More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_1119 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013441  Gbro_3803  translation elongation factor Tu  85.86 
 
 		 396 aa  710    Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  0.875507  n/a   
 
 
-
 
NC_014151  Cfla_2661  translation elongation factor Tu  84.13 
 
 		 397 aa  689    Cellulomonas flavigena DSM 20109  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1015  elongation factor Tu  85.35 
 
 		 396 aa  692    Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  1  normal  0.345465 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03960  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  83.12 
 
 		 397 aa  682    Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2648  elongation factor Tu  82.37 
 
 		 397 aa  672    Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.428976  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_2692  elongation factor Tu  82.62 
 
 		 396 aa  671    Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  0.487048 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_4509  translation elongation factor Tu  83.38 
 
 		 397 aa  658    Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  0.936276  n/a   
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_5122  translation elongation factor Tu  81.11 
 
 		 397 aa  662    Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.821409 
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0560  translation elongation factor Tu  80.86 
 
 		 397 aa  645    Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_6616  translation elongation factor Tu  81.61 
 
 		 397 aa  644    Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_5075  elongation factor Tu  84.85 
 
 		 396 aa  689    Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.602594  normal  0.915347 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_0685  elongation factor Tu  82.37 
 
 		 397 aa  648    Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  1  normal  0.731809 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4323  translation elongation factor Tu  81.36 
 
 		 397 aa  645    Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013521  Sked_29780  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  82.12 
 
 		 396 aa  668    Sanguibacter keddieii DSM 10542  Bacteria  normal  1  normal  0.573725 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1084  elongation factor Tu  80.86 
 
 		 397 aa  643    Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172914 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0580  elongation factor Tu  82.12 
 
 		 397 aa  646    Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.700966  normal  1 
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3145  elongation factor Tu  83.84 
 
 		 396 aa  677    Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.23221  normal  1 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_3466  translation elongation factor Tu  85.82 
 
 		 396 aa  711    Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.0246546  n/a   
 
 
-
 
NC_012803  Mlut_17200  elongation factor Tu  82.62 
 
 		 396 aa  640    Micrococcus luteus NCTC 2665  Bacteria  normal  0.232418  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1183  translation elongation factor Tu  78.09 
 
 		 397 aa  642    Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  1  normal  0.120688 
 
 
-
 
NC_013174  Jden_0585  translation elongation factor Tu  79.6 
 
 		 396 aa  655    Jonesia denitrificans DSM 20603  Bacteria  normal  0.344387  normal  0.178311 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_0924  translation elongation factor Tu  82.12 
 
 		 397 aa  642    Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.0489446  normal  1 
 
 
-
 
NC_013169  Ksed_20900  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  79.29 
 
 		 397 aa  662    Kytococcus sedentarius DSM 20547  Bacteria  normal  0.191388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_10699  elongation factor Tu  85.1 
 
 		 396 aa  673    Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_0987  elongation factor Tu  85.35 
 
 		 396 aa  692    Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0625  translation elongation factor Tu  81.34 
 
 		 401 aa  664    Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1282  elongation factor Tu  84.6 
 
 		 396 aa  704    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0674069  normal  0.99115 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1119  translation elongation factor Tu  100 
 
 		 396 aa  802    Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013172  Bfae_23870  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  80.3 
 
 		 395 aa  666    Brachybacterium faecium DSM 4810  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008541  Arth_2979  elongation factor Tu  82.87 
 
 		 396 aa  675    Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  0.990994  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0304  elongation factor Tu  80.86 
 
 		 397 aa  664    Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00273769 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3922  elongation factor Tu  78.34 
 
 		 397 aa  647    Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1005  elongation factor Tu  85.35 
 
 		 396 aa  692    Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6051  elongation factor Tu  82.12 
 
 		 397 aa  633  1e-180  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.198403  normal  0.396578 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3925  elongation factor Tu  80.35 
 
 		 397 aa  626  1e-178  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_4317  elongation factor Tu  80.35 
 
 		 397 aa  627  1e-178  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00391297 
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2713  translation elongation factor Tu  75.31 
 
 		 395 aa  618  1e-176  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  decreased coverage  0.0000152961  n/a   
 
 
-
 
NC_013165  Shel_08650  translation elongation factor 1A (EF-1A/EF-Tu)  72.57 
 
 		 400 aa  598  1e-170  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  hitchhiker  0.0000915749  hitchhiker  0.000000299529 
 
 
-
 
NC_002977  MCA1059  elongation factor Tu  72.18 
 
 		 396 aa  593  1e-168  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.0877336  n/a   
 
 
-
 
NC_002977  MCA2374  elongation factor Tu  72.18 
 
 		 396 aa  593  1e-168  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0185  elongation factor Tu  71.97 
 
