More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Bfae_18780 on replicon NC_013172
Organism: Brachybacterium faecium DSM 4810



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013172  Bfae_18780  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  100 
 
 
535 aa  1039    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.0156164  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7791  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  61.96 
 
 
535 aa  609  1e-173  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.443673 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2814  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  57.22 
 
 
529 aa  601  1.0000000000000001e-171  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8047  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  56.47 
 
 
529 aa  592  1e-168  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0328727  normal 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3385  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  60.71 
 
 
536 aa  590  1e-167  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.367289  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2536  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  58.16 
 
 
529 aa  585  1e-166  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0175573  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2276  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  57.97 
 
 
529 aa  584  1.0000000000000001e-165  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000102369 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1093  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  58.19 
 
 
529 aa  571  1e-161  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0174  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  55.16 
 
 
529 aa  570  1e-161  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.996447  normal  0.371451 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08910  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  55.08 
 
 
531 aa  565  1e-160  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_08560  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  61.01 
 
 
531 aa  567  1e-160  Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.461142  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3546  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  54.6 
 
 
531 aa  567  1e-160  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0709  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  56.93 
 
 
530 aa  566  1e-160  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.484859  normal 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3637  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  56.69 
 
 
529 aa  557  1e-157  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1236  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  54.89 
 
 
531 aa  543  1e-153  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.276789 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1126  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  54.7 
 
 
531 aa  539  9.999999999999999e-153  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000124748 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6017  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  54.22 
 
 
532 aa  535  1e-151  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.214925  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0614  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  55.24 
 
 
528 aa  535  1e-150  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.86187  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1471  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  53.61 
 
 
530 aa  522  1e-147  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.00147089  normal  0.075058 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2856  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  52.91 
 
 
528 aa  522  1e-147  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4068  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  57.04 
 
 
533 aa  519  1e-146  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.568841  n/a   
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3225  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  52.64 
 
 
531 aa  514  1e-144  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13011  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  53.28 
 
 
528 aa  506  9.999999999999999e-143  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  hitchhiker  0.0000000000000841945  normal  0.820914 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4312  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  52.91 
 
 
533 aa  502  1e-141  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4234  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  54.03 
 
 
528 aa  487  1e-136  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.203577  normal  0.41809 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1910  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  53.1 
 
 
528 aa  483  1e-135  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  0.890693  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1956  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  53.1 
 
 
528 aa  483  1e-135  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.176743  normal 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1890  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  53.1 
 
 
528 aa  483  1e-135  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  normal  0.168381 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2128  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  53.66 
 
 
528 aa  479  1e-134  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1530  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  47.74 
 
 
527 aa  417  9.999999999999999e-116  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2125  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.26 
 
 
531 aa  383  1e-105  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000018587  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0835  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.57 
 
 
523 aa  382  1e-105  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1821  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.38 
 
 
523 aa  382  1e-104  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0837  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  42.94 
 
 
527 aa  382  1e-104  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.746889  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0009  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.96 
 
 
530 aa  379  1e-103  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0352108  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1082  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.57 
 
 
523 aa  376  1e-103  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3375  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  44.67 
 
 
652 aa  372  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.973939 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2428  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.67 
 
 
525 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2377  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.67 
 
 
525 aa  369  1e-101  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3759  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  43.39 
 
 
526 aa  366  1e-100  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000435115  normal  0.110256 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1436  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  42.12 
 
 
524 aa  366  1e-100  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0567  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.11 
 
 
523 aa  368  1e-100  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2156  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.97 
 
 
526 aa  363  3e-99  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0900  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.39 
 
 
523 aa  361  2e-98  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1224  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.28 
 
 
523 aa  360  4e-98  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0527  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.64 
 
 
528 aa  360  5e-98  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.209223  n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1189  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.48 
 
 
535 aa  359  7e-98  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1501  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.68 
 
 
546 aa  358  9.999999999999999e-98  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2150  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.02 
 
 
528 aa  358  1.9999999999999998e-97  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.204731  normal  0.434509 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1873  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.93 
 
