More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0465 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0465  response regulator receiver protein  100 
 
 		 128 aa  253  8e-67  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000462355 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0251  response regulator receiver protein  41.96 
 
 		 126 aa  95.1  3e-19  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0376  response regulator receiver protein  36.36 
 
 		 125 aa  90.5  6e-18  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1619  response regulator receiver protein  35.85 
 
 		 116 aa  83.6  9e-16  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0452  response regulator receiver protein  39.29 
 
 		 130 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000249276 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_0359  CheY like protein  36.84 
 
 		 120 aa  73.6  0.0000000000008  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.0502207  n/a   
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0707  response regulator receiver protein  31.73 
 
 		 216 aa  71.6  0.000000000003  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1980  response regulator receiver  41.03 
 
 		 126 aa  70.9  0.000000000006  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1619  chemotaxis protein CheY  35.83 
 
 		 119 aa  70.5  0.000000000008  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_1596  response regulator receiver  32.28 
 
 		 130 aa  68.9  0.00000000002  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2316  response regulator receiver protein  44.33 
 
 		 121 aa  68.6  0.00000000003  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1607  response regulator receiver domain-containing protein  35.83 
 
 		 119 aa  68.6  0.00000000003  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000758062  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1771  response regulator receiver protein  34.58 
 
 		 117 aa  68.2  0.00000000004  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10620  response regulator receiver protein  35.58 
 
 		 122 aa  68.2  0.00000000004  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00212992  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_3211  response regulator receiver domain-containing protein  30.17 
 
 		 122 aa  67  0.00000000009  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000000000097826 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_3314  response regulator receiver protein  38.16 
 
 		 124 aa  66.6  0.0000000001  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_4841  response regulator receiver protein  41.86 
 
 		 118 aa  66.6  0.0000000001  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  normal  0.202718  n/a   
 
 
-
 
NC_008228  Patl_3677  response regulator receiver protein  36 
 
 		 315 aa  66.6  0.0000000001  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_1321  response regulator receiver protein  36.63 
 
 		 120 aa  65.5  0.0000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1439  response regulator receiver domain-containing protein  35.09 
 
 		 120 aa  65.1  0.0000000003  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2159  response regulator receiver protein  31.03 
 
 		 120 aa  65.1  0.0000000003  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00200925  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2544  DNA binding domain protein, excisionase family  29.51 
 
 		 264 aa  64.7  0.0000000004  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.0361834  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0126  response regulator receiver domain-containing protein  37.23 
 
 		 120 aa  64.7  0.0000000004  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2935  response regulator receiver protein  30.97 
 
 		 125 aa  64.3  0.0000000005  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  hitchhiker  0.00116443  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_1546  response regulator receiver protein  37.5 
 
 		 122 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1748  chemotaxis response regulator  37.5 
 
 		 122 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_0945  response regulator receiver protein  30.33 
 
 		 120 aa  63.9  0.0000000007  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0428151  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1805  chemotaxis response regulator  37.5 
 
 		 122 aa  63.9  0.0000000007  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.536294  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2019  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 123 aa  63.9  0.0000000008  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1556  response regulator receiver domain-containing protein  30.91 
 
 		 125 aa  63.5  0.0000000008  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.848966  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0108  response regulator receiver domain-containing protein  32.46 
 
 		 120 aa  63.9  0.0000000008  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002939  GSU2816  sensory box histidine kinase/response regulator  25.42 
 
 		 882 aa  63.5  0.0000000009  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2016  response regulator receiver protein  34.75 
 
 		 119 aa  63.5  0.0000000009  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS1541  chemotaxis response regulator  37.5 
 
 		 122 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1517  chemotaxis protein cheY  37.5 
 
 		 122 aa  63.2  0.000000001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1506  chemotaxis protein  37.5 
 
 		 122 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  0.161419  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0986  chemotaxis response regulator  33.02 
 
 		 121 aa  63.2  0.000000001  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_1660  chemotaxis response regulator  37.5 
 
 		 122 aa  63.2  0.000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.241918  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3651  chemotaxis response regulator  35.04 
 
 		 122 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1727  chemotaxis response regulator  37.5 
 
 		 122 aa  63.2  0.000000001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_002967  TDE0149  DNA-binding response regulator  35.06 
 
 		 201 aa  62.4  0.000000002  Treponema denticola ATCC 35405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_1392  response regulator receiver protein  29.06 
 
 		 119 aa  62.4  0.000000002  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_0722  response regulator receiver protein  29.57 
 
 		 121 aa  62.8  0.000000002  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1486  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.42 
 
 		 886 aa  62.4  0.000000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1075  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  27.35 
 
 		 829 aa  62.4  0.000000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    unclonable  2.46099e-33 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0960  response regulator receiver protein  25.86 
 
 		 120 aa  62.4  0.000000002  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1695  chemotaxis response regulator  34.19 
 
 		 122 aa  61.6  0.000000003  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1289  response regulator receiver protein  30.09 
 
 		 125 aa  62  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  2.97319e-30 
 
 
-
 
NC_007519  Dde_0328  response regulator receiver domain-containing protein  29.09 
 
 		 406 aa  62  0.000000003  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. G20  Bacteria  normal  0.918345  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2886  response regulator receiver protein  30.09 
 
 		 125 aa  62  0.000000003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8267e-27 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0972  two component LuxR family transcriptional regulator  34.62 
 
 		 227 aa  61.2  0.000000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.299836  normal  0.0302219 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1372  response regulator receiver protein  31.62 
 
