More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1431 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_010085  Nmar_1431  TatD-related deoxyribonuclease  100 
 
 
272 aa  566  1e-160  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0044  hydrolase, TatD family  29.48 
 
 
256 aa  114  1.0000000000000001e-24  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0238  putative deoxyribonuclease, TatD family  33.33 
 
 
254 aa  112  7.000000000000001e-24  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.331267  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0118  TatD family hydrolase  29.5 
 
 
276 aa  111  1.0000000000000001e-23  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.373882  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5088  putative deoxyribonuclease, TatD family  32.86 
 
 
254 aa  108  1e-22  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.279248  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1030  TatD-related deoxyribonuclease  34.93 
 
 
247 aa  107  2e-22  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.413487  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0237  TatD family deoxyribonuclease  32.71 
 
 
265 aa  107  2e-22  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.108192  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2029  TatD-related deoxyribonuclease  29.85 
 
 
253 aa  106  3e-22  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  0.755342  normal 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0231  putative deoxyribonuclease, TatD family  31.75 
 
 
254 aa  106  4e-22  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0199  TatD-related deoxyribonuclease  31.25 
 
 
256 aa  105  7e-22  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0129  hydrolase, TatD family  26.38 
 
 
259 aa  105  7e-22  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.0130316  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0202  TatD-related deoxyribonuclease  31.75 
 
 
260 aa  105  9e-22  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.242402  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0198  TatD-related deoxyribonuclease  30.81 
 
 
260 aa  103  3e-21  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.865826  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1778  TatD-related deoxyribonuclease  27.75 
 
 
281 aa  103  4e-21  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0068  hydrolase, TatD family  25.68 
 
 
253 aa  102  5e-21  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00105138  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0212  TatD family deoxyribonuclease  30.81 
 
 
254 aa  102  5e-21  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0222  TatD family deoxyribonuclease  30.81 
 
 
254 aa  102  5e-21  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013171  Apre_1511  hydrolase, TatD family  26.29 
 
 
253 aa  102  8e-21  Anaerococcus prevotii DSM 20548  Bacteria  decreased coverage  0.00000000902805  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_1574  DNase, TatD family  29.96 
 
 
255 aa  101  1e-20  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.0443076  n/a   
 
 
-
 
NC_008261  CPF_2843  TatD family hydrolase  28.74 
 
 
256 aa  101  1e-20  Clostridium perfringens ATCC 13124  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008262  CPR_2529  TatD family hydrolase  29.13 
 
 
256 aa  101  1e-20  Clostridium perfringens SM101  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003295  RSc1787  hypothetical protein  25.39 
 
 
267 aa  100  2e-20  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.36132  normal  0.0764381 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0256  putative deoxyribonuclease, TatD family  31.16 
 
 
254 aa  100  2e-20  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0034  hydrolase, TatD family  26.38 
 
 
256 aa  99.8  4e-20  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.301628  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A0611  TatD family hydrolase  29.52 
 
 
255 aa  99.4  6e-20  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  normal  0.130062  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1463  hydrolase, TatD family  26.46 
 
 
267 aa  99  7e-20  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.145299  normal  0.0126411 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1299  TatD family hydrolase  31.73 
 
 
251 aa  99  8e-20  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_1422  hydrolase, TatD family  26.46 
 
 
267 aa  98.2  1e-19  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  normal  normal  0.236836 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0037  TatD family deoxyribonuclease  24.41 
 
 
255 aa  97.4  2e-19  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0038  TatD family deoxyribonuclease  24.41 
 
 
255 aa  97.8  2e-19  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0035  TatD related DNase  24.41 
 
 
255 aa  97.8  2e-19  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2194  TatD-related deoxyribonuclease  25.31 
 
 
257 aa  97.4  2e-19  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  normal  0.632013 
 
 
-
 
NC_010510  Mrad2831_6142  TatD-related deoxyribonuclease  32 
 
 
247 aa  97.8  2e-19  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0037  TatD family deoxyribonuclease  24.41 
 
 
255 aa  97.8  2e-19  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0044  deoxyribonuclease, TatD family  24.41 
 
 
255 aa  97.8  2e-19  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0034  TatD family hydrolase  24.41 
 
 
255 aa  97.4  2e-19  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0943  sec-independent transport protein TatD  26.11 
 
