More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ndas_0174 on replicon NC_014210
Organism: Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013510  Tcur_3546  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  72.54 
 
 
531 aa  770    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0614  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  81.29 
 
 
528 aa  825    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86187  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1236  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  64.84 
 
 
531 aa  664    Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.276789 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7791  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  66.79 
 
 
535 aa  685    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.443673 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3637  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  66.1 
 
 
529 aa  674    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2814  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  70.89 
 
 
529 aa  767    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1093  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  65.9 
 
 
529 aa  680    Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2536  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  63.14 
 
 
529 aa  667    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0175573  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2276  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  61.81 
 
 
529 aa  657    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000102369 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0709  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  66.98 
 
 
530 aa  689    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.484859  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0174  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  100 
 
 
529 aa  1043    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.996447  normal  0.371451 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8047  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  73.16 
 
 
529 aa  782    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0328727  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1126  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  64.27 
 
 
531 aa  657    Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000124748 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3385  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  67.43 
 
 
536 aa  688    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.367289  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4312  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  60.11 
 
 
533 aa  602  1.0000000000000001e-171  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08910  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  58.37 
 
 
531 aa  598  1e-170  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08560  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  59.32 
 
 
531 aa  600  1e-170  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.461142  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4068  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  63.05 
 
 
533 aa  593  1e-168  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.568841  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2856  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  55.6 
 
 
528 aa  565  1e-160  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1471  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  54.99 
 
 
530 aa  562  1.0000000000000001e-159  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00147089  normal  0.075058 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6017  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  57.5 
 
 
532 aa  554  1e-156  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.214925  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18780  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  55.16 
 
 
535 aa  551  1e-155  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0156164  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3225  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  53.82 
 
 
531 aa  548  1e-154  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13011  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  55.79 
 
 
528 aa  541  1e-153  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000841945  normal  0.820914 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4234  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  57.12 
 
 
528 aa  539  9.999999999999999e-153  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.203577  normal  0.41809 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2128  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  56.55 
 
 
528 aa  530  1e-149  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1910  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  54.65 
 
 
528 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.890693  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1956  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  54.65 
 
 
528 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176743  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1890  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  54.65 
 
 
528 aa  516  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.168381 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0837  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  47.07 
 
 
527 aa  461  9.999999999999999e-129  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.746889  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1530  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  49.41 
 
 
527 aa  446  1.0000000000000001e-124  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0009  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  44.92 
 
 
530 aa  444  1e-123  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0352108  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0010  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  45.42 
 
 
527 aa  418  9.999999999999999e-116  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.155189  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2306  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  43.24 
 
 
531 aa  409  1e-113  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.551653  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0014  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  42.05 
 
 
526 aa  405  1.0000000000000001e-112  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00744014  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1873  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  44.16 
 
 
526 aa  405  1e-111  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00847931 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2125  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.85 
 
 
531 aa  397  1e-109  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000018587  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4340  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.01 
 
 
526 aa  393  1e-108  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2150  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.97 
 
 
528 aa  390  1e-107  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.204731  normal  0.434509 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3561  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  43.13 
 
 
541 aa  392  1e-107  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0818825  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0012  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  42.41 
 
 
526 aa  388  1e-106  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.578759  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0527  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.54 
 
 
528 aa  387  1e-106  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.209223  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0039  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.73 
 
 
525 aa  387  1e-106  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00530837  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05241  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.97 
 
 
528 aa  386  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1224  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.2 
 
 
523 aa  384  1e-105  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2699  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.25 
 
 
528 aa  381  1e-104  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000966677  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0574  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.42 
 
 
526 aa  380  1e-104  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3375  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.05 
 
 
652 aa  381  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.973939 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2164  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.15 
 
 
534 aa  377  1e-103  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0599  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.83 
 
 
526 aa  373  1e-102  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0013465  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_539  phosphoglycerate dehydrogenase  40.83 
 
 
526 aa  373  1e-102  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.366241  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2428  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.33 
 
 
525 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1431  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.8 
 
 
523 aa  374  1e-102  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0875304 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3759  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.84 
 
 
526 aa  375  1e-102  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000435115  normal  0.110256 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4196  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.31 
 
 
527 aa  375  1e-102  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2377  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.33 
 
 
525 aa  373  1e-102  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2156  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.26 
 
 
526 aa  374  1e-102  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15401  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.75 
 
 
528 aa  372  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0931759  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3521  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  42.32 
 
 
529 aa  372  1e-101  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.598848  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2968  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.58 
 
 
529 aa  371  1e-101  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0896  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.8 
 
 
527 aa  369  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.643854  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1452  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.75 
 
 
528 aa  370  1e-101  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0020  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  44.36 
 
 
525 aa  372  1e-101  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.173691  hitchhiker  0.000002432 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0439  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.47 
 
 
532 aa  372  1e-101  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0587451  normal  0.906143 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2385  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.94 
 
 
523 aa  370  1e-101  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.917938  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1018  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.8 
 
 
527 aa  369  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000612711 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17821  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.04 
 
 
528 aa  371  1e-101  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.877269 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1850  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.86 
 
 
527 aa  372  1e-101  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1821  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.77 
 
 
523 aa  370  1e-101  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1189  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.69 
 
 
535 aa  366  1e-100  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0926  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.84 
 
 
528 aa  368  1e-100  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2197  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.81 
 
 
525 aa  368  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000367655  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1436  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.5 
 
 
524 aa  366  1e-100  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0616  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.23 
 
 
528 aa  368  1e-100  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.640549 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1084  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  42.29 
 
 
524 aa  367  1e-100  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00214537  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2138  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.81 
 
 
525 aa  365  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15551  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.19 
 
 
528 aa  367  1e-100  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2650  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.66 
 
 
528 aa  365  1e-99  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14091  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.6 
 
 
528 aa  364  2e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.187324  normal  0.0498894 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3063  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.38 
 
 
528 aa  364  2e-99  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.737613  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4106  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.62 
 
 
529 aa  364  2e-99  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.885327  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2852  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.23 
 
 
527 aa  363  4e-99  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00180336  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0567  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.52 
 
 
523 aa  363  6e-99  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4789  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.46 
 
 
529 aa  361  2e-98  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1082  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.45 
 
 
523 aa  361  2e-98  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0835  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.45 
 
 
523 aa  360  3e-98  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4778  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.96 
 
 
527 aa  360  4e-98  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.801669 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1119  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.42 
 
 
529 aa  360  4e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.480596  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1231  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.3 
 
 
529 aa  359  7e-98  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.325344  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1315  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.27 
 
 
529 aa  359  7e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.357791 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1826  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.89 
 
 
529 aa  357  1.9999999999999998e-97  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.94456 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2618  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.27 
 
 
531 aa  357  1.9999999999999998e-97  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.497758  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3905  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.27 
 
 
529 aa  356  5e-97  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1269  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.81 
 
 
529 aa  356  5e-97  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0254425 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0261  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.42 
 
 
531 aa  356  5.999999999999999e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0263  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.58 
 
 
524 aa  355  8.999999999999999e-97  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.542041  normal  0.03617 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4685  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.08 
 
 
525 aa  355  1e-96  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.436149 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3649  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.95 
 
 
526 aa  355  1e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0277903  normal  0.752498 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0259  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.12 
 
 
529 aa  354  2e-96  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1779  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.07 
 
 
534 aa  353  2.9999999999999997e-96  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.742834  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>