More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Hmuk_0793 on replicon NC_013202
Organism: Halomicrobium mukohataei DSM 12286



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_013743  Htur_0077  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  73.53 
 
 
528 aa  762    Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_1887  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  71.83 
 
 
528 aa  746    Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2722  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  73.16 
 
 
534 aa  779    Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0793  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  100 
 
 
529 aa  1052    Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1349  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  54.46 
 
 
520 aa  530  1e-149  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.877509  n/a   
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1491  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  54.06 
 
 
528 aa  516  1.0000000000000001e-145  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.580091  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0014  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  46.21 
 
 
526 aa  453  1.0000000000000001e-126  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00744014  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_2385  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  44.02 
 
 
523 aa  452  1.0000000000000001e-126  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  0.917938  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2164  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  44.17 
 
 
534 aa  450  1e-125  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0012  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  43.75 
 
 
526 aa  448  1.0000000000000001e-124  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.578759  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A1431  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  44.4 
 
 
523 aa  437  1e-121  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal  0.0875304 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4340  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  44.13 
 
 
526 aa  434  1e-120  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3649  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  42.05 
 
 
526 aa  433  1e-120  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  0.0277903  normal  0.752498 
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1224  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.83 
 
 
523 aa  429  1e-119  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1231  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  45.42 
 
 
529 aa  430  1e-119  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.325344  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1850  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  44.76 
 
 
527 aa  430  1e-119  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0020  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  44.4 
 
 
525 aa  423  1e-117  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.173691  hitchhiker  0.000002432 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0010  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  43.56 
 
 
527 aa  424  1e-117  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.155189  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3063  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  43.89 
 
 
528 aa  421  1e-116  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.737613  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2852  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.78 
 
 
527 aa  421  1e-116  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00180336  n/a   
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2197  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  42.11 
 
 
525 aa  419  1e-116  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000367655  n/a   
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0567  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.83 
 
 
523 aa  421  1e-116  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0439  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  43.26 
 
 
532 aa  419  1e-116  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0587451  normal  0.906143 
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0432  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  42.05 
 
 
524 aa  412  1e-114  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0527  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.97 
 
 
528 aa  415  1e-114  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  0.209223  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2150  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  42.34 
 
 
528 aa  413  1e-114  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.204731  normal  0.434509 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3375  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  42.66 
 
 
652 aa  414  1e-114  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.973939 
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05241  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  43.21 
 
 
528 aa  412  1e-114  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1452  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  42.33 
 
 
528 aa  409  1e-113  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15551  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.94 
 
 
528 aa  409  1e-113  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1543  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  42.08 
 
 
527 aa  409  1e-113  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00623773  hitchhiker  0.0000362163 
 
 
-
 
NC_002976  SERP1288  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.48 
 
 
531 aa  407  1.0000000000000001e-112  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.605181  n/a   
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0835  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.1 
 
 
523 aa  407  1.0000000000000001e-112  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1082  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.48 
 
 
523 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15401  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.75 
 
 
528 aa  405  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0931759  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_14091  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  44.27 
 
 
528 aa  402  1e-111  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.187324  normal  0.0498894 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0039  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.1 
 
 
525 aa  404  1e-111  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00530837  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1821  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.72 
 
 
523 aa  405  1e-111  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1436  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.17 
 
 
524 aa  399  9.999999999999999e-111  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3620  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.62 
 
 
525 aa  399  9.999999999999999e-111  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.737909  normal 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2138  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.95 
 
 
525 aa  398  1e-109  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0616  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  43.43 
 
 
528 aa  397  1e-109  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.640549 
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0786  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.81 
 
 
527 aa  395  1e-109  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15151  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.55 
 
 
528 aa  397  1e-109  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1198  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  42.33 
 
 
542 aa  395  1e-108  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0190635  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1269  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  42.15 
 
 
529 aa  394  1e-108  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0254425 
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_0926  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.32 
 
 
528 aa  392  1e-108  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2618  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.96 
 
 
531 aa  392  1e-108  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.497758  normal 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1779  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.54 
 
 
534 aa  392  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.742834  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3161  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.38 
 