 		 119 aa  61.2  0.000000004  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.000000494587  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU3198  chemotaxis protein CheY  26.72 
 
 		 121 aa  60.8  0.000000005  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1124  response regulator receiver protein  34.29 
 
 		 119 aa  61.2  0.000000005  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1407  response regulator receiver protein  33.04 
 
 		 120 aa  61.2  0.000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.926591  normal  1 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2853  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  33.91 
 
 		 476 aa  60.8  0.000000005  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2798  response regulator receiver  27.59 
 
 		 306 aa  60.8  0.000000006  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.151747  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1885  response regulator receiver protein  28.95 
 
 		 1066 aa  60.8  0.000000006  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  0.166704  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1034  response regulator receiver domain-containing protein  34.88 
 
 		 120 aa  60.8  0.000000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.114962  n/a   
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_1536  response regulator receiver protein  31.82 
 
 		 115 aa  60.5  0.000000007  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2151  multi-sensor hybrid histidine kinase  25.86 
 
 		 1184 aa  60.5  0.000000007  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_0716  signal transduction histidine kinase, nitrogen specific, NtrB  27.83 
 
 		 890 aa  60.5  0.000000007  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0334  response regulator receiver protein  30.68 
 
 		 124 aa  60.5  0.000000008  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  hitchhiker  0.00357504  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0230  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 120 aa  60.5  0.000000009  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0228  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 120 aa  60.5  0.000000009  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2335  response regulator receiver protein  26.79 
 
 		 411 aa  59.7  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.0000388714  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3023  response regulator  34.34 
 
 		 597 aa  60.1  0.00000001  Bacillus cereus E33L  Bacteria  decreased coverage  0.000011368  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3151  response regulator receiver protein  26.55 
 
 		 120 aa  60.1  0.00000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.276361  n/a   
 
 
-
 
NC_009616  Tmel_0931  response regulator receiver protein  27.97 
 
 		 120 aa  59.7  0.00000001  Thermosipho melanesiensis BI429  Bacteria  normal  0.252152  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_1248  response regulator receiver protein  27.36 
 
 		 118 aa  60.1  0.00000001  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_1097  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.14 
 
 		 915 aa  60.1  0.00000001  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_3461  response regulator receiver protein  26.27 
 
 		 122 aa  59.7  0.00000001  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009012  Cthe_1318  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 123 aa  58.9  0.00000002  Clostridium thermocellum ATCC 27405  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0822  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.85 
 
 		 223 aa  58.9  0.00000002  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  0.628591  normal  0.692285 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0803  response regulator receiver domain-containing protein  28.1 
 
 		 120 aa  58.9  0.00000002  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_07590  response regulator receiver protein  31.73 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00000000535524  n/a   
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_0692  response regulator receiver protein  29.91 
 
 		 119 aa  58.9  0.00000002  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0064  response regulator receiver protein  30.09 
 
 		 119 aa  58.9  0.00000002  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2069  multi-sensor hybrid histidine kinase  25 
 
 		 1184 aa  59.3  0.00000002  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2019  GAF sensor hybrid histidine kinase  29.17 
 
 		 1016 aa  59.3  0.00000002  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.25506  normal  1 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1338  response regulator receiver protein  29.82 
 
 		 120 aa  58.5  0.00000003  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  0.376219 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_2382  response regulator receiver protein  28.57 
 
 		 122 aa  58.2  0.00000003  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_1013  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  33.06 
 
 		 456 aa  58.5  0.00000003  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  normal  0.0616674 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0827  acetoacetate metabolism regulatory protein AtoC  33.02 
 
 		 460 aa  58.5  0.00000003  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  0.158461 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0863  response regulator receiver protein  28.7 
 
 		 120 aa  58.5  0.00000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_3394  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.77 
 
 		 560 aa  58.5  0.00000003  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_1342  response regulator receiver protein  34.41 
 
 		 144 aa  58.5  0.00000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.0271909  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2331  response regulator receiver protein  31.2 
 
 		 142 aa  58.2  0.00000004  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00000000425244  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4062  response regulator receiver protein  27.03 
 
 		 129 aa  57.8  0.00000004  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.259152  normal  0.0683436 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2314  sporulation transcriptional activator Spo0A  26.98 
 
 		 259 aa  58.2  0.00000004  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  0.453721  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2908  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.04 
 
 		 860 aa  58.2  0.00000004  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_2606  CheC, inhibitor of MCP methylation  29.66 
 
 		 342 aa  58.2  0.00000004  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  hitchhiker  0.00328703  n/a   
 
 
-
 
NC_013162  Coch_1562  histidine kinase  27.91 
 
 		 1296 aa  58.2  0.00000004  Capnocytophaga ochracea DSM 7271  Bacteria  normal  0.655639  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2129  response regulator receiver protein  27.59 
 
 		 118 aa  57.8  0.00000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_2701  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 120 aa  57.8  0.00000005  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  decreased coverage  0.000335112  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2747  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  25.62 
 
 		 886 aa  57.8  0.00000005  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007954  Sden_1794  response regulator receiver  34.29 
 
 		 320 aa  57.8  0.00000005  Shewanella denitrificans OS217  Bacteria  hitchhiker  0.000277143  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1059  response regulator receiver protein  32.99 
 
 		 127 aa  57.8  0.00000005  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.0577913  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0283  two component, sigma54 specific, transcriptional regulator, Fis family  29.13 
 
 		 456 aa  57.4  0.00000006  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0064  response regulator receiver protein  32.71 
 
 		 119 aa  57.4  0.00000006  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>