More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Ccel_1189 on replicon NC_011898
Organism: Clostridium cellulolyticum H10



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_011898  Ccel_1189  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  100 
 
 
535 aa  1087    Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2125  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  56.72 
 
 
531 aa  599  1e-170  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000018587  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2306  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  51.87 
 
 
531 aa  538  9.999999999999999e-153  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.551653  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0009  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  47.01 
 
 
530 aa  469  1.0000000000000001e-131  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0352108  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0837  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  43.75 
 
 
527 aa  438  1e-121  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.746889  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0014  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  43.87 
 
 
526 aa  432  1e-120  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00744014  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4340  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  42.46 
 
 
526 aa  431  1e-119  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0010  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  44.94 
 
 
527 aa  422  1e-117  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.155189  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0012  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  42.64 
 
 
526 aa  421  1e-116  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.578759  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0077  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.42 
 
 
528 aa  403  1e-111  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3063  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.91 
 
 
528 aa  401  9.999999999999999e-111  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.737613  normal 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_2814  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  42.15 
 
 
529 aa  402  9.999999999999999e-111  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3546  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  42.97 
 
 
531 aa  397  1e-109  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8047  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.19 
 
 
529 aa  394  1e-108  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.0328727  normal 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0039  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  44.07 
 
 
525 aa  394  1e-108  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00530837  n/a   
 
 
-
 
NC_008576  Mmc1_1423  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.25 
 
 
527 aa  394  1e-108  Magnetococcus sp. MC-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2164  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.78 
 
 
534 aa  394  1e-108  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2699  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  42.83 
 
 
528 aa  394  1e-108  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000966677  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1887  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.3 
 
 
528 aa  394  1e-108  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1850  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.53 
 
 
527 aa  393  1e-108  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0020  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  42.94 
 
 
525 aa  390  1e-107  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.173691  hitchhiker  0.000002432 
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0439  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.17 
 
 
532 aa  389  1e-107  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0587451  normal  0.906143 
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0259  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  42.75 
 
 
529 aa  392  1e-107  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1530  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.7 
 
 
527 aa  388  1e-106  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0793  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.55 
 
 
529 aa  383  1e-105  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2428  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.04 
 
 
525 aa  383  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2385  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.06 
 
 
523 aa  385  1e-105  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.917938  n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1224  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.51 
 
 
523 aa  383  1e-105  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3100  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.45 
 
 
525 aa  383  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.659114 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3649  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.59 
 
 
526 aa  384  1e-105  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0277903  normal  0.752498 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2377  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.04 
 
 
525 aa  383  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2650  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.03 
 
 
528 aa  379  1e-104  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4789  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.22 
 
 
529 aa  380  1e-104  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007413  Ava_3759  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.7 
 
 
526 aa  379  1e-104  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  hitchhiker  0.0000435115  normal  0.110256 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2138  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.81 
 
 
525 aa  380  1e-104  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3192  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.11 
 
 
531 aa  377  1e-103  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1431  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.37 
 
 
523 aa  376  1e-103  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0875304 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3637  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.18 
 
 
529 aa  377  1e-103  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1315  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.85 
 
 
529 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.357791 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4196  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.76 
 
 
527 aa  376  1e-103  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1826  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.6 
 
 
529 aa  377  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.94456 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2197  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.25 
 
 
525 aa  377  1e-103  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000367655  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3375  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.83 
 
 
652 aa  376  1e-103  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.973939 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2722  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.65 
 
 
534 aa  378  1e-103  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2852  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.85 
 
 
527 aa  374  1e-102  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00180336  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4778  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.28 
 
 
527 aa  375  1e-102  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.801669 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2680  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.25 
 
 
540 aa  372  1e-102  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3905  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.22 
 
 
529 aa  375  1e-102  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3860  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.12 
 
 
539 aa  374  1e-102  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000678395  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0432  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.74 
 
 
524 aa  373  1e-102  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1229  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.29 
 
