More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mjls_1890 on replicon NC_009077
Organism: Mycobacterium sp. JLS



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_009565  TBFG_13011  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  86.17 
 
 
528 aa  867    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000841945  normal  0.820914 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2856  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  75.38 
 
 
528 aa  772    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1910  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  99.81 
 
 
528 aa  1031    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.890693  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3225  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  77 
 
 
531 aa  790    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1956  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  99.81 
 
 
528 aa  1031    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176743  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2128  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  83.52 
 
 
528 aa  824    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1890  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  100 
 
 
528 aa  1032    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.168381 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4234  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  83.9 
 
 
528 aa  828    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.203577  normal  0.41809 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08910  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  62.74 
 
 
531 aa  634  1e-180  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6017  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  65.65 
 
 
532 aa  623  1e-177  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.214925  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1471  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  61.39 
 
 
530 aa  573  1.0000000000000001e-162  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00147089  normal  0.075058 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3637  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  57.12 
 
 
529 aa  548  1e-155  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1093  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  57.31 
 
 
529 aa  550  1e-155  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2814  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  53.22 
 
 
529 aa  548  1e-154  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3546  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  55.41 
 
 
531 aa  545  1e-153  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0174  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  54.65 
 
 
529 aa  544  1e-153  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.996447  normal  0.371451 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7791  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  57.25 
 
 
535 aa  544  1e-153  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.443673 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8047  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  53.98 
 
 
529 aa  542  1e-153  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0328727  normal 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1126  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  55.13 
 
 
531 aa  538  1e-151  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000124748 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4312  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  57.5 
 
 
533 aa  537  1e-151  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1236  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  54.94 
 
 
531 aa  535  1e-151  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.276789 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0614  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  56.17 
 
 
528 aa  535  1e-150  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86187  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4068  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  59.51 
 
 
533 aa  530  1e-149  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.568841  n/a   
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3385  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  55.92 
 
 
536 aa  529  1e-149  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.367289  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2536  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  51.61 
 
 
529 aa  520  1e-146  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0175573  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0709  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  54.65 
 
 
530 aa  519  1e-146  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.484859  normal 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2276  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  51.04 
 
 
529 aa  514  1e-144  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000102369 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_18780  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  53.1 
 
 
535 aa  490  1e-137  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0156164  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08560  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  52.62 
 
 
531 aa  486  1e-136  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.461142  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1530  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  48.05 
 
 
527 aa  409  1e-113  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0837  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  43.84 
 
 
527 aa  399  9.999999999999999e-111  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.746889  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1082  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  42.38 
 
 
523 aa  384  1e-105  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1873  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  42.62 
 
 
526 aa  384  1e-105  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00847931 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0835  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.49 
 
 
523 aa  380  1e-104  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1821  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.11 
 
 
523 aa  381  1e-104  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3521  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  43.23 
 
 
529 aa  378  1e-103  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.598848  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0012  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  42.22 
 
 
526 aa  375  1e-102  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.578759  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0010  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.79 
 
 
527 aa  375  1e-102  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.155189  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0900  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.54 
 
 
523 aa  372  1e-102  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0574  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.85 
 
 
526 aa  369  1e-101  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2197  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.04 
 
 
525 aa  369  1e-101  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000367655  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0567  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.85 
 
 
523 aa  372  1e-101  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0599  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.85 
 
 
526 aa  367  1e-100  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0013465  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2428  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.41 
 
 
525 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2377  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.41 
 
 
525 aa  365  1e-100  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_539  phosphoglycerate dehydrogenase  39.85 
 
 
526 aa  367  1e-100  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.366241  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0009  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.92 
 
 
530 aa  369  1e-100  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0352108  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0014  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.77 
 
 
526 aa  367  1e-100  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00744014  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0432  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41 
 
 
524 aa  365  1e-99  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3021  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.96 
 
 
531 aa  363  3e-99  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.487247 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4340  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.37 
 
