214 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Mthe_0219 on replicon NC_008553
Organism: Methanosaeta thermophila PT



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession

Locus tag

Product

% identity

Alignment on query gene

Alignment on homolog gene

Length

Bit score

E-value

Organism name

Kingdom

Plasmid clonability

Plasmid unclonability p-value

Fosmid clonability

Fosmid unclonability p-value

Coverage Plot

PanDaTox homologs

Experimental validation
NC_008553  Mthe_0219  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  100 
 
 
354 aa  713    Methanosaeta thermophila PT  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007355  Mbar_A0291  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  58.07 
 
 
356 aa  422  1e-117  Methanosarcina barkeri str. Fusaro  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007955  Mbur_1032  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  56.69 
 
 
357 aa  405  1.0000000000000001e-112  Methanococcoides burtonii DSM 6242  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011832  Mpal_0948  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  53.85 
 
 
359 aa  355  6.999999999999999e-97  Methanosphaerula palustris E1-9c  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013158  Huta_0604  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  52.14 
 
 
352 aa  348  1e-94  Halorhabdus utahensis DSM 12940  Archaea  normal  0.0281363  n/a   
 
 
-
 
NC_013922  Nmag_2535  3-dehydroquinate synthase  52.27 
 
 
353 aa  344  1e-93  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007796  Mhun_1136  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  52.31 
 
 
359 aa  342  5.999999999999999e-93  Methanospirillum hungatei JF-1  Archaea  normal  normal  0.954733 
 
 
-
 
NC_009712  Mboo_1960  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  53.39 
 
 
359 aa  339  2.9999999999999998e-92  Candidatus Methanoregula boonei 6A8  Archaea  normal  normal  0.990143 
 
 
-
 
NC_013926  Aboo_0536  3-dehydroquinate synthase  48.3 
 
 
351 aa  336  3.9999999999999995e-91  Aciduliprofundum boonei T469  Archaea  decreased coverage  0.00000000695262  n/a   
 
 
-
 
NC_013743  Htur_3191  3-dehydroquinate synthase  52.56 
 
 
353 aa  336  5e-91  Haloterrigena turkmenica DSM 5511  Archaea  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_013202  Hmuk_3139  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  51.86 
 
 
352 aa  333  2e-90  Halomicrobium mukohataei DSM 12286  Archaea  normal  normal  0.419716 
 
 
-
 
NC_009051  Memar_2045  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  51.16 
 
 
360 aa  331  1e-89  Methanoculleus marisnigri JR1  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012029  Hlac_0655  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  49.28 
 
 
350 aa  316  3e-85  Halorubrum lacusprofundi ATCC 49239  Archaea  normal  0.46328  normal  0.0636599 
 
 
-
 
NC_008942  Mlab_1308  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  47.7 
 
 
360 aa  313  3.9999999999999997e-84  Methanocorpusculum labreanum Z  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009440  Msed_2255  NAD(P)-dependent glycerol-1-phosphate dehydrogenase  45.93 
 
 
351 aa  305  6e-82  Metallosphaera sedula DSM 5348  Archaea  normal  normal  0.259775 
 
 
-
 
NC_010085  Nmar_1729  3-dehydroquinate synthase  42.37 
 
 
354 aa  288  1e-76  Nitrosopumilus maritimus SCM1  Archaea  n/a    normal  0.0599522 
 
 
-
 
NC_009376  Pars_1827  3-dehydroquinate synthase  44.41 
 
 
342 aa  266  5.999999999999999e-70  Pyrobaculum arsenaticum DSM 13514  Archaea  normal  0.0648145  normal  0.20433 
 
 
-
 
NC_009954  Cmaq_1971  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  41.78 
 
 
358 aa  265  8.999999999999999e-70  Caldivirga maquilingensis IC-167  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010525  Tneu_0711  3-dehydroquinate synthase  44.7 
 
 
342 aa  263  4e-69  Thermoproteus neutrophilus V24Sta  Archaea  normal  normal 
 
 
-
 
CP001800  Ssol_1816  3-dehydroquinate synthase  42.61 
 
 
351 aa  261  2e-68  Sulfolobus solfataricus 98/2  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_008701  Pisl_1689  3-dehydroquinate synthase  43.55 
 
 
342 aa  257  2e-67  Pyrobaculum islandicum DSM 4184  Archaea  normal  0.0528349  normal  0.0148653 
 
