More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0697 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0697  50S ribosomal protein L1P  100 
 
 		 259 aa  525  1e-148  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0912  ribosomal protein L1  78.39 
 
 		 237 aa  380  1e-104  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.911951  normal  0.174852 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2675  ribosomal protein L1  76.07 
 
 		 238 aa  366  1e-100  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4354  ribosomal protein L1  75.21 
 
 		 236 aa  363  2e-99  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0577  ribosomal protein L1  74.15 
 
 		 236 aa  360  2e-98  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0677262  hitchhiker  0.00322479 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2657  50S ribosomal protein L1P  74.57 
 
 		 235 aa  359  3e-98  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.106941  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3160  ribosomal protein L1  72.88 
 
 		 238 aa  357  7e-98  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.496068  normal  0.206569 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0677  50S ribosomal protein L1  76.07 
 
 		 238 aa  357  9.999999999999999e-98  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29860  LSU ribosomal protein L1P  72.69 
 
 		 238 aa  355  2.9999999999999997e-97  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1070  50S ribosomal protein L1  76.92 
 
 		 237 aa  353  2e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.353105  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1236  50S ribosomal protein L1  72.77 
 
 		 235 aa  352  4e-96  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.988417  normal  0.475189 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0539  50S ribosomal protein L1  75.64 
 
 		 237 aa  346  2e-94  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.653827  normal  0.0435444 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23970  LSU ribosomal protein L1P  72.77 
 
 		 239 aa  346  3e-94  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0702955  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0613  ribosomal protein L1  71.97 
 
 		 238 aa  345  5e-94  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2705  50S ribosomal protein L1  74.35 
 
 		 235 aa  343  1e-93  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0280715 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4328  50S ribosomal protein L1  68.83 
 
 		 238 aa  341  5e-93  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2993  50S ribosomal protein L1  73.48 
 
 		 235 aa  340  1e-92  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.560135  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0296  50S ribosomal protein L1P  72.69 
 
 		 239 aa  338  4e-92  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5111  ribosomal protein L1  72.32 
 
 		 225 aa  338  8e-92  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.253072  normal  0.533351 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3936  50S ribosomal protein L1  67.1 
 
 		 238 aa  337  9.999999999999999e-92  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5963  50S ribosomal protein L1  70 
 
 		 236 aa  336  1.9999999999999998e-91  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6639  50S ribosomal protein L1  71.43 
 
 		 238 aa  336  1.9999999999999998e-91  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4523  ribosomal protein L1  68.62 
 
 		 239 aa  337  1.9999999999999998e-91  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0743  ribosomal protein L1  71.31 
 
 		 237 aa  335  5e-91  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0952  50S ribosomal protein L1  72.1 
 
 		 235 aa  332  3e-90  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0924  50S ribosomal protein L1  72.1 
 
 		 235 aa  332  3e-90  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0941  50S ribosomal protein L1  72.1 
 
 		 235 aa  332  3e-90  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10654  50S ribosomal protein L1  72.77 
 
 		 235 aa  325  4.0000000000000003e-88  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0559095 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03650  50S ribosomal protein L1  68.62 
 
 		 239 aa  323  2e-87  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  0.57947  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5115  50S ribosomal protein L1  71.49 
 
 		 239 aa  321  7e-87  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1015  ribosomal protein L1  69.2 
 
 		 237 aa  320  9.999999999999999e-87  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6060  50S ribosomal protein L1  67.23 
 
 		 237 aa  318  7.999999999999999e-86  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.166987  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0570  50S ribosomal protein L1  63.86 
 
 		 259 aa  317  2e-85  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_21010  LSU ribosomal protein L1P  74.55 
 
 		 230 aa  316  3e-85  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.343147  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1209  ribosomal protein L1  68.44 
 
 		 231 aa  315  6e-85  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000000136712 
 
 
-
 
NC_010816  BLD_1624  50S ribosomal protein L1  67.84 
 
 		 230 aa  313  1.9999999999999998e-84  Bifidobacterium longum DJO10A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1113  ribosomal protein L1  70.64 
 
 		 238 aa  312  3.9999999999999997e-84  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.15602  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17280  50S ribosomal protein L1  70.31 
 
