More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0713 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_008553  Mthe_0713  alanine dehydrogenase  100 
 
 		 324 aa  660    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1274  alanine dehydrogenase  60.68 
 
 		 326 aa  393  1e-108  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A3192  alanine dehydrogenase  57.96 
 
 		 326 aa  387  1e-106  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  0.897841  hitchhiker  0.00412741 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_1004  ornithine cyclodeaminase  54.83 
 
 		 313 aa  305  8.000000000000001e-82  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  0.0342377  n/a   
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_0844  ornithine cyclodeaminase  53.67 
 
 		 311 aa  300  3e-80  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013440  Hoch_2639  Ornithine cyclodeaminase  51.39 
 
 		 320 aa  296  3e-79  Haliangium ochraceum DSM 14365  Bacteria  normal  0.436683  normal  1 
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1928  ornithine cyclodeaminase  47.04 
 
 		 324 aa  275  7e-73  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009455  DehaBAV1_0238  L-alanine dehydrogenase  47.2 
 
 		 319 aa  272  6e-72  Dehalococcoides sp. BAV1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_3081  Ornithine cyclodeaminase  45.65 
 
 		 329 aa  270  2.9999999999999997e-71  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.305858  n/a   
 
 
-
 
NC_013552  DhcVS_140  ornithine cyclodeaminase  47.3 
 
 		 319 aa  270  4e-71  Dehalococcoides sp. VS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013744  Htur_4059  Ornithine cyclodeaminase  45.29 
 
 		 329 aa  263  3e-69  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3660  Ornithine cyclodeaminase  46.08 
 
 		 331 aa  259  3e-68  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_0978  Ornithine cyclodeaminase  42.81 
 
 		 330 aa  251  9.000000000000001e-66  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  1  normal  0.311273 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_1639  Ornithine cyclodeaminase  43.32 
 
 		 338 aa  251  1e-65  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2104  Ornithine cyclodeaminase  41.48 
 
 		 359 aa  243  3.9999999999999997e-63  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0439  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  40.88 
 
 		 351 aa  234  2.0000000000000002e-60  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  1  normal  0.25136 
 
 
-
 
NC_013165  Shel_13720  predicted ornithine cyclodeaminase, mu-crystallin  36.9 
 
 		 340 aa  213  2.9999999999999995e-54  Slackia heliotrinireducens DSM 20476  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_3082  ornithine cyclodeaminase  36.94 
 
 		 329 aa  208  8e-53  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  1  normal  0.0653828 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_4418  Ornithine cyclodeaminase  37.65 
 
 		 331 aa  204  2e-51  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.405243  normal  1 
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_0208  ornithine cyclodeaminase  40.4 
 
 		 345 aa  198  7.999999999999999e-50  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.118382  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B4387  ornithine cyclodeaminase  35.58 
 
 		 325 aa  197  2.0000000000000003e-49  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  0.196038  hitchhiker  2.3288500000000002e-24 
 
 
-
 
NC_013526  Tter_2752  Ornithine cyclodeaminase  41.03 
 
 		 302 aa  196  3e-49  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  hitchhiker  0.0000954732  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A0944  ornithine cyclodeaminase  35.58 
 
 		 325 aa  196  4.0000000000000005e-49  Bacillus cereus B4264  Bacteria  hitchhiker  0.00286859  n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A1083  ornithine cyclodeaminase  34.05 
 
 		 325 aa  194  2e-48  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0801  ornithine cyclodeaminase  35.08 
 
 		 325 aa  193  3e-48  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  0.272961  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK0803  ornithine cyclodeaminase  34.36 
 
 		 325 aa  192  8e-48  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_0990  ornithine cyclodeaminase  34.36 
 
 		 325 aa  192  8e-48  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    unclonable  6.7286400000000005e-62 
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_0800  ornithine cyclodeaminase  34.36 
 
 		 325 aa  191  2e-47  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_0995  ornithine cyclodeaminase  33.74 
 
 		 325 aa  189  5e-47  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005945  BAS0854  ornithine cyclodeaminase  34.36 
 
