64 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmul_A0117 on replicon NC_007614
Organism: Nitrosospira multiformis ATCC 25196



Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_007614  Nmul_A0117  hypothetical protein  100 
 
 
118 aa  248  3e-65  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009469  Acry_3516  hypothetical protein  72.64 
 
 
113 aa  162  1.0000000000000001e-39  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013422  Hneap_2103  protein of unknown function DUF891  68.87 
 
 
112 aa  162  2.0000000000000002e-39  Halothiobacillus neapolitanus c2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3839  hypothetical protein  67.59 
 
 
123 aa  161  2.0000000000000002e-39  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.0135391  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1108  protein of unknown function DUF891  65.42 
 
 
114 aa  155  2e-37  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.535364  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1038  hypothetical protein  67.92 
 
 
112 aa  155  3e-37  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_0746  hypothetical protein  60.53 
 
 
117 aa  150  7e-36  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.215681  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1227  hypothetical protein  60.53 
 
 
117 aa  149  1e-35  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.988714  n/a   
 
 
-
 
NC_004632  PSPTO_B0025  hypothetical protein  64.04 
 
 
112 aa  147  3e-35  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  decreased coverage  0.0000520365  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_1200  hypothetical protein  59.65 
 
 
117 aa  147  4e-35  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0186123  normal  0.644581 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_1110  hypothetical protein  58.04 
 
 
117 aa  141  3e-33  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.394957  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4347  hypothetical protein  71.11 
 
 
107 aa  138  1.9999999999999998e-32  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.230249  normal  0.629082 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_1582  hypothetical protein  57.01 
 
 
109 aa  131  3e-30  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.464954  normal  0.0435717 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_2999  hypothetical protein  57.14 
 
 
112 aa  129  9e-30  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal  0.219413 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4386  hypothetical protein  54.63 
 
 
116 aa  127  4.0000000000000003e-29  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4296  hypothetical protein  48.7 
 
 
120 aa  125  2.0000000000000002e-28  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4237  hypothetical protein  47.83 
 
 
120 aa  122  2e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A4336  hypothetical protein  62.79 
 
 
91 aa  122  2e-27  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4131  putative cytoplasmic protein  53.47 
 
 
105 aa  121  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4188  putative cytoplasmic protein  53.47 
 
 
105 aa  121  3e-27  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1023  hypothetical protein  52.94 
 
 
108 aa  118  1.9999999999999998e-26  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.395575  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_27830  hypothetical protein  61.8 
 
 
103 aa  118  1.9999999999999998e-26  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A3974  hypothetical protein  48.25 
 
 
114 aa  117  7.999999999999999e-26  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  normal  0.0863486 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0724  protein of unknown function DUF891  50 
 
 
115 aa  113  6.9999999999999995e-25  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.967068  normal  0.26766 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_0550  protein of unknown function DUF891  57.45 
 
 
102 aa  104  4e-22  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007615  Nmul_B2803  hypothetical protein  41.07 
 
 
128 aa  84.3  5e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1359  hypothetical protein  61.54 
 
 
69 aa  83.2  0.000000000000001  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3691  hypothetical protein  37.74 
 
 
123 aa  80.9  0.000000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_2998  hypothetical protein  41.35 
 
 
125 aa  75.1  0.0000000000003  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  normal  normal  0.553466 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3746  hypothetical protein  37.84 
 
 
121 aa  73.6  0.0000000000008  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0644286  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0936  hypothetical protein  37.5 
 
 
119 aa  72.4  0.000000000002  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  0.464426  normal 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0767  protein of unknown function DUF891  40.59 
 
 
134 aa  70.9  0.000000000005  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.291185  normal  0.0218259 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_3842  hypothetical protein  37.5 
 
 
123 aa  68.9  0.00000000002  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_0998  hypothetical protein  59.18 
 
 
73 aa  69.3  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007617  Nmul_D2815  hypothetical protein  37.61 
 
 
128 aa  68.9  0.00000000002  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.342274  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4351  protein of unknown function DUF891  36.89 
 
 
127 aa  65.9  0.0000000002  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  0.102654  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4451  hypothetical protein  34.02 
 
 
127 aa  64.3  0.0000000005  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_1131  protein of unknown function DUF891  40.22 
 
 
121 aa  63.2  0.000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008782  Ajs_1884  hypothetical protein  35.45 
 
 
127 aa  60.8  0.000000007  Acidovorax sp. JS42  Bacteria  normal  0.440545  normal  0.626168 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0275  hypothetical protein  46.03 
 
 
71 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000118934 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2509  hypothetical protein  34.55 
 
 
127 aa  58.2  0.00000004  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.406225  normal  0.110118 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_0732  hypothetical protein  29.46 
 
 
117 aa  57.4  0.00000006  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.0134513  normal 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0292  hypothetical protein  46.03 
 
 
71 aa  56.6  0.0000001  Pseudomonas putida F1  Bacteria  hitchhiker  0.00028346  normal  0.248973 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1384  hypothetical protein  36.56 
 
 
113 aa  54.3  0.0000005  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.311049  n/a   
 
 
-
 
NC_010514  Mrad2831_6395  hypothetical protein  29.46 
 
 
138 aa  49.7  0.00001  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3281  hypothetical protein  37.31 
 
 
113 aa  48.1  0.00004  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal  0.868788 
 
 
-
 
NC_006368  lpp0073  hypothetical protein  34.62 
 
 
107 aa  47.8  0.00005  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_3586  hypothetical protein  36.76 
 
 
82 aa  47  0.00009  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.487271  normal  0.441638 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1816  hypothetical protein  35.09 
 
 
123 aa  45.8  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  0.338143  n/a   
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4156  hypothetical protein  32.2 
 
 
113 aa  45.8  0.0002  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.355495  normal 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1926  hypothetical protein  34.43 
 
 
109 aa  45.4  0.0002  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0038  prophage protein gp49  37.93 
 
 
103 aa  45.1  0.0003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  0.369926  n/a   
 
 
-
 
NC_010660  SbBS512_A0098  prophage protein gp49  37.93 
 
 
103 aa  45.4  0.0003  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_3860  protein of unknown function DUF891  41.18 
 
 
112 aa  43.9  0.0007  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0764  hypothetical protein  30.99 
 
 
117 aa  43.9  0.0008  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_3470  hypothetical protein  28.89 
 
 
116 aa  43.5  0.001  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  normal  0.681724 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1032  protein of unknown function DUF891  41.51 
 
 
72 aa  43.1  0.001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  hitchhiker  0.00000376666  normal  0.587168 
 
 
-
 
NC_011060  Ppha_2124  protein of unknown function DUF891  29.79 
 
 
117 aa  42.4  0.002  Pelodictyon phaeoclathratiforme BU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I3275  hypothetical protein  34.48 
 
 
190 aa  42.7  0.002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0656  protein of unknown function DUF891  32.22 
 
 
111 aa  41.6  0.004  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.08735  n/a   
 
 
-
 
NC_008786  Veis_4346  hypothetical protein  48.94 
 
 
119 aa  40.4  0.008  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.11309  normal  0.658248 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2563  hypothetical protein  31.03 
 
 
108 aa  40.4  0.009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.23616 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1337  hypothetical protein  31.03 
 
 
108 aa  40.4  0.009  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal  0.251676 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2788  protein of unknown function DUF891  30.99 
 
 
113 aa  40  0.01  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.491646  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 1    << first  < prev  1  next >  last >>