181 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nther_0154 on replicon NC_010718
Organism: Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010718  Nther_0154  apurinic endonuclease Apn1  100 
 
 
284 aa  585  1e-166  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.342426  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07910  apurinic endonuclease Apn1  37.68 
 
 
278 aa  203  3e-51  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0185  apurinic endonuclease Apn1  35.74 
 
 
276 aa  196  3e-49  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.635232  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1744  apurinic endonuclease Apn1  37.86 
 
 
282 aa  196  4.0000000000000005e-49  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  hitchhiker  0.0098767  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_2402  apurinic endonuclease Apn1  35.38 
 
 
276 aa  193  2e-48  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.683524  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2551  apurinic endonuclease Apn1  37.14 
 
 
286 aa  193  3e-48  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0654  apurinic endonuclease Apn1  35.48 
 
 
281 aa  192  7e-48  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0638  apurinic endonuclease Apn1  35.97 
 
 
282 aa  191  1e-47  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.920931  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0549  apurinic endonuclease Apn1  38.27 
 
 
289 aa  190  2e-47  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0406  apurinic endonuclease Apn1  35.02 
 
 
291 aa  188  9e-47  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  0.0163374  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_1968  apurinic endonuclease Apn1  34.52 
 
 
286 aa  184  1.0000000000000001e-45  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal  0.163854 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1685  apurinic endonuclease Apn1  37.45 
 
 
296 aa  180  2e-44  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0614  apurinic endonuclease Apn1  36.69 
 
 
293 aa  179  4e-44  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.820419  normal  0.0550538 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0531  apurinic endonuclease Apn1  34.81 
 
 
291 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.888127 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0453  apurinic endonuclease Apn1  35.48 
 
 
283 aa  173  1.9999999999999998e-42  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.00920847  n/a   
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_1834  apurinic endonuclease Apn1  34.64 
 
 
282 aa  174  1.9999999999999998e-42  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.0300993  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0969  apurinic endonuclease Apn1  33.45 
 
 
295 aa  173  1.9999999999999998e-42  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_1402  apurinic endonuclease Apn1  37.5 
 
 
283 aa  172  5e-42  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.21791  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1627  apurinic endonuclease Apn1  35.64 
 
 
293 aa  171  1e-41  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00209687  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0947  apurinic endonuclease Apn1  34.35 
 
 
292 aa  170  2e-41  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.00857924  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0659  apurinic endonuclease Apn1  32.97 
 
 
326 aa  169  3e-41  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0356  apurinic endonuclease Apn1  34.17 
 
 
283 aa  169  7e-41  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.0248399  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1782  apurinic endonuclease (APN1)  32.13 
 
 
286 aa  168  1e-40  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_0226  endonuclease IV  35 
 
 
281 aa  167  2e-40  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1814  apurinic endonuclease Apn1  36.96 
 
 
287 aa  167  2e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.602458  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2988  apurinic endonuclease Apn1  31.72 
 
 
289 aa  166  2.9999999999999998e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3071  endonuclease IV  33.83 
 
 
282 aa  166  4e-40  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000208028  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_0337  apurinic endonuclease Apn1  32.73 
 
 
283 aa  166  5e-40  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.75145e-30 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0383  apurinic endonuclease Apn1  35.31 
 
 
289 aa  165  9e-40  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.469557  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2908  apurinic endonuclease Apn1  35.23 
 
 
287 aa  165  9e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.112339  normal  0.154844 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2994  endonuclease IV  33.93 
 
 
285 aa  164  1.0000000000000001e-39  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.097029  normal  0.446678 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1326  endonuclease IV  33.57 
 
 
328 aa  163  2.0000000000000002e-39  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0570  apurinic endonuclease Apn1  36.6 
 
 
287 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU0529  endonuclease IV  33.96 
 
 
296 aa  163  3e-39  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.143061  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1956  endonuclease IV  36.5 
 
 
293 aa  163  3e-39  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_1668  endonuclease IV  33.46 
 
 
297 aa  162  5.0000000000000005e-39  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3584  apurinic endonuclease Apn1  33.94 
 
 
281 aa  161  1e-38  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0211601  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0064  apurinic endonuclease Apn1  33.21 
 
 
279 aa  160  2e-38  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.751168 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3914  apurinic endonuclease Apn1  31.65 
 
 
282 aa  159  7e-38  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_1735  endonuclease IV  34.73 
 
 
296 aa  157  1e-37  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  normal  0.652839 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_1286  apurinic endonuclease Apn1  34.16 
 
 
283 aa  157  1e-37  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.218784  normal  0.414124 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0556  apurinic endonuclease Apn1  34.72 
 
 
287 aa  155  7e-37  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.00064756  n/a   
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2402  endonuclease IV  32.73 
 
 
294 aa  154  2e-36  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.0690778  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_1738  apurinic endonuclease Apn1  33.45 
 
 
279 aa  153  2e-36  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000624135  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1704  endonuclease IV  32.7 
 
 
283 aa  151  1e-35  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3037  apurinic endonuclease Apn1  31.91 
 
 
286 aa  150  2e-35  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0139303  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1050  endonuclease IV  32.27 
 
 
275 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1177  apurinic endonuclease Apn1  31.56 
 
 
275 aa  150  2e-35  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1106  apurinic endonuclease Apn1  31.56 
 
 
275 aa  150  3e-35  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3605  apurinic endonuclease Apn1  34.42 
 
 
289 aa  149  5e-35  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.637243 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_1100  apurinic endonuclease Apn1  32.62 
 
 
280 aa  149  5e-35  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_21620  apurinic endonuclease APN1  32.82 
 
