More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_4021 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_4021  transcriptional regulator, LacI family  100 
 
 		 350 aa  680    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.613602  normal  0.127498 
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2402  transcriptional regulator, LacI family  60.83 
 
 		 346 aa  383  1e-105  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00787022 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_1878  transcriptional regulator, LacI family  59.47 
 
 		 351 aa  335  1e-90  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.0941149  normal  1 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_08380  transcriptional regulator  61.13 
 
 		 351 aa  330  3e-89  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.689367  normal  0.241125 
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0403  transcriptional regulator, LacI family  54.76 
 
 		 350 aa  319  3.9999999999999996e-86  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_2841  transcriptional regulator, LacI family  54.76 
 
 		 345 aa  315  9e-85  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.595775  normal  1 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_1895  LacI family transcriptional regulator  49.4 
 
 		 339 aa  288  8e-77  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.371942 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0938  LacI family transcription regulator  48.97 
 
 		 340 aa  286  2.9999999999999996e-76  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.0104625  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_1789  transcriptional regulator, LacI family  49.41 
 
 		 343 aa  285  7e-76  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5334  transcriptional regulator, LacI family  51.65 
 
 		 339 aa  285  9e-76  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.431046 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_1510  LacI family transcription regulator  50.48 
 
 		 348 aa  283  4.0000000000000003e-75  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00014462 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1561  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  50.32 
 
 		 348 aa  282  6.000000000000001e-75  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.63047 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0838  LacI family transcriptional regulator  51.05 
 
 		 331 aa  282  7.000000000000001e-75  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.620074  normal  0.213955 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3304  LacI family transcription regulator  47.89 
 
 		 335 aa  280  3e-74  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.547709 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1732  transcriptional regulator, LacI family  48.55 
 
 		 340 aa  279  6e-74  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  0.0521835  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2615  transcriptional regulator, LacI family  52.71 
 
 		 337 aa  278  1e-73  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3721  transcriptional regulator  48.01 
 
 		 350 aa  276  3e-73  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  0.940328  normal  0.590974 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_0809  transcriptional regulator, LacI family  47.67 
 
 		 344 aa  276  4e-73  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.119427 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0134  LacI family transcription regulator  47.2 
 
 		 343 aa  273  3e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1798  LacI family transcription regulator  47.08 
 
 		 473 aa  273  3e-72  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  normal  0.651793 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7169  transcriptional repressor RbsR  49.85 
 
 		 331 aa  271  2e-71  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0351473 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_6278  transcriptional regulator, LacI family  45.59 
 
 		 338 aa  271  2e-71  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_0389  LacI family transcription regulator  50.75 
 
 		 335 aa  269  4e-71  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.0127409 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3984  LacI family transcription regulator  49.12 
 
 		 339 aa  269  5e-71  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  0.125023  n/a   
 
 
-
 
NC_009380  Strop_0325  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  49.25 
 
 		 335 aa  268  1e-70  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5463  LacI family transcription regulator  49.85 
 
 		 344 aa  268  1e-70  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.316293  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_5673  transcriptional regulator, LacI family  49.4 
 
 		 343 aa  255  1.0000000000000001e-66  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.227027  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_03890  transcriptional regulator, LacI family  42.09 
 
 		 337 aa  248  1e-64  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.229438 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_3491  transcriptional regulator, LacI family  44.44 
 
 		 349 aa  247  2e-64  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.201292  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_3394  transcriptional regulator  46.55 
 
 		 361 aa  244  1.9999999999999999e-63  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.330741 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3965  Alanine racemase  48.08 
 
 		 338 aa  243  5e-63  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.578436 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_13170  transcriptional regulator  46.69 
 
 		 359 aa  235  7e-61  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  0.362617  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3075  transcriptional regulator, LacI family  45.67 
 
 		 338 aa  233  5e-60  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.494184  normal  0.554684 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0307  transcriptional regulator, LacI family  38.67 
 
 		 337 aa  227  2e-58  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.211089  normal  0.109292 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4568  transcriptional regulator, LacI family  44.94 
 
