More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1413 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1413  glycosyl transferase, group 1  100 
 
 		 377 aa  758    Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  1  normal  0.71517 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_2465  glycosyl transferase, group 1  85.9 
 
 		 377 aa  654    Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.356534  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_2695  glycosyl transferase, group 1  72.8 
 
 		 378 aa  545  1e-154  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.811647  normal  0.485445 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4606  putative glycosyl transferase, group 1  70.56 
 
 		 377 aa  543  1e-153  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  0.0423402  normal  0.43747 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3090  glycosyl transferase group 1  72.92 
 
 		 380 aa  527  1e-148  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.251732  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_2683  glycosyl transferase, group 1  71.89 
 
 		 384 aa  517  1.0000000000000001e-145  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.0254204  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_2660  glycosyl transferase, group 1  70.43 
 
 		 389 aa  511  1e-144  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  0.138584 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2956  glycosyl transferase group 1  48.4 
 
 		 468 aa  320  1.9999999999999998e-86  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  1  normal  0.0637205 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5212  glycosyl transferase group 1  47.31 
 
 		 416 aa  303  4.0000000000000003e-81  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1857  glycosyl transferase group 1  43.24 
 
 		 419 aa  293  2e-78  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.497677  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_2192  glycosyl transferase group 1  43.24 
 
 		 419 aa  294  2e-78  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.744931  normal  0.963833 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_1808  glycosyl transferase group 1  44.47 
 
 		 397 aa  287  2e-76  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2711  glycosyl transferase group 1  43.92 
 
 		 399 aa  275  9e-73  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.0628944 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_2507  glycosyl transferase group 1  42.51 
 
 		 387 aa  273  4.0000000000000004e-72  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_0852  glycosyl transferase group 1  40.43 
 
 		 389 aa  270  4e-71  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.248563 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_1155  glycosyl transferase, group 1  40.53 
 
 		 375 aa  268  2e-70  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.596903  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_1311  glycosyl transferase group 1  38.81 
 
 		 389 aa  265  1e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_1223  glycosyl transferase group 1  38.81 
 
 		 389 aa  262  8e-69  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1664  glycosyl transferase  37.93 
 
 		 378 aa  248  1e-64  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3001  glycosyl transferase group 1  39.78 
 
 		 406 aa  202  8e-51  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.469537 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2020  glycosyl transferase group 1  29.32 
 
 		 376 aa  130  4.0000000000000003e-29  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4244  glycosyl transferase group 1  32.55 
 
 		 407 aa  129  1.0000000000000001e-28  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.973071  normal  0.179652 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1638  glycosyl transferase group 1  28.2 
 
 		 378 aa  118  9.999999999999999e-26  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000167998  hitchhiker  0.00440424 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_1661  glycosyl transferase  28.61 
 
 		 419 aa  105  1e-21  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2739  glycosyl transferase group 1  27.86 
 
 		 377 aa  103  6e-21  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.363262  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4119  glycosyl transferase group 1  24.81 
 
 		 377 aa  97.8  3e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  0.0989352  unclonable  0.000000000308882 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2867  glycosyl transferase, group 1  29.43 
 
 		 415 aa  97.4  4e-19  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1437  glycosyl transferase group 1  27.42 
 
 		 353 aa  97.1  5e-19  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0825  glycosyl transferase group 1  28.07 
 
 		 382 aa  97.1  5e-19  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.761905  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2854  glycosyl transferase group 1  25.88 
 
 		 390 aa  96.7  6e-19  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2547  glycosyl transferase group 1  27.24 
 
 		 414 aa  95.1  2e-18  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.148819 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_3114  glycosyl transferase group 1  24.77 
 
 		 369 aa  94.4  3e-18  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000549793  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0306  glycosyl transferase group 1  40.23 
 
 		 412 aa  94.4  3e-18  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0282  glycosyl transferase group 1  33.16 
 
 		 364 aa  91.7  2e-17  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0407  glycosyl transferase group 1  32.43 
 
 		 750 aa  90.9  4e-17  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3263  glycosyl transferase group 1  27.93 
 
 		 425 aa  90.5  5e-17  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_1082  glycosyl transferase, group 1  38.92 
 
 		 389 aa  89.7  8e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0865164  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1513  glycosyl transferase, group 1  26.53 
 
 		 399 aa  89.4  9e-17  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.0232535  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1976  glycosyl transferase, group 1 family protein  27.51 
 
 		 373 aa  88.6  2e-16  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13048  transferase  25.07 
 
 		 414 aa  88.2  2e-16  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00789661 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1238  glycosyl transferase group 1  31.82 
 
 		 394 aa  88.2  2e-16  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_0387  glycosyl transferase group 1  28.76 
 
 		 364 aa  87.8  2e-16  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1507  glycosyl transferase group 1  30.36 
 
 		 395 aa  88.2  2e-16  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  1  normal  0.255833 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0348  glycosyl transferase group 1  31.92 
 
 		 739 aa  87.8  3e-16  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_5286  glycosyl transferase group 1  24.75 
 
 		 409 aa  86.7  6e-16  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0587  glycosyl transferase group 1  23.3 
 
 		 387 aa  86.7  7e-16  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4007  glycosyl transferase, group 1  32.26 
 
 		 390 aa  86.3  8e-16  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.308231  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2597  glycosyl transferase group 1  25.54 
 
 		 367 aa  85.5  0.000000000000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA0154  glycosyl transferase, group 1 family protein  29.3 
 
 		 360 aa  85.5  0.000000000000001  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5273  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.34 
 
 		 366 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  0.0104828  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5670  group 1 family glycosyl transferase  24.34 
 
 		 366 aa  85.9  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.00270519  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1853  glycosyl transferase, group 1  27.83 
 
