More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_2072 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008726  Mvan_2072  response regulator receiver protein  100 
 
 		 144 aa  284  2e-76  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.527517 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3719  response regulator receiver protein  46.85 
 
 		 117 aa  83.2  0.000000000000001  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.092296  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6493  response regulator receiver protein  39.47 
 
 		 131 aa  63.2  0.000000001  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0923194  normal  0.49413 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0641  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.26 
 
 		 1648 aa  62  0.000000003  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2548  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.24 
 
 		 218 aa  61.6  0.000000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_2295  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.38 
 
 		 222 aa  60.8  0.000000006  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  0.031577  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_4290  two component LuxR family transcriptional regulator  31.09 
 
 		 218 aa  59.7  0.00000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_3200  multi-sensor hybrid histidine kinase  33.33 
 
 		 1768 aa  59.3  0.00000002  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_0679  two component LuxR family transcriptional regulator  32.35 
 
 		 213 aa  59.3  0.00000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_0772  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  40.78 
 
 		 353 aa  58.9  0.00000002  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  0.446886  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0408  CheA signal transduction histidine kinase  38.55 
 
 		 2423 aa  59.3  0.00000002  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_4563  two component LuxR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.0560765 
 
 
-
 
NC_008061  Bcen_5187  two component LuxR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_5672  two component LuxR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 214 aa  58.5  0.00000003  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00685344 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0300  two component transcriptional regulator, LuxR family  25.66 
 
 		 224 aa  58.2  0.00000004  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008044  TM1040_0876  two component LuxR family transcriptional regulator  33.87 
 
 		 233 aa  58.2  0.00000004  Ruegeria sp. TM1040  Bacteria  normal  0.481499  normal  0.345787 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0036  putative two-component response regulator  34.65 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.035019  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00430  putative two-component response regulator  34.65 
 
 		 207 aa  58.2  0.00000004  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.247974 
 
 
-
 
NC_007298  Daro_0834  LuxR response regulator receiver  37.86 
 
 		 221 aa  57.8  0.00000005  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  0.0179337 
 
 
-
 
NC_013216  Dtox_0656  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  39.8 
 
 		 346 aa  57.8  0.00000005  Desulfotomaculum acetoxidans DSM 771  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0000622897 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_4577  response regulator receiver protein  37.14 
 
 		 223 aa  57.8  0.00000005  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.172592 
 
 
-
 
NC_011883  Ddes_1377  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  38.83 
 
 		 356 aa  57.8  0.00000006  Desulfovibrio desulfuricans subsp. desulfuricans str. ATCC 27774  Bacteria  normal  0.165106  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0026  two component LuxR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 214 aa  57  0.00000007  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007575  Suden_1556  response regulator receiver domain-containing protein  32 
 
 		 125 aa  57.4  0.00000007  Sulfurimonas denitrificans DSM 1251  Bacteria  normal  0.848966  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_0335  two component transcriptional regulator, LuxR family  42.62 
 
 		 220 aa  57.4  0.00000007  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_0470  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  41.57 
 
 		 355 aa  57  0.00000009  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  0.0887137  normal  0.635476 
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_5498  two component LuxR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 214 aa  57  0.00000009  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00509748 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_4946  two component LuxR family transcriptional regulator  37.62 
 
 		 214 aa  57  0.00000009  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  1  normal  0.0203352 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0513  response regulator  32.61 
 
 		 2458 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009901  Spea_0628  multi-sensor hybrid histidine kinase  31.75 
 
 		 1765 aa  56.2  0.0000001  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_2627  two component transcriptional regulator, LuxR family  28.46 
 
 		 211 aa  56.6  0.0000001  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_0765  two component LuxR family transcriptional regulator  40.57 
 
 		 237 aa  57  0.0000001  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.272345  normal  1 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0943  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  35.63 
 
 		 354 aa  56.2  0.0000001  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013525  Tter_1109  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.25 
 
 		 218 aa  56.6  0.0000001  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_05390  ChpA  32.61 
 
 		 2476 aa  56.2  0.0000001  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.812783  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2780  two component transcriptional regulator, LuxR family  32.84 
 
 		 219 aa  55.8  0.0000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.855193  normal  0.402473 
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_0094  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.53 
 
 		 220 aa  55.8  0.0000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009664  Krad_3810  two component transcriptional regulator, LuxR family  37.17 
 