 
257 aa  97.1  3e-19  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0048  deoxyribonuclease, TatD family  24.41 
 
 
255 aa  97.1  3e-19  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0034  TatD family hydrolase  24.41 
 
 
255 aa  95.9  7e-19  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_0168  hydrolase, TatD family  25.42 
 
 
255 aa  95.9  7e-19  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  0.61634  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0044  deoxyribonuclease, TatD family  24.02 
 
 
255 aa  95.5  8e-19  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  0.413884  n/a   
 
 
-
 
NC_008531  LEUM_1615  Mg-dependent DNase  24.79 
 
 
265 aa  95.5  8e-19  Leuconostoc mesenteroides subsp. mesenteroides ATCC 8293  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0049  TatD-related deoxyribonuclease  25.59 
 
 
256 aa  95.5  9e-19  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000233797 
 
 
-
 
NC_011374  UUR10_0017  deoxyribonuclease, TatD family  27.27 
 
 
265 aa  95.1  1e-18  Ureaplasma urealyticum serovar 10 str. ATCC 33699  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0067  TatD family hydrolase  26.94 
 
 
255 aa  95.1  1e-18  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  hitchhiker  0.000000334455  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B5272  deoxyribonuclease, TatD family  24.02 
 
 
255 aa  94.7  1e-18  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0035  TatD related DNase  24.02 
 
 
255 aa  94  3e-18  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.305116  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1540  TatD-related deoxyribonuclease  27.23 
 
 
262 aa  93.2  4e-18  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  0.259473  normal  0.131374 
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_2095  TatD family hydrolase  26.17 
 
 
255 aa  92.8  5e-18  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006055  Mfl047  Mg2+ dependent DNAse  30.7 
 
 
266 aa  92.8  6e-18  Mesoplasma florum L1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007347  Reut_A1437  TatD-related deoxyribonuclease  27.12 
 
 
265 aa  91.7  1e-17  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0042  TatD family hydrolase  26.09 
 
 
261 aa  91.7  1e-17  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.804298  n/a   
 
 
-
 
NC_009524  PsycPRwf_1914  TatD family hydrolase  25.49 
 
 
262 aa  91.3  2e-17  Psychrobacter sp. PRwf-1  Bacteria  unclonable  0.0000000000354209  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0032  hydrolase, TatD family  23.83 
 
 
256 aa  90.9  2e-17  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3651  TatD-related deoxyribonuclease  26.87 
 
 
259 aa  90.1  3e-17  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2114  hydrolase, TatD family  26.83 
 
 
261 aa  90.1  3e-17  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.167709  n/a   
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_1025  TatD-related deoxyribonuclease  28.29 
 
 
236 aa  90.1  4e-17  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal  0.0609004 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1497  TatD-related deoxyribonuclease  25.83 
 
 
258 aa  89.7  4e-17  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.119222  normal 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1695  Mg-dependent DNase  25.39 
 
 
464 aa  89.7  5e-17  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011662  Tmz1t_2500  hydrolase, TatD family  24.77 
 
 
258 aa  89.4  6e-17  Thauera sp. MZ1T  Bacteria  normal  0.0534824  n/a   
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0720  TatD-related deoxyribonuclease  28.26 
 
 
257 aa  89  7e-17  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0885  hydrolase, TatD family  28.1 
 
 
263 aa  89  7e-17  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  0.46453  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_4330  TatD family hydrolase  24.29 
 
 
273 aa  89  8e-17  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.643835  normal  0.41357 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0103  TatD family hydrolase  25.97 
 
 
269 aa  89  8e-17  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  normal  0.0970628  normal  0.125784 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0107  hydrolase, TatD family  25 
 
 
256 aa  88.6  9e-17  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.000974122  hitchhiker  0.000198831 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_21920  hydrolase, TatD family  24.21 
 
 
257 aa  89  9e-17  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_0262  hydrolase, TatD family  23.62 
 
 
251 aa  88.6  1e-16  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000000135646  n/a   
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_1825  TatD-related deoxyribonuclease  27.88 
 
 
265 aa  88.2  1e-16  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0332643  hitchhiker  0.00471039 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4413  TatD family hydrolase  23.89 
 
