More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Sterm_2699 on replicon NC_013517
Organism: Sebaldella termitidis ATCC 33386



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013517  Sterm_2699  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  100 
 
 
528 aa  1057    Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000966677  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0009  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  50.96 
 
 
530 aa  502  1e-141  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0352108  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4340  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.59 
 
 
526 aa  433  1e-120  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2306  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  44.82 
 
 
531 aa  435  1e-120  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.551653  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0010  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  43.8 
 
 
527 aa  424  1e-117  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.155189  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3759  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.49 
 
 
526 aa  414  1e-114  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000435115  normal  0.110256 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3375  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.87 
 
 
652 aa  414  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.973939 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2377  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.38 
 
 
525 aa  409  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2428  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.38 
 
 
525 aa  409  1e-113  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2156  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.17 
 
 
526 aa  399  9.999999999999999e-111  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0527  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.72 
 
 
528 aa  401  9.999999999999999e-111  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.209223  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4778  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.11 
 
 
527 aa  400  9.999999999999999e-111  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.801669 
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0014  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.25 
 
 
526 aa  400  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00744014  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1821  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.32 
 
 
523 aa  398  1e-109  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0039  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.32 
 
 
525 aa  396  1e-109  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00530837  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2150  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.72 
 
 
528 aa  397  1e-109  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.204731  normal  0.434509 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1501  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.16 
 
 
546 aa  395  1e-109  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2125  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  43.39 
 
 
531 aa  396  1e-109  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000018587  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4196  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.95 
 
 
527 aa  398  1e-109  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0835  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.32 
 
 
523 aa  397  1e-109  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0012  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.13 
 
 
526 aa  392  1e-108  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.578759  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0837  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.11 
 
 
527 aa  393  1e-108  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.746889  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1189  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  42.83 
 
 
535 aa  394  1e-108  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1082  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.57 
 
 
523 aa  390  1e-107  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2197  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.62 
 
 
525 aa  390  1e-107  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000367655  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15151  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.08 
 
 
528 aa  390  1e-107  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3546  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.54 
 
 
531 aa  387  1e-106  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3521  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.62 
 
 
529 aa  385  1e-106  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.598848  normal 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0432  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.96 
 
 
524 aa  385  1e-106  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1231  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.62 
 
 
529 aa  382  1e-105  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.325344  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0639  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.06 
 
 
535 aa  383  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.295873 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0900  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.21 
 
 
523 aa  379  1e-104  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1452  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.72 
 
 
528 aa  382  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3649  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.56 
 
 
526 aa  381  1e-104  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0277903  normal  0.752498 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0174  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.25 
 
 
529 aa  381  1e-104  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.996447  normal  0.371451 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08910  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.32 
 
 
531 aa  377  1e-103  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11540  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.82 
 
 
527 aa  377  1e-103  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00507142  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15401  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.16 
 
 
528 aa  378  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0931759  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0261  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.75 
 
 
531 aa  377  1e-103  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0567  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.92 
 
 
523 aa  377  1e-103  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3595  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.11 
 
 
531 aa  376  1e-103  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.86096  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15551  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.35 
 
 
528 aa  378  1e-103  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05241  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.28 
 
 
528 aa  377  1e-103  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_002936  DET0599  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.85 
 
 
526 aa  372  1e-102  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0013465  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1826  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.82 
 
 
529 aa  374  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.94456 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0614  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  42.51 
 
 
528 aa  374  1e-102  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86187  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0660  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.78 
 
 
535 aa  373  1e-102  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.288846 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1315  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.45 
 
 
529 aa  373  1e-102  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.357791 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3063  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.61 
 
 
528 aa  375  1e-102  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.737613  normal 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_6798  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.55 
 
 
531 aa  373  1e-102  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.902777  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_539  phosphoglycerate dehydrogenase  37.48 
 
 
526 aa  372  1e-102  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.366241  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1224  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.88 
 
 
523 aa  374  1e-102  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3100  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38 
 
 
525 aa  375  1e-102  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.659114 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0010  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.49 
 
 
531 aa  375  1e-102  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.570425  hitchhiker  0.00544887 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0672  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.97 
 
 
535 aa  373  1e-102  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.472751  normal  0.0431754 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17821  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.41 
 
 
528 aa  372  1e-102  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.877269 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1850  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.95 
 
 
527 aa  372  1e-102  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0574  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.85 
 
 
526 aa  372  1e-101  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0926  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.22 
 
 
528 aa  369  1e-101  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2618  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.07 
 
 
531 aa  369  1e-101  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.497758  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3905  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.09 
 
 
529 aa  370  1e-101  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4789  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.57 
 
 
529 aa  372  1e-101  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1873  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.19 
 
 
526 aa  370  1e-101  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00847931 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2164  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.09 
 
 
534 aa  369  1e-101  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0020  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.74 
 
 
531 aa  369  1e-101  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2968  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.49 
 
 
529 aa  368  1e-100  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1352  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.74 
 
 
534 aa  369  1e-100  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3637  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.54 
 
 
529 aa  369  1e-100  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2138  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.92 
 
 
525 aa  368  1e-100  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4106  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.45 
 
 
529 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.885327  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1269  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.39 
 
 
529 aa  368  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0254425 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4467  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.12 
 
 
526 aa  367  1e-100  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0468875  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3192  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.05 
 
 
531 aa  367  1e-100  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0709  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.98 
 
 
530 aa  366  1e-100  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.484859  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3561  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.17 
 
 
541 aa  365  1e-99  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0818825  normal 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0020  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.19 
 
 
525 aa  365  1e-99  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.173691  hitchhiker  0.000002432 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2814  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.03 
 
 
529 aa  364  2e-99  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3486  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.67 
 
 
531 aa  364  2e-99  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.158391 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2680  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.45 
 
 
540 aa  364  2e-99  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1202  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.58 
 
 
528 aa  364  2e-99  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.661102  normal 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0814  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.72 
 
 
529 aa  365  2e-99  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119542  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1093  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.45 
 
 
529 aa  364  2e-99  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0259  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.04 
 
 
529 aa  363  4e-99  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2650  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.43 
 
 
528 aa  363  5.0000000000000005e-99  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4685  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.74 
 
 
525 aa  362  7.0000000000000005e-99  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.436149 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1236  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.71 
 
 
531 aa  362  8e-99  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.276789 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3021  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.87 
 
 
531 aa  362  9e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.487247 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1119  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.3 
 
 
529 aa  361  2e-98  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.480596  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1760  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.98 
 
 
531 aa  360  2e-98  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1188  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.63 
 
 
526 aa  360  5e-98  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1126  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.29 
 
 
531 aa  359  8e-98  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000124748 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2852  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.16 
 
 
527 aa  359  8e-98  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00180336  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0439  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.97 
 
 
532 aa  358  1.9999999999999998e-97  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0587451  normal  0.906143 
 
 
-
 
NC_010511  M446_6394  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.6 
 
 
531 aa  357  2.9999999999999997e-97  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  normal  0.224939 
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0922  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.93 
 
 
527 aa  357  3.9999999999999996e-97  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14091  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.03 
 
 
528 aa  356  6.999999999999999e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.187324  normal  0.0498894 
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1423  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  34.47 
 
 
527 aa  355  1e-96  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8047  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.77 
 
 
529 aa  355  2e-96  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0328727  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1431  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.43 
 
 
523 aa  354  2e-96  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0875304 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3161  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.66 
 
 
532 aa  354  2e-96  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>