110 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_1668 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_014210  Ndas_1668  protein of unknown function DUF418  100 
 
 
420 aa  810    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.620816  normal 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0622  hypothetical protein  48.85 
 
 
439 aa  337  1.9999999999999998e-91  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3607  protein of unknown function DUF418  51.26 
 
 
407 aa  323  5e-87  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.526186  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3111  protein of unknown function DUF418  49.88 
 
 
443 aa  293  5e-78  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.414343  normal 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_15990  predicted membrane protein  46.87 
 
 
414 aa  277  2e-73  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.76161  normal  0.230384 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1063  protein of unknown function DUF405  46.95 
 
 
472 aa  270  2.9999999999999997e-71  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.397871 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1461  hypothetical protein  44.53 
 
 
401 aa  263  3e-69  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.586682  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2581  hypothetical protein  43.66 
 
 
388 aa  254  2.0000000000000002e-66  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.365833  normal  0.0605789 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_24880  predicted membrane protein  42.54 
 
 
432 aa  222  9.999999999999999e-57  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0615892  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8135  hypothetical protein  40 
 
 
397 aa  218  1e-55  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.026592  normal  0.136087 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1670  hypothetical protein  38.88 
 
 
405 aa  204  3e-51  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.704713  normal  0.19338 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1416  protein of unknown function DUF405  41.31 
 
 
407 aa  199  6e-50  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.548338  normal 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_0505  protein of unknown function DUF418  40 
 
 
407 aa  192  1e-47  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  decreased coverage  0.000000344824 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3529  protein of unknown function DUF418  38.64 
 
 
398 aa  191  2e-47  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.296308  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0072  hypothetical protein  40.56 
 
 
380 aa  186  6e-46  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.484765  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4741  hypothetical protein  39.56 
 
 
392 aa  186  7e-46  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.400946  normal  0.447309 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1415  protein of unknown function DUF405  40.82 
 
 
399 aa  186  8e-46  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.845184  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0719  protein of unknown function DUF418  40.44 
 
 
405 aa  180  4e-44  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.699875  normal  0.0836204 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2152  hypothetical protein  32.84 
 
 
393 aa  179  7e-44  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.391046 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0035  hypothetical protein  37.34 
 
 
402 aa  179  8e-44  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1078  protein of unknown function DUF418  37.47 
 
 
384 aa  171  2e-41  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4293  protein of unknown function DUF418  38.94 
 
 
390 aa  168  1e-40  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1236  hypothetical protein  39.04 
 
 
399 aa  154  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0984  protein of unknown function DUF418  41.27 
 
 
387 aa  147  5e-34  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0392587  normal 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_07880  predicted membrane protein  35.77 
 
 
407 aa  138  2e-31  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3780  hypothetical protein  34.89 
 
 
401 aa  132  1.0000000000000001e-29  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.769148 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4159  hypothetical protein  33.92 
 
 
401 aa  109  1e-22  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  0.776458  decreased coverage  0.000152397 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2115  protein of unknown function DUF418  28.57 
 
 
412 aa  101  3e-20  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_4423  hypothetical protein  30.31 
 
 
417 aa  100  4e-20  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  hitchhiker  0.00407884  normal  0.808497 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2327  hypothetical protein  30.64 
 
 
388 aa  90.9  3e-17  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0455  hypothetical protein  28.78 
 
 
415 aa  88.2  3e-16  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.222068  hitchhiker  0.00425561 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4881  hypothetical protein  25.49 
 
 
390 aa  84.7  0.000000000000002  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  hitchhiker  0.00420784  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0045  hypothetical protein  25.3 
 
 
389 aa  83.2  0.000000000000008  Bacillus cereus G9842  Bacteria  unclonable  0.00000000457904  unclonable  9.769680000000001e-26 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0683  protein of unknown function DUF405  26.57 
 
 
387 aa  80.5  0.00000000000006  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_2860  protein of unknown function DUF418  28.33 
 
 
415 aa  80.1  0.00000000000006  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_0076  protein of unknown function DUF418  28.12 
 
 
416 aa  79.7  0.0000000000001  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.477208  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_30910  predicted membrane protein  28.54 
 
 
392 aa  75.5  0.000000000002  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2885  protein of unknown function DUF405  29.45 
 
 
414 aa  74.3  0.000000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.802913  normal 
 
 
-
 
NC_005707  BCE_A0015  hypothetical protein  21.91 
 
 
381 aa  73.2  0.000000000008  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  0.428508  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_3067  hypothetical protein  29.53 
 
 
404 aa  73.2  0.000000000008  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_3087  hypothetical protein  33.12 
 
 
411 aa  72.8  0.00000000001  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0746  protein of unknown function DUF405  32.24 
 
 
204 aa  72.4  0.00000000001  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal  0.685935 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_00200  predicted membrane protein  24.88 
 
 
397 aa  72.4  0.00000000001  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal  0.220914 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1066  hypothetical protein  28.3 
 
 
401 aa  71.6  0.00000000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1661  transport protein  25.3 
 
 
430 aa  72.4  0.00000000002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.414626  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_1608  hypothetical protein  25.06 
 
 
430 aa  72  0.00000000002  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_2066  protein of unknown function DUF418  27.34 
 
 
404 aa  71.6  0.00000000002  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.0837783  normal 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_3078  hypothetical protein  22.72 
 
 
411 aa  70.9  0.00000000004  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_0285  protein of unknown function DUF418  25.84 
 
 
409 aa  70.5  0.00000000005  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_1289  protein of unknown function DUF405  32.89 
 
