More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_1292 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_1292  AsnC family transcriptional regulator  100 
 
 		 139 aa  270  6e-72  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0155415 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1135  transcriptional regulator, AsnC family  46.04 
 
 		 142 aa  117  4.9999999999999996e-26  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.118615  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0166  AsnC family transcriptional regulator  45.11 
 
 		 141 aa  109  1.0000000000000001e-23  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000165238  normal  0.103345 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6708  transcriptional regulator, AsnC family  32.59 
 
 		 153 aa  78.2  0.00000000000004  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_1554  transcriptional regulator, AsnC family  34.09 
 
 		 137 aa  77  0.00000000000007  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  0.0285947  normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1053  regulatory proteins, AsnC/Lrp  32.58 
 
 		 142 aa  75.9  0.0000000000002  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5040  AsnC family transcriptional regulator  30.99 
 
 		 152 aa  74.3  0.0000000000005  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0166005 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A3468  AsnC family transcriptional regulator  29.2 
 
 		 141 aa  72  0.000000000002  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  0.278987  n/a   
 
 
-
 
NC_009440  Msed_0688  AsnC family transcriptional regulator  32.86 
 
 		 155 aa  72  0.000000000002  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  hitchhiker  0.0000000313702  unclonable  0.000000226618 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3617  transcriptional regulator, AsnC family  31.47 
 
 		 154 aa  70.9  0.000000000005  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4530  AsnC/Lrp family regulatory protein  30.28 
 
 		 152 aa  69.7  0.00000000001  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.668495 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_2332  putative transcriptional regulator, AsnC family  31.65 
 
 		 162 aa  69.7  0.00000000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0418  transcriptional regulator, AsnC family  29.41 
 
 		 137 aa  68.6  0.00000000003  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.550786  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6662  transcriptional regulator, AsnC family  29.08 
 
 		 149 aa  68.6  0.00000000003  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.392475  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2729  transcriptional regulator, AsnC family  31.06 
 
 		 137 aa  67.8  0.00000000005  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.134973  n/a   
 
 
-
 
NC_008700  Sama_1629  AsnC family transcriptional regulator  30.3 
 
 		 142 aa  67  0.00000000007  Shewanella amazonensis SB2B  Bacteria  normal  1  normal  0.700582 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3579  transcriptional regulator, AsnC family  31.39 
 
 		 154 aa  67  0.00000000008  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.345066  normal  1 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1136  transcriptional regulator, AsnC family  29.86 
 
 		 151 aa  66.2  0.0000000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4861  AsnC family transcriptional regulator  31.16 
 
 		 173 aa  66.6  0.0000000001  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.441197  normal  0.0801896 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2326  transcriptional regulator, AsnC family  29.55 
 
 		 137 aa  65.9  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.572639 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_2809  transcriptional regulator, AsnC family  29.5 
 
 		 156 aa  65.1  0.0000000003  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.668889  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7972  transcriptional regulator, AsnC family  28.06 
 
 		 146 aa  65.1  0.0000000003  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0778  transcriptional regulator, AsnC family  31.58 
 
 		 137 aa  65.1  0.0000000003  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0122  AsnC family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 175 aa  65.1  0.0000000003  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7459  transcriptional regulator  29.29 
 
 		 149 aa  65.5  0.0000000003  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_1796  AsnC family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 143 aa  64.7  0.0000000004  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  1  normal  0.029477 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3398  transcriptional regulator, AsnC family  28.68 
 
 		 165 aa  64.7  0.0000000004  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.180554  n/a   
 
 
-
 
CP001800  Ssol_0159  transcriptional regulator, AsnC family  27.86 
 
 		 153 aa  64.3  0.0000000005  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  0.288383  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_3892  AsnC family transcriptional regulator  28.15 
 
 		 147 aa  64.3  0.0000000005  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1219  AsnC family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 176 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1246  AsnC family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 176 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1236  AsnC family transcriptional regulator  28.68 
 
 		 176 aa  63.9  0.0000000007  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.467641  normal  1 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_0162  AsnC family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 142 aa  63.5  0.0000000009  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1166  AsnC family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 143 aa  62.8  0.000000001  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  0.0224688 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1571  AsnC family transcriptional regulator  29.86 
 
 		 173 aa  63.2  0.000000001  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.171615  normal  0.576892 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4327  AsnC family transcriptional regulator  26.81 
 
 		 143 aa  62.4  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_2657  AsnC family transcriptional regulator  27.41 
 
 		 142 aa  62.4  0.000000002  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2719  AsnC family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 149 aa  62  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.519485  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1377  AsnC family transcriptional regulator  28.93 
 
 		 149 aa  62  0.000000003  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.370813  normal  0.278019 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6172  transcriptional regulator, AsnC family  26.47 
 
 		 167 aa  61.2  0.000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2919  AsnC family transcriptional regulator  29.55 
 
 		 154 aa  60.8  0.000000005  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.608239  normal  1 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_0818  transcriptional regulator, AsnC family  23.7 
 
 		 152 aa  60.8  0.000000006  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0669  transcriptional regulator, AsnC family  28.89 
 
 		 153 aa  60.8  0.000000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.51735  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1170  AsnC family transcriptional regulator  28.57 
 
 		 156 aa  60.5  0.000000007  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.588839  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5648  AsnC family transcriptional regulator  26.12 
 
 		 140 aa  60.5  0.000000007  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.377862 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5584  transcriptional regulator, AsnC family  28.89 
 
 		 153 aa  60.5  0.000000008  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2890  AsnC family transcriptional regulator  27.94 
 
 		 144 aa  60.5  0.000000008  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_0663  AsnC family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 145 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_2154  AsnC family transcriptional regulator  27.46 
 
