More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_4107 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008699  Noca_4107  enoyl-CoA hydratase  100 
 
 
263 aa  518  1e-146  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.540982  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0485  enoyl-CoA hydratase  39.15 
 
 
261 aa  181  1e-44  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.474885  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2224  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  44.11 
 
 
260 aa  178  7e-44  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0549039  hitchhiker  0.0000374036 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0274  enoyl-CoA hydratase  38.76 
 
 
262 aa  177  2e-43  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.960297  normal  0.314622 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_7538  enoyl-CoA hydratase  37.4 
 
 
264 aa  172  5.999999999999999e-42  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_2068  enoyl-CoA hydratase  49.4 
 
 
259 aa  171  1e-41  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.847679  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0815  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.84 
 
 
257 aa  170  2e-41  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.731883  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4351  enoyl-CoA hydratase  38.78 
 
 
282 aa  169  3e-41  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0852  enoyl-CoA hydratase/isomerase  44.49 
 
 
265 aa  168  7e-41  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.938482  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5557  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.22 
 
 
264 aa  168  9e-41  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1993  enoyl-CoA hydratase  37.36 
 
 
294 aa  167  1e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_4597  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.16 
 
 
266 aa  166  4e-40  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.937217 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0786  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  45.42 
 
 
260 aa  165  5.9999999999999996e-40  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.994732  n/a   
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3622  enoyl-CoA hydratase  40.45 
 
 
268 aa  163  2.0000000000000002e-39  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.538204  n/a   
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0080  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.02 
 
 
266 aa  163  3e-39  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1754  enoyl-CoA hydratase  40.89 
 
 
276 aa  161  8.000000000000001e-39  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1773  enoyl-CoA hydratase  40.89 
 
 
281 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.493322  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1820  enoyl-CoA hydratase  40.89 
 
 
281 aa  161  1e-38  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_0420  enoyl-CoA hydratase  37.45 
 
 
270 aa  161  1e-38  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.697882  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0111  enoyl-CoA hydratase  38.02 
 
 
275 aa  160  2e-38  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.503929  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3272  enoyl-CoA hydratase  40.23 
 
 
266 aa  159  3e-38  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.0614086 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0691  enoyl-CoA hydratase  36.5 
 
 
270 aa  159  4e-38  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0603  enoyl-CoA hydratase  37.36 
 
 
267 aa  158  7e-38  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0110461  normal  0.0769343 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0555  enoyl-CoA hydratase  37.98 
 
 
262 aa  157  1e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.323488  normal  0.0688647 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_06370  Enoyl-CoA hydratase  45.83 
 
 
283 aa  157  2e-37  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.622554  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2626  enoyl-CoA hydratase  38.4 
 
 
263 aa  157  2e-37  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.0588068 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2453  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.15 
 
 
267 aa  157  2e-37  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000878614 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4801  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.64 
 
 
271 aa  157  2e-37  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.517511  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2180  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.76 
 
 
264 aa  156  3e-37  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.470778  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2341  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  43.24 
 
 
266 aa  155  5.0000000000000005e-37  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.829982  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1304  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.79 
 
 
271 aa  155  6e-37  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.285704 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2037  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.93 
 
 
264 aa  155  8e-37  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0054  enoyl-CoA hydratase  38.15 
 
 
270 aa  155  9e-37  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3100  enoyl-CoA hydratase  38.43 
 
 
263 aa  154  1e-36  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.26522  hitchhiker  0.000108196 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_3163  enoyl-CoA hydratase  39.85 
 
 
280 aa  153  2e-36  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  hitchhiker  0.000989513  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3163  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.98 
 
 
261 aa  153  2.9999999999999998e-36  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.125416  normal 
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A3282  enoyl-CoA hydratase / short chain enoyl-CoA hydratase  40.6 
 
 
261 aa  153  2.9999999999999998e-36  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0639  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.43 
 
 
262 aa  153  2.9999999999999998e-36  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.108232  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3726  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.49 
 
 
264 aa  152  4e-36  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.297829  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_3726  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.38 
 
 
258 aa  152  4e-36  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.452007  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7128  enoyl-CoA hydratase  36.8 
 
 
265 aa  152  5e-36  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0269  enoyl-CoA hydratase  37.7 
 
 
259 aa  152  5.9999999999999996e-36  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.453887  normal 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2613  enoyl-CoA hydratase  36.5 
 
 
263 aa  152  7e-36  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.870505  normal  0.148892 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3841  enoyl-CoA hydratase  37.55 
 
 
270 aa  152  8e-36  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.198619  normal  0.203847 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7935  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.96 
 
 
267 aa  151  8.999999999999999e-36  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3213  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.09 
 
 
267 aa  151  8.999999999999999e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3684  enoyl-CoA hydratase  34.46 
 
 
269 aa  151  1e-35  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.981735  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3917  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.02 
 
 
271 aa  150  1e-35  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2863  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.09 
 
 
257 aa  150  2e-35  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2636  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.84 
 
 
274 aa  150  2e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.768032  normal  0.556061 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_0629  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.69 
 
 
265 aa  149  3e-35  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.78613  normal  0.0668742 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0810  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.43 
 