 
401 aa  70.5  0.00000000006  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal  0.34904 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_3230  hypothetical protein  31.85 
 
 
411 aa  70.1  0.00000000007  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007322  GBAA_pXO1_0117  membrane protein  22.81 
 
 
381 aa  69.7  0.0000000001  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  hitchhiker  0.000725343  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_1538  protein of unknown function DUF405  27.92 
 
 
406 aa  68.9  0.0000000002  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_3571  protein of unknown function DUF418  26.67 
 
 
405 aa  68.6  0.0000000002  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.983337  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_0252  protein of unknown function DUF405  30.53 
 
 
410 aa  67.8  0.0000000003  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  normal  0.680617 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4921  hypothetical protein  25 
 
 
265 aa  66.6  0.0000000009  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  hitchhiker  0.0008351  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0733  protein of unknown function DUF405  27.62 
 
 
398 aa  65.9  0.000000001  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2290  protein of unknown function DUF405  26.45 
 
 
391 aa  65.9  0.000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.578329  normal  0.0235381 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0190  hypothetical protein  28.98 
 
 
428 aa  64.3  0.000000003  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.55784  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_2201  hypothetical protein  28.31 
 
 
416 aa  63.9  0.000000005  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  0.964455  normal  0.524788 
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2799  hypothetical protein  24.52 
 
 
414 aa  63.9  0.000000005  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_0820  hypothetical protein  30.24 
 
 
365 aa  63.9  0.000000005  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_0775  hypothetical protein  26.9 
 
 
401 aa  63.2  0.000000008  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  hitchhiker  0.0095945  normal  0.285929 
 
 
-
 
NC_004347  SO_1396  hypothetical protein  23.5 
 
 
399 aa  62.8  0.00000001  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2882  hypothetical protein  30 
 
 
414 aa  61.6  0.00000003  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_4097  hypothetical protein  26.8 
 
 
399 aa  59.7  0.0000001  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1203  hypothetical protein  28.19 
 
 
398 aa  58.2  0.0000003  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3566  protein of unknown function DUF418  35.66 
 
 
459 aa  58.2  0.0000003  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  normal  0.726105 
 
 
-
 
NC_011655  BCAH187_C0179  hypothetical protein  21.27 
 
 
381 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.000571802  hitchhiker  1.74871e-35 
 
 
-
 
NC_011777  BCAH820_B0178  hypothetical protein  30.5 
 
 
381 aa  57.8  0.0000004  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1499  protein of unknown function DUF405  26.21 
 
 
388 aa  57.4  0.0000005  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1628  hypothetical protein  31.71 
 
 
387 aa  56.2  0.000001  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.000608067  n/a   
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1171  protein of unknown function DUF418  26.07 
 
 
394 aa  55.5  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010655  Amuc_1736  protein of unknown function DUF405  25.95 
 
 
410 aa  55.5  0.000002  Akkermansia muciniphila ATCC BAA-835  Bacteria  normal  0.310002  normal 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2978  hypothetical protein  33.33 
 
 
414 aa  55.1  0.000003  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01909  transport protein  29.64 
 
 
409 aa  54.7  0.000003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.694528  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A5273  hypothetical protein  31.03 
 
 
312 aa  53.9  0.000005  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B3717  hypothetical protein  29.7 
 
 
387 aa  53.5  0.000007  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_1818  hypothetical protein  25.14 
 
 
415 aa  53.5  0.000008  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  normal  0.993356 
 
 
-
 
NC_012880  Dd703_2305  hypothetical protein  33.58 
 
 
391 aa  53.1  0.000008  Dickeya dadantii Ech703  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013730  Slin_3565  protein of unknown function DUF418  31.82 
 
 
431 aa  53.1  0.000009  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  0.708888  normal  0.443247 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4804  transmembrane protein  30.34 
 
 
312 aa  52.8  0.00001  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  hitchhiker  0.000142062  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_2840  hypothetical protein  26.38 
 
 
414 aa  52.4  0.00001  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.110654 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4479  membrane spanning protein  27.5 
 
 
340 aa  51.2  0.00004  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1739  hypothetical protein  31.4 
 
 
387 aa  50.8  0.00004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  hitchhiker  0.00248027  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_1561  hypothetical protein  38.36 
 
 
393 aa  50.4  0.00005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4889  hypothetical protein  27.5 
 
 
340 aa  50.4  0.00006  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4497  membrane spanning protein  27.5 
 
 
340 aa  50.1  0.00008  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012912  Dd1591_2404  hypothetical protein  30.77 
 
 
382 aa  50.1  0.00008  Dickeya zeae Ech1591  Bacteria  normal  0.334101  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4858  hypothetical protein  26.58 
 
 
340 aa  49.7  0.00009  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1699  hypothetical protein  30.58 
 
 
387 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4868  hypothetical protein  26.88 
 
 
340 aa  49.3  0.0001  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4644  hypothetical protein  26.58 
 
 
340 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_4998  hypothetical protein  26.58 
 
 
340 aa  48.5  0.0002  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_3043  hypothetical protein  32 
 
 
382 aa  48.9  0.0002  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0379  hypothetical protein  27.89 
 
 
340 aa  48.9  0.0002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK1450  hypothetical protein  27.54 
 
 
387 aa  47.4  0.0005  Bacillus cereus E33L  Bacteria  hitchhiker  0.000207641  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1888  hypothetical protein  26.32 
 
 
389 aa  47.4  0.0005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_1449  hypothetical protein  22.78 
 
 
387 aa  47  0.0006  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  0.831542  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_1663  hypothetical protein  22.78 
 
 
387 aa  47  0.0006  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>