 
532 aa  392  1e-108  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1814  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.54 
 
 
534 aa  392  1e-108  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.375906  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_539  phosphoglycerate dehydrogenase  41.98 
 
 
526 aa  390  1e-107  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  0.366241  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2378  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  42.47 
 
 
541 aa  390  1e-107  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0367603  normal 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0574  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.78 
 
 
526 aa  389  1e-107  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0900  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.28 
 
 
523 aa  391  1e-107  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2256  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.15 
 
 
532 aa  391  1e-107  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3318  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.13 
 
 
531 aa  391  1e-107  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.677421  normal 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_1961  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.04 
 
 
532 aa  391  1e-107  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  0.829673  n/a   
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_17821  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.13 
 
 
528 aa  389  1e-107  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  normal  0.877269 
 
 
-
 
NC_002936  DET0599  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.78 
 
 
526 aa  389  1e-106  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  hitchhiker  0.0013465  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2125  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.4 
 
 
531 aa  387  1e-106  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000018587  n/a   
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4789  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.47 
 
 
529 aa  387  1e-106  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3595  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.9 
 
 
531 aa  387  1e-106  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.86096  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1315  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.66 
 
 
529 aa  385  1e-106  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.357791 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0837  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  43.5 
 
 
527 aa  387  1e-106  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.746889  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_2827  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.32 
 
 
546 aa  387  1e-106  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1530  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  43.1 
 
 
527 aa  388  1e-106  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1093  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  43.05 
 
 
529 aa  383  1e-105  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1501  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  42.22 
 
 
546 aa  385  1e-105  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3561  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.37 
 
 
541 aa  383  1e-105  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0818825  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1202  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.23 
 
 
528 aa  382  1e-105  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.661102  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2377  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.95 
 
 
525 aa  383  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3021  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.77 
 
 
531 aa  384  1e-105  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.487247 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2428  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.95 
 
 
525 aa  383  1e-105  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1189  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.55 
 
 
535 aa  383  1e-105  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4778  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.16 
 
 
527 aa  381  1e-104  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  0.801669 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3192  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.2 
 
 
531 aa  381  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3486  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.39 
 
 
531 aa  380  1e-104  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.158391 
 
 
-
 
NC_007794  Saro_2680  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.65 
 
 
540 aa  380  1e-104  Novosphingobium aromaticivorans DSM 12444  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0261  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.55 
 
 
531 aa  380  1e-104  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1737  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.78 
 
 
541 aa  379  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2087  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.93 
 
 
535 aa  379  1e-104  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0521319  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4685  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  42.43 
 
 
525 aa  380  1e-104  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.436149 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3860  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  42.17 
 
 
539 aa  381  1e-104  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000678395  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0259  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.49 
 
 
529 aa  375  1e-103  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2968  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.8 
 
 
529 aa  378  1e-103  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_2156  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.77 
 
 
526 aa  377  1e-103  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0660  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.91 
 
 
535 aa  375  1e-103  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  normal  0.288846 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3637  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  44.05 
 
 
529 aa  377  1e-103  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3905  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.08 
 
 
529 aa  377  1e-103  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4196  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.61 
 
 
527 aa  377  1e-103  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0010  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.2 
 
 
531 aa  378  1e-103  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.570425  hitchhiker  0.00544887 
 
 
-
 
NC_011757  Mchl_0672  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  42.11 
 
 
535 aa  376  1e-103  Methylobacterium chloromethanicum CM4  Bacteria  normal  0.472751  normal  0.0431754 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1826  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.09 
 
 
529 aa  376  1e-103  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.94456 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1352  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.45 
 
 
534 aa  373  1e-102  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2813  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.67 
 
 
532 aa  375  1e-102  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1229  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  40.49 
 
 
533 aa  374  1e-102  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.270378  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2306  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.06 
 
 
531 aa  375  1e-102  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.551653  n/a   
 
 
-
 
NC_010338  Caul_4467  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.86 
 
 
526 aa  374  1e-102  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.0468875  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_0271  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  42.11 
 
 
524 aa  374  1e-102  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.353808  unclonable  0.0000123013 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>