 
533 aa  375  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.270378  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2156  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.02 
 
 
526 aa  374  1e-102  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3595  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.92 
 
 
531 aa  373  1e-102  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.86096  n/a   
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3486  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.29 
 
 
531 aa  372  1e-102  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.158391 
 
 
-
 
NC_004310  BR1685  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.92 
 
 
533 aa  372  1e-101  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.447631  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1231  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.18 
 
 
529 aa  370  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.325344  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2968  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.66 
 
 
529 aa  370  1e-101  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2378  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.43 
 
 
541 aa  369  1e-101  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0367603  normal 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1629  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.92 
 
 
533 aa  372  1e-101  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_7791  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.9 
 
 
535 aa  370  1e-101  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  normal  0.443673 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3161  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.55 
 
 
532 aa  372  1e-101  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1093  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.91 
 
 
529 aa  371  1e-101  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2618  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.55 
 
 
531 aa  368  1e-100  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.497758  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0174  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.69 
 
 
529 aa  366  1e-100  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.996447  normal  0.371451 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1202  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.48 
 
 
528 aa  368  1e-100  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.661102  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4106  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.22 
 
 
529 aa  367  1e-100  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.885327  normal 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1119  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.04 
 
 
529 aa  365  1e-100  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.480596  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0616  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.25 
 
 
528 aa  365  1e-100  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.640549 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0567  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.75 
 
 
523 aa  367  1e-100  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3620  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.04 
 
 
525 aa  369  1e-100  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.737909  normal 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2536  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  42.74 
 
 
529 aa  368  1e-100  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0175573  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0660  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.66 
 
 
535 aa  366  1e-100  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.288846 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1269  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.22 
 
 
529 aa  368  1e-100  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0254425 
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0639  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.66 
 
 
535 aa  367  1e-100  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.295873 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2276  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.95 
 
 
529 aa  365  1e-99  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000102369 
 
 
-
 
NC_002939  GSU1198  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.42 
 
 
542 aa  364  2e-99  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0190635  n/a   
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0672  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.66 
 
 
535 aa  365  2e-99  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.472751  normal  0.0431754 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1760  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.55 
 
 
531 aa  365  2e-99  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2256  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.73 
 
 
532 aa  363  3e-99  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1501  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.35 
 
 
546 aa  363  5.0000000000000005e-99  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2150  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.74 
 
 
528 aa  363  6e-99  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.204731  normal  0.434509 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1961  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.55 
 
 
532 aa  362  7.0000000000000005e-99  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.829673  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05241  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.43 
 
 
528 aa  362  8e-99  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3521  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.92 
 
 
529 aa  362  1e-98  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.598848  normal 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1436  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.95 
 
 
524 aa  361  1e-98  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15401  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.86 
 
 
528 aa  362  1e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0931759  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3561  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.42 
 
 
541 aa  361  2e-98  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0818825  normal 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4685  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.32 
 
 
525 aa  361  2e-98  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.436149 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_1873  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.19 
 
 
526 aa  361  2e-98  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  hitchhiker  0.00847931 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3385  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  43.14 
 
 
536 aa  360  3e-98  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.367289  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1452  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.48 
 
 
528 aa  360  4e-98  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0814  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.99 
 
 
529 aa  360  5e-98  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119542  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3021  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.55 
 
 
531 aa  358  9e-98  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.487247 
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15551  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.48 
 
 
528 aa  359  9e-98  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1737  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.46 
 
 
541 aa  358  9.999999999999999e-98  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0261  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.99 
 
 
531 aa  358  9.999999999999999e-98  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0900  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.98 
 
 
523 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15151  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.03 
 
 
528 aa  358  1.9999999999999998e-97  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1543  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.18 
 
 
527 aa  357  1.9999999999999998e-97  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00623773  hitchhiker  0.0000362163 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3318  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.26 
 
 
531 aa  357  2.9999999999999997e-97  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.677421  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>