More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Arth_2536 on replicon NC_008541
Organism: Arthrobacter sp. FB24



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_012803  Mlut_08560  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  68.71 
 
 
531 aa  693    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.461142  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0614  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  62.19 
 
 
528 aa  644    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86187  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0174  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  63.14 
 
 
529 aa  692    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.996447  normal  0.371451 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8047  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  62.57 
 
 
529 aa  675    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0328727  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2814  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  62.19 
 
 
529 aa  674    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2536  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  100 
 
 
529 aa  1046    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0175573  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3546  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  60.61 
 
 
531 aa  665    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3385  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  65.52 
 
 
536 aa  671    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.367289  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7791  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  64.39 
 
 
535 aa  684    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.443673 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2276  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  96.22 
 
 
529 aa  986    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000102369 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0709  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  60.72 
 
 
530 aa  629  1e-179  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.484859  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3637  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  58.86 
 
 
529 aa  621  1e-177  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1093  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  58.67 
 
 
529 aa  621  1e-177  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1236  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  58.22 
 
 
531 aa  598  1e-170  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.276789 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1126  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  57.47 
 
 
531 aa  594  1e-168  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000124748 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18780  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  58.16 
 
 
535 aa  585  1e-166  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0156164  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4068  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  57.69 
 
 
533 aa  574  1.0000000000000001e-162  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.568841  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4312  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  55.39 
 
 
533 aa  565  1e-160  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08910  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  52.56 
 
 
531 aa  566  1e-160  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6017  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  53.79 
 
 
532 aa  551  1e-155  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.214925  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1471  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  51.32 
 
 
530 aa  541  1e-153  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00147089  normal  0.075058 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3225  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  50.38 
 
 
531 aa  538  1e-151  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2856  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  51.04 
 
 
528 aa  533  1e-150  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1910  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  51.61 
 
 
528 aa  515  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.890693  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1956  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  51.61 
 
 
528 aa  515  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176743  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1890  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  51.61 
 
 
528 aa  515  1.0000000000000001e-145  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.168381 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13011  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  49.91 
 
 
528 aa  513  1e-144  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000841945  normal  0.820914 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4234  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  51.42 
 
 
528 aa  508  9.999999999999999e-143  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.203577  normal  0.41809 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2128  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  50.85 
 
 
528 aa  499  1e-140  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0837  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  44.81 
 
 
527 aa  439  9.999999999999999e-123  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.746889  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1530  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  47.71 
 
 
527 aa  432  1e-120  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0010  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  46.09 
 
 
527 aa  427  1e-118  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.155189  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0012  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  45.27 
 
 
526 aa  416  9.999999999999999e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.578759  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2385  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  42.91 
 
 
523 aa  408  1.0000000000000001e-112  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.917938  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3649  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.87 
 
 
526 aa  408  1.0000000000000001e-112  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0277903  normal  0.752498 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0020  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  45.08 
 
 
525 aa  403  1e-111  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.173691  hitchhiker  0.000002432 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0039  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.66 
 
 
525 aa  404  1e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00530837  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4340  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.7 
 
 
526 aa  399  9.999999999999999e-111  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0009  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.07 
 
 
530 aa  399  9.999999999999999e-111  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0352108  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0014  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  42.02 
 
 
526 aa  395  1e-109  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00744014  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2156  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  42.42 
 
 
526 aa  392  1e-108  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3375  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  43.24 
 
 
652 aa  394  1e-108  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.973939 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2125  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.08 
 
 
531 aa  394  1e-108  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000018587  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1189  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  42.74 
 
 
535 aa  392  1e-107  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1431  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.75 
 
 
523 aa  392  1e-107  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0875304 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3759  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  42.8 
 
 
526 aa  389  1e-107  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000435115  normal  0.110256 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2306  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.43 
 
 
531 aa  391  1e-107  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.551653  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0900  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.1 
 
 
523 aa  387  1e-106  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1873  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  43.15 
 
 
526 aa  387  1e-106  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00847931 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1436  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.95 
 
 
524 aa  387  1e-106  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15551  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.65 
 
 
528 aa  387  1e-106  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1850  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.63 
 
 
527 aa  388  1e-106  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15401  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.85 
 
 
528 aa  387  1e-106  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0931759  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2377  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.39 
 
 
525 aa  385  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1452  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.85 
 
 
528 aa  385  1e-105  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3561  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  42.48 
 
 
541 aa  383  1e-105  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0818825  normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3521  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.47 
 
 
529 aa  384  1e-105  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.598848  normal 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1224  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.85 
 
 
523 aa  382  1e-105  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2428  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.39 
 
 
525 aa  385  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1821  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.43 
 
 
523 aa  384  1e-105  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0599  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.96 
 
 
526 aa  381  1e-104  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0013465  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_539  phosphoglycerate dehydrogenase  41.76 
 
 
526 aa  379  1e-104  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.366241  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1501  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.03 
 
 
546 aa  380  1e-104  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0574  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.76 
 
 
526 aa  380  1e-104  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0835  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.04 
 
 
523 aa  382  1e-104  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4196  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.73 
 
 
527 aa  376  1e-103  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1082  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.31 
 
 
523 aa  377  1e-103  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3115  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.23 
 
 
535 aa  374  1e-102  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00187643  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1826  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.81 
 
 
529 aa  374  1e-102  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.94456 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3063  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.53 
 
 
528 aa  374  1e-102  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.737613  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0261  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.5 
 
 
531 aa  374  1e-102  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0077  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  42.36 
 
 
528 aa  372  1e-102  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3620  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.39 
 
 
525 aa  373  1e-102  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.737909  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2164  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.61 
 
 
534 aa  374  1e-102  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1231  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.02 
 
 
529 aa  371  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.325344  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2138  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.81 
 
 
525 aa  371  1e-101  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0896  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.41 
 
 
527 aa  371  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.643854  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1018  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.41 
 
 
527 aa  371  1e-101  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000612711 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2699  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.16 
 
 
528 aa  369  1e-101  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000966677  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0263  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.15 
 
 
524 aa  372  1e-101  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.542041  normal  0.03617 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0271  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.15 
 
 
524 aa  368  1e-100  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.353808  unclonable  0.0000123013 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4789  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.85 
 
 
529 aa  366  1e-100  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2968  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.65 
 
 
529 aa  366  1e-100  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0527  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.85 
 
 
528 aa  367  1e-100  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.209223  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2197  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.67 
 
 
525 aa  366  1e-100  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000367655  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1887  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  42.12 
 
 
528 aa  368  1e-100  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0616  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.96 
 
 
528 aa  368  1e-100  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.640549 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2852  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.37 
 
 
527 aa  366  1e-100  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00180336  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2087  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.64 
 
 
535 aa  366  1e-100  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0521319  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15151  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.49 
 
 
528 aa  367  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05241  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.85 
 
 
528 aa  368  1e-100  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0439  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.73 
 
 
532 aa  365  1e-100  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0587451  normal  0.906143 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2150  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.85 
 
 
528 aa  365  1e-99  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.204731  normal  0.434509 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4778  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.29 
 
 
527 aa  365  1e-99  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.801669 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1269  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.97 
 
 
529 aa  364  2e-99  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0254425 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0567  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.65 
 
 
523 aa  365  2e-99  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0432  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.23 
 
 
524 aa  363  6e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1315  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.85 
 
 
529 aa  362  1e-98  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.357791 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3905  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.65 
 
 
529 aa  362  1e-98  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2378  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.04 
 
 
541 aa  361  2e-98  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0367603  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>