 		 357 aa  228  2e-58  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3030  transcriptional regulator, LacI family  45.65 
 
 		 342 aa  227  2e-58  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_2155  transcriptional regulator, LacI family  39.46 
 
 		 338 aa  221  9.999999999999999e-57  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  0.677334  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1685  transcriptional regulator, LacI family  38.81 
 
 		 337 aa  219  5e-56  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6684  transcriptional regulator, LacI family  47.62 
 
 		 338 aa  211  1e-53  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  1  normal  0.594008 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_14510  transcriptional regulator, LacI family  36.53 
 
 		 333 aa  210  3e-53  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.000000207214  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0297  LacI family transcription regulator  37.46 
 
 		 340 aa  203  4e-51  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_04030  transcriptional regulator  40.76 
 
 		 351 aa  198  1.0000000000000001e-49  Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_1193  transcriptional regulator, LacI family  42.68 
 
 		 335 aa  192  6e-48  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  0.0624061  normal  0.122686 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2024  LacI family transcription regulator  36.26 
 
 		 348 aa  191  2e-47  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012793  GWCH70_0699  transcriptional regulator, LacI family  32.84 
 
 		 341 aa  185  1.0000000000000001e-45  Geobacillus sp. WCH70  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_14260  transcriptional regulator  41.24 
 
 		 330 aa  184  2.0000000000000003e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  0.419378  normal  0.681325 
 
 
-
 
NC_013521  Sked_20430  transcriptional regulator  41.07 
 
 		 337 aa  182  8.000000000000001e-45  Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_0911  transcriptional regulator, LacI family  37.43 
 
 		 332 aa  181  2e-44  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1515  transcriptional regulator, LacI family  32.34 
 
 		 339 aa  180  2.9999999999999997e-44  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009784  VIBHAR_06943  hypothetical protein  35.88 
 
 		 334 aa  180  4e-44  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0161  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  30.57 
 
 		 336 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_2203  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  33.04 
 
 		 336 aa  179  4.999999999999999e-44  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.0000000348221  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_4523  transcriptional repressor RbsR  36.28 
 
 		 331 aa  177  2e-43  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  hitchhiker  0.00220391  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_4199  LacI family transcription regulator  37.71 
 
 		 353 aa  177  2e-43  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0828  transcriptional regulator, LacI family  35.82 
 
 		 332 aa  176  5e-43  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012917  PC1_4233  transcriptional repressor RbsR  36.09 
 
 		 328 aa  175  9.999999999999999e-43  Pectobacterium carotovorum subsp. carotovorum PC1  Bacteria  hitchhiker  0.00129115  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_16200  transcriptional regulator, LacI family  33.33 
 
 		 336 aa  174  1.9999999999999998e-42  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  hitchhiker  0.00346268  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0952  LacI family transcription regulator  32.36 
 
 		 341 aa  173  2.9999999999999996e-42  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0663  transcriptional regulator, LacI family  29.71 
 
 		 338 aa  173  2.9999999999999996e-42  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_2910  transcriptional regulator, LacI family  37.85 
 
 		 333 aa  173  3.9999999999999995e-42  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  1  normal  0.0171477 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0457  transcriptional regulator, LacI family  36.45 
 
 		 353 aa  173  3.9999999999999995e-42  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.532528  normal  0.622739 
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_1556  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.75 
 
 		 333 aa  172  5e-42  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  0.0687903  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_1618  LacI family transcription regulator  33.55 
 
 		 333 aa  172  5.999999999999999e-42  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.010762  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_04075  galactose operon repressor  34.12 
 
 		 333 aa  171  2e-41  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0944  transcriptional regulator, LacI family  40.54 
 
 		 334 aa  171  2e-41  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.694443 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2830  transcriptional regulator, LacI family  39.18 
 
 		 344 aa  169  8e-41  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_18230  transcriptional regulator, LacI family  31.16 
 
 		 386 aa  168  1e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0832  LacI family transcription regulator  29.02 
 
