73 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nwi_1263 on replicon NC_007406
Organism: Nitrobacter winogradskyi Nb-255



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_007406  Nwi_1263  XRE family transcriptional regulator  100 
 
 		 117 aa  234  3e-61  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.197496  normal  0.35007 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2854  XRE family transcriptional regulator  48.04 
 
 		 128 aa  92.8  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0770075  normal  0.3412 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2614  XRE family transcriptional regulator  48.04 
 
 		 127 aa  92.8  1e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.105443  normal  1 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2662  XRE family transcriptional regulator  48.04 
 
 		 128 aa  92.8  2e-18  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_2752  XRE family transcriptional regulator  35.85 
 
 		 113 aa  72.4  0.000000000002  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.272342  normal  1 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0826  XRE family transcriptional regulator  46.05 
 
 		 96 aa  71.2  0.000000000005  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  hitchhiker  0.000131659  unclonable  0.000000470251 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1745  XRE family transcriptional regulator  39.18 
 
 		 126 aa  61.6  0.000000003  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.00000375519  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1422  transcriptional regulator, XRE family  38.46 
 
 		 652 aa  60.8  0.000000005  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0650  transcriptional regulator, XRE family  34.21 
 
 		 110 aa  52.8  0.000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1448  transcriptional regulator, XRE family  36.11 
 
 		 117 aa  52.4  0.000002  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  0.458013 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0807  XRE family transcriptional regulator  37.5 
 
 		 176 aa  52.4  0.000002  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.163665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0642  XRE family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 161 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.112362  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0635  XRE family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 161 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.453741  normal  0.0430623 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0655  XRE family transcriptional regulator  36.11 
 
 		 161 aa  51.6  0.000003  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.0535888  normal  1 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_1318  transcriptional regulator, XRE family  35.71 
 
 		 135 aa  50.8  0.000005  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0908  XRE family transcriptional regulator  38.24 
 
 		 121 aa  50.8  0.000006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0101  XRE family transcriptional regulator  34.72 
 
 		 182 aa  50.8  0.000007  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.0310115  normal  1 
 
 
-
 
NC_014150  Bmur_1900  transcriptional regulator, XRE family  37.5 
 
 		 104 aa  50.1  0.00001  Brachyspira murdochii DSM 12563  Bacteria  decreased coverage  1.43236e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_0407  transcriptional regulator  30.59 
 
 		 108 aa  48.9  0.00002  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_1462  transcriptional regulator, XRE family  35.56 
 
 		 114 aa  48.9  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2824  XRE family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 111 aa  49.3  0.00002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.829687  n/a   
 
 
-
 
NC_007483  Noc_A0038  XRE family transcriptional regulator  29.41 
 
 		 111 aa  48.1  0.00003  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0773  helix-turn-helix domain protein  36.11 
 
 		 141 aa  47.4  0.00006  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4622  transcriptional regulator, XRE family  39.39 
 
 		 170 aa  46.6  0.0001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.759922  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1064  transcriptional regulator, XRE family  31.37 
 
 		 206 aa  46.6  0.0001  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0300833  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10482  transcriptional regulator  34.67 
 
 		 140 aa  46.2  0.0001  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3659  transcriptional regulator, XRE family  38.57 
 
 		 128 aa  45.8  0.0002  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.391703  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3931  transcriptional regulator, XRE family  41.67 
 
 		 253 aa  45.8  0.0002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.183179  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0840  transcriptional regulator, XRE family  43.08 
 
 		 162 aa  45.1  0.0003  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0310  XRE family transcriptional regulator  30.67 
 
 		 474 aa  45.4  0.0003  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_17420  predicted transcriptional regulator  30.3 
 
 		 414 aa  45.1  0.0003  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.697974  normal  1 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_0012  transcriptional regulator  36.76 
 
 		 131 aa  44.7  0.0004  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.388282  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_02480  Helix-turn-helix protein  35.38 
 
 		 156 aa  44.3  0.0005  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.251654  normal  0.974666 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0460  XRE family transcriptional regulator  36.92 
 
 		 325 aa  44.3  0.0006  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.321413 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1522  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 68 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.379498  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1891  XRE family transcriptional regulator  40.68 
 
