215 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_2257 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010718  Nther_2257  amidophosphoribosyltransferase-like protein  100 
 
 		 303 aa  621  1e-177  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.0114297  normal  1 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2936  competence protein F, putative  26.15 
 
 		 243 aa  85.1  0.000000000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0346269  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0447  phosphoribosyltransferase  27.34 
 
 		 229 aa  79.7  0.00000000000005  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.300519  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4754  phosphoribosyltransferase  26.67 
 
 		 276 aa  75.9  0.0000000000008  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  0.00000000000000245098  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET1458  comF family protein, putative  28.79 
 
 		 233 aa  74.7  0.000000000002  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  unclonable  0.00000115929  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_1236  ComF  30.52 
 
 		 233 aa  74.7  0.000000000002  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.105721  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0559  phosphoribosyltransferase  26.56 
 
 		 248 aa  73.9  0.000000000003  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.230828  normal  1 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_1495  phosphoribosyltransferase  28.63 
 
 		 217 aa  73.6  0.000000000004  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_5199  hypothetical protein  26.77 
 
 		 243 aa  73.2  0.000000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0225  phosphoribosyltransferase  31.77 
 
 		 222 aa  72.8  0.000000000007  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000000513263  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_1259  amidophosphoribosyltransferase-like protein  27.27 
 
 		 233 aa  72.8  0.000000000007  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  decreased coverage  0.00000170778  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_3746  hypothetical protein  24.8 
 
 		 219 aa  70.5  0.00000000003  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.345034 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1875  amidophosphoribosyltransferase-like protein  26.13 
 
 		 215 aa  70.5  0.00000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0387  amidophosphoribosyltransferase-like protein  26.03 
 
 		 243 aa  70.1  0.00000000004  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.336558  normal  0.927727 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0383  competence protein F  25.52 
 
 		 255 aa  70.1  0.00000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.366991  normal  0.800288 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0361  competence protein ComF, putative  26.03 
 
 		 243 aa  68.6  0.0000000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2404  hypothetical protein  23.72 
 
 		 246 aa  68.6  0.0000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  decreased coverage  0.0000861354  normal  0.0119521 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4125  amidophosphoribosyltransferase-like protein  26.29 
 
 		 238 aa  68.6  0.0000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  unclonable  0.000000000102342  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1047  amidophosphoribosyltransferase family protein  31.1 
 
 		 221 aa  67.4  0.0000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_2675  competence protein F  23.78 
 
 		 253 aa  67  0.0000000004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.222101  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16480  amidophosphoribosyltransferase  26.01 
 
 		 243 aa  66.6  0.0000000005  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  2.58809e-17  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4202  phosphoribosyltransferase  25.7 
 
 		 213 aa  66.6  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.0030984 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1907  phosphoribosyltransferase  21.84 
 
 		 279 aa  66.6  0.0000000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000754112  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0124  competence protein F, putative  27.86 
 
 		 238 aa  66.2  0.0000000006  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_2863  phosphoribosyltransferase  26.01 
 
 		 242 aa  65.9  0.0000000007  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0938  competence protein ComF, putative  24.15 
 
 		 207 aa  65.9  0.0000000008  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  0.536329 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1124  competence protein F  24.56 
 
 		 233 aa  65.9  0.0000000009  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0307  competence protein F  25.42 
 
 		 255 aa  65.9  0.0000000009  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  0.387643 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_4688  phosphoribosyltransferase  25 
 
 		 244 aa  65.1  0.000000001  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.482553  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_0911  hypothetical protein  25.11 
 
 		 255 aa  65.5  0.000000001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.466894  normal  1 
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_3540  ComF family protein  25.56 
 
 		 242 aa  65.1  0.000000001  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_0797  amidophosphoribosyltransferase-like protein  25.21 
 
 		 206 aa  65.5  0.000000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.582256  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_0391  phosphoribosyltransferase  25 
 
 		 243 aa  64.7  0.000000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  0.214316 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0126  putative phosphoribosyltransferase  29.58 
 
 		 260 aa  65.1  0.000000002  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0837099  normal  0.0454325 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3894  phosphoribosyltransferase  26.59 
 
 		 259 aa  64.7  0.000000002  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.148595 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1736  phosphoribosyltransferase  30.32 
 
 		 258 aa  64.3  0.000000002  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3333  phosphoribosyltransferase  26.17 
 
 		 242 aa  63.5  0.000000004  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_2102  competence protein F  25.49 
 
 		 246 aa  63.2  0.000000005  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_5177  phosphoribosyltransferase  24.57 
 
 		 246 aa  62.8  0.000000006  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  0.039124  normal  0.248772 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2731  competence protein F, putative  24.47 
 
 		 245 aa  63.2  0.000000006  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  unclonable  0.000000000243751  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4886  comF operon protein 3  23.95 
 
 		 234 aa  62.8  0.000000008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3629  competence protein ComF  24.45 
 
 		 252 aa  62.4  0.000000008  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0976  hypothetical protein  24.15 
 
 		 229 aa  62  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.0430992  normal  1 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2437  competence protein F  25.59 
 
 		 262 aa  62.4  0.00000001  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  1  normal  0.104634 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0569  competence protein F, putative  26.67 
 
 		 249 aa  62.4  0.00000001  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2248  phosphoribosyltransferase  23.55 
 
 		 220 aa  61.6  0.00000001  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.000079712  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3242  phosphoribosyltransferase  27.93 
 
 		 235 aa  61.6  0.00000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.284089  normal  1 
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_0493  competence protein ComF, putative  23.29 
 
 		 244 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A4174  putative competence protein f-related protein  25.35 
 
 		 261 aa  61.2  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_4841  competence protein ComF  25.29 
 
