187 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Namu_0276 on replicon NC_013235
Organism: Nakamurella multipartita DSM 44233



Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_013235  Namu_0276  HNH nuclease  100 
 
 		 130 aa  261  2e-69  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_3190  hypothetical protein  61.26 
 
 		 151 aa  140  5e-33  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_3946  HNH endonuclease  44 
 
 		 151 aa  62.8  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1834  HNH endonuclease  35.96 
 
 		 165 aa  57.8  0.00000005  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  0.0645517  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1583  HNH endonuclease  42.67 
 
 		 166 aa  57.4  0.00000007  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011059  Paes_0170  HNH endonuclease  40.28 
 
 		 171 aa  56.2  0.0000001  Prosthecochloris aestuarii DSM 271  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013386  Adeg_2160  HNH endonuclease  35.62 
 
 		 459 aa  55.5  0.0000002  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010803  Clim_0162  HNH endonuclease  38.96 
 
 		 170 aa  56.2  0.0000002  Chlorobium limicola DSM 245  Bacteria  normal  0.504267  n/a   
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_5432  HNH endonuclease  40.48 
 
 		 174 aa  56.2  0.0000002  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  1  normal  0.0404895 
 
 
-
 
NC_013385  Adeg_0842  HNH endonuclease  35.62 
 
 		 459 aa  55.1  0.0000003  Ammonifex degensii KC4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2650  HNH endonuclease  41.07 
 
 		 236 aa  55.1  0.0000003  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.479892 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3583  HNH nuclease  36.36 
 
 		 172 aa  54.7  0.0000004  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007512  Plut_0126  HNH nuclease  40.28 
 
 		 168 aa  54.3  0.0000005  Chlorobium luteolum DSM 273  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008639  Cpha266_2497  HNH endonuclease  40.85 
 
 		 170 aa  54.3  0.0000005  Chlorobium phaeobacteroides DSM 266  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2202  HNH nuclease  47.37 
 
 		 165 aa  54.3  0.0000006  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.815076 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0513  HNH endonuclease  41.33 
 
 		 176 aa  54.3  0.0000006  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009355  OSTLU_8502  predicted protein  44.64 
 
 		 167 aa  53.5  0.0000009  Ostreococcus lucimarinus CCE9901  Eukaryota  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011886  Achl_0915  HNH endonuclease  45.76 
 
 		 166 aa  52.4  0.000002  Arthrobacter chlorophenolicus A6  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_011761  AFE_1152  HNH endonuclease domain protein  45.76 
 
 		 181 aa  52.8  0.000002  Acidithiobacillus ferrooxidans ATCC 23270  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_002936  DET0537  HNH endonuclease domain-containing protein  40 
 
 		 177 aa  52  0.000003  Dehalococcoides ethenogenes 195  Bacteria  normal  0.525131  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_478  restriction endonuclease  40 
 
 		 176 aa  52  0.000003  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008312  Tery_1582  HNH endonuclease  47.37 
 
 		 167 aa  51.6  0.000003  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  1  normal  0.485926 
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3551  HNH endonuclease  50.88 
 
 		 166 aa  51.2  0.000004  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  decreased coverage  0.00264695  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1202  HNH endonuclease  40.35 
 
 		 205 aa  51.2  0.000005  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01815  restriction endonuclease  40.35 
 
 		 184 aa  50.8  0.000006  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  unclonable  0.00000133785  n/a   
 
 
-
 
NC_013946  Mrub_2818  HNH endonuclease  39.33 
 
 		 173 aa  50.8  0.000006  Meiothermus ruber DSM 1279  Bacteria  normal  1  normal  0.0346696 
 
 
-
 
NC_013730  Slin_5662  HNH endonuclease  31.46 
 
 		 171 aa  50.8  0.000006  Spirosoma linguale DSM 74  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5313  HNH endonuclease  44.07 
 
 		 173 aa  50.8  0.000006  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.45285 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_1153  HNH endonuclease  44.07 
 
 		 171 aa  50.4  0.000008  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.733906  normal  1 
 
 
-
 
NC_010831  Cphamn1_0175  HNH endonuclease  38.89 
 
 		 172 aa  50.4  0.000008  Chlorobium phaeobacteroides BS1  Bacteria  normal  0.0259524  normal  1 
 
 
-
 
NC_013223  Dret_0405  HNH endonuclease  33.75 
 
 		 169 aa  50.4  0.000008  Desulfohalobium retbaense DSM 5692  Bacteria  normal  1  normal  0.359772 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_0798  HNH endonuclease  44.07 
 
 		 166 aa  50.1  0.000009  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_4081  HNH endonuclease  39.02 
 
 		 169 aa  50.4  0.000009  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0389  HNH endonuclease  47.37 
 
 		 165 aa  50.1  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.235309  normal  0.408465 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_4460  HNH endonuclease  35 
 
