More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Nmar_0452 on replicon NC_010085
Organism: Nitrosopumilus maritimus SCM1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_010085  Nmar_0452  response regulator receiver protein  100 
 
 		 130 aa  253  5e-67  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.00000000249276 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1619  response regulator receiver protein  50.47 
 
 		 116 aa  109  1.0000000000000001e-23  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0251  response regulator receiver protein  41.23 
 
 		 126 aa  100  9e-21  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0707  response regulator receiver protein  35.14 
 
 		 216 aa  88.2  4e-17  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0465  response regulator receiver protein  39.29 
 
 		 128 aa  82.4  0.000000000000002  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    hitchhiker  0.000462355 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_0376  response regulator receiver protein  34.78 
 
 		 125 aa  76.6  0.00000000000009  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_1980  response regulator receiver  34.78 
 
 		 126 aa  69.3  0.00000000001  Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2218  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  33.61 
 
 		 1070 aa  68.2  0.00000000004  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  1  normal  0.0765203 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2508  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  32.23 
 
 		 784 aa  66.2  0.0000000001  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  0.033945 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_4464  response regulator receiver domain-containing protein  34.17 
 
 		 250 aa  66.6  0.0000000001  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  1  normal  0.579086 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4508  two component transcriptional regulator, winged helix family  31.71 
 
 		 231 aa  65.5  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_2798  response regulator receiver  29.09 
 
 		 306 aa  65.1  0.0000000003  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  0.151747  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0257  response regulator receiver  31.97 
 
 		 241 aa  64.7  0.0000000004  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.926332  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2272  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  36.36 
 
 		 382 aa  64.7  0.0000000004  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.275022  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1109  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.21 
 
 		 218 aa  64.7  0.0000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_04130  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  33.63 
 
 		 236 aa  63.9  0.0000000006  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.118973  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0784  two component transcriptional regulator  33.63 
 
 		 239 aa  63.5  0.0000000008  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_3276  winged helix family two component transcriptional regulator  30.97 
 
 		 234 aa  63.5  0.0000000009  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.208422  normal  0.192837 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2107  response regulator  29.89 
 
 		 184 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.131412  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1495  response regulator  29.89 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  hitchhiker  0.000357944  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1556  response regulator receiver domain-containing protein  35.09 
 
 		 125 aa  62.8  0.000000001  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.848966  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_2112  Cache sensor hybrid histidine kinase  33.91 
 
 		 1361 aa  62.8  0.000000001  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07910  response regulator with CheY-like receiver domain and winged-helix DNA-binding domain  34.51 
 
 		 239 aa  62.8  0.000000001  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1415  response regulator  29.89 
 
 		 208 aa  62.8  0.000000001  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  0.0114828  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3794  response regulator receiver sensor signal transduction histidine kinase  35.65 
 
 		 376 aa  62.4  0.000000002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.0277983  normal  0.543799 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1034  response regulator receiver domain-containing protein  40 
 
 		 120 aa  62.8  0.000000002  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.114962  n/a   
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0531  response regulator receiver protein  32.71 
 
 		 120 aa  62  0.000000002  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1989  response regulator receiver domain-containing protein  33.61 
 
 		 126 aa  62.8  0.000000002  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_3548  GAF sensor hybrid histidine kinase  37.19 
 
 		 1942 aa  62.4  0.000000002  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2445  response regulator receiver  33.9 
 
 		 125 aa  62.4  0.000000002  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.942791  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1135  response regulator  29.89 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  hitchhiker  0.00129352  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3281  response regulator  29.89 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0546093  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3167  response regulator  29.89 
 
 		 117 aa  62.8  0.000000002  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2401  response regulator  29.89 
 
 		 122 aa  62.4  0.000000002  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.31432  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6507  two component transcriptional regulator  29.66 
 
 		 270 aa  62.8  0.000000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0763131  normal  0.20607 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0308  two component transcriptional regulator  31.86 
 
 		 239 aa  61.6  0.000000003  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3913  LytTR family two component transcriptional regulator  30.25 
 
 		 268 aa  61.6  0.000000003  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.316099  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0693  two component transcriptional regulator, winged helix family  35.04 
 
 		 229 aa  61.2  0.000000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0225  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.03 
 
 		 1418 aa  61.2  0.000000004  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.180068  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_1974  response regulator receiver protein  33.63 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1058  response regulator receiver domain-containing protein  30.33 
 
 		 181 aa  61.2  0.000000004  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  decreased coverage  0.0000718409  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2054  response regulator receiver domain-containing protein  35.34 
 
 		 198 aa  61.6  0.000000004  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  0.595634 
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1889  response regulator receiver protein  33.63 
 
 		 126 aa  61.2  0.000000004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1062  response regulator receiver protein  29.57 
 
 		 120 aa  61.2  0.000000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.58489  hitchhiker  0.0000344775 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_2051  two component transcriptional regulator, winged helix family  32.74 
 
 		 236 aa  60.8  0.000000005  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2998  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.51 
 
 		 807 aa  60.8  0.000000005  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  0.745142 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4549  response regulator receiver protein  29.89 
 
 		 122 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0252334  normal  0.61339 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5173  response regulator receiver protein  29.89 
 
 		 122 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.00428361  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5686  response regulator receiver protein  29.89 
 
 		 122 aa  61.2  0.000000005  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.280105  decreased coverage  0.000257331 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0067  LytTR family two component transcriptional regulator  33.94 
 
 		 268 aa  60.8  0.000000006  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.169577  normal  0.169612 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3467  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  30.7 
 
