More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Noca_0249 on replicon NC_008699
Organism: Nocardioides sp. JS614



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008699  Noca_0249  ABC transporter related  100 
 
 		 314 aa  621  1e-177  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1431  ABC transporter related protein  73.36 
 
 		 301 aa  432  1e-120  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.278958  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_39130  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  59.41 
 
 		 317 aa  359  4e-98  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.42007 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2673  ABC transporter related protein  60.52 
 
 		 346 aa  356  2.9999999999999997e-97  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2964  ABC transporter related protein  62.87 
 
 		 319 aa  353  1e-96  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0297674  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1540  ABC transporter related  59.48 
 
 		 348 aa  346  3e-94  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.84586  normal  0.0898029 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2175  ABC transporter related  58.94 
 
 		 316 aa  343  2.9999999999999997e-93  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.481863  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1052  ABC transporter related  57.7 
 
 		 315 aa  342  4e-93  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.264315  normal  0.415576 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6532  ABC transporter related  56.49 
 
 		 314 aa  340  2e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.163665  normal  0.0814815 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0921  ABC transporter related protein  58.6 
 
 		 314 aa  338  8e-92  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.284556  normal  0.658376 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1244  ABC transporter related  57.89 
 
 		 335 aa  338  9e-92  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.442261 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08110  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  57.98 
 
 		 318 aa  338  9.999999999999999e-92  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.017135  normal  0.490252 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_2001  ABC transporter related  58.68 
 
 		 318 aa  335  5e-91  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.0145023  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_7020  ABC transporter related  58.09 
 
 		 306 aa  334  1e-90  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0256  ABC transporter related  57.93 
 
 		 373 aa  334  1e-90  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_5323  ABC transporter related  57.48 
 
 		 355 aa  332  4e-90  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_4341  ABC transporter related  57.28 
 
 		 368 aa  332  7.000000000000001e-90  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3765  ABC transporter related protein  57.33 
 
 		 306 aa  330  2e-89  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.456335  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_4387  ABC transporter related protein  55.84 
 
 		 310 aa  330  2e-89  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_4137  ABC transporter related  54.26 
 
 		 314 aa  329  3e-89  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_0712  ABC transporter-related protein  56.72 
 
 		 301 aa  329  4e-89  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.533749  normal  0.0261728 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1436  ABC-type multidrug transport system ATPase component  56.82 
 
 		 308 aa  325  6e-88  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.200508  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5722  ABC transporter related  54.93 
 
 		 320 aa  321  9.999999999999999e-87  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_0021  ABC transporter related protein  57.24 
 
 		 314 aa  319  5e-86  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3386  ABC transporter related  55.38 
 
 		 313 aa  318  5e-86  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00141609  hitchhiker  0.000608139 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3716  ABC transporter related  52.96 
 
 		 313 aa  317  2e-85  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0016772  normal  0.328535 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0549  ABC transporter related  56.44 
 
 		 300 aa  316  3e-85  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.802344  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_0561  ABC transporter related  56.44 
 
 		 300 aa  316  3e-85  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  0.494582 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_0539  ABC transporter related  56.44 
 
 		 300 aa  316  3e-85  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2016  ABC transporter related protein  57.43 
 
 		 313 aa  315  6e-85  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.414495  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3742  ABC transporter related protein  52.41 
 
 		 312 aa  315  7e-85  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_3915  ABC transporter related  54.28 
 
 		 319 aa  315  8e-85  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011879  Achl_4035  ABC transporter related  55.02 
 
 		 309 aa  313  2.9999999999999996e-84  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.0423003 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5617  ABC transporter ATP-binding protein  57.38 
 
 		 328 aa  310  2e-83  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.199013  normal  0.655587 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1738  ABC transporter related protein  53.77 
 
 		 303 aa  310  2e-83  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_0193  ABC transporter related  55.15 
 
 		 306 aa  309  2.9999999999999997e-83  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0579  ABC transporter related  54.9 
 
 		 324 aa  307  1.0000000000000001e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.737031  normal  0.129756 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_1977  ABC transporter related  56.07 
 
 		 304 aa  308  1.0000000000000001e-82  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1242  ABC transporter related  50.75 
 
 		 361 aa  306  2.0000000000000002e-82  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.309729 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_2646  ABC transporter related  53.27 
 
 		 322 aa  303  3.0000000000000004e-81  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00134399  hitchhiker  0.00776323 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_3182  ABC transporter related  53.04 
 
 		 310 aa  298  6e-80  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6407  ABC transporter related  54.79 
 
 		 309 aa  295  6e-79  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4579  lantibiotic transport ATP-binding protein  54.13 
 
 		 302 aa  293  2e-78  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.196973 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6353  ABC transporter related  51.91 
 
 		 318 aa  291  7e-78  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2130  ABC transporter related protein  54.75 
 
 		 305 aa  291  1e-77  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2508  lantibiotic transport ATP-binding protein  53.92 
 
 		 310 aa  291  1e-77  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.723395  normal  0.930619 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2234  ABC transporter related  56.44 
 
 		 304 aa  289  4e-77  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.18079  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7103  ABC transporter related  53.92 
 
 		 305 aa  289  5.0000000000000004e-77  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.798057  normal  0.375982 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5649  lantibiotic transport ATP-binding protein  51.97 
 
 		 305 aa  284  1.0000000000000001e-75  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7841  ABC transporter related  51.49 
 
