binding-protein dependent transport system inner membrane protein  34.73 
 
 		 267 aa  152  4e-36  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6775  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  37.24 
 
 		 260 aa  150  2e-35  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.261463  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1064  ornithine carbamoyltransferase  33.96 
 
 		 275 aa  150  2e-35  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3006  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  32.84 
 
 		 271 aa  150  2e-35  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0313  ornithine carbamoyltransferase  35.8 
 
 		 273 aa  149  4e-35  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.516071  normal  1 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1441  spermidine/putrescine ABC transporter, permease protein  37.25 
 
 		 266 aa  149  4e-35  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.0782345  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_01122  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  34.32 
 
 		 264 aa  148  8e-35  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2523  Ornithine carbamoyltransferase  34.32 
 
 		 264 aa  148  8e-35  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000122553  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01130  hypothetical protein  34.32 
 
 		 264 aa  148  8e-35  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2002  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  34.32 
 
 		 264 aa  148  8e-35  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  1  normal  0.818334 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2479  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  34.32 
 
 		 264 aa  148  8e-35  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  0.0237436  normal  0.58915 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1502  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  34.32 
 
 		 264 aa  148  8e-35  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  hitchhiker  0.000827524  normal  1 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E2201  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  34.32 
 
 		 264 aa  148  8e-35  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  0.381737  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1244  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  34.32 
 
 		 264 aa  148  8e-35  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  0.0760675  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1247  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  34.32 
 
 		 264 aa  148  8e-35  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.0802676  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0166  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  39.91 
 
 		 272 aa  147  2.0000000000000003e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1119  binding-protein-dependent transport systems inner membrane component  40.18 
 
 		 261 aa  146  3e-34  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.00123252  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3799  ornithine carbamoyltransferase  34.85 
 
 		 260 aa  146  3e-34  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.195582 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_2943  ornithine carbamoyltransferase  36.18 
 
 		 272 aa  146  4.0000000000000006e-34  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012917  PC1_1695  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  33.84 
 
 		 281 aa  145  5e-34  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  0.714449  n/a   
 
 
-
 
NC_010511  M446_6381  ornithine carbamoyltransferase  35.86 
 
 		 258 aa  145  5e-34  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.970819 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1159  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  37.15 
 
 		 255 aa  145  5e-34  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  hitchhiker  0.0000268862  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4563  Ornithine carbamoyltransferase  36.03 
 
 		 259 aa  145  6e-34  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  0.145972 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1364  TonB-dependent receptor  34.83 
 
 		 270 aa  145  6e-34  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4192  ornithine carbamoyltransferase  36.03 
 
 		 259 aa  145  6e-34  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.457573  normal  1 
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3925  ornithine carbamoyltransferase  36.08 
 
 		 273 aa  145  7.0000000000000006e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.13527  n/a   
 
 
-
 
NC_009457  VC0395_A1037  spermidine/putrescine ABC transporter membrane protein  35.37 
 
 		 256 aa  145  8.000000000000001e-34  Vibrio cholerae O395  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000490693  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_2727  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  34.8 
 
 		 281 aa  144  1e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1566  putrescine transporter subunit: membrane component of ABC superfamily  34.8 
 
 		 281 aa  145  1e-33  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>