More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_3380 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_009076  BURPS1106A_0782  cytochrome c oxidase, subunit III:cytochrome c oxidase, subunit I  66.84 
 
 		 974 aa  807    Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010087  Bmul_5501  cytochrome c oxidase, subunit I  65.11 
 
 		 876 aa  831    Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  0.0931338 
 
 
-
 
NC_007434  BURPS1710b_0944  cytochrome C oxidase subunit I  67.01 
 
 		 950 aa  810    Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.358792  n/a   
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_5490  cytochrome c oxidase, subunit I  67.09 
 
 		 669 aa  879    Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.164888  normal  1 
 
 
-
 
NC_010557  BamMC406_6287  cytochrome c oxidase, subunit I  64.52 
 
 		 879 aa  831    Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  0.171761  normal  0.0477153 
 
 
-
 
NC_007614  Nmul_A0459  cytochrome-c oxidase  66.24 
 
 		 671 aa  864    Nitrosospira multiformis ATCC 25196  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010512  Bcenmc03_6145  cytochrome c oxidase, subunit I  64.47 
 
 		 1004 aa  828    Burkholderia cenocepacia MC0-3  Bacteria  normal  0.564835  normal  0.440203 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2184  cytochrome-c oxidase  67.74 
 
 		 679 aa  877    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  0.0453262 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0080  putative cytochrome c oxidase subunit I  66.45 
 
 		 680 aa  866    Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.150485  hitchhiker  0.00336295 
 
 
-
 
NC_008060  Bcen_1293  cytochrome c oxidase, subunit I  65 
 
 		 879 aa  832    Burkholderia cenocepacia AU 1054  Bacteria  normal  0.377928  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_3380  cytochrome c oxidase, subunit I  100 
 
 		 650 aa  1292    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_2027  cytochrome c oxidase, subunit I  67.15 
 
 		 678 aa  878    Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  hitchhiker  0.000053383 
 
 
-
 
NC_009074  BURPS668_0770  cytochrome c oxidase, subunit I/subunit III  67.01 
 
 		 962 aa  809    Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  0.0306921  n/a   
 
 
-
 
NC_008392  Bamb_6573  cytochrome c oxidase, subunit I  62.89 
 
 		 882 aa  832    Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0983225  normal  1 
 
 
-
 
NC_008544  Bcen2424_6538  cytochrome c oxidase, subunit I  65 
 
 		 879 aa  832    Burkholderia cenocepacia HI2424  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0696  cytochrome c oxidase, subunit I  49.2 
 
 		 662 aa  607  9.999999999999999e-173  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009622  Smed_6355  cytochrome c oxidase subunit I type  49.04 
 
 		 635 aa  606  9.999999999999999e-173  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010511  M446_2990  cytochrome c oxidase, subunit I  51.69 
 
 		 638 aa  603  1.0000000000000001e-171  Methylobacterium sp. 4-46  Bacteria  normal  0.155569  normal  0.0328949 
 
 
-
 
NC_010172  Mext_0095  cytochrome c oxidase, subunit I  49.84 
 
 		 638 aa  599  1e-170  Methylobacterium extorquens PA1  Bacteria  normal  0.160377  normal  1 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_2348  cytochrome c oxidase, subunit I  50 
 
 		 638 aa  592  1e-167  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009972  Haur_0105  cytochrome c oxidase subunit I type  49.34 
 
 		 615 aa  590  1e-167  Herpetosiphon aurantiacus ATCC 23779  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007947  Mfla_1448  cytochrome-c oxidase  46.88 
 
 		 631 aa  585  1e-166  Methylobacillus flagellatus KT  Bacteria  normal  1  normal  0.0923755 
 
 
-
 
NC_012853  Rleg_5827  cytochrome c oxidase, subunit I  48.29 
 
 		 635 aa  579  1e-164  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM1325  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011368  Rleg2_5243  cytochrome c oxidase, subunit I  46.24 
 
 		 637 aa  574  1.0000000000000001e-162  Rhizobium leguminosarum bv. trifolii WSM2304  Bacteria  normal  0.407043  normal  0.600413 
 
 
-
 
NC_012560  Avin_11180  cytochrome o ubiquinol oxidase, subunit I  46.37 
 
 		 835 aa  568  1e-161  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  decreased coverage  0.00773028  n/a   
 