 
-
 
NC_009073  Pcal_0566  3-dehydroquinate synthase  43.5 
 
 
338 aa  256  4e-67  Pyrobaculum calidifontis JCM 11548  Archaea  n/a    normal 
 
 
-
 
NC_009637  MmarC7_1225  3-dehydroquinate synthase  41.08 
 
 
334 aa  236  5.0000000000000005e-61  Methanococcus maripaludis C7  Archaea  normal  0.284072  normal 
 
 
-
 
NC_009635  Maeo_0518  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  39.72 
 
 
341 aa  227  2e-58  Methanococcus aeolicus Nankai-3  Archaea  normal  0.0418101  n/a   
 
 
-
 
NC_008698  Tpen_1231  3-dehydroquinate synthase  41.23 
 
 
347 aa  223  4e-57  Thermofilum pendens Hrk 5  Archaea  normal  0.0263473  n/a   
 
 
-
 
NC_009135  MmarC5_1469  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  39.38 
 
 
334 aa  211  2e-53  Methanococcus maripaludis C5  Archaea  normal  0.194336  n/a   
 
 
-
 
NC_009975  MmarC6_0730  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  39.94 
 
 
334 aa  194  2e-48  Methanococcus maripaludis C6  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009634  Mevan_1239  glutamate-1-semialdehyde 2,1-aminomutase  42.97 
 
 
334 aa  175  9.999999999999999e-43  Methanococcus vannielii SB  Archaea  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_014165  Tbis_0723  3-dehydroquinate synthase  36.68 
 
 
352 aa  171  2e-41  Thermobispora bispora DSM 43833  Bacteria  normal  0.731489  normal  0.0127257 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_4488  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  34.38 
 
 
355 aa  166  8e-40  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  normal  0.0458399 
 
 
-
 
NC_013595  Sros_1355  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  35.62 
 
 
352 aa  162  6e-39  Streptosporangium roseum DSM 43021  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013510  Tcur_4107  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  33.94 
 
 
357 aa  157  3e-37  Thermomonospora curvata DSM 43183  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009953  Sare_5002  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  33.33 
 
 
356 aa  155  1e-36  Salinispora arenicola CNS-205  Bacteria  normal  hitchhiker  0.0000318278 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_5680  3-dehydroquinate synthase  34.05 
 
 
351 aa  154  2e-36  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  normal  0.79825 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3866  3-dehydroquinate synthase  34.47 
 
 
355 aa  153  4e-36  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  normal  0.948172 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2533  putative glycerol 1-phosphate dehydrogenase  34.88 
 
 
349 aa  150  3e-35  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  0.528656  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_2721  3-dehydroquinate synthase  32.98 
 
 
403 aa  148  1.0000000000000001e-34  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011898  Ccel_2486  3-dehydroquinate synthase  34.13 
 
 
353 aa  145  7.0000000000000006e-34  Clostridium cellulolyticum H10  Bacteria  hitchhiker  0.00205436  n/a   
 
 
-
 
NC_014148  Plim_1578  3-dehydroquinate synthase  33.9 
 
 
348 aa  142  7e-33  Planctomyces limnophilus DSM 3776  Bacteria  normal  0.186801  n/a   
 
 
-
 
NC_010003  Pmob_0302  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  28.15 
 
 
389 aa  135  9.999999999999999e-31  Petrotoga mobilis SJ95  Bacteria  normal  0.93515  n/a   
 
 
-
 
NC_008741  Dvul_3015  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  32.66 
 
 
349 aa  130  3e-29  Desulfovibrio vulgaris DP4  Bacteria  normal  0.397676  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_1913  3-dehydroquinate synthase  37.5 
 
 
349 aa  128  2.0000000000000002e-28  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.00367507  decreased coverage  0.000286832 
 
 
-
 
NC_011661  Dtur_1751  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  33.6 
 
 
399 aa  124  2e-27  Dictyoglomus turgidum DSM 6724  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_013205  Aaci_2896  3-dehydroquinate synthase  31.7 
 
 
397 aa  122  7e-27  Alicyclobacillus acidocaldarius subsp. acidocaldarius DSM 446  Bacteria  normal  0.46656  n/a   
 