 		 325 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007530  GBAA_0902  ornithine cyclodeaminase  34.36 
 
 		 325 aa  189  5.999999999999999e-47  Bacillus anthracis str. 'Ames Ancestor'  Bacteria  normal  0.350786  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1709  Ornithine cyclodeaminase  35.89 
 
 		 327 aa  188  9e-47  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_2675  ornithine cyclodeaminase  37.62 
 
 		 316 aa  185  1.0000000000000001e-45  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.648145  normal  1 
 
 
-
 
NC_006369  lpl2120  hypothetical protein  35.17 
 
 		 323 aa  184  2.0000000000000003e-45  Legionella pneumophila str. Lens  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_006368  lpp2145  hypothetical protein  35.17 
 
 		 323 aa  183  4.0000000000000006e-45  Legionella pneumophila str. Paris  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_3190  ornithine cyclodeaminase  37.54 
 
 		 315 aa  181  2e-44  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_002976  SERP0192  ornithine cyclodeaminase  33.65 
 
 		 316 aa  180  2.9999999999999997e-44  Staphylococcus epidermidis RP62A  Bacteria  hitchhiker  0.0057728  n/a   
 
 
-
 
NC_009512  Pput_2526  ornithine cyclodeaminase  37.22 
 
 		 315 aa  180  2.9999999999999997e-44  Pseudomonas putida F1  Bacteria  normal  0.0910957  normal  1 
 
 
-
 
NC_007908  Rfer_0976  ornithine cyclodeaminase  37.09 
 
 		 323 aa  175  9e-43  Rhodoferax ferrireducens T118  Bacteria  normal  0.25864  n/a   
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_1351  ornithine cyclodeaminase  37.19 
 
 		 326 aa  174  9.999999999999999e-43  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  0.0591538  normal  1 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1163  ornithine cyclodeaminase  36.45 
 
 		 318 aa  173  2.9999999999999996e-42  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2042  ornithine cyclodeaminase  31.46 
 
 		 324 aa  172  5e-42  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.234067  n/a   
 
 
-
 
NC_010117  COXBURSA331_A1919  ornithine cyclodeaminase  32.72 
 
 		 336 aa  171  2e-41  Coxiella burnetii RSA 331  Bacteria  hitchhiker  0.000355793  n/a   
 
 
-
 
NC_009727  CBUD_0275  ornithine cyclodeaminase  32.72 
 
 		 336 aa  171  2e-41  Coxiella burnetii Dugway 5J108-111  Bacteria  normal  0.631235  n/a   
 
 
-
 
NC_009668  Oant_3468  ectoine utilization protein EutC  35.47 
 
 		 338 aa  169  6e-41  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1923  Ornithine cyclodeaminase  33.74 
 
 		 332 aa  168  1e-40  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_007969  Pcryo_0978  ornithine cyclodeaminase  33.97 
 
 		 333 aa  167  2.9999999999999998e-40  Psychrobacter cryohalolentis K5  Bacteria  normal  0.553397  normal  0.242292 
 
 
-
 
NC_013522  Taci_0365  Ornithine cyclodeaminase  35.26 
 
 		 328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Thermanaerovibrio acidaminovorans DSM 6589  Bacteria  normal  0.230413  n/a   
 
 
-
 
NC_011831  Cagg_1111  Ornithine cyclodeaminase  35.26 
 
 		 328 aa  164  2.0000000000000002e-39  Chloroflexus aggregans DSM 9485  Bacteria  hitchhiker  0.00600131  unclonable  0.0000000383135 
 
 
-
 
NC_007498  Pcar_0765  putative ornithine cyclodeaminase  32.41 
 
 		 319 aa  163  3e-39  Pelobacter carbinolicus DSM 2380  Bacteria  hitchhiker  0.00000000000000110452  n/a   
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5520  ectoine utilization protein EutC  35.58 
 
 		 330 aa  163  3e-39  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.135398  hitchhiker  0.0025889 
 
