More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mvan_1417 on replicon NC_008726
Organism: Mycobacterium vanbaalenii PYR-1



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008726  Mvan_1417  peptidase S15  100 
 
 
321 aa  643    Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3465  peptidase S15  66.04 
 
 
317 aa  404  1e-111  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal  0.499781 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0267  hypothetical protein  43.89 
 
 
318 aa  202  4e-51  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.586637  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2852  alpha/beta hydrolase fold  39.09 
 
 
297 aa  192  8e-48  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  0.142259  normal  0.522222 
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7336  Alpha/beta hydrolase  37.25 
 
 
315 aa  176  4e-43  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_2964  alpha/beta hydrolase fold  41.23 
 
 
295 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_3008  alpha/beta hydrolase fold  41.23 
 
 
295 aa  173  3.9999999999999995e-42  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.792567  normal  0.417001 
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6451  peptidase S15  37.09 
 
 
295 aa  166  4e-40  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0515284  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2419  alpha/beta hydrolase fold  37.83 
 
 
295 aa  166  5e-40  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.104164  normal  0.0845077 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_3976  dienelactone hydrolase  38.76 
 
 
296 aa  165  6.9999999999999995e-40  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6158  peptidase S15  37.09 
 
 
295 aa  165  1.0000000000000001e-39  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008545  Bcen2424_6845  hypothetical protein  34.98 
 
 
306 aa  164  2.0000000000000002e-39  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_1202  hypothetical protein  34.44 
 
 
306 aa  161  2e-38  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009943  Dole_2905  hypothetical protein  34.55 
 
 
295 aa  150  2e-35  Desulfococcus oleovorans Hxd3  Bacteria  hitchhiker  0.000000728427  n/a   
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0323  alpha/beta hydrolase  34.22 
 
 
316 aa  144  2e-33  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.323866  n/a   
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1735  alpha/beta hydrolase fold  39.06 
 
 
313 aa  144  2e-33  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.319321  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3871  alpha/beta hydrolase fold protein  37.01 
 
 
313 aa  143  4e-33  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1754  alpha/beta hydrolase fold  38.58 
 
 
313 aa  142  8e-33  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1801  alpha/beta hydrolase fold  38.58 
 
 
313 aa  142  8e-33  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  0.920716  normal  0.37834 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_6460  peptidase S15  36.04 
 
 
308 aa  139  4.999999999999999e-32  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.412944  normal  0.0890268 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2878  alpha/beta hydrolase fold protein  40.13 
 
 
312 aa  137  2e-31  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.0338969  normal 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_0594  dienelactone hydrolase  32.06 
 
 
305 aa  137  4e-31  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_3841  hypothetical protein  34.9 
 
 
298 aa  130  2.0000000000000002e-29  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_3936  peptidase S15  40.67 
 
 
309 aa  130  3e-29  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.752665  normal 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4372  alpha/beta hydrolase fold  33.44 
 
 
296 aa  129  7.000000000000001e-29  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_1972  alpha/beta hydrolase fold  33.22 
 
 
302 aa  128  1.0000000000000001e-28  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.0542244  normal 
 
 
-
 
NC_013757  Gobs_1832  peptidase S15  32.59 
 
 
299 aa  124  2e-27  Geodermatophilus obscurus DSM 43160  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B5156  Alpha/beta hydrolase fold  33.02 
 
 
316 aa  122  7e-27  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2440  peptidase S15  32.7 
 
 
298 aa  122  7e-27  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3671  alpha/beta hydrolase fold  33.11 
 
 
314 aa  121  9.999999999999999e-27  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  normal  0.416177 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B2670  Alpha/beta hydrolase  33.92 
 
 
304 aa  120  3e-26  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_14490  putative hydrolase  37.67 
 
 
307 aa  120  3e-26  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010581  Bind_2979  hypothetical protein  29.77 
 
 
300 aa  117  1.9999999999999998e-25  Beijerinckia indica subsp. indica ATCC 9039  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009092  Shew_2712  peptidase S15  32.2 
 
 
309 aa  118  1.9999999999999998e-25  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.85912  decreased coverage  0.0000621665 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_5227  hypothetical protein  35.86 
 
 
315 aa  117  3e-25  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  normal  0.335555 
 
 
-
 
NC_011350  ECH74115_B0081  hydrolase, alpha/beta fold family  29.01 
 
 
286 aa  117  3.9999999999999997e-25  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  0.221816  normal 
 