 
253 aa  87.8  2e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.0000106704  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_1466  TatD-related deoxyribonuclease  25.39 
 
 
278 aa  87.4  2e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  normal  0.876594  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A1381  TatD-related deoxyribonuclease  25.1 
 
 
254 aa  87.4  2e-16  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1700  TatD-related deoxyribonuclease  29.13 
 
 
270 aa  87.8  2e-16  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.294138  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1914  TatD-related deoxyribonuclease  28.23 
 
 
268 aa  87.4  2e-16  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  hitchhiker  0.00000115474  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0050  TatD family hydrolase  24.1 
 
 
256 aa  87.4  2e-16  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  unclonable  0.000000022674  n/a   
 
 
-
 
NC_008530  LGAS_0206  Mg-dependent DNase  25.59 
 
 
256 aa  87.4  2e-16  Lactobacillus gasseri ATCC 33323  Bacteria  decreased coverage  0.000000791491  normal  0.0173908 
 
 
-
 
NC_007633  MCAP_0768  TatD family deoxyribonuclease  30.09 
 
 
266 aa  87  3e-16  Mycoplasma capricolum subsp. capricolum ATCC 27343  Bacteria  normal  0.465027  n/a   
 
 
-
 
NC_010531  Pnec_0491  TatD-related deoxyribonuclease  27.19 
 
 
244 aa  87  3e-16  Polynucleobacter necessarius subsp. necessarius STIR1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_1295  TatD-related deoxyribonuclease  28.02 
 
 
234 aa  87  3e-16  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013515  Smon_0567  hydrolase, TatD family  27.09 
 
 
256 aa  87  3e-16  Streptobacillus moniliformis DSM 12112  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009376  Pars_2071  TatD-related deoxyribonuclease  26.09 
 
 
234 aa  86.7  4e-16  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.270704  normal  0.0636834 
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1823  TatD-related deoxyribonuclease  27.54 
 
 
234 aa  86.3  5e-16  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  decreased coverage  0.00210636  hitchhiker  0.000000000367552 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0246  TatD family hydrolase  25.87 
 
 
258 aa  86.3  5e-16  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_4099  putative deoxyribonuclease (ycfH)  24.69 
 
 
263 aa  86.3  5e-16  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.0543603 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1010  hydrolase, TatD family  25.3 
 
 
258 aa  86.3  5e-16  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_0468  hydrolase, TatD family  24.81 
 
 
264 aa  86.3  6e-16  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  normal  0.573991 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3937  hydrolase, TatD family  26.37 
 
 
259 aa  85.9  6e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.969343  n/a   
 
 
-
 
NC_011312  VSAL_I0615  putative DNase  25.59 
 
 
258 aa  85.9  6e-16  Aliivibrio salmonicida LFI1238  Bacteria  normal  0.830738  n/a   
 
 
-
 
NC_008043  TM1040_3593  TatD-related deoxyribonuclease  23.69 
 
 
267 aa  85.9  6e-16  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.520657 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0129  TatD family deoxyribonuclease  23.51 
 
 
256 aa  85.9  7e-16  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_1656  hydrolase, TatD family  26.98 
 
 
269 aa  85.5  8e-16  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2311  TatD-related deoxyribonuclease  31.65 
 
 
253 aa  85.5  8e-16  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_1278  TatD family hydrolase  24.11 
 
 
259 aa  85.5  9e-16  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  0.897869  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0963  TatD family hydrolase  25 
 
 
256 aa  85.1  0.000000000000001  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_1461  TatD-related deoxyribonuclease  25.31 
 
 
263 aa  84.7  0.000000000000001  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6920  hydrolase, TatD family  22.89 
 
 
268 aa  84.7  0.000000000000001  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.324634  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0883  TatD family hydrolase  28.5 
 
 
253 aa  84.7  0.000000000000001  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_1239  hydrolase, TatD family  28.65 
 
 
454 aa  84.7  0.000000000000001  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_1289  TatD family hydrolase  25.9 
 
 
259 aa  84  0.000000000000002  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1867  TatD family hydrolase  25.24 
 
 
459 aa  84.3  0.000000000000002  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  0.0284119  normal 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0066  TatD family hydrolase  24.29 
 
 
257 aa  84.7  0.000000000000002  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  0.0305827  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>