 		 181 aa  49.7  0.00001  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.282325  normal  1 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1537  HNH endonuclease  37.97 
 
 		 178 aa  49.7  0.00001  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_2838  HNH endonuclease  35.79 
 
 		 165 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  1  normal  0.576583 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2776  HNH endonuclease  36.14 
 
 		 179 aa  49.7  0.00001  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  0.228269  n/a   
 
 
-
 
NC_010577  XfasM23_0934  HNH endonuclease  42.11 
 
 		 186 aa  49.7  0.00001  Xylella fastidiosa M23  Bacteria  normal  0.39126  n/a   
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_3285  HNH endonuclease  35.79 
 
 		 165 aa  50.1  0.00001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0844  HNH endonuclease  36.49 
 
 		 127 aa  50.1  0.00001  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002977  MCA2596  HNH endonuclease domain-containing protein  37.18 
 
 		 196 aa  48.9  0.00002  Methylococcus capsulatus str. Bath  Bacteria  normal  0.821966  n/a   
 
 
-
 
NC_010513  Xfasm12_1053  hypothetical protein  42.11 
 
 		 204 aa  49.3  0.00002  Xylella fastidiosa M12  Bacteria  normal  0.368832  n/a   
 
 
-
 
NC_008347  Mmar10_2350  HNH endonuclease  49.09 
 
 		 188 aa  49.7  0.00002  Maricaulis maris MCS10  Bacteria  normal  0.459711  normal  1 
 
 
-
 
NC_011729  PCC7424_0860  HNH endonuclease  43.86 
 
 		 168 aa  49.7  0.00002  Cyanothece sp. PCC 7424  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_2277  HNH endonuclease  45 
 
 		 194 aa  49.3  0.00002  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2501  HNH endonuclease  44.64 
 
 		 146 aa  48.9  0.00002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000947022  n/a   
 
 
-
 
NC_013947  Snas_4633  HNH endonuclease  43.86 
 
 		 177 aa  48.9  0.00002  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.57722  normal  0.0386344 
 
 
-
 
NC_013204  Elen_0845  HNH endonuclease  32.86 
 
 		 240 aa  48.5  0.00003  Eggerthella lenta DSM 2243  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2211  HNH nuclease  40.58 
 
 		 184 aa  48.9  0.00003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012918  GM21_1765  HNH endonuclease  42.31 
 
 		 101 aa  48.5  0.00003  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.00276107 
 
 
-
 
NC_007760  Adeh_1905  HNH endonuclease  43.86 
 
 		 204 aa  48.5  0.00003  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-C  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4201  HNH endonuclease  37.5 
 
 		 213 aa  48.9  0.00003  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00342669 
 
 
-
 
NC_008340  Mlg_2772  HNH endonuclease  36 
 
 		 199 aa  48.5  0.00003  Alkalilimnicola ehrlichii MLHE-1  Bacteria  normal  0.583807  normal  1 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_01172  HNH endonuclease family protein  42.37 
 
 		 220 aa  48.5  0.00003  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  0.572297  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_1603  HNH endonuclease  41.77 
 
 		 186 aa  48.5  0.00003  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.21186  normal  1 
 
 
-
 
NC_008819  NATL1_19741  HNH endonuclease family protein  38.6 
 
 		 168 aa  48.5  0.00003  Prochlorococcus marinus str. NATL1A  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009091  P9301_17201  HNH endonuclease family protein  30 
 
 		 185 aa  48.9  0.00003  Prochlorococcus marinus str. MIT 9301  Bacteria  normal  0.659718  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_2452  HNH endonuclease  42.31 
 
 		 101 aa  48.5  0.00003  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007335  PMN2A_1099  HNH endonuclease family protein  38.6 
 
 		 168 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. NATL2A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007577  PMT9312_1621  HNH endonuclease family protein  33.71 
 
 		 185 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9312  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011891  A2cp1_2059  HNH endonuclease  43.86 
 
 		 198 aa  47.8  0.00004  Anaeromyxobacter dehalogenans 2CP-1  Bacteria  normal  0.26208  n/a   
 
 
-
 
NC_010505  Mrad2831_4342  HNH endonuclease  50 
 
 		 182 aa  48.1  0.00004  Methylobacterium radiotolerans JCM 2831  Bacteria  normal  1  normal  0.64843 
 
 
-
 
NC_008817  P9515_17101  HNH endonuclease family protein  30 
 
 		 187 aa  48.1  0.00004  Prochlorococcus marinus str. MIT 9515  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011145  AnaeK_1974  HNH endonuclease  43.86 
 
 		 198 aa  47.8  0.00004  Anaeromyxobacter sp. K  Bacteria  normal  0.54643  n/a   
 
 
-
 
NC_009952  Dshi_1687  putative HNH endonuclease  40.28 
 
 		 198 aa  48.1  0.00004  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  decreased coverage  0.00321972  normal  0.0401015 
 