 		 121 aa  43.9  0.0007  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.195255  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_2436  XRE family transcriptional regulator  33.33 
 
 		 68 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  0.109963  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0148  transcriptional regulator, XRE family  32.86 
 
 		 134 aa  43.9  0.0007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0214  XRE family transcriptional regulator  28.24 
 
 		 131 aa  43.9  0.0007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1427  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 68 aa  43.9  0.0007  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0371  XRE family transcriptional regulator  36.62 
 
 		 91 aa  43.1  0.001  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  0.340091  normal  0.26916 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0315  helix-turn-helix domain-containing protein  30.19 
 
 		 133 aa  43.5  0.001  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00000138688  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2021  transcriptional regulator, XRE family  25 
 
 		 500 aa  43.1  0.001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_277  DNA-binding protein  33.78 
 
 		 133 aa  43.1  0.001  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  hitchhiker  0.000000765574  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1444  helix-turn-helix domain-containing protein  34.38 
 
 		 68 aa  43.1  0.001  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.557197  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1025  helix-turn-helix domain-containing protein  31.58 
 
 		 130 aa  42.4  0.002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  hitchhiker  0.00102853  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4201  helix-turn-helix domain-containing protein  31.88 
 
 		 128 aa  42.4  0.002  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2180  transcriptional regulator, XRE family  34.67 
 
 		 101 aa  42.4  0.002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.165219  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6157  XRE family transcriptional regulator  35.38 
 
 		 277 aa  42.7  0.002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.540338  normal  0.674007 
 
 
-
 
NC_002936  DET0336  DNA-binding protein, putative  34.25 
 
 		 133 aa  42  0.003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.00628261  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0695  transcriptional regulator, XRE family  34.92 
 
 		 101 aa  41.6  0.004  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.381064  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0488  XRE family transcriptional regulator  34.33 
 
 		 145 aa  41.6  0.004  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.578439  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20950  putative prophage repressor  36.51 
 
 		 200 aa  41.6  0.004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000578065  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1276  transcriptional regulator, XRE family  31.75 
 
 		 69 aa  41.2  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1193  helix-turn-helix domain-containing protein  32.26 
 
 		 68 aa  41.2  0.004  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.67349  normal  1 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1147  XRE family transcriptional regulator  31.75 
 
 		 69 aa  41.2  0.004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1953  transcriptional regulator, XRE family  29.58 
 
 		 131 aa  41.2  0.004  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1207  transcriptional regulator, XRE family  31.75 
 
 		 69 aa  41.2  0.004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.12255  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_4719  transcriptional regulator, XRE family  31.4 
 
 		 156 aa  41.2  0.005  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1197  XRE family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 107 aa  40.8  0.005  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.0325651  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1003  XRE family transcriptional regulator  31.65 
 
 		 107 aa  40.8  0.006  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.77905  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4414  immunity repressor protein  31.88 
 
 		 139 aa  40.4  0.007  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_6329  putative transcriptional regulator, XRE family  32.81 
 
 		 407 aa  40.8  0.007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.523133 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_1032  helix-turn-helix domain-containing protein  40.48 
 
 		 162 aa  40.8  0.007  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_0931  transcriptional regulator, XRE family  33.33 
 
 		 99 aa  40.4  0.008  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009340  Mflv_5593  XRE family transcriptional regulator  32.43 
 
 		 118 aa  40.4  0.008  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_3236  transcriptional regulator, XRE family  32.08 
 
 		 113 aa  40.4  0.009  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  0.355166  n/a   
 
 
-
 
NC_002967  TDE0079  DNA-binding protein  32.84 
 
 		 191 aa  40  0.01  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1613  Cro/CI family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 470 aa  40  0.01  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.1413  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1557  Cro/CI family transcriptional regulator  31.08 
 
 		 470 aa  40  0.01  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4828  XRE family transcriptional regulator  30.39 
 
 		 123 aa  40  0.01  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_4469  helix-turn-helix domain-containing protein  31.88 
 
 		 209 aa  40  0.01  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_4933  transcriptional regulator, XRE family  31.88 
 
 		 209 aa  40  0.01  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.131947  normal  0.360863 
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>