 		 151 aa  60.5  0.000000009  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_0697  AsnC family transcriptional regulator  27.86 
 
 		 145 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  normal  0.0107782 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4365  AsnC family transcriptional regulator  25.18 
 
 		 153 aa  59.7  0.00000001  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_5570  transcriptional regulator, AsnC family  29.5 
 
 		 145 aa  59.7  0.00000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0663  transcriptional regulator, AsnC family  31.62 
 
 		 153 aa  60.1  0.00000001  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2627  transcriptional regulator, AsnC family  32 
 
 		 308 aa  60.1  0.00000001  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000419459  n/a   
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1990  AsnC family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.67489  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2138  AsnC family transcriptional regulator  27.27 
 
 		 147 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_3088  AsnC family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.296569 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5059  transcriptional regulator, AsnC family  30 
 
 		 146 aa  58.9  0.00000002  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2578  AsnC family transcriptional regulator  24.43 
 
 		 156 aa  58.9  0.00000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.522022  normal  0.412871 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03340  transcriptional regulator, AsnC family  27.64 
 
 		 148 aa  58.9  0.00000002  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.672148 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2322  AsnC family transcriptional regulator  25.19 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000002  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.810886  normal  0.405625 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0700  AsnC family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 143 aa  59.3  0.00000002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A1172  AsnC family transcriptional regulator  25.55 
 
 		 152 aa  58.5  0.00000003  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4681  AsnC family transcriptional regulator  26.67 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000003  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_1123  AsnC family transcriptional regulator  28.06 
 
 		 148 aa  58.5  0.00000003  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.338845  hitchhiker  0.00138165 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_1645  Transcription regulator, AsnC-type-like protein  26.62 
 
 		 148 aa  58.2  0.00000004  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0865  AsnC family transcriptional regulator  32.37 
 
 		 140 aa  58.2  0.00000004  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.271014  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0579  AsnC family transcriptional regulator  27.01 
 
 		 156 aa  58.2  0.00000004  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0684  AsnC family transcriptional regulator  27.74 
 
 		 164 aa  57.8  0.00000005  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.465795  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0777  transcriptional regulator, AsnC family  26.62 
 
 		 156 aa  57.8  0.00000005  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0994  AsnC family transcriptional regulator  25 
 
 		 163 aa  57.8  0.00000005  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_1214  transcriptional regulator, AsnC family  28.89 
 
 		 145 aa  57.4  0.00000006  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1022  AsnC family transcriptional regulator  25 
 
 		 148 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.69535  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1012  AsnC family transcriptional regulator  25 
 
 		 148 aa  57.4  0.00000006  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.824426  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_0806  AsnC family transcriptional regulator  26.06 
 
 		 150 aa  57.4  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_1050  AsnC family transcriptional regulator  27.61 
 
 		 143 aa  57.4  0.00000007  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  0.751551  normal  0.0115287 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3532  AsnC family transcriptional regulator  24.44 
 
 		 140 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_05336  transcriptional regulators Psort location  27.01 
 
 		 151 aa  56.2  0.0000001  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_2150  transcriptional regulator, AsnC family  28.15 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.171869 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4332  AsnC family transcriptional regulator  27.34 
 
 		 164 aa  56.6  0.0000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011992  Dtpsy_0593  transcriptional regulator, AsnC family  27.01 
 
 		 143 aa  56.2  0.0000001  Acidovorax ebreus TPSY  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0948  AsnC family transcriptional regulator  30.15 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.449147 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3230  AsnC family transcriptional regulator  34.29 
 
 		 162 aa  56.6  0.0000001  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2269  transcriptional regulator, AsnC family  25.36 
 
 		 152 aa  55.5  0.0000002  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  0.921895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2602  transcriptional regulator, AsnC family  27.74 
 
 		 163 aa  55.8  0.0000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_2925  transcriptional regulator, AsnC family  23.13 
 
 		 141 aa  55.8  0.0000002  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.820892  normal  1 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2688  transcriptional regulator, AsnC family  26.81 
 
 		 157 aa  55.5  0.0000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  decreased coverage  0.0000432173  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0452  AsnC family transcriptional regulator  27.78 
 
 		 144 aa  55.8  0.0000002  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.348057  normal  1 
 
 
-
 
NC_012792  Vapar_5594  transcriptional regulator, AsnC family  25.9 
 
 		 153 aa  55.5  0.0000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3250  transcriptional regulator AsnC family  27.27 
 
 		 153 aa  56.2  0.0000002  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_1385  transcriptional regulator, AsnC family  29.86 
 
 		 158 aa  55.5  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.990948  normal  1 
 
 
-
 
NC_003296  RS00360  transcription regulator protein  25.93 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000003  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.164175  normal  1 
 
 
-
 
NC_011365  Gdia_0671  transcriptional regulator, AsnC family  26.39 
 
 		 145 aa  55.1  0.0000003  Gluconacetobacter diazotrophicus PAl 5  Bacteria  normal  0.0943569  hitchhiker  0.00922833 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1007  AsnC family transcriptional regulator  28.47 
 
 		 161 aa  55.1  0.0000003  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.620589  normal  0.111043 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00527  transcriptional regulator AsnC/lrp family  28.79 
 
 		 143 aa  54.7  0.0000004  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0388  AsnC family transcriptional regulator  33.62 
 
 		 140 aa  54.7  0.0000004  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  1  normal  0.298931 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3305  transcriptional regulator, AsnC family  29.79 
 
 		 148 aa  55.1  0.0000004  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008062  Bcen_6354  AsnC family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3562  AsnC family transcriptional regulator  26.09 
 
 		 157 aa  54.7  0.0000004  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_1724  AsnC family transcriptional regulator  24.82 
 
 		 154 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>