 
-
 
NC_009953  Sare_3910  HNH endonuclease  44.07 
 
 		 177 aa  48.1  0.00004  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  1  normal  0.937815 
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_1162  HNH endonuclease  40.85 
 
 		 194 aa  47.8  0.00005  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00934225 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0931  HNH endonuclease  44.07 
 
 		 174 aa  47.8  0.00005  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  0.432363  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_3535  HNH endonuclease  44.07 
 
 		 177 aa  47.8  0.00005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014212  Mesil_1417  HNH endonuclease  43.06 
 
 		 174 aa  47.8  0.00005  Meiothermus silvanus DSM 9946  Bacteria  normal  0.421094  normal  1 
 
 
-
 
NC_007517  Gmet_0936  HNH endonuclease  46.15 
 
 		 104 aa  47.4  0.00006  Geobacter metallireducens GS-15  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007802  Jann_1966  HNH endonuclease  39.44 
 
 		 198 aa  47.4  0.00006  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  hitchhiker  0.00730089  normal  0.446836 
 
 
-
 
NC_008228  Patl_4054  HNH endonuclease  35.53 
 
 		 191 aa  47.4  0.00006  Pseudoalteromonas atlantica T6c  Bacteria  hitchhiker  0.0000779297  n/a   
 
 
-
 
NC_008816  A9601_17361  HNH endonuclease family protein  33.71 
 
 		 185 aa  47.4  0.00006  Prochlorococcus marinus str. AS9601  Bacteria  normal  0.334321  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_2952  HNH endonuclease family protein  43.33 
 
 		 96 aa  47.4  0.00007  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007958  RPD_0342  HNH endonuclease  44.83 
 
 		 185 aa  47  0.00008  Rhodopseudomonas palustris BisB5  Bacteria  normal  0.440485  normal  0.426528 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0891  HNH endonuclease  35.14 
 
 		 174 aa  47.4  0.00008  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  0.374169  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1715  HNH endonuclease  45.76 
 
 		 197 aa  47  0.00008  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  0.513097 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1995  HNH endonuclease  45.76 
 
 		 168 aa  47  0.00008  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0301593 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_2729  restriction endonuclease  35.9 
 
 		 194 aa  47  0.00009  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.0771488  n/a   
 
 
-
 
NC_002939  GSU2070  HNH endonuclease family protein  44.23 
 
 		 101 aa  46.2  0.0001  Geobacter sulfurreducens PCA  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007513  Syncc9902_0033  HNH nuclease  35.44 
 
 		 136 aa  46.2  0.0001  Synechococcus sp. CC9902  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0478  HNH endonuclease  45.61 
 
 		 185 aa  46.6  0.0001  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3215  hypothetical protein  41.82 
 
 		 193 aa  46.2  0.0001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008312  Tery_4021  HNH endonuclease  28.57 
 
 		 81 aa  46.6  0.0001  Trichodesmium erythraeum IMS101  Bacteria  normal  0.209781  normal  0.194615 
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2778  HNH endonuclease  42.37 
 
 		 221 aa  46.2  0.0001  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.572366  normal  1 
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1387  HNH endonuclease  35.9 
 
 		 194 aa  47  0.0001  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  0.322582  normal  1 
 
 
-
 
NC_009485  BBta_1131  putative HNH endonuclease  45.61 
 
 		 185 aa  46.6  0.0001  Bradyrhizobium sp. BTAi1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_0613  HNH endonuclease  45.61 
 
 		 185 aa  45.8  0.0002  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_2144  HNH endonuclease  47.37 
 
 		 189 aa  46.2  0.0002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3024  HNH endonuclease  34.31 
 
 		 185 aa  45.8  0.0002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_0411  HNH endonuclease  31.46 
 
 		 165 aa  46.2  0.0002  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008820  P9303_23331  HNH endonuclease family protein  42.11 
 
 		 189 aa  45.4  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9303  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_2129  HNH endonuclease  34.62 
 
 		 139 aa  45.8  0.0002  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  0.830228 
 
 
-
 
NC_010511  M446_3060  HNH endonuclease  45.16 
 
 		 183 aa  45.8  0.0002  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.137861  normal  0.0666766 
 
 
-
 
NC_013037  Dfer_3479  HNH endonuclease  33.8 
 
 		 169 aa  46.2  0.0002  Dyadobacter fermentans DSM 18053  Bacteria  normal  0.0281943  normal  0.571859 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3705  HNH endonuclease  30.11 
 
 		 205 aa  45.8  0.0002  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  0.189968  normal  1 
 
 
-
 
NC_009972  Haur_4220  HNH endonuclease  42.11 
 
 		 177 aa  46.2  0.0002  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009976  P9211_16481  HNH endonuclease family protein  34.67 
 
 		 168 aa  45.8  0.0002  Prochlorococcus marinus str. MIT 9211  Bacteria  normal  0.587799  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 2    << first  < prev  1  2    next >  last >>