More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Swol_0009 on replicon NC_008346
Organism: Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008346  Swol_0009  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  100 
 
 
530 aa  1065    Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0352108  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2699  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  50.96 
 
 
528 aa  502  1e-141  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000966677  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2125  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  47.34 
 
 
531 aa  478  1e-133  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000018587  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4340  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  44.81 
 
 
526 aa  476  1e-133  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0010  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  48.27 
 
 
527 aa  472  1e-132  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.155189  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1189  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  47.01 
 
 
535 aa  469  1.0000000000000001e-131  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0014  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  44.62 
 
 
526 aa  471  1.0000000000000001e-131  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00744014  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2306  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  46.86 
 
 
531 aa  463  1e-129  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.551653  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0012  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  44.81 
 
 
526 aa  456  1e-127  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.578759  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0567  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  44.17 
 
 
523 aa  445  1.0000000000000001e-124  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0174  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  44.92 
 
 
529 aa  444  1e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.996447  normal  0.371451 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3063  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  44.98 
 
 
528 aa  441  9.999999999999999e-123  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.737613  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1224  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.89 
 
 
523 aa  435  1e-120  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8047  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  43.74 
 
 
529 aa  427  1e-118  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0328727  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0837  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  43.44 
 
 
527 aa  425  1e-118  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.746889  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1431  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  44.02 
 
 
523 aa  423  1e-117  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0875304 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2164  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  43.4 
 
 
534 aa  424  1e-117  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3546  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  43.74 
 
 
531 aa  422  1e-117  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2385  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.31 
 
 
523 aa  422  1e-117  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.917938  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0439  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  42.39 
 
 
532 aa  424  1e-117  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0587451  normal  0.906143 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1850  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.54 
 
 
527 aa  422  1e-117  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1826  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.27 
 
 
529 aa  420  1e-116  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.94456 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0020  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  45.31 
 
 
525 aa  421  1e-116  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.173691  hitchhiker  0.000002432 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2814  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  42.94 
 
 
529 aa  417  9.999999999999999e-116  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0039  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  42.72 
 
 
525 aa  415  9.999999999999999e-116  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00530837  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0835  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.01 
 
 
523 aa  414  1e-114  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0900  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.39 
 
 
523 aa  412  1e-114  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1821  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.81 
 
 
523 aa  415  1e-114  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1082  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.23 
 
 
523 aa  409  1e-113  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2968  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.07 
 
 
529 aa  411  1e-113  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1231  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.92 
 
 
529 aa  411  1e-113  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.325344  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1423  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.27 
 
 
527 aa  407  1.0000000000000001e-112  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1543  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  42.2 
 
 
527 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00623773  hitchhiker  0.0000362163 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3375  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.51 
 
 
652 aa  405  1.0000000000000001e-112  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.973939 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0614  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  44.32 
 
 
528 aa  402  1e-111  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86187  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3905  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.12 
 
 
529 aa  403  1e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1236  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.83 
 
 
531 aa  399  9.999999999999999e-111  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.276789 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4106  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.88 
 
 
529 aa  401  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.885327  normal 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11540  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.07 
 
 
527 aa  400  9.999999999999999e-111  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00507142  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0709  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  42.75 
 
 
530 aa  401  9.999999999999999e-111  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.484859  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2138  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.62 
 
 
525 aa  400  9.999999999999999e-111  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4789  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.54 
 
 
529 aa  399  9.999999999999999e-111  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08910  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.04 
 
 
531 aa  396  1e-109  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3637  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.97 
 
 
529 aa  395  1e-109  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1315  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.35 
 
 
529 aa  397  1e-109  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.357791 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0786  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.5 
 
 
527 aa  397  1e-109  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3649  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.27 
 
 
526 aa  396  1e-109  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0277903  normal  0.752498 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2197  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.42 
 
 
525 aa  395  1e-109  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000367655  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1126  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.44 
 
 
531 aa  396  1e-109  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000124748 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1119  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.92 
 
 
529 aa  394  1e-108  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.480596  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3161  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.49 
 
 
532 aa  394  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0432  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.01 
 
 
524 aa  392  1e-108  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0259  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.42 
 
 
529 aa  395  1e-108  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2852  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.47 
 
 
527 aa  391  1e-107  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00180336  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1093  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.62 
 
 
529 aa  385  1e-106  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2428  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.46 
 
 
525 aa  388  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3561  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.04 
 
 
541 aa  385  1e-106  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0818825  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2377  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.46 
 
 
525 aa  388  1e-106  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2856  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.31 
 
 
528 aa  383  1e-105  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0672  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.73 
 
 
535 aa  384  1e-105  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.472751  normal  0.0431754 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3759  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.5 
 
 
526 aa  383  1e-105  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000435115  normal  0.110256 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0660  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.54 
 
 
535 aa  384  1e-105  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.288846 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1269  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.62 
 
 
529 aa  384  1e-105  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0254425 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1452  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.95 
 
 
528 aa  384  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3100  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.35 
 
 
525 aa  384  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.659114 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0077  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.73 
 
 
528 aa  384  1e-105  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0639  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.89 
 
 
535 aa  382  1e-105  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.295873 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3521  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  42.6 
 
 
529 aa  384  1e-105  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.598848  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15401  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.76 
 
 
528 aa  383  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0931759  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3225  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.19 
 
 
531 aa  381  1e-104  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2618  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.92 
 
 
531 aa  381  1e-104  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.497758  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0710  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.63 
 
 
542 aa  381  1e-104  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.196237  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2156  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.31 
 
 
526 aa  380  1e-104  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1530  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.46 
 
 
527 aa  379  1e-104  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4312  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.84 
 
 
533 aa  382  1e-104  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15151  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.14 
 
 
528 aa  382  1e-104  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0922  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.52 
 
 
527 aa  377  1e-103  Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2150  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.54 
 
 
528 aa  378  1e-103  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.204731  normal  0.434509 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1501  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.55 
 
 
546 aa  376  1e-103  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1202  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.85 
 
 
528 aa  377  1e-103  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.661102  normal 
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1887  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.54 
 
 
528 aa  377  1e-103  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4778  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.88 
 
 
527 aa  378  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.801669 
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1188  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.31 
 
 
526 aa  377  1e-103  Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4196  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.5 
 
 
527 aa  377  1e-103  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1760  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.77 
 
 
531 aa  376  1e-103  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7791  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.8 
 
 
535 aa  377  1e-103  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.443673 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3860  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.7 
 
 
539 aa  376  1e-103  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000678395  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2536  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.07 
 
 
529 aa  376  1e-103  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0175573  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15551  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.19 
 
 
528 aa  377  1e-103  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0793  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.61 
 
 
529 aa  375  1e-102  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003912  CJE0970  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.52 
 
 
527 aa  374  1e-102  Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3115  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.26 
 
 
535 aa  374  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00187643  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0527  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.15 
 
 
528 aa  372  1e-102  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.209223  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2378  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.53 
 
 
541 aa  375  1e-102  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0367603  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2276  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.88 
 
 
529 aa  374  1e-102  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000102369 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2256  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.57 
 
 
532 aa  372  1e-102  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6017  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.53 
 
 
532 aa  372  1e-102  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.214925  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0900  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.52 
 
 
527 aa  375  1e-102  Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05241  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.34 
 
 
528 aa  372  1e-102  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0926  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.54 
 
 
528 aa  370  1e-101  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>