 
-
 
NC_009767  Rcas_3557  cytochrome c oxidase subunit I type  47.95 
 
 		 641 aa  563  1.0000000000000001e-159  Roseiflexus castenholzii DSM 13941  Bacteria  normal  1  normal  0.0739643 
 
 
-
 
NC_009523  RoseRS_2264  cytochrome-c oxidase  47.79 
 
 		 641 aa  563  1.0000000000000001e-159  Roseiflexus sp. RS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007953  Bxe_C0168  putative cytochrome c oxidase subunit I  48.29 
 
 		 877 aa  562  1.0000000000000001e-159  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  0.606404  normal  1 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2267  cytochrome-c oxidase  46.35 
 
 		 843 aa  558  1e-157  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  0.0715373  hitchhiker  0.007718 
 
 
-
 
NC_010623  Bphy_4793  cytochrome c oxidase, subunit I  45.55 
 
 		 874 aa  541  9.999999999999999e-153  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  0.153175  normal  0.530231 
 
 
-
 
NC_009956  Dshi_3891  cytochrome c oxidase subunit I type  44.84 
 
 		 853 aa  538  1e-151  Dinoroseobacter shibae DFL 12  Bacteria  normal  0.561544  normal  0.116226 
 
 
-
 
NC_007925  RPC_3850  cytochrome-c oxidase  44.59 
 
 		 840 aa  532  1e-150  Rhodopseudomonas palustris BisB18  Bacteria  normal  0.550588  normal  1 
 
 
-
 
NC_013739  Cwoe_1909  cytochrome c oxidase, subunit I  47.99 
 
 		 566 aa  526  1e-148  Conexibacter woesei DSM 14684  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007778  RPB_0155  cytochrome-c oxidase  44.26 
 
 		 841 aa  526  1e-148  Rhodopseudomonas palustris HaA2  Bacteria  normal  0.479577  normal  1 
 
 
-
 
NC_011138  MADE_01476  putative cytochrome c oxidase subunit I  43.45 
 
 		 835 aa  522  1e-147  Alteromonas macleodii 'Deep ecotype'  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009620  Smed_4762  cytochrome c oxidase subunit I type  44.32 
 
 		 840 aa  520  1e-146  Sinorhizobium medicae WSM419  Bacteria  normal  1  normal  0.28484 
 
 
-
 
NC_009429  Rsph17025_3669  ECF subfamily RNA polymerase sigma-24 factor  44.65 
 
 		 825 aa  516  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  0.0157977  normal  0.798163 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3097  QoxA, quinol oxidase subunit I  43.7 
 
 		 825 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.866737  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3824  cytochrome-c oxidase  43.7 
 
 		 825 aa  518  1.0000000000000001e-145  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  0.961299 
 
 
-
 
NC_007484  Noc_1766  cytochrome c oxidase  42.28 
 
 		 853 aa  511  1e-143  Nitrosococcus oceani ATCC 19707  Bacteria  hitchhiker  0.00671331  n/a   
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_1992  cytochrome c oxidase, subunit I  43.83 
 
 		 844 aa  501  1e-140  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.394035  n/a   
 
 
-
 
NC_008254  Meso_2791  cytochrome c oxidase, subunit I  44.12 
 
 		 845 aa  499  1e-140  Chelativorans sp. BNC1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010571  Oter_2071  cytochrome c oxidase, subunit I  42.69 
 
 		 661 aa  489  1e-137  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  0.619356 
 
 
-
 
NC_007406  Nwi_2314  cytochrome c oxidase, subunit I  42.08 
 
 		 839 aa  475  1e-132  Nitrobacter winogradskyi Nb-255  Bacteria  normal  0.162476  normal  1 
 
 
-
 
NC_010571  Oter_3541  cytochrome c oxidase, subunit I  45.45 
 
 		 743 aa  473  1e-132  Opitutus terrae PB90-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007493  RSP_0117  cytochrome c oxidase, subunit I  41.12 
 
 		 857 aa  472  1e-132  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009049  Rsph17029_1753  cytochrome-c oxidase  40.79 
 
 		 857 aa  474  1e-132  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013124  Afer_1823  cytochrome c oxidase, subunit I  43.82 
 