 		 353 aa  85.5  0.000000000000001  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_4417  glycosyl transferase group 1  34.48 
 
 		 406 aa  85.9  0.000000000000001  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_5214  glycosyl transferase group 1  23.32 
 
 		 369 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00137382  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0201  glycosyl transferase, group 1  36.59 
 
 		 398 aa  84.7  0.000000000000002  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5406  glycosyltransferase  24.67 
 
 		 369 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.000000781684  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0726  glycosyl transferase, group 1  26.13 
 
 		 373 aa  84.3  0.000000000000003  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.173519  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2349  glycosyl transferase group 1  31.93 
 
 		 414 aa  84.3  0.000000000000003  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2283  glycosyl transferase, group 1  23.14 
 
 		 373 aa  84.7  0.000000000000003  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK5117  glycosyltransferase group 1 family protein  24.34 
 
 		 366 aa  84  0.000000000000004  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000816463  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0121  glycosyl transferase group 1  25.06 
 
 		 388 aa  84  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0116  glycosyl transferase, group 1  25.06 
 
 		 388 aa  84  0.000000000000004  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4495  glycosyl transferase group 1  29.85 
 
 		 394 aa  84  0.000000000000004  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5516  glycosyl transferase, group 1 family protein  24.43 
 
 		 366 aa  83.6  0.000000000000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1843  glycosyl transferase group 1  34.07 
 
 		 396 aa  83.6  0.000000000000005  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1004  putative glycosyl transferase, group 1 family protein  32.53 
 
 		 408 aa  83.6  0.000000000000005  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.531302 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_5100  glycosyltransferase group 1 family protein  24.43 
 
 		 366 aa  83.6  0.000000000000006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000151173  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_3565  glycosyl transferase group 1  31.11 
 
 		 390 aa  83.2  0.000000000000007  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0355  glycosyl transferase group 1  27.8 
 
 		 364 aa  82.8  0.000000000000008  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  0.984651 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6499  glycosyl transferase, group 1  32.16 
 
 		 384 aa  82.8  0.000000000000008  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_2861  glycosyl transferase group 1  27.49 
 
 		 366 aa  82.8  0.000000000000009  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2019  glycosyl transferase, group 1  29.96 
 
 		 363 aa  82.8  0.000000000000009  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.891192  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1934  glycosyl transferase, group 1  26.15 
 
 		 446 aa  82.8  0.000000000000009  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.00109377  hitchhiker  0.0000195577 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3700  glycosyl transferase group 1  26.61 
 
 		 373 aa  82  0.00000000000001  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.24149 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5601  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.53 
 
 		 369 aa  82.4  0.00000000000001  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00000123727  n/a   
 
 
-
 
NC_008010  Dgeo_2654  glycosyl transferase, group 1  36.9 
 
 		 388 aa  82  0.00000000000001  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.0179694  n/a   
 
 
-
 
NC_009621  Smed_5686  glycosyl transferase group 1  32.78 
 
 		 1080 aa  82.4  0.00000000000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_1530  glycosyltransferase  23.91 
 
 		 366 aa  82.4  0.00000000000001  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  hitchhiker  0.0000442427  normal  0.18466 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1935  glycosyl transferase group 1  30.48 
 
 		 424 aa  82  0.00000000000001  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1851  glycosyl transferase group 1  24.65 
 
 		 406 aa  81.6  0.00000000000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2380  glycosyl transferase, group 1  29.91 
 
 		 391 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_02220  hypothetical protein  30.1 
 
 		 370 aa  81.6  0.00000000000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2001  glycosyl transferase, group 1  25.45 
 
 		 380 aa  82  0.00000000000002  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4345  glycosyl transferase, group 1  30.63 
 
 		 447 aa  82  0.00000000000002  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_4331  glycosyl transferase group 1  27.62 
 
 		 422 aa  81.6  0.00000000000002  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.0666241 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2453  glycosyl transferase, group 1  26.13 
 
 		 370 aa  81.3  0.00000000000002  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  0.0165094  n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2906  glycosyl transferase group 1  32.84 
 
 		 400 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  0.61318 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2548  glycosyl transferase, group 1  32.35 
 
 		 367 aa  81.6  0.00000000000002  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.742963  normal  0.196776 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0758  glycosyl transferase group 1  28.44 
 
 		 371 aa  81.3  0.00000000000002  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.11154 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_5549  glycosyl transferase, group 1 family protein  23.26 
 
 		 369 aa  80.9  0.00000000000003  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  hitchhiker  0.00000141225  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4262  glycosyl transferase, group 1  24.64 
 
 		 410 aa  80.9  0.00000000000003  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.666553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3244  glycosyl transferase, group 1  25.55 
 
 		 367 aa  80.9  0.00000000000003  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.912834  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2692  glycosyl transferase, group 1  25.44 
 
 		 367 aa  81.3  0.00000000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  unclonable  0.00000000235502  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0693  glycosyl transferase, group 1  22.44 
 
 		 360 aa  80.9  0.00000000000003  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  hitchhiker  0.00441091  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1129  glycosyltransferase  27.8 
 
 		 401 aa  80.5  0.00000000000004  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.30708  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1281  glycosyl transferase group 1  25.25 
 
 		 372 aa  80.9  0.00000000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.282786  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0688  glycosyl transferase, group 1  21.88 
 
 		 348 aa  80.5  0.00000000000004  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA1433  glycosyl transferase, group 1 family protein  32.83 
 
 		 409 aa  80.5  0.00000000000005  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.985375  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_5016  glycosyl transferase, group 1 family protein  33.8 
 
 		 378 aa  80.5  0.00000000000005  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.506111  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3899  glycosyl transferase group 1  31.15 
 
 		 382 aa  80.1  0.00000000000005  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>