 
-
 
NC_009786  EcE24377A_F0031  alpha/beta fold family hydrolase  29.01 
 
 
286 aa  116  5e-25  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009719  Plav_2790  peptidase S15  31.17 
 
 
297 aa  115  7.999999999999999e-25  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  normal  0.23186 
 
 
-
 
NC_007336  Reut_C6038  hypothetical protein  40.82 
 
 
298 aa  112  7.000000000000001e-24  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  0.491675  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_0676  peptidase S15  31.25 
 
 
292 aa  105  9e-22  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2027  peptidase S15  31.56 
 
 
311 aa  105  1e-21  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  normal  0.501878 
 
 
-
 
NC_008825  Mpe_A2886  hypothetical protein  31.27 
 
 
301 aa  101  2e-20  Methylibium petroleiphilum PM1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1886  hypothetical protein  31.84 
 
 
326 aa  97.1  4e-19  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_5082  alpha/beta hydrolase fold protein  30.74 
 
 
321 aa  96.3  6e-19  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.94828  normal  0.128374 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_2038  peptidase S15  36.88 
 
 
306 aa  92.4  9e-18  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.907978  normal 
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_0582  E3 binding domain protein  41.48 
 
 
467 aa  92.4  9e-18  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_3195  hypothetical protein  34.5 
 
 
451 aa  87.8  2e-16  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0838  dienelactone hydrolase  30.7 
 
 
302 aa  79.3  0.00000000000007  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0778  peptidase S15  36.5 
 
 
303 aa  79.3  0.00000000000008  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  0.398198  n/a   
 
 
-
 
NC_007509  Bcep18194_C7591  alpha/beta fold family hydrolase  36.15 
 
 
301 aa  75.9  0.0000000000009  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007005  Psyr_3799  hypothetical protein  34.88 
 
 
342 aa  74.7  0.000000000002  Pseudomonas syringae pv. syringae B728a  Bacteria  normal  0.851496  hitchhiker  0.000320227 
 
 
-
 
NC_010506  Swoo_0698  peptidase S15  33.79 
 
 
345 aa  74.3  0.000000000002  Shewanella woodyi ATCC 51908  Bacteria  hitchhiker  0.00191719  normal 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1971  hypothetical protein  34.81 
 
 
307 aa  73.6  0.000000000004  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.213035  normal  0.550271 
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A1165  alpha/beta superfamily hydrolase  34.04 
 
 
305 aa  73.2  0.000000000006  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_1211  hypothetical protein  33.33 
 
 
305 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4176  alpha/beta superfamily hydrolase  33.33 
 
 
305 aa  71.6  0.00000000002  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1264  dienelactone hydrolase domain protein  33.33 
 
 
305 aa  70.1  0.00000000004  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_004578  PSPTO_1580  hypothetical protein  33.57 
 
 
342 aa  69.7  0.00000000006  Pseudomonas syringae pv. tomato str. DC3000  Bacteria  normal  0.19158  n/a   
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_0635  putative signal peptide protein  30.81 
 
 
360 aa  69.3  0.00000000008  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_0783  conserved hypothetical signal peptide protein  33.1 
 
 
356 aa  69.3  0.00000000009  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_3608  putative signal peptide protein  34.03 
 
 
360 aa  68.2  0.0000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_003295  RSc0206  putative signal peptide protein  32.39 
 
 
342 aa  67.8  0.0000000002  Ralstonia solanacearum GMI1000  Bacteria  normal  normal  0.990614 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_4101  peptidase S15  38.85 
 
 
313 aa  67.8  0.0000000002  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  0.978818  normal  0.160295 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_0572  twin-arginine translocation pathway signal  31.39 
 
 
340 aa  68.2  0.0000000002  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  0.165929  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_2980  dienelactone hydrolase  36.67 
 
 
342 aa  67.4  0.0000000003  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.273684  normal  0.444829 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_8503  putative lipoprotein  39.58 
 
 
276 aa  67.4  0.0000000003  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2600  dienelactone hydrolase  33.6 
 
 
321 aa  67  0.0000000004  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  normal  0.379294 
 
 
-
 
NC_009511  Swit_3021  peptidase S15  29.93 
 
 
292 aa  67  0.0000000004  Sphingomonas wittichii RW1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
BN001302  ANIA_03611  conserved hypothetical protein  32.71 
 