 
269 aa  149  4e-35  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.748292  normal  0.305394 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2057  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  38.85 
 
 
278 aa  149  4e-35  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0685085  normal  0.0230217 
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0750  enoyl-CoA hydratase/isomerase  32.58 
 
 
265 aa  149  4e-35  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  normal  0.276485 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A0984  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  42.7 
 
 
266 aa  149  4e-35  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  0.540223  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1147  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.37 
 
 
275 aa  149  5e-35  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3812  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.36 
 
 
260 aa  148  8e-35  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  0.163737  n/a   
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_0753  enoyl-CoA hydratase  32.36 
 
 
265 aa  147  1.0000000000000001e-34  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  normal  0.33751 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_1808  enoyl-CoA hydratase  37.16 
 
 
280 aa  147  1.0000000000000001e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.399068  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_4073  enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.53 
 
 
258 aa  147  1.0000000000000001e-34  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.581265 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_3834  enoyl-CoA hydratase  36.64 
 
 
262 aa  148  1.0000000000000001e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_4207  enoyl-CoA hydratase/isomerase  40.56 
 
 
270 aa  147  2.0000000000000003e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.686575  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2808  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  39.69 
 
 
262 aa  147  2.0000000000000003e-34  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000172921  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_5524  enoyl-CoA hydratase  39.78 
 
 
263 aa  147  2.0000000000000003e-34  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.854664  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_3629  enoyl-CoA hydratase  37.16 
 
 
270 aa  147  2.0000000000000003e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.486389  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1625  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41.6 
 
 
259 aa  147  3e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.0454555 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6043  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.9 
 
 
258 aa  146  3e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5150  enoyl-CoA hydratase  37.74 
 
 
264 aa  146  3e-34  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.258357  normal  0.801479 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2476  enoyl-CoA hydratase  36.67 
 
 
263 aa  146  4.0000000000000006e-34  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0811  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.71 
 
 
281 aa  145  5e-34  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.7195  normal  0.177861 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3018  enoyl-CoA hydratase/isomerase  43.35 
 
 
273 aa  145  5e-34  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0224  phenylacetate degradation, enoyl-CoA hydratase paaB  35 
 
 
262 aa  145  8.000000000000001e-34  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal  0.186635 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3603  enoyl-CoA hydratase/isomerase  38.06 
 
 
264 aa  145  8.000000000000001e-34  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal  0.158658 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4030  enoyl-CoA hydratase  36.78 
 
 
280 aa  145  9e-34  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal  0.697919 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3871  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.45 
 
 
263 aa  145  9e-34  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.266339 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1300  short chain enoyl-CoA hydratase / enoyl-CoA hydratase  38.76 
 
 
256 aa  145  9e-34  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.132411  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0063  enoyl-CoA hydratase  35.97 
 
 
262 aa  144  1e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2372  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.93 
 
 
290 aa  144  1e-33  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00516706  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2378  enoyl-CoA hydratase  36.98 
 
 
257 aa  144  2e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0269514  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1063  enoyl-CoA hydratase  37.31 
 
 
266 aa  143  2e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0298  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.4 
 
 
262 aa  143  2e-33  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.342394 
 
 
-
 
NC_010676  Bphyt_5771  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.74 
 
 
260 aa  143  2e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal  0.606655 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2034  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.3 
 
 
266 aa  144  2e-33  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.868532  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2302  enoyl-CoA hydratase/isomerase  35.36 
 
 
261 aa  144  2e-33  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1893  enoyl-CoA hydratase  36.33 
 
 
266 aa  143  3e-33  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8421  enoyl-CoA hydratase  41.83 
 
 
261 aa  143  3e-33  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.629328  normal 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_1897  enoyl-CoA hydratase  36.64 
 
 
260 aa  143  3e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  0.248521  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0344  enoyl-CoA hydratase  38.1 
 
 
256 aa  143  3e-33  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.458261  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2177  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.9 
 
 
255 aa  142  4e-33  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0592  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.88 
 
 
259 aa  142  4e-33  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3283  enoyl-CoA hydratase  35.36 
 
 
263 aa  142  5e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_3661  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.93 
 
 
258 aa  142  5e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.57083  hitchhiker  9.492269999999999e-21 
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_3263  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.9 
 
 
267 aa  142  5e-33  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  0.0768349  normal 
 
 
-
 
NC_009427  Saro_3447  enoyl-CoA hydratase/isomerase  41 
 
 
261 aa  142  6e-33  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2158  Enoyl-CoA hydratase/isomerase  42.02 
 
 
277 aa  142  6e-33  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.83195  normal  0.489603 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1205  enoyl-CoA hydratase  40.15 
 
 
264 aa  142  6e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.755368  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4110  short chain enoyl-CoA hydratase  36.3 
 
 
265 aa  142  7e-33  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.741375  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_0110  enoyl-CoA hydratase/isomerase  36.47 
 
 
264 aa  141  8e-33  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  normal  0.411949 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_1567  enoyl-CoA hydratase/isomerase  37.12 
 
 
273 aa  141  9e-33  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.870859  normal 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_0090  enoyl-CoA hydratase  35.97 
 
 
262 aa  141  9e-33  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>