 
-
 
NC_013173  Dbac_1146  Ornithine cyclodeaminase  31.96 
 
 		 319 aa  162  6e-39  Desulfomicrobium baculatum DSM 4028  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_4377  ectoine utilization protein EutC  34.15 
 
 		 330 aa  162  1e-38  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012848  Rleg_5241  ectoine utilization protein EutC  35.67 
 
 		 330 aa  160  4e-38  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  0.326235 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3909  ornithine cyclodeaminase  35.11 
 
 		 326 aa  160  4e-38  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.263994  normal  0.077542 
 
 
-
 
NC_009620  Smed_3694  ectoine utilization protein EutC  35.71 
 
 		 329 aa  158  9e-38  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007204  Psyc_1391  ornithine cyclodeaminase  33.55 
 
 		 333 aa  158  1e-37  Psychrobacter arcticus 273-4  Bacteria  normal  0.24882  normal  1 
 
 
-
 
NC_008541  Arth_3596  ornithine cyclodeaminase  32.71 
 
 		 328 aa  158  1e-37  Arthrobacter sp. FB24  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3942  Ornithine cyclodeaminase  31.5 
 
 		 342 aa  158  1e-37  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013530  Xcel_3303  Ornithine cyclodeaminase  37.5 
 
 		 353 aa  155  1e-36  Xylanimonas cellulosilytica DSM 15894  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007963  Csal_2722  ectoine utilization protein EutC  35.55 
 
 		 319 aa  153  2.9999999999999998e-36  Chromohalobacter salexigens DSM 3043  Bacteria  normal  0.667084  n/a   
 
 
-
 
NC_008709  Ping_2540  ornithine cyclodeaminase  31.94 
 
 		 314 aa  154  2.9999999999999998e-36  Psychromonas ingrahamii 37  Bacteria  normal  0.984456  normal  1 
 
 
-
 
NC_013525  Tter_0841  Ornithine cyclodeaminase  32.09 
 
 		 317 aa  152  5e-36  Thermobaculum terrenum ATCC BAA-798  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009832  Spro_3024  ornithine cyclodeaminase  34.36 
 
 		 318 aa  152  5.9999999999999996e-36  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_0286  ectoine utilization protein EutC  37.34 
 
 		 325 aa  152  5.9999999999999996e-36  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.857001  normal  1 
 
 
-
 
NC_007974  Rmet_4824  putative ornithine cyclodeaminase  34.36 
 
 		 326 aa  151  1e-35  Cupriavidus metallidurans CH34  Bacteria  normal  0.0411643  normal  0.294021 
 
 
-
 
NC_008148  Rxyl_2097  ornithine cyclodeaminase  30.75 
 
 		 316 aa  151  1e-35  Rubrobacter xylanophilus DSM 9941  Bacteria  decreased coverage  0.00174569  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_6144  ectoine utilization protein EutC  38.15 
 
 		 334 aa  150  4e-35  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000639  ornithine cyclodeaminase  34.58 
 
 		 319 aa  150  4e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007949  Bpro_5200  ornithine cyclodeaminase  32.34 
 
 		 337 aa  149  5e-35  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.65234  normal  1 
 
 
-
 
NC_008687  Pden_3918  ornithine cyclodeaminase  32.27 
 
 		 320 aa  149  5e-35  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.438934  normal  1 
 
 
-
 
NC_004311  BRA0899  ornithine cyclodeaminase  33.92 
 
 		 358 aa  149  7e-35  Brucella suis 1330  Bacteria  normal  0.212548  n/a   
 
 
-
 
NC_003910  CPS_4886  putative ornithine cyclodeaminase  33.33 
 
 		 345 aa  148  1.0000000000000001e-34  Colwellia psychrerythraea 34H  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010552  BamMC406_3483  ornithine cyclodeaminase  33.74 
 
 		 323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.738983  normal  0.0519836 
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_5302  ornithine cyclodeaminase  33.74 
 
 		 323 aa  148  1.0000000000000001e-34  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.599287  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1041  ornithine cyclodeaminase  31.91 
 
 		 329 aa  147  2.0000000000000003e-34  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  0.726287  normal  1 
 