 		 236 aa  55.8  0.0000002  Kineococcus radiotolerans SRS30216  Bacteria  normal  0.225059  normal  0.0261757 
 
 
-
 
NC_008751  Dvul_2052  putative PAS/PAC sensor protein  37.62 
 
 		 414 aa  55.8  0.0000002  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.948346  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_4080  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.78 
 
 		 241 aa  55.5  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  0.858367 
 
 
-
 
NC_011901  Tgr7_2171  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.31 
 
 		 227 aa  55.1  0.0000003  Thioalkalivibrio sp. HL-EbGR7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_0492  response regulator receiver:CheW-like protein:ATP-binding region, ATPase-like:Hpt  33.33 
 
 		 1992 aa  55.1  0.0000003  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014211  Ndas_4872  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.54 
 
 		 232 aa  55.1  0.0000003  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.247388  normal  1 
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A3133  LuxR family DNA-binding response regulator  37.25 
 
 		 215 aa  55.5  0.0000003  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008609  Ppro_2713  two component LuxR family transcriptional regulator  33.66 
 
 		 208 aa  55.1  0.0000003  Pelobacter propionicus DSM 2379  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6192  two component LuxR family transcriptional regulator  42.86 
 
 		 231 aa  54.7  0.0000004  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.446565  normal  0.0472092 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_4307  sigma54 specific transcriptional regulator, Fis family  31.63 
 
 		 635 aa  54.7  0.0000004  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  0.056389 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_3359  two component transcriptional regulator, LuxR family  38.38 
 
 		 219 aa  54.7  0.0000004  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00321115  hitchhiker  0.000132937 
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0023  two component LuxR family transcriptional regulator  34.95 
 
 		 221 aa  54.7  0.0000004  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.273145  hitchhiker  0.00000136124 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5840  two component LuxR family transcriptional regulator  39.83 
 
 		 237 aa  54.7  0.0000004  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.0206065  normal  0.380036 
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_601  DNA-binding response regulator, LuxR family  27.45 
 
 		 224 aa  54.3  0.0000005  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0632  two component LuxR family transcriptional regulator  27.45 
 
 		 224 aa  54.7  0.0000005  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  hitchhiker  0.00385785  n/a   
 
 
-
 
NC_007484  Noc_0126  CheA signal transduction histidine kinase  30.36 
 
 		 1758 aa  54.3  0.0000006  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_1651  two component transcriptional regulator, LuxR family  34.17 
 
 		 218 aa  53.9  0.0000006  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  hitchhiker  0.000163278  n/a   
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_0268  two component LuxR family transcriptional regulator  35.87 
 
 		 217 aa  54.3  0.0000006  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  0.289536  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1684  response regulator receiver protein  39.81 
 
 		 207 aa  53.9  0.0000007  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.966789 
 
 
-
 
NC_006349  BMAA2071  LuxR family DNA-binding response regulator  36.27 
 
 		 215 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1379  LuxR family DNA-binding response regulator  36.27 
 
 		 215 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1100  LuxR family DNA-binding response regulator  36.27 
 
 		 215 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2491  LuxR response regulator receiver  37.5 
 
 		 242 aa  53.9  0.0000007  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.470277  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1463  LuxR family DNA-binding response regulator  36.27 
 
 		 215 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A3248  LuxR family DNA-binding response regulator  36.27 
 
 		 215 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.780539  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2364  LuxR family DNA-binding response regulator  36.27 
 
 		 215 aa  53.9  0.0000007  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_4002  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.1 
 
 		 222 aa  53.5  0.0000009  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  0.947887  normal  0.770727 
 
 
-
 
NC_003910  CPS_1406  DNA-binding response regulator  33.01 
 
 		 215 aa  53.5  0.000001  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  0.253896  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_5030  sensor histidine kinase/response regulator  32.35 
 
 		 1987 aa  53.1  0.000001  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_1845  LuxR response regulator receiver  30.22 
 
 		 215 aa  53.1  0.000001  Thermobifida fusca YX  Bacteria  hitchhiker  0.00433344  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1579  two component LuxR family transcriptional regulator  41.57 
 
 		 242 aa  53.1  0.000001  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_6623  two component transcriptional regulator, LytTR family  28.93 
 