 
526 aa  362  1e-98  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3318  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.31 
 
 
531 aa  360  3e-98  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.677421  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0271  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  44.11 
 
 
524 aa  360  3e-98  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.353808  unclonable  0.0000123013 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0814  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.59 
 
 
529 aa  359  5e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119542  normal 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3375  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.79 
 
 
652 aa  358  9.999999999999999e-98  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.973939 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_0263  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  42.2 
 
 
524 aa  358  9.999999999999999e-98  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.542041  normal  0.03617 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2306  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.28 
 
 
531 aa  357  3.9999999999999996e-97  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.551653  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0261  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.77 
 
 
531 aa  356  5e-97  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3100  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.37 
 
 
525 aa  356  5e-97  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.659114 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3192  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.86 
 
 
531 aa  355  1e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1189  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.35 
 
 
535 aa  354  2e-96  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3649  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.83 
 
 
526 aa  355  2e-96  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0277903  normal  0.752498 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3620  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.99 
 
 
525 aa  354  2.9999999999999997e-96  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.737909  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3561  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.55 
 
 
541 aa  354  2.9999999999999997e-96  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0818825  normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4778  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.61 
 
 
527 aa  352  7e-96  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.801669 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0020  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.13 
 
 
531 aa  352  8e-96  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1352  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.13 
 
 
534 aa  352  8.999999999999999e-96  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3486  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.67 
 
 
531 aa  352  8.999999999999999e-96  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.158391 
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1018  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  42.47 
 
 
527 aa  351  2e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000612711 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1269  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40 
 
 
529 aa  351  2e-95  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0254425 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0896  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  42.47 
 
 
527 aa  351  2e-95  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.643854  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0010  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.13 
 
 
531 aa  349  6e-95  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.570425  hitchhiker  0.00544887 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3115  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.66 
 
 
535 aa  349  8e-95  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00187643  n/a   
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2680  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.57 
 
 
540 aa  349  8e-95  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3905  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.12 
 
 
529 aa  348  1e-94  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0616  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.74 
 
 
528 aa  347  2e-94  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.640549 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3860  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.06 
 
 
539 aa  347  3e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000678395  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4196  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.51 
 
 
527 aa  347  4e-94  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1315  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.29 
 
 
529 aa  345  8e-94  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.357791 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0039  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.79 
 
 
525 aa  345  8e-94  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00530837  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1850  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.84 
 
 
527 aa  345  8e-94  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4789  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.34 
 
 
529 aa  345  1e-93  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0077  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.01 
 
 
528 aa  345  1e-93  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4685  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.08 
 
 
525 aa  345  2e-93  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.436149 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1436  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.95 
 
 
524 aa  344  2e-93  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1501  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.33 
 
 
546 aa  343  2.9999999999999997e-93  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_1084  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.31 
 
 
524 aa  343  2.9999999999999997e-93  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  hitchhiker  0.00214537  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2618  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.32 
 
 
531 aa  343  5e-93  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.497758  normal 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1229  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.31 
 
 
533 aa  342  1e-92  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.270378  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1231  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.37 
 
 
529 aa  342  1e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.325344  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2164  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.34 
 
 
534 aa  341  2e-92  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3595  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.74 
 
 
531 aa  341  2e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.86096  n/a   
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1119  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.57 
 
 
529 aa  340  2.9999999999999998e-92  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.480596  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0639  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.74 
 
 
535 aa  340  2.9999999999999998e-92  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.295873 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1826  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.1 
 
 
529 aa  340  2.9999999999999998e-92  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.94456 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2125  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.23 
 
 
531 aa  340  2.9999999999999998e-92  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000018587  n/a   
 
 
-
 
NC_004310  BR1685  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.61 
 
 
533 aa  340  4e-92  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.447631  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2156  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.09 
 
 
526 aa  340  4e-92  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1629  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.61 
 
 
533 aa  340  4e-92  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2378  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.81 
 
 
541 aa  340  4e-92  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0367603  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>