 		 346 aa  168  1e-40  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013131  Caci_2511  transcriptional regulator, LacI family  36.34 
 
 		 334 aa  169  1e-40  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.155489  normal  1 
 
 
-
 
NC_010338  Caul_0415  LacI family transcription regulator  34.81 
 
 		 335 aa  167  2.9999999999999998e-40  Caulobacter sp. K31  Bacteria  normal  0.280412  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_2788  transcriptional regulator, LacI family  36.04 
 
 		 339 aa  166  4e-40  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_03798  galactose operon repressor  32.02 
 
 		 333 aa  166  4e-40  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04200  transcriptional regulator, LacI family  30.33 
 
 		 341 aa  166  6.9999999999999995e-40  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4896  transcriptional repressor RbsR  36.58 
 
 		 333 aa  165  9e-40  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  decreased coverage  0.000156613  hitchhiker  0.000000782419 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_22540  transcriptional regulator, LacI family  31.97 
 
 		 332 aa  165  1.0000000000000001e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_2273  LacI family transcription regulator  35.87 
 
 		 333 aa  164  2.0000000000000002e-39  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.0311079  hitchhiker  0.000018406 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0376  transcriptional regulator, LacI family  36.33 
 
 		 358 aa  164  2.0000000000000002e-39  Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_0673  transcriptional regulator, LacI family  34.94 
 
 		 382 aa  164  2.0000000000000002e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.208846  normal  0.309345 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04570  transcriptional regulator, LacI family  28.57 
 
 		 335 aa  163  3e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_1120  regulatory protein, LacI  31.21 
 
 		 324 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0861  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  42.45 
 
 		 292 aa  163  4.0000000000000004e-39  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  0.19022 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_3179  transcriptional regulator, LacI family  35.99 
 
 		 355 aa  163  5.0000000000000005e-39  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.588941  normal  1 
 
 
-
 
NC_011899  Hore_04250  transcriptional regulator, LacI family  28.83 
 
 		 337 aa  162  6e-39  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  0.335349  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_002667  Galactose operon repressor  33.83 
 
 		 332 aa  162  6e-39  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0881  periplasmic binding protein/LacI transcriptional regulator  32.23 
 
 		 325 aa  162  6e-39  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.188257  normal  0.666839 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_2083  LacI family transcription regulator  32.9 
 
 		 342 aa  161  1e-38  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2204  transcriptional regulator, LacI family  28.25 
 
 		 337 aa  162  1e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2870  transcriptional regulator, LacI family  32.73 
 
 		 342 aa  161  2e-38  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_2398  LacI family transcription regulator  33.83 
 
 		 368 aa  160  3e-38  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0409  transcriptional regulator, LacI family  30.29 
 
 		 342 aa  160  3e-38  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.521683  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0566  transcriptional regulator, LacI family  29.41 
 
 		 328 aa  160  4e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0582  alanine racemase  32.25 
 
 		 337 aa  160  4e-38  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  decreased coverage  0.000000548778  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0219  LacI family transcription regulator  35.91 
 
 		 351 aa  159  5e-38  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0402  transcriptional regulator, LacI family  30.45 
 
 		 339 aa  159  6e-38  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  unclonable  0.00000000159796  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_3025  transcriptional regulator, LacI family  38.35 
 
 		 347 aa  159  7e-38  Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2690  transcriptional regulator, LacI family  31.11 
 
 		 355 aa  159  8e-38  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4111  transcriptional repressor RbsR  35.02 
 
 		 333 aa  159  9e-38  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  0.0488485  normal  0.0159443 
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4270  transcriptional repressor RbsR  35.22 
 
 		 330 aa  159  9e-38  Escherichia coli E24377A  Bacteria  hitchhiker  0.000205239  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1725  transcriptional regulator, LacI family  32.69 
 
 		 338 aa  158  1e-37  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008048  Sala_1024  LacI family transcription regulator  36.04 
 
 		 342 aa  158  1e-37  Sphingopyxis alaskensis RB2256  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>