 
-
 
NC_009831  Ssed_0112  glycerol dehydrogenase-like protein  30.97 
 
 
356 aa  118  9.999999999999999e-26  Shewanella sediminis HAW-EB3  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007354  Ecaj_0871  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P))  37.38 
 
 
419 aa  112  9e-24  Ehrlichia canis str. Jake  Bacteria  normal  0.0971202  n/a   
 
 
-
 
NC_012034  Athe_0802  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  32.32 
 
 
405 aa  110  4.0000000000000004e-23  Anaerocellum thermophilum DSM 6725  Bacteria  hitchhiker  0.00306069  n/a   
 
 
-
 
NC_007799  ECH_1084  AraM protein  33.5 
 
 
419 aa  101  2e-20  Ehrlichia chaffeensis str. Arkansas  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0627  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  30.57 
 
 
403 aa  94  3e-18  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_012669  Bcav_1503  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  30.5 
 
 
454 aa  93.6  5e-18  Beutenbergia cavernae DSM 12333  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_013923  Nmag_3814  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.49 
 
 
380 aa  90.5  3e-17  Natrialba magadii ATCC 43099  Archaea  normal  0.594531  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3322  3-dehydroquinate synthase  30.21 
 
 
459 aa  88.6  1e-16  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  hitchhiker  0.0090517  hitchhiker  0.00984822 
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0522  glycerol dehydrogenase  25.87 
 
 
364 aa  88.2  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  0.386114  n/a   
 
 
-
 
NC_002978  WD0787  araM protein  32.29 
 
 
418 aa  88.2  2e-16  Wolbachia endosymbiont of Drosophila melanogaster  Bacteria  normal  0.497052  n/a   
 
 
-
 
NC_010483  TRQ2_0652  glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  30.46 
 
 
403 aa  88.2  2e-16  Thermotoga sp. RQ2  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009486  Tpet_0498  glycerol dehydrogenase  25.87 
 
 
364 aa  88.2  2e-16  Thermotoga petrophila RKU-1  Bacteria  hitchhiker  0.000685434  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_001639  glycerol dehydrogenase  25.94 
 
 
360 aa  87.8  3e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4859  glycerol dehydrogenase  25.79 
 
 
360 aa  87.8  3e-16  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.84426 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_4002  Glycerol-1-phosphate dehydrogenase (NAD(P)(+))  34.67 
 
 
423 aa  86.7  6e-16  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.355652  n/a   
 
 
-
 
NC_010718  Nther_2706  iron-containing alcohol dehydrogenase  25 
 
 
366 aa  84.7  0.000000000000002  Natranaerobius thermophilus JW/NM-WN-LF  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_4112  3-dehydroquinate synthase  27.21 
 
 
321 aa  84.3  0.000000000000003  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2701  3-dehydroquinate synthase  27.82 
 
 
451 aa  84  0.000000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  0.260631  normal 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_2426  iron-containing alcohol dehydrogenase  27.68 
 
 
385 aa  83.2  0.000000000000007  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.0709781  normal  0.330647 
 
 
-
 
NC_010501  PputW619_1690  glycerol dehydrogenase  27.25 
 
 
367 aa  81.6  0.00000000000002  Pseudomonas putida W619  Bacteria  normal  0.386813  normal 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2285  glycerol dehydrogenase  26.95 
 
 
359 aa  81.6  0.00000000000002  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.370062  normal 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_4273  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.98 
 
 
368 aa  81.6  0.00000000000002  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  normal  0.510478 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_2801  glycerol dehydrogenase  26.98 
 
 
395 aa  80.9  0.00000000000003  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_5962  iron-containing alcohol dehydrogenase  28.71 
 
 
365 aa  80.9  0.00000000000003  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  normal  0.323555 
 
 
-
 
NC_013161  Cyan8802_0085  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.21 
 
 
373 aa  80.9  0.00000000000003  Cyanothece sp. PCC 8802  Bacteria  normal  normal  0.196497 
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_1386  3-dehydroquinate synthase  27.5 
 
 
321 aa  80.5  0.00000000000004  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  0.593428  normal 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A4325  glycerol dehydrogenase  25.15 
 
 
367 aa  80.1  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A4440  glycerol dehydrogenase  25.15 
 
 
367 aa  80.1  0.00000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  normal  0.91593 
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A4514  glycerol dehydrogenase  25.15 
 