 
342 aa  66.6  0.0000000005  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  normal  0.151481 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_2963  hypothetical protein  34.81 
 
 
312 aa  66.6  0.0000000005  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.138316  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2457  putative signal peptide protein  30.32 
 
 
337 aa  66.6  0.0000000005  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  0.914964  normal 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4452  hypothetical protein  35.07 
 
 
359 aa  66.6  0.0000000006  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.0556925  normal 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6854  hypothetical protein  31.91 
 
 
336 aa  66.2  0.0000000007  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0039  conserved hypothetical signal peptide protein  33.1 
 
 
355 aa  65.5  0.000000001  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_2573  peptidase S15  32.89 
 
 
497 aa  64.7  0.000000002  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  decreased coverage  0.000000331981  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_3497  hypothetical protein  31.78 
 
 
351 aa  64.7  0.000000002  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
BN001304  ANIA_07083  DltD N-terminal domain protein (AFU_orthologue; AFUA_8G00380)  28.67 
 
 
269 aa  64.3  0.000000003  Aspergillus nidulans FGSC A4  Eukaryota  normal  0.727401  normal  0.949036 
 
 
-
 
CP001509  ECD_01305  predicted hydrolase  29.53 
 
 
310 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  0.24888  n/a   
 
 
-
 
NC_012892  B21_01315  hypothetical protein  29.53 
 
 
310 aa  64.3  0.000000003  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  0.224039  n/a   
 
 
-
 
NC_011071  Smal_2014  conserved hypothetical signal peptide protein  31.47 
 
 
345 aa  63.9  0.000000004  Stenotrophomonas maltophilia R551-3  Bacteria  normal  0.354348  normal  0.746698 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_2297  peptidase S15  29.37 
 
 
306 aa  63.5  0.000000005  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_1975  hypothetical protein  29.37 
 
 
306 aa  63.5  0.000000005  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_008025  Dgeo_0798  hydrolase, putative  38.26 
 
 
246 aa  62.8  0.000000007  Deinococcus geothermalis DSM 11300  Bacteria  normal  normal  0.905028 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000424  hydrolase of the alpha/beta superfamily  31.37 
 
 
367 aa  62.4  0.000000009  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.712062  n/a   
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3004  peptidase S15  40.77 
 
 
282 aa  62.4  0.000000009  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.0110068  normal 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1946  peptidase S15  30.08 
 
 
368 aa  62  0.00000001  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3027  ABC transporter related  34.07 
 
 
1010 aa  62  0.00000001  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  normal  0.0527794  hitchhiker  0.00388212 
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_1794  hypothetical protein  28.67 
 
 
306 aa  62  0.00000001  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3071  hypothetical protein  31.34 
 
 
320 aa  62.4  0.00000001  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_2318  conserved hypothetical protein  29.37 
 
 
306 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  0.243417  n/a   
 
 
-
 
NC_002620  TC0426  hypothetical protein  32.48 
 
 
316 aa  61.2  0.00000002  Chlamydia muridarum Nigg  Bacteria  normal  0.814085  n/a   
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A1443  hypothetical protein  29.37 
 
 
306 aa  61.6  0.00000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011769  DvMF_2946  hypothetical protein  33.59 
 
 
351 aa  61.6  0.00000002  Desulfovibrio vulgaris str. 'Miyazaki F'  Bacteria  n/a    normal  0.0623517 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_00920  alpha/beta superfamily hydrolase  26.56 
 
 
333 aa  61.2  0.00000002  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  0.650913  normal  0.340226 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E1565  hypothetical protein  29.37 
 
 
306 aa  61.6  0.00000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_0271  membrane protein  28.05 
 
 
320 aa  60.8  0.00000003  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  0.974828  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_1540  hypothetical protein  29.37 
 
 
306 aa  60.8  0.00000003  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_1086  alpha/beta family hydrolase  28.72 
 
 
354 aa  60.8  0.00000003  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009092  Shew_1978  hypothetical protein  33.01 
 
 
304 aa  60.8  0.00000003  Shewanella loihica PV-4  Bacteria  normal  0.0892878  normal 
 
 
-
 
NC_010644  Emin_0876  dienelactone hydrolase  32.57 
 
 
347 aa  60.8  0.00000003  Elusimicrobium minutum Pei191  Bacteria  hitchhiker  0.0000509815  decreased coverage  0.000000000273866 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>