 		 235 aa  302  3.0000000000000004e-81  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0388  ribosomal protein L1  57.64 
 
 		 241 aa  291  7e-78  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013203  Apar_1173  ribosomal protein L1  58.12 
 
 		 235 aa  287  9e-77  Atopobium parvulum DSM 20469  Bacteria  unclonable  0.00000000649528  unclonable  0.0000000262625 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2471  50S ribosomal protein L1  60.18 
 
 		 231 aa  286  2.9999999999999996e-76  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000180886  hitchhiker  0.00777473 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1530  50S ribosomal protein L1  59.73 
 
 		 230 aa  278  9e-74  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000000127232  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_01060  ribosomal protein L1  55.26 
 
 		 235 aa  269  2.9999999999999997e-71  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  unclonable  8.745230000000001e-18  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2723  ribosomal protein L1  58.04 
 
 		 233 aa  268  5.9999999999999995e-71  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.302793  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08710  LSU ribosomal protein L1P  58.47 
 
 		 236 aa  266  2e-70  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.190625  hitchhiker  0.000000021546 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0182  LSU ribosomal protein L1P  54.42 
 
 		 233 aa  266  2e-70  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  unclonable  0.000000000000240107  normal  1 
 
 
-
 
NC_013170  Ccur_09650  LSU ribosomal protein L1P  56.12 
 
 		 238 aa  267  2e-70  Cryptobacterium curtum DSM 15641  Bacteria  normal  0.284817  hitchhiker  0.000232644 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_2128  ribosomal protein L1  58.87 
 
 		 237 aa  265  4e-70  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  0.628826  normal  0.786973 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0095  50S ribosomal protein L1  59.56 
 
 		 233 aa  265  5e-70  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0204  ribosomal protein L1  58.85 
 
 		 229 aa  265  5e-70  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000198509  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1510  ribosomal protein L1  57.96 
 
 		 235 aa  264  1e-69  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  unclonable  0.00000000430301  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1373  50S ribosomal protein L1  53.39 
 
 		 242 aa  261  4.999999999999999e-69  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00191675  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_2345  ribosomal protein L1  53.78 
 
 		 233 aa  261  6.999999999999999e-69  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0238114  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0099  50S ribosomal protein L1  58.67 
 
 		 233 aa  260  1e-68  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  unclonable  0.0000000000132548  n/a   
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3452  50S ribosomal protein L1  56.05 
 
 		 232 aa  259  3e-68  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  decreased coverage  0.00102084  normal  0.0363138 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0407  50S ribosomal protein L1  57.47 
 
 		 230 aa  259  4e-68  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  unclonable  4.3464e-16  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1324  ribosomal protein L1  52.17 
 
 		 242 aa  259  4e-68  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.752665  normal  1 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_1546  ribosomal protein L1  53.45 
 
 		 234 aa  258  9e-68  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  1  normal  0.826154 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_2993  50S ribosomal protein L1  56.14 
 
 		 235 aa  257  1e-67  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0309  50S ribosomal protein L1  56.33 
 
 		 230 aa  258  1e-67  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.0170319  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP0179  50S ribosomal protein L1  54.19 
 
 		 231 aa  256  2e-67  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.000606052  n/a   
 
 
-
 
NC_008527  LACR_2283  50S ribosomal protein L1  56.44 
 
 		 229 aa  256  2e-67  Lactococcus lactis subsp. cremoris SK11  Bacteria  hitchhiker  0.00159003  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1105  ribosomal protein L1  57.59 
 
 		 236 aa  257  2e-67  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.0193805  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl608  50S ribosomal protein L1  56.7 
 
 		 227 aa  255  4e-67  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0066  50S ribosomal protein L1  54.95 
 
 		 226 aa  255  5e-67  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_4019  ribosomal protein L1  56.76 
 
 		 235 aa  254  1.0000000000000001e-66  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.534035 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_1805  50S ribosomal protein L1P  55 
 
 		 232 aa  254  1.0000000000000001e-66  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.163663 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2721  50S ribosomal protein L1  55.7 
 
 		 231 aa  253  2.0000000000000002e-66  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  hitchhiker  0.0000000127574  n/a   
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0316  50S ribosomal protein L1  55.25 
 
