More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene CJE0970 on replicon NC_003912
Organism: Campylobacter jejuni RM1221



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_003912  CJE0970  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  100 
 
 
527 aa  1069    Campylobacter jejuni RM1221  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009715  CCV52592_0512  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  68.95 
 
 
525 aa  741    Campylobacter curvus 525.92  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009714  CHAB381_0480  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  63.67 
 
 
525 aa  684    Campylobacter hominis ATCC BAA-381  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012039  Cla_1188  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  75.81 
 
 
526 aa  844    Campylobacter lari RM2100  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008599  CFF8240_1248  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  65.52 
 
 
525 aa  690    Campylobacter fetus subsp. fetus 82-40  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009802  CCC13826_1569  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  68.76 
 
 
525 aa  733    Campylobacter concisus 13826  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009707  JJD26997_0922  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  98.48 
 
 
527 aa  1054    Campylobacter jejuni subsp. doylei 269.97  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013512  Sdel_0615  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  66.54 
 
 
528 aa  715    Sulfurospirillum deleyianum DSM 6946  Bacteria  normal  0.0119419  n/a   
 
 
-
 
NC_008787  CJJ81176_0900  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  99.43 
 
 
527 aa  1065    Campylobacter jejuni subsp. jejuni 81-176  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007575  Suden_0875  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  56.06 
 
 
529 aa  587  1e-166  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.0119441  n/a   
 
 
-
 
NC_011126  HY04AAS1_0786  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  42.67 
 
 
527 aa  395  1e-108  Hydrogenobaculum sp. Y04AAS1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010730  SYO3AOP1_0259  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  41.38 
 
 
529 aa  391  1e-107  Sulfurihydrogenibium sp. YO3AOP1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1850  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.42 
 
 
527 aa  379  1e-104  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0009  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.52 
 
 
530 aa  374  1e-102  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  normal  0.0352108  n/a   
 
 
-
 
NC_009253  Dred_0014  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.52 
 
 
526 aa  373  1e-102  Desulfotomaculum reducens MI-1  Bacteria  decreased coverage  0.00744014  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_1231  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.41 
 
 
529 aa  370  1e-101  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.325344  n/a   
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0010  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.62 
 
 
527 aa  371  1e-101  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  0.155189  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_2164  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.68 
 
 
534 aa  368  1e-100  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_2197  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.98 
 
 
525 aa  362  1e-98  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  decreased coverage  0.0000367655  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_0837  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.16 
 
 
527 aa  358  9e-98  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.746889  n/a   
 
 
-
 
NC_010424  Daud_0012  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.81 
 
 
526 aa  358  9.999999999999999e-98  Candidatus Desulforudis audaxviator MP104C  Bacteria  normal  0.578759  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0439  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.74 
 
 
532 aa  358  9.999999999999999e-98  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  0.0587451  normal  0.906143 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_4340  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.81 
 
 
526 aa  357  3.9999999999999996e-97  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_2699  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.55 
 
 
528 aa  352  1e-95  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.0000000966677  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_0432  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.86 
 
 
524 aa  352  1e-95  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008553  Mthe_1224  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.94 
 
 
523 aa  350  3e-95  Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0039  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.87 
 
 
525 aa  349  9e-95  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  hitchhiker  0.00530837  n/a   
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0814  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.16 
 
 
529 aa  347  4e-94  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.119542  normal 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_0020  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  35.91 
 
 
531 aa  347  4e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_1352  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  35.91 
 
 
534 aa  346  5e-94  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1093  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.16 
 
 
529 aa  347  5e-94  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_0010  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.56 
 
 
531 aa  346  7e-94  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.570425  hitchhiker  0.00544887 
 
 
-
 
NC_012850  Rleg_3486  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.36 
 
 
531 aa  345  1e-93  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  normal  0.158391 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3161  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.26 
 
 
532 aa  345  1e-93  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3561  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.59 
 
 
541 aa  345  1e-93  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0818825  normal 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2125  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.62 
 
 
531 aa  344  2.9999999999999997e-93  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.000000018587  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_3063  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.28 
 
 
528 aa  344  2.9999999999999997e-93  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  0.737613  normal 
 
 
-
 
NC_010814  Glov_2087  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.23 
 
 
535 aa  343  4e-93  Geobacter lovleyi SZ  Bacteria  normal  0.0521319  n/a   
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2852  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.8 
 
 
527 aa  343  5.999999999999999e-93  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.00180336  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3521  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.74 
 
 
529 aa  342  7e-93  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.598848  normal 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1826  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.46 
 
 
529 aa  342  7e-93  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  normal  0.94456 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_3100  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  35.98 
 
 
525 aa  342  8e-93  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal  0.659114 
 
 
-
 
NC_011004  Rpal_4789  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.45 
 
 
529 aa  342  1e-92  Rhodopseudomonas palustris TIE-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0020  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  35.48 
 
 
525 aa  340  2.9999999999999998e-92  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.173691  hitchhiker  0.000002432 
 
 
-
 
NC_011369  Rleg2_3192  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.04 
 
 
531 aa  340  2.9999999999999998e-92  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2968  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.54 
 
 
529 aa  340  4e-92  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_0261  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.45 
 
 
531 aa  340  5e-92  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007958  RPD_3905  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.64 
 