 
280 aa  149  5e-35  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.483925  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1147  endonuclease IV  33.8 
 
 
289 aa  146  4.0000000000000006e-34  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2406  endonuclease IV  34.44 
 
 
298 aa  145  6e-34  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.794114  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2857  apurinic endonuclease Apn1  33.33 
 
 
277 aa  145  6e-34  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_0897  apurinic endonuclease Apn1  30.83 
 
 
300 aa  143  4e-33  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00175083 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_1356  apurinic endonuclease Apn1  34.89 
 
 
266 aa  142  6e-33  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  0.0191838  normal  0.257421 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_1882  endonuclease IV  31.39 
 
 
284 aa  142  8e-33  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  normal  0.0101436 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_1981  endonuclease IV  33.46 
 
 
284 aa  142  8e-33  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0165  endonuclease IV  34.44 
 
 
299 aa  141  9.999999999999999e-33  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1615  endonuclease IV  34.91 
 
 
296 aa  139  6e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.264651  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1649  endonuclease IV  34.91 
 
 
296 aa  139  6e-32  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.013206  n/a   
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_1274  apurinic endonuclease Apn1  30.29 
 
 
289 aa  139  6e-32  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.0481447 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3481  apurinic endonuclease Apn1  32.27 
 
 
287 aa  139  7.999999999999999e-32  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  normal  0.0239086 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_01100  apurinic endonuclease APN1  32.65 
 
 
260 aa  138  8.999999999999999e-32  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0835  apurinic endonuclease Apn1  31.25 
 
 
277 aa  138  1e-31  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.995182  n/a   
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2282  endonuclease IV  29.3 
 
 
280 aa  138  1e-31  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000448343  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1123  endonuclease IV  33.7 
 
 
296 aa  137  2e-31  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.212537  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1687  apurinic endonuclease Apn1  31.32 
 
 
277 aa  136  4e-31  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1017  apurinic endonuclease Apn1  32.96 
 
 
282 aa  135  8e-31  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0985  endonuclease IV  32.31 
 
 
287 aa  135  9e-31  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002620  TC0914  endonuclease IV  32.01 
 
 
288 aa  134  9.999999999999999e-31  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1768  endonuclease IV  30.68 
 
 
290 aa  135  9.999999999999999e-31  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.0578127  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_0845  apurinic endonuclease Apn1  30.77 
 
 
277 aa  134  9.999999999999999e-31  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.220183  normal 
 
 
-
 
NC_007514  Cag_0528  endonuclease IV  29.67 
 
 
282 aa  134  1.9999999999999998e-30  Chlorobium chlorochromatii CaD3  Bacteria  unclonable  0.00000000000858771  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3254  apurinic endonuclease Apn1  32.16 
 
 
286 aa  134  1.9999999999999998e-30  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.238578 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3316  apurinic endonuclease Apn1  31.3 
 
 
296 aa  134  1.9999999999999998e-30  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.876706  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2770  Deoxyribonuclease IV (phage-T(4)-induced)  33.09 
 
 
283 aa  133  3e-30  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.416579  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1083  apurinic endonuclease Apn1  29.23 
 
 
283 aa  133  3e-30  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0228384  normal  0.0872132 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_2033  apurinic endonuclease Apn1  34.18 
 
 
282 aa  132  5e-30  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.576144  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_1124  endonuclease IV  28.62 
 
 
279 aa  129  4.0000000000000003e-29  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_1499  apurinic endonuclease Apn1  31.44 
 
 
285 aa  129  7.000000000000001e-29  Escherichia coli DH1  Bacteria  hitchhiker  0.000000000022557  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_3295  endonuclease IV  31.44 
 
 
285 aa  129  7.000000000000001e-29  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.11698  normal  0.148014 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A2442  endonuclease IV  30 
 
 
285 aa  129  7.000000000000001e-29  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  0.155245  normal  0.685993 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_0486  endonuclease IV  31.18 
 
 
283 aa  128  8.000000000000001e-29  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  0.631384  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_02088  endonuclease IV  31.44 
 
 
285 aa  128  9.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.0380549  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_02047  hypothetical protein  31.44 
 
 
285 aa  128  9.000000000000001e-29  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.0302541  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A2553  endonuclease IV  30 
 
 
285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.764772  hitchhiker  0.000695113 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C2439  endonuclease IV  30 
 
 
285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.26562  hitchhiker  0.00122179 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B2351  endonuclease IV  30 
 
 
285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  hitchhiker  0.0000082686  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A2395  endonuclease IV  30.8 
 
 
285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.881879  hitchhiker  0.00046987 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A2295  endonuclease IV  31.44 
 
 
285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_2456  endonuclease IV  31.44 
 
 
285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_1489  endonuclease IV  31.44 
 
 
285 aa  128  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  hitchhiker  0.00000729188  normal  0.0153717 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_2306  endonuclease IV  31.44 
 
 
285 aa  127  1.0000000000000001e-28  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0013882 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1070  apurinic endonuclease Apn1  29.56 
 
 
284 aa  127  2.0000000000000002e-28  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.858381  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_1179  deoxyribonuclease IV (phage-T(4)-induced)  28.47 
 
 
286 aa  126  4.0000000000000003e-28  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_1303  endonuclease IV  29.32 
 
 
300 aa  126  4.0000000000000003e-28  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1235  apurinic endonuclease Apn1  29.72 
 
 
278 aa  126  4.0000000000000003e-28  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2483  apurinic endonuclease Apn1  31.66 
 
 
277 aa  126  5e-28  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.590577  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>