 		 245 aa  61.2  0.00000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.399762  normal  1 
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1381  phosphoribosyltransferase protein-like protein  25.36 
 
 		 229 aa  61.2  0.00000002  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.431166  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2108  phosphoribosyltransferase  29.33 
 
 		 269 aa  60.5  0.00000003  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.227962  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5516  phosphoribosyltransferase  25.78 
 
 		 239 aa  60.8  0.00000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4633  gluconate periplasmic binding protein  25.11 
 
 		 227 aa  60.5  0.00000004  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_05970  amidophosphoribosyltransferase  30.41 
 
 		 238 aa  60.1  0.00000004  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.096525  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0548  amidophosphoribosyltransferase  24.12 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0531  hypothetical protein  24.12 
 
 		 217 aa  60.1  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0617  phosphoribosyltransferase  26.62 
 
 		 247 aa  59.7  0.00000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_0235  gluconate periplasmic binding protein  25.51 
 
 		 239 aa  59.3  0.00000007  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3532  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  26.85 
 
 		 258 aa  59.3  0.00000007  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0351  competence protein F  25.34 
 
 		 255 aa  59.3  0.00000007  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.733482  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_02872  competence protein F  29.3 
 
 		 118 aa  59.3  0.00000008  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_3090  phosphoribosyltransferase  24.76 
 
 		 255 aa  59.3  0.00000008  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.318018  normal  0.255488 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_0480  phosphoribosyltransferase  23.13 
 
 		 270 aa  59.3  0.00000008  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3970  competence protein F  26.04 
 
 		 236 aa  59.3  0.00000008  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0188  phosphoribosyltransferase  24.22 
 
 		 239 aa  58.9  0.0000001  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.138467  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2264  phosphoribosyltransferase  25.82 
 
 		 255 aa  58.5  0.0000001  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.200709  normal  1 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4871  comF operon protein 3  23.29 
 
 		 234 aa  57.8  0.0000002  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0939  phosphoribosyltransferase  24.3 
 
 		 215 aa  57.8  0.0000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  0.430972 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0385  phosphoribosyltransferase  23.45 
 
 		 271 aa  58.2  0.0000002  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.543655  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_1977  hypothetical protein  24.5 
 
 		 231 aa  58.2  0.0000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4986  comF operon protein 3  23.03 
 
 		 234 aa  57.4  0.0000003  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0877  phosphoribosyltransferase  22.47 
 
 		 232 aa  57  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_2183  competence protein F  25.22 
 
 		 256 aa  56.6  0.0000004  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.0808644  normal  1 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3823  competence protein F (phosphoribosyltransferase protein)  25.46 
 
 		 258 aa  57  0.0000004  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008309  HS_1490  competence protein  24.55 
 
 		 232 aa  57  0.0000004  Haemophilus somnus 129PT  Bacteria  normal  0.923217  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_5425  ComF operon protein 3  24.1 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000005  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.412025  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_5281  comF operon protein 3  24.1 
 
 		 190 aa  56.6  0.0000005  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000208608 
 
 
-
 
NC_008783  BARBAKC583_0367  comF family protein  23.78 
 
 		 251 aa  56.6  0.0000005  Bartonella bacilliformis KC583  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0248  amidophosphoribosyltransferase  22.42 
 
 		 245 aa  56.2  0.0000006  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  0.067407  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A5311  comF operon protein 3  23.53 
 
 		 190 aa  56.2  0.0000007  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.0506612  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS5041  comF operon protein 3  24.1 
 
 		 234 aa  55.8  0.0000008  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_3978  amidophosphoribosyltransferase  25.58 
 
 		 247 aa  55.5  0.000001  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.00000000228235  hitchhiker  0.000000230998 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A3184  putative phosphoribosyl transferase  25.68 
 
 		 230 aa  55.1  0.000001  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  1  normal  0.392419 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7594  putative competence protein F (COMF)  24.44 
 
 		 267 aa  55.5  0.000001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  0.0419159 
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4118  gluconate periplasmic binding protein  23.43 
 
 		 233 aa  55.1  0.000002  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014230  CA2559_01730  putative amidophosphoribosyl-transferase  29.55 
 
 		 226 aa  54.7  0.000002  Croceibacter atlanticus HTCC2559  Bacteria  normal  0.398316  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1140  phosphoribosyltransferase  22.26 
 
 		 264 aa  55.1  0.000002  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  0.0794906  normal  0.739937 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_0273  putative competence protein F-related protein  20.07 
 
 		 268 aa  53.9  0.000003  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.317287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1242  hypothetical protein  25.79 
 
 		 271 aa  53.9  0.000003  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5646  comF operon protein 3  22.96 
 
 		 190 aa  53.9  0.000003  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.740013  hitchhiker  0.00000001662 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2902  competence protein F, putative  23.75 
 
 		 243 aa  54.3  0.000003  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_4090  amidophosphoribosyltransferase-like protein  23.3 
 
 		 246 aa  53.9  0.000003  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0165  phosphoribosyltransferase  24.54 
 
 		 223 aa  54.3  0.000003  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  decreased coverage  0.0000298653  n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_3925  gluconate periplasmic binding protein  22.62 
 
 		 233 aa  53.5  0.000004  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_3856  phosphoribosyltransferase  24.25 
 
 		 232 aa  53.5  0.000004  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2633  amidophosphoribosyltransferase-like protein  22.84 
 
 		 240 aa  53.5  0.000004  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_3823  competence protein F  24.69 
 
 		 231 aa  53.1  0.000006  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.523279  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0541  phosphoribosyltransferase  23.59 
 
 		 261 aa  53.1  0.000006  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.380195  normal  1 
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I0423  ComF family protein  23.49 
 
 		 255 aa  52.8  0.000008  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>