 
529 aa  340  5e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_4106  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.64 
 
 
529 aa  339  5.9999999999999996e-92  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.885327  normal 
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_1189  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.22 
 
 
535 aa  338  9.999999999999999e-92  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011989  Avi_3595  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.43 
 
 
531 aa  338  9.999999999999999e-92  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  0.86096  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_1315  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.07 
 
 
529 aa  338  1.9999999999999998e-91  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  normal  0.357791 
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2306  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.74 
 
 
531 aa  338  1.9999999999999998e-91  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  0.551653  n/a   
 
 
-
 
NC_009511  Swit_4685  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.67 
 
 
525 aa  337  2.9999999999999997e-91  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal  0.436149 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3637  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  35.22 
 
 
529 aa  337  3.9999999999999995e-91  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2618  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.36 
 
 
531 aa  336  5e-91  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.497758  normal 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_3021  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  35.74 
 
 
531 aa  335  9e-91  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  normal  0.487247 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2650  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.99 
 
 
528 aa  335  1e-90  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010581  Bind_1269  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.73 
 
 
529 aa  335  2e-90  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal  0.0254425 
 
 
-
 
NC_007964  Nham_1119  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.74 
 
 
529 aa  335  2e-90  Nitrobacter hamburgensis X14  Bacteria  normal  0.480596  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_3860  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.76 
 
 
539 aa  330  3e-89  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  hitchhiker  0.00000678395  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_15551  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  35.06 
 
 
528 aa  330  3e-89  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_11540  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.55 
 
 
527 aa  330  3e-89  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00507142  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2276  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  39.11 
 
 
529 aa  330  3e-89  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000000102369 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1229  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.08 
 
 
533 aa  330  4e-89  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.270378  n/a   
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0174  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  35.6 
 
 
529 aa  330  5.0000000000000004e-89  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.996447  normal  0.371451 
 
 
-
 
NC_011666  Msil_1760  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.56 
 
 
531 aa  329  6e-89  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_08910  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.31 
 
 
531 aa  329  6e-89  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009720  Xaut_1202  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.42 
 
 
528 aa  329  7e-89  Xanthobacter autotrophicus Py2  Bacteria  normal  0.661102  normal 
 
 
-
 
NC_004310  BR1685  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  35.7 
 
 
533 aa  329  8e-89  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.447631  n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_0616  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.95 
 
 
528 aa  329  8e-89  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  normal  0.640549 
 
 
-
 
NC_009505  BOV_1629  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  35.7 
 
 
533 aa  329  8e-89  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_3318  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.05 
 
 
531 aa  328  1.0000000000000001e-88  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.677421  normal 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_15401  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  35.11 
 
 
528 aa  328  2.0000000000000001e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.0931759  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1821  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  35.47 
 
 
523 aa  328  2.0000000000000001e-88  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0710  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.14 
 
 
542 aa  327  3e-88  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  0.196237  normal 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1543  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  34.96 
 
 
527 aa  327  3e-88  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  hitchhiker  0.00623773  hitchhiker  0.0000362163 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_0835  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  35.23 
 
 
523 aa  327  4.0000000000000003e-88  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1452  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  34.86 
 
 
528 aa  327  4.0000000000000003e-88  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009483  Gura_1737  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.91 
 
 
541 aa  325  1e-87  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_2378  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.23 
 
 
541 aa  325  2e-87  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  0.0367603  normal 
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_1814  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.85 
 
 
534 aa  324  2e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  normal  0.375906  n/a   
 
 
-
 
NC_010725  Mpop_0639  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  35.4 
 
 
535 aa  325  2e-87  Methylobacterium populi BJ001  Bacteria  normal  normal  0.295873 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2536  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  38.71 
 
 
529 aa  325  2e-87  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.0175573  n/a   
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_1779  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.85 
 
 
534 aa  324  2e-87  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.742834  n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0793  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.43 
 
 
529 aa  324  3e-87  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_15151  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  35.24 
 
 
528 aa  323  4e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_05241  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  34.56 
 
 
528 aa  323  5e-87  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2428  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  35.78 
 
 
525 aa  323  6e-87  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_2377  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  35.78 
 
 
525 aa  323  6e-87  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_1082  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  34.69 
 
 
523 aa  322  8e-87  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0900  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  35.1 
 
 
523 aa  322  9.999999999999999e-87  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU1198  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.53 
 
 
542 aa  321  1.9999999999999998e-86  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  0.0190635  n/a   
 
 
-
 
NC_002976  SERP1288  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  35.84 
 
 
531 aa  321  1.9999999999999998e-86  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  normal  0.605181  n/a   
 
 
-
 
NC_007516  Syncc9605_2150  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  34.1 
 
 
528 aa  321  1.9999999999999998e-86  Synechococcus sp. CC9605  Bacteria  normal  0.204731  normal  0.434509 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_3375  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.1 
 
 
652 aa  320  5e-86  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  normal  0.973939 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_2256  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.69 
 
 
532 aa  320  5e-86  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_013743  Htur_0077  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  36.36 
 
 
528 aa  319  6e-86  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1501  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  35.19 
 
 
546 aa  319  7.999999999999999e-86  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4196  D-3-phosphoglycerate dehydrogenase  37.02 
 
 
527 aa  318  1e-85  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>