 
367 aa  79  0.0000000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  hitchhiker  0.000391797 
 
 
-
 
NC_011726  PCC8801_0088  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.21 
 
 
373 aa  79  0.0000000000001  Cyanothece sp. PCC 8801  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_009436  Ent638_4031  glycerol dehydrogenase  25.23 
 
 
367 aa  77.8  0.0000000000002  Enterobacter sp. 638  Bacteria  normal  normal  0.710337 
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_0498  iron-containing alcohol dehydrogenase  25.86 
 
 
383 aa  77  0.0000000000004  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C4443  glycerol dehydrogenase  24.85 
 
 
367 aa  76.6  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  normal  0.0136708 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B4356  glycerol dehydrogenase  24.85 
 
 
367 aa  77  0.0000000000005  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0464  Iron-containing alcohol dehydrogenase  27.24 
 
 
363 aa  76.6  0.0000000000006  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  normal  0.392924  normal 
 
 
-
 
NC_007348  Reut_B4570  glycerol dehydrogenase  29.34 
 
 
365 aa  74.7  0.000000000002  Ralstonia eutropha JMP134  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009636  Smed_2460  glycerol dehydrogenase  25.59 
 
 
364 aa  73.9  0.000000000004  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0016  Iron-containing alcohol dehydrogenase  25.29 
 
 
396 aa  73.2  0.000000000006  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  0.537378  normal 
 
 
-
 
NC_007798  NSE_0940  AraM domain-containing protein  24.91 
 
 
379 aa  73.2  0.000000000006  Neorickettsia sennetsu str. Miyayama  Bacteria  normal  0.041205  n/a   
 
 
-
 
NC_013517  Sterm_1067  iron-containing alcohol dehydrogenase  26.92 
 
 
364 aa  73.2  0.000000000007  Sebaldella termitidis ATCC 33386  Bacteria  hitchhiker  0.000211882  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_39990  glycerol dehydrogenase  32.86 
 
 
379 aa  72  0.00000000001  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  0.284351  n/a   
 
 
-
 
NC_014248  Aazo_3356  iron-containing alcohol dehydrogenase  24.57 
 
 
378 aa  72.4  0.00000000001  'Nostoc azollae' 0708  Bacteria  normal  0.875561  n/a   
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_1653  glycerol dehydrogenase  30.64 
 
 
398 aa  72  0.00000000001  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  0.218949  normal  0.875823 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A3796  glycerol dehydrogenase  31.32 
 
 
369 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.0209909  normal 
 
 
-
 
NC_008554  Sfum_0519  iron-containing alcohol dehydrogenase  23.31 
 
 
374 aa  72  0.00000000001  Syntrophobacter fumaroxidans MPOB  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_011149  SeAg_B3730  glycerol dehydrogenase  30.77 
 
 
369 aa  72  0.00000000001  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Agona str. SL483  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001509  ECD_03831  glycerol dehydrogenase  24.92 
 
 
367 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli BL21(DE3)  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
CP001637  EcDH1_4040  iron-containing alcohol dehydrogenase  24.92 
 
 
367 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli DH1  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_009801  EcE24377A_4485  glycerol dehydrogenase  24.92 
 
 
367 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli E24377A  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_010498  EcSMS35_4393  glycerol dehydrogenase  24.92 
 
 
367 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli SMS-3-5  Bacteria  normal  normal  0.652154 
 
 
-
 
NC_010468  EcolC_4070  glycerol dehydrogenase  24.92 
 
 
367 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli ATCC 8739  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_010658  SbBS512_E4432  glycerol dehydrogenase  24.92 
 
 
367 aa  71.6  0.00000000002  Shigella boydii CDC 3083-94  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A3899  glycerol dehydrogenase  30.77 
 
 
369 aa  71.6  0.00000000002  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  0.406608  normal  0.540531 
 
 
-
 
NC_009800  EcHS_A4180  glycerol dehydrogenase  24.92 
 
 
367 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli HS  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
NC_011353  ECH74115_5406  glycerol dehydrogenase  24.92 
 
 
367 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli O157:H7 str. EC4115  Bacteria  normal  normal 
 
 
-
 
NC_012892  B21_03780  hypothetical protein  24.92 
 
 
367 aa  71.6  0.00000000002  Escherichia coli BL21  Bacteria  normal  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>