 		 865 aa  60.5  0.000000007  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007492  Pfl01_2646  multi-sensor hybrid histidine kinase  36.21 
 
 		 1163 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas fluorescens Pf0-1  Bacteria  normal  1  normal  0.898724 
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2002  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.04 
 
 		 1155 aa  60.5  0.000000007  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00831305 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0694  response regulator receiver protein  35.96 
 
 		 119 aa  60.5  0.000000007  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_2480  PAS/PAC sensor hybrid histidine kinase  34.48 
 
 		 846 aa  60.5  0.000000007  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000921222 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0012  response regulator receiver protein  30.95 
 
 		 122 aa  60.5  0.000000008  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.0723201  normal  1 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2739  two component, sigma54 specific, Fis family transcriptional regulator  30.84 
 
 		 451 aa  60.5  0.000000008  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.693002  n/a   
 
 
-
 
NC_008781  Pnap_1073  multi-sensor hybrid histidine kinase  35.34 
 
 		 1158 aa  60.5  0.000000008  Polaromonas naphthalenivorans CJ2  Bacteria  hitchhiker  0.00830683  normal  0.406928 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2106  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.04 
 
 		 1155 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002947  PP_3761  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.04 
 
 		 1155 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.358181  normal  0.485688 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_2159  two component transcriptional regulator, winged helix family  33.75 
 
 		 227 aa  60.1  0.000000009  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.00177162  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_3719  response regulator receiver protein  32.46 
 
 		 123 aa  60.1  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  0.173125  normal  0.315103 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3665  response regulator receiver protein  32.46 
 
 		 123 aa  60.1  0.000000009  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_0126  response regulator receiver domain-containing protein  35 
 
 		 120 aa  60.1  0.000000009  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2906  two component LuxR family transcriptional regulator  29.91 
 
 		 203 aa  60.1  0.000000009  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2142  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.04 
 
 		 1149 aa  60.1  0.000000009  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.694825  hitchhiker  0.00121197 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000289  sensor histidine kinase CqsS  31.09 
 
 		 681 aa  60.1  0.00000001  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.487379  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_1771  response regulator receiver protein  32.74 
 
 		 117 aa  59.7  0.00000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_0913  response regulator receiver protein  32.08 
 
 		 301 aa  60.1  0.00000001  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  0.348072  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_1086  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.62 
 
 		 1431 aa  59.7  0.00000001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_1607  response regulator receiver domain-containing protein  31.58 
 
 		 119 aa  59.7  0.00000001  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000758062  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3035  response regulator receiver domain-containing protein  28.18 
 
 		 127 aa  59.7  0.00000001  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_3574  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.33 
 
 		 301 aa  59.7  0.00000001  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  0.0249095  normal  1 
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1714  two component LuxR family transcriptional regulator  32.14 
 
 		 213 aa  60.1  0.00000001  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  0.975164  hitchhiker  0.000785935 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_1407  response regulator receiver protein  33.33 
 
 		 120 aa  59.7  0.00000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  0.926591  normal  1 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3168  response regulator receiver protein  28.74 
 
 		 122 aa  59.7  0.00000001  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.000557514  normal  0.634749 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_4410  response regulator receiver protein  29.51 
 
 		 131 aa  60.1  0.00000001  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  0.686937 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_0064  response regulator receiver protein  32.73 
 
 		 119 aa  59.7  0.00000001  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_2019  response regulator receiver protein  39.76 
 
 		 123 aa  60.1  0.00000001  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1619  chemotaxis protein CheY  30.7 
 
 		 119 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1097  response regulator receiver protein  29.2 
 
 		 131 aa  58.9  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00801176  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1483  response regulator receiver modulated diguanylate cyclase  35.23 
 
 		 335 aa  59.3  0.00000002  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.882912  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_1083  multi-sensor hybrid histidine kinase  39.74 
 
 		 887 aa  58.9  0.00000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.240403  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_1546  histidine kinase  34.82 
 
 		 545 aa  58.9  0.00000002  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_10620  response regulator receiver protein  38.46 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00212992  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_1989  GAF sensor hybrid histidine kinase  35.65 
 
 		 1937 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2886  response regulator receiver protein  30.77 
 
 		 125 aa  59.3  0.00000002  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  1.8267e-27 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1439  response regulator receiver domain-containing protein  30.91 
 
 		 120 aa  58.9  0.00000002  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B0007  response regulator receiver domain-containing protein  28.05 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.0579548  normal  1 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4958  response regulator receiver protein  28.74 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.382884  normal  0.0760928 
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3831  GAF sensor hybrid histidine kinase  32.79 
 
 		 1177 aa  59.3  0.00000002  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  normal  0.195944  normal  0.0220401 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1219  response regulator receiver protein  31.19 
 
 		 126 aa  58.9  0.00000002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6147  two component transcriptional regulator, winged helix family  28.57 
 
 		 244 aa  58.9  0.00000002  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.200947 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4143  response regulator receiver protein  27.59 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.144227  normal  1 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_1671  histidine kinase  35.65 
 
 		 1937 aa  58.9  0.00000002  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2340  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.5 
 
 		 217 aa  59.3  0.00000002  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.273151  normal  1 
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06089  transmembrane sensor histidine kinase  31.93 
 
 		 681 aa  58.9  0.00000002  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1894  sporulation transcriptional activator Spo0A  30.58 
 
 		 281 aa  59.3  0.00000002  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00000000258911  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_2177  response regulator receiver protein  29.2 
 
 		 120 aa  59.3  0.00000002  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5511  response regulator receiver protein  28.74 
 
 		 122 aa  59.3  0.00000002  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  0.0318397 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>