 
-
 
NC_007948  Bpro_1163  ornithine cyclodeaminase  31.12 
 
 		 341 aa  147  2.0000000000000003e-34  Polaromonas sp. JS666  Bacteria  normal  0.371691  normal  1 
 
 
-
 
NC_014148  Plim_0721  Ornithine cyclodeaminase  30.98 
 
 		 318 aa  147  2.0000000000000003e-34  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008543  Bcen2424_3568  ornithine cyclodeaminase  34.36 
 
 		 323 aa  147  2.0000000000000003e-34  Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  0.226645  normal  1 
 
 
-
 
NC_009667  Oant_1471  ornithine cyclodeaminase  35.71 
 
 		 358 aa  147  3e-34  Ochrobactrum anthropi ATCC 49188  Bacteria  normal  0.32391  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2974  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  31.25 
 
 		 334 aa  147  3e-34  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010322  PputGB1_1891  ornithine cyclodeaminase  33.73 
 
 		 354 aa  146  5e-34  Pseudomonas putida GB-1  Bacteria  normal  0.529227  normal  1 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_0322  Ornithine cyclodeaminase  32.3 
 
 		 317 aa  146  5e-34  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010515  Bcenmc03_3952  ornithine cyclodeaminase  34.05 
 
 		 323 aa  145  7.0000000000000006e-34  Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  1  normal  0.280902 
 
 
-
 
NC_011981  Avi_7398  ornithine cyclodeaminase  32.03 
 
 		 338 aa  145  9e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_1536  Ornithine cyclodeaminase  33.43 
 
 		 333 aa  144  2e-33  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_002947  PP_4431  ectoine utilization protein EutC  35.33 
 
 		 330 aa  144  2e-33  Pseudomonas putida KT2440  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.00000737861 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_0007  ornithine cyclodeaminase  32.87 
 
 		 317 aa  144  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.337644  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_4147  ornithine cyclodeaminase  32.87 
 
 		 317 aa  144  3e-33  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_2032  ornithine cyclodeaminase/mu-crystallin  32.92 
 
 		 332 aa  143  3e-33  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.46077  normal  0.343668 
 
 
-
 
NC_009901  Spea_1610  ornithine cyclodeaminase  32.28 
 
 		 313 aa  143  4e-33  Shewanella pealeana ATCC 700345  Bacteria  normal  0.0130388  n/a   
 
 
-
 
NC_009504  BOV_A0842  ornithine cyclodeaminase  33.22 
 
 		 358 aa  143  5e-33  Brucella ovis ATCC 25840  Bacteria  normal  0.450318  n/a   
 
 
-
 
NC_007643  Rru_A2867  ornithine cyclodeaminase  35.71 
 
 		 320 aa  142  6e-33  Rhodospirillum rubrum ATCC 11170  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007298  Daro_3361  ornithine cyclodeaminase  32.34 
 
 		 317 aa  142  8e-33  Dechloromonas aromatica RCB  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008786  Veis_2150  ectoine utilization protein EutC  36.57 
 
 		 327 aa  142  9e-33  Verminephrobacter eiseniae EF01-2  Bacteria  normal  0.553131  normal  1 
 
 
-
 
NC_009487  SaurJH9_0104  ornithine cyclodeaminase  29.64 
 
 		 336 aa  141  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH9  Bacteria  normal  0.0246437  n/a   
 
 
-
 
NC_009632  SaurJH1_0108  ornithine cyclodeaminase  29.64 
 
 		 336 aa  141  9.999999999999999e-33  Staphylococcus aureus subsp. aureus JH1  Bacteria  hitchhiker  0.00211883  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_0121  ornithine cyclodeaminase  33.8 
 
 		 382 aa  141  9.999999999999999e-33  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008254  Meso_3311  ornithine cyclodeaminase  32.57 
 
 		 321 aa  142  9.999999999999999e-33  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_5775  ectoine utilization protein EutC  37.46 
 
 		 334 aa  141  1.9999999999999998e-32  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.0743164  normal  1 
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>