 		 229 aa  253  2.0000000000000002e-66  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  hitchhiker  0.000103871  hitchhiker  0.000950319 
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0357  50S ribosomal protein L1  53.98 
 
 		 230 aa  253  2.0000000000000002e-66  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000538139 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_4480  ribosomal protein L1  53.78 
 
 		 232 aa  252  5.000000000000001e-66  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0192233  normal  1 
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2725  50S ribosomal protein L1  56.89 
 
 		 229 aa  252  5.000000000000001e-66  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  unclonable  0.00000000462552  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2411  50S ribosomal protein L1  56.89 
 
 		 229 aa  252  5.000000000000001e-66  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  unclonable  0.000000000512351  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0212  50S ribosomal protein L1  51.77 
 
 		 231 aa  252  5.000000000000001e-66  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.0231088  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0691  50S ribosomal protein L1  54.02 
 
 		 233 aa  251  7e-66  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  unclonable  3.4447699999999995e-21  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0846  50S ribosomal protein L1  53.54 
 
 		 235 aa  250  1e-65  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  hitchhiker  0.000865088  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_1928  ribosomal protein L1  55.75 
 
 		 232 aa  250  1e-65  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.0450124  n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_3692  ribosomal protein L1  57.46 
 
 		 230 aa  250  1e-65  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.00000151678  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0856  50S ribosomal protein L1  55.31 
 
 		 230 aa  250  2e-65  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.000000000185888  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0561  50S ribosomal protein L1  53.33 
 
 		 230 aa  249  3e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  hitchhiker  0.0000069455  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0275  50S ribosomal protein L1  53.3 
 
 		 232 aa  249  3e-65  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00000501108  hitchhiker  0.000549627 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5208  50S ribosomal protein L1  55.56 
 
 		 230 aa  249  3e-65  Bacillus cereus G9842  Bacteria  hitchhiker  0.0000000140164  unclonable  7.070390000000001e-26 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0575  50S ribosomal protein L1  53.33 
 
 		 230 aa  249  3e-65  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.0000352195  n/a   
 
 
-
 
NC_008532  STER_1797  50S ribosomal protein L1  57.27 
 
 		 229 aa  249  3e-65  Streptococcus thermophilus LMD-9  Bacteria  hitchhiker  0.00156418  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0092  50S ribosomal protein L1  55.56 
 
 		 230 aa  249  4e-65  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  unclonable  0.0000000171982  n/a   
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3471  50S ribosomal protein L1  55.95 
 
 		 230 aa  249  4e-65  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.409515  normal  1 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2274  50S ribosomal protein L1  56.19 
 
 		 234 aa  248  6e-65  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2362  50S ribosomal protein L1  56.19 
 
 		 234 aa  248  6e-65  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.193513  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0923  50S ribosomal protein L1  54.22 
 
 		 233 aa  248  6e-65  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0522  ribosomal protein L1  48.67 
 
 		 235 aa  248  7e-65  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0118  50S ribosomal protein L1  55.56 
 
 		 230 aa  248  9e-65  Bacillus cereus B4264  Bacteria  unclonable  0.0000153199  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0643  50S ribosomal protein L1  52.5 
 
 		 232 aa  247  1e-64  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.0857628  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1589  50S ribosomal protein L1  55.71 
 
 		 234 aa  247  1e-64  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3338  50S ribosomal protein L1  54.67 
 
 		 233 aa  247  1e-64  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.000142685 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2165  50S ribosomal protein L1P  53.19 
 
 		 230 aa  247  1e-64  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.0086429  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2866  50S ribosomal protein L1  53.39 
 
 		 234 aa  246  2e-64  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0098  50S ribosomal protein L1  55.56 
 
 		 230 aa  246  2e-64  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.000000000382446  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0285  50S ribosomal protein L1  56.62 
 
 		 229 aa  246  2e-64  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  decreased coverage  0.0000000105773  hitchhiker  0.00394818 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0109  50S ribosomal protein L1  55.56 
 
 		 230 aa  246  2e-64  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  2.9844e-61 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2726  ribosomal protein L1  54.19 
 
 		 233 aa  246  2e-64  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.181132  normal  0.31349 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>