 		 394 aa  593  1e-168  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  unclonable  0.0000000201579  hitchhiker  0.00891044 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0180  elongation factor Tu  71.97 
 
 		 394 aa  593  1e-168  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  unclonable  0.00000449049  hitchhiker  0.00322221 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0185  elongation factor Tu  71.97 
 
 		 394 aa  592  1e-168  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000202802  normal  0.069078 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_0197  elongation factor Tu  71.97 
 
 		 394 aa  592  1e-168  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  hitchhiker  0.00000214684  hitchhiker  0.0000000334083 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0229  elongation factor Tu  72.47 
 
 		 394 aa  588  1e-167  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0810  elongation factor Tu  71.96 
 
 		 400 aa  588  1e-167  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.0000000557985  n/a   
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2855  elongation factor Tu  72.43 
 
 		 396 aa  588  1e-167  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0256724  normal  0.29734 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2183  translation elongation factor Tu  72.43 
 
 		 396 aa  590  1e-167  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  0.557033  normal  1 
 
 
-
 
NC_013721  HMPREF0424_1094  elongation factor Tu domain protein  72.43 
 
 		 399 aa  589  1e-167  Gardnerella vaginalis 409-05  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_013889  TK90_2171  translation elongation factor Tu  72.43 
 
 		 396 aa  590  1e-167  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  hitchhiker  0.00686859  normal  0.373473 
 
 
-
 
NC_010622  Bphy_2842  elongation factor Tu  72.43 
 
 		 396 aa  588  1e-167  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.0284377  normal  0.173199 
 
 
-
 
NC_004347  SO_0217  elongation factor Tu  72.22 
 
 		 394 aa  586  1e-166  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3432  elongation factor Tu  71.68 
 
 		 396 aa  586  1e-166  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.000000234353  normal  1 
 
 
-
 
NC_007510  Bcep18194_A3445  elongation factor Tu  71.68 
 
 		 396 aa  586  1e-166  Burkholderia sp. 383  Bacteria  hitchhiker  0.00000180875  normal  0.0858427 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0261  elongation factor Tu  71.68 
 
 		 396 aa  585  1e-166  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.000273962  normal  0.384792 
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_0274  elongation factor Tu  71.68 
 
 		 396 aa  585  1e-166  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  hitchhiker  0.00680281  normal  0.135864 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3659  elongation factor Tu  71.68 
 
 		 396 aa  586  1e-166  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  decreased coverage  0.000000150336  hitchhiker  0.00000130036 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0299  elongation factor Tu  71.68 
 
 		 396 aa  584  1e-166  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000130927  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A0312  elongation factor Tu  71.68 
 
 		 396 aa  584  1e-166  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  hitchhiker  0.0000000663244  normal  0.0566649 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2761  elongation factor Tu  71.68 
 
 		 396 aa  586  1e-166  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.14554  n/a   
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_2774  elongation factor Tu  71.68 
 
 		 396 aa  586  1e-166  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  hitchhiker  0.000183999  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0197  elongation factor Tu  72.22 
 
 		 394 aa  586  1e-166  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  hitchhiker  0.00000553237  unclonable  0.0000000000241033 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_0192  elongation factor Tu  72.22 
 
 		 394 aa  587  1e-166  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  decreased coverage  0.00059163  decreased coverage  0.000414976 
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0325  elongation factor Tu  71.68 
 
 		 396 aa  586  1e-166  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.0223104  normal  0.0648127 
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0252  elongation factor Tu  71.68 
 
 		 396 aa  586  1e-166  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  decreased coverage  0.0000268752  n/a   
 
 
-
 
NC_008390  Bamb_0265  elongation factor Tu  71.68 
 
 		 396 aa  586  1e-166  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0194583  n/a   
 
 
-
 
NC_010508  Bcenmc03_0312  elongation factor Tu  71.68 
 
 		 396 aa  586  1e-166  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  hitchhiker  0.000000814669  normal  0.179373 
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0333  elongation factor Tu  71.68 
 
 		 396 aa  586  1e-166  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  decreased coverage  0.0000426715  n/a   
 
 
-
 
NC_008542  Bcen2424_0346  elongation factor Tu  71.68 
 
 		 396 aa  586  1e-166  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.0260269  n/a   
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_3646  elongation factor Tu  71.68 
 
 		 396 aa  586  1e-166  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  unclonable  0.000000015318  hitchhiker  0.0000000000310582 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2722  elongation factor Tu  71.43 
 