 
526 aa  357  1.9999999999999998e-97  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00847931 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2306  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.79 
 
 
531 aa  355  1e-96  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.551653  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4196  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.54 
 
 
527 aa  354  2e-96  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2087  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.53 
 
 
535 aa  354  2.9999999999999997e-96  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0521319  n/a   
 
 
-
 
NC_011206  Lferr_1018  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  42.72 
 
 
527 aa  353  4e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 53993  Bacteria  normal  unclonable  0.0000000000612711 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_0896  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  42.72 
 
 
527 aa  353  4e-96  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  0.643854  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3521  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.38 
 
 
529 aa  353  5e-96  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.598848  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2378  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.39 
 
 
541 aa  352  8e-96  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0367603  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2699  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.75 
 
 
528 aa  352  8e-96  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000966677  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1198  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.69 
 
 
542 aa  351  2e-95  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0190635  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0039  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.06 
 
 
525 aa  351  2e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00530837  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2852  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.38 
 
 
527 aa  350  4e-95  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00180336  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4340  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.31 
 
 
526 aa  348  2e-94  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3860  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.84 
 
 
539 aa  347  3e-94  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000678395  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2256  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.34 
 
 
532 aa  347  3e-94  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4778  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.44 
 
 
527 aa  346  6e-94  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.801669 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1850  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.85 
 
 
527 aa  346  7e-94  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05241  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.09 
 
 
528 aa  345  1e-93  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3561  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.21 
 
 
541 aa  344  2e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0818825  normal 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0439  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.38 
 
 
532 aa  343  2.9999999999999997e-93  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0587451  normal  0.906143 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0010  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.58 
 
 
527 aa  343  4e-93  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.155189  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1961  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.76 
 
 
532 aa  343  5e-93  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.829673  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0020  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  43.25 
 
 
525 aa  343  5.999999999999999e-93  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.173691  hitchhiker  0.000002432 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_3115  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.77 
 
 
535 aa  342  1e-92  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00187643  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1452  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.91 
 
 
528 aa  342  1e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1737  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.03 
 
 
541 aa  341  2e-92  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1231  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.52 
 
 
529 aa  340  5e-92  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.325344  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0012  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.04 
 
 
526 aa  340  5e-92  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.578759  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15401  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.52 
 
 
528 aa  338  9.999999999999999e-92  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0931759  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15551  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.52 
 
 
528 aa  338  1.9999999999999998e-91  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0014  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.9 
 
 
526 aa  337  5e-91  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00744014  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1431  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.5 
 
 
523 aa  336  5e-91  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0875304 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2968  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.37 
 
 
529 aa  335  9e-91  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0259  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.97 
 
 
529 aa  335  1e-90  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2164  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.65 
 
 
534 aa  335  2e-90  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3595  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.28 
 
 
531 aa  335  2e-90  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.86096  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_539  phosphoglycerate dehydrogenase  38.39 
 
 
526 aa  334  2e-90  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.366241  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4467  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.73 
 
 
526 aa  335  2e-90  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0468875  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2385  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.57 
 
 
523 aa  334  3e-90  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.917938  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15151  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.93 
 
 
528 aa  334  3e-90  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17821  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.87 
 
 
528 aa  334  3e-90  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.877269 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0926  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.69 
 
 
528 aa  333  4e-90  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0574  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.2 
 
 
526 aa  333  5e-90  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_1699  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.89 
 
 
539 aa  333  6e-90  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  hitchhiker  0.000359421  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0599  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.39 
 
 
526 aa  331  2e-89  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0013465  n/a   
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1826  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.36 
 
 
529 aa  331  2e-89  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.94456 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0261  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.21 
 
 
531 aa  330  3e-89  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4789  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.77 
 
 
529 aa  330  4e-89  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0639  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.22 
 
 
535 aa  330  4e-89  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.295873 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1229  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.43 
 
 
533 aa  329  6e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.270378  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0616  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.74 
 
 
528 aa  329  7e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.640549 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>