 		 302 aa  281  8.000000000000001e-75  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.134356 
 
 
-
 
NC_009806  Krad_4658  ABC transporter-related protein  51.86 
 
 		 327 aa  280  2e-74  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.0989465 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4130  ABC transporter related  50.99 
 
 		 303 aa  276  5e-73  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5876  ABC transporter related  50.99 
 
 		 330 aa  273  2.0000000000000002e-72  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.145407 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1901  ABC transporter related protein  51.89 
 
 		 337 aa  271  7e-72  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.762737  normal  0.0811231 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3488  ABC transporter related protein  48.99 
 
 		 316 aa  268  8.999999999999999e-71  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4257  ABC transporter related protein  58.47 
 
 		 398 aa  267  2e-70  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03500  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  60.45 
 
 		 252 aa  267  2e-70  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1681  ABC transporter related protein  49.17 
 
 		 298 aa  261  6.999999999999999e-69  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.948388  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2846  ABC transporter related protein  59.36 
 
 		 241 aa  258  7e-68  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00949753 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4068  ABC transporter related  50 
 
 		 311 aa  256  3e-67  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.247576  normal  0.22054 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4167  ABC transporter related protein  46.95 
 
 		 330 aa  254  1.0000000000000001e-66  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.400455  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3688  ABC transporter related  49.82 
 
 		 311 aa  254  1.0000000000000001e-66  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.382746  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_0100  ABC transporter, ATP-binding protein  40.56 
 
 		 330 aa  254  2.0000000000000002e-66  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  0.174206 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0096  ABC transporter related protein  57.78 
 
 		 234 aa  249  4e-65  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0311  ABC transporter related protein  56.05 
 
 		 244 aa  240  2.9999999999999997e-62  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.139464 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_09560  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  47.95 
 
 		 319 aa  240  2.9999999999999997e-62  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.212664 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1707  ABC transporter related protein  45.42 
 
 		 300 aa  238  6.999999999999999e-62  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  0.132816 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_18430  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  45.49 
 
 		 324 aa  237  2e-61  Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_4497  ABC transporter related  48 
 
 		 314 aa  236  3e-61  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3543  ABC transporter related protein  46.18 
 
 		 297 aa  235  6e-61  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.856374  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1320  ABC transporter related  45.33 
 
 		 300 aa  234  2.0000000000000002e-60  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_1021  ABC transporter related  45.82 
 
 		 298 aa  230  2e-59  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_1601  ABC transporter related protein  54.55 
 
 		 496 aa  229  4e-59  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_30550  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  41.94 
 
 		 368 aa  228  1e-58  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2470  ABC transporter related protein  47.02 
 
 		 297 aa  227  3e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.00132883  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6250  ABC transporter related  41.56 
 
 		 457 aa  223  3e-57  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1804  ABC transporter related  44.04 
 
 		 305 aa  222  6e-57  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.389813  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0153  ABC transporter related  44.52 
 
 		 316 aa  221  9e-57  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  hitchhiker  0.00972111  normal  1 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2512  ABC transporter related  44.34 
 
 		 303 aa  219  5e-56  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.166295  normal  0.98268 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_5481  lantibiotic transport ATP-binding protein  50.68 
 
 		 238 aa  218  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0111213  decreased coverage  0.00654963 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2732  ABC transporter related protein  43.67 
 
 		 308 aa  213  3.9999999999999995e-54  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.449251  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0397  ABC transporter related  46.89 
 
 		 299 aa  212  7e-54  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0761  ABC transporter related protein  52.04 
 
 		 242 aa  211  9e-54  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.7197  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4674  ABC transporter related protein  51.82 
 
 		 237 aa  210  3e-53  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.330871 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_25040  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  45.33 
 
 		 350 aa  209  5e-53  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7158  ABC transporter related  49.58 
 
 		 258 aa  208  9e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5658  ABC transporter related protein  43.75 
 
 		 309 aa  208  1e-52  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.498228  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5464  ABC transporter related protein  47.91 
 
 		 245 aa  206  5e-52  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.230295 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_0892  ABC transporter related  45.45 
 
 		 302 aa  206  6e-52  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_06380  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  51.2 
 
 		 247 aa  205  7e-52  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1601  ABC transporter related  46.1 
 
 		 299 aa  203  3e-51  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.469607  normal  0.0295427 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_02610  ABC-type multidrug transport system, ATPase component  42.76 
 
 		 341 aa  202  6e-51  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.737934  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3888  ABC transporter related  52.97 
 
 		 237 aa  200  1.9999999999999998e-50  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.710144 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6186  ABC transporter related  53.69 
 
 		 317 aa  199  3.9999999999999996e-50  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.289429  normal  0.0935603 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_7276  ABC transporter related  42.38 
 
 		 307 aa  197  2.0000000000000003e-49  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.332861  normal  0.0851548 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0791  ABC transporter related protein  40.47 
 
 		 311 aa  196  4.0000000000000005e-49  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2895  ABC transporter related  40.76 
 
 		 326 aa  196  5.000000000000001e-49  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.10766  normal  0.0275551 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0812  ABC transporter related protein  40.2 
 
 		 301 aa  194  2e-48  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1156  ABC transporter related protein  42.72 
 
 		 323 aa  192  5e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0354846  hitchhiker  0.000104476 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0361  ABC transporter related  40.86 
 
 		 310 aa  192  6e-48  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  0.764721 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>