 		 396 aa  582  1.0000000000000001e-165  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.0752612  normal  0.841998 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0284  elongation factor Tu  70.9 
 
 		 400 aa  584  1.0000000000000001e-165  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  hitchhiker  0.00091062  hitchhiker  0.00368673 
 
 
-
 
NC_011830  Dhaf_0420  elongation factor Tu  70.65 
 
 		 400 aa  583  1.0000000000000001e-165  Desulfitobacterium hafniense DCB-2  Bacteria  hitchhiker  0.0000158382  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2326  elongation factor Tu  70.43 
 
 		 396 aa  581  1.0000000000000001e-165  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  decreased coverage  0.0000151481  n/a   
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0270  elongation factor Tu  70.9 
 
 		 400 aa  584  1.0000000000000001e-165  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  unclonable  0.0000000107043  normal  0.0107333 
 
 
-
 
NC_010001  Cphy_0238  elongation factor Tu  70.85 
 
 		 397 aa  581  1.0000000000000001e-165  Clostridium phytofermentans ISDg  Bacteria  hitchhiker  0.0000000602877  n/a   
 
 
-
 
NC_013061  Phep_0842  elongation factor Tu  69.52 
 
 		 395 aa  582  1.0000000000000001e-165  Pedobacter heparinus DSM 2366  Bacteria  normal  1  normal  0.445688 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0860  elongation factor Tu  72.46 
 
 		 396 aa  582  1.0000000000000001e-165  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  0.412967  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1932  elongation factor Tu  71.93 
 
 		 396 aa  583  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0752  elongation factor Tu  70.18 
 
 		 396 aa  582  1.0000000000000001e-165  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.993523  n/a   
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0765  elongation factor Tu  70.18 
 
 		 396 aa  582  1.0000000000000001e-165  Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  0.0667226  n/a   
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2338  elongation factor Tu  70.43 
 
 		 396 aa  581  1.0000000000000001e-165  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  0.0567224  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2734  elongation factor Tu  71.43 
 
 		 396 aa  582  1.0000000000000001e-165  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.102462 
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0247  elongation factor Tu  71.18 
 
 		 396 aa  583  1.0000000000000001e-165  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000151927  normal  0.238121 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_2952  elongation factor Tu  70.79 
 
 		 402 aa  581  1.0000000000000001e-165  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  hitchhiker  0.00124181  hitchhiker  0.00000107296 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_0396  translation elongation factor Tu  74.56 
 
 		 395 aa  583  1.0000000000000001e-165  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0851  elongation factor Tu  70.15 
 
 		 400 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000784672  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2367  elongation factor Tu  71.93 
 
 		 396 aa  583  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.709055  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_2279  elongation factor Tu  71.93 
 
 		 396 aa  583  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010320  Teth514_0865  elongation factor Tu  70.15 
 
 		 400 aa  582  1.0000000000000001e-165  Thermoanaerobacter sp. X514  Bacteria  unclonable  0.00000000288327  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0742  elongation factor Tu  70.43 
 
 		 396 aa  581  1.0000000000000001e-165  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000000028539  normal  1 
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2017  elongation factor Tu  71.93 
 
 		 396 aa  583  1.0000000000000001e-165  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_0754  elongation factor Tu  70.43 
 
 		 396 aa  581  1.0000000000000001e-165  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  hitchhiker  0.0000150197  normal  0.0210812 
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0051  elongation factor Tu  70.85 
 
 		 396 aa  582  1.0000000000000001e-165  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  hitchhiker  0.000000252436  n/a   
 
 
-
 
NC_009379  Pnuc_0039  elongation factor Tu  70.85 
 
 		 396 aa  582  1.0000000000000001e-165  Polynucleobacter necessarius subsp. asymbioticus QLW-P1DMWA-1  Bacteria  unclonable  0.00000000135478  n/a   
 
 
-
 
NC_010084  Bmul_0234  elongation factor Tu  71.18 
 
 		 396 aa  582  1.0000000000000001e-165  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  hitchhiker  0.00000045907  normal  0.0164851 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0872  elongation factor Tu  72.39 
 
 		 396 aa  580  1e-164  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009076  BURPS1106A_3806  elongation factor Tu  71.18 
 
 		 396 aa  580  1e-164  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.222005  n/a   
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_3762  elongation factor Tu  71.18 
 
 		 396 aa  580  1e-164  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  decreased coverage  0.000000000163409  n/a   
 
 
-
 
NC_010682  Rpic_3299  elongation factor Tu  70.54 
 
 		 402 aa  579  1e-164  Ralstonia pickettii 12J  Bacteria  hitchhiker  0.00521718  hitchhiker  0.000291329 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>