 		 258 aa  53.1  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  0.0991065  normal  0.080317 
 
 
-
 
NC_009718  Fnod_1246  LytTR family two component transcriptional regulator  32.89 
 
 		 254 aa  53.1  0.000001  Fervidobacterium nodosum Rt17-B1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_0043  two component LuxR family transcriptional regulator  32.48 
 
 		 234 aa  53.1  0.000001  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.14113 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_1869  two component LuxR family transcriptional regulator  40.23 
 
 		 231 aa  53.1  0.000001  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_3629  putative CheA signal transduction histidine kinases  33.33 
 
 		 2336 aa  53.1  0.000001  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007952  Bxe_B2471  two component LuxR family transcriptional regulator  37 
 
 		 220 aa  53.5  0.000001  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.55611 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_0673  CheA signal transduction histidine kinases  34.88 
 
 		 1989 aa  53.1  0.000001  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.765625  normal  0.432631 
 
 
-
 
NC_013132  Cpin_0374  two component transcriptional regulator, LytTR family  33.73 
 
 		 242 aa  52.8  0.000001  Chitinophaga pinensis DSM 2588  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008009  Acid345_1770  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  36.9 
 
 		 363 aa  53.5  0.000001  Candidatus Koribacter versatilis Ellin345  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_7211  response regulator receiver protein  34.85 
 
 		 215 aa  53.1  0.000001  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  0.0769384 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_0239  response regulator receiver protein  32.35 
 
 		 128 aa  53.5  0.000001  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009441  Fjoh_4628  two component LuxR family transcriptional regulator  31.43 
 
 		 219 aa  52.8  0.000001  Flavobacterium johnsoniae UW101  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013501  Rmar_1123  two component transcriptional regulator, LuxR family  33.02 
 
 		 242 aa  52.8  0.000001  Rhodothermus marinus DSM 4252  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_4862  CheA signal transduction histidine kinase  34.83 
 
 		 1646 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  1  decreased coverage  0.00418474 
 
 
-
 
NC_002947  PP_4988  CheA signal transduction histidine kinase  34.83 
 
 		 1646 aa  52.8  0.000002  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  0.4615  normal  1 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0672  putative composite two component regulatory (sensor histidine kinase and response regulator hybrid) transcription regulator protein  36.14 
 
 		 2048 aa  52.4  0.000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  0.843202  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2278  LuxR response regulator receiver  41.67 
 
 		 217 aa  52.8  0.000002  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_0564  CheA signal transduction histidine kinase  36.14 
 
 		 2012 aa  52.4  0.000002  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.472069  normal  1 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_6933  two component LuxR family transcriptional regulator  32.91 
 
 		 244 aa  52.4  0.000002  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.322421 
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_5038  CheA signal transduction histidine kinase  34.83 
 
 		 1647 aa  52.4  0.000002  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007520  Tcr_0758  response regulator receiver (CheY-like) modulated CheB methylesterase  38.64 
 
 		 376 aa  52.8  0.000002  Thiomicrospira crunogena XCL-2  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3326  two component transcriptional regulator, LuxR family  40.78 
 
 		 223 aa  52.4  0.000002  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II2335  LuxR family DNA-binding response regulator  36.27 
 
 		 215 aa  52.8  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007651  BTH_I1849  DNA-binding response regulator NarL  35.92 
 
 		 233 aa  52  0.000002  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011899  Hore_20270  response regulator receiver modulated CheB methylesterase  29.41 
 
 		 339 aa  52.4  0.000002  Halothermothrix orenii H 168  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_3891  two component transcriptional regulator, LuxR family  36.89 
 
 		 221 aa  52.4  0.000002  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007973  Rmet_2087  two component LuxR family transcriptional regulator  31.15 
 
 		 217 aa  52.8  0.000002  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  1  normal  0.332036 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0315  two component LuxR family transcriptional regulator  30.69 
 
 		 214 aa  52.8  0.000002  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.0084678 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_1550  two component LuxR family transcriptional regulator  35.54 
 
 		 220 aa  52.8  0.000002  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_0715  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.47 
 
 		 1767 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_3307  multi-sensor hybrid histidine kinase  28.47 
 
 		 1767 aa  52.4  0.000002  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3159  response regulator receiver and ANTAR domain protein  31 
 
 		 212 aa  52.8  0.000002  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>