 		 563 aa  468  9.999999999999999e-131  Acidimicrobium ferrooxidans DSM 10331  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013093  Amir_2198  cytochrome c oxidase, subunit I  48.27 
 
 		 589 aa  465  9.999999999999999e-131  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  0.552552  n/a   
 
 
-
 
NC_014158  Tpau_2942  cytochrome c oxidase, subunit I  44.87 
 
 		 581 aa  467  9.999999999999999e-131  Tsukamurella paurometabola DSM 20162  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2493  cytochrome-c oxidase  44.81 
 
 		 605 aa  464  1e-129  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  0.526922  normal  0.741402 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_0895  cytochrome c oxidase subunit I type  45.09 
 
 		 561 aa  464  1e-129  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  0.822333  normal  0.123512 
 
 
-
 
NC_011884  Cyan7425_1212  cytochrome c oxidase, subunit I  45.39 
 
 		 587 aa  464  1e-129  Cyanothece sp. PCC 7425  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008699  Noca_3140  cytochrome-c oxidase  45.13 
 
 		 582 aa  461  9.999999999999999e-129  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009428  Rsph17025_1704  cytochrome c, monohaem  43.29 
 
 		 878 aa  460  9.999999999999999e-129  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17025  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_2622  cytochrome c oxidase, subunit I  44.87 
 
 		 594 aa  461  9.999999999999999e-129  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013235  Namu_3649  cytochrome c oxidase, subunit I  45.54 
 
 		 582 aa  460  9.999999999999999e-129  Nakamurella multipartita DSM 44233  Bacteria  decreased coverage  0.000010381  normal  0.149508 
 
 
-
 
NC_009719  Plav_0564  cytochrome c oxidase subunit I type  41.23 
 
 		 840 aa  456  1e-127  Parvibaculum lavamentivorans DS-1  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013093  Amir_0989  cytochrome c oxidase, subunit I  45.75 
 
 		 596 aa  456  1e-127  Actinosynnema mirum DSM 43827  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_1196  cytochrome-c oxidase  45.99 
 
 		 592 aa  456  1e-127  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.843895  normal  1 
 
 
-
 
NC_013441  Gbro_3281  cytochrome c oxidase, subunit I  45.65 
 
 		 593 aa  458  1e-127  Gordonia bronchialis DSM 43247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0490  cytochrome-c oxidase  44.77 
 
 		 589 aa  458  1e-127  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.575526  normal  0.236102 
 
 
-
 
NC_008697  Noca_4865  cytochrome-c oxidase  45.54 
 
 		 567 aa  456  1e-127  Nocardioides sp. JS614  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_0590  cytochrome aa3 quinol oxidase subunit I  37.66 
 
 		 644 aa  451  1e-125  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013159  Svir_29310  cytochrome c oxidase, subunit I  44.79 
 
 		 594 aa  449  1e-125  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  0.426648 
 
 
-
 
NC_008703  Mkms_5670  cytochrome-c oxidase  44.17 
 
 		 581 aa  449  1e-125  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5341  cytochrome-c oxidase  44.17 
 
 		 581 aa  449  1e-125  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007604  Synpcc7942_2603  cytochrome-c oxidase  46.76 
 
 		 541 aa  449  1e-125  Synechococcus elongatus PCC 7942  Bacteria  normal  1  normal  0.240231 
 
 
-
 
NC_009921  Franean1_1802  cytochrome c oxidase subunit I type  44.42 
 
 		 568 aa  450  1e-125  Frankia sp. EAN1pec  Bacteria  normal  1  normal  0.115752 
 
 
-
 
NC_013947  Snas_1517  cytochrome c oxidase subunit I  44.7 
 
 		 572 aa  448  1.0000000000000001e-124  Stackebrandtia nassauensis DSM 44728  Bacteria  normal  0.0873125  normal  1 
 
 
-
 
NC_007413  Ava_0529  cytochrome c oxidase, subunit I  43.14 
 
 		 575 aa  446  1.0000000000000001e-124  Anabaena variabilis ATCC 29413  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_3704  cytochrome-c oxidase  45.54 
 
 		 581 aa  448  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.574025  normal  1 
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_2082  cytochrome-c oxidase  43.62 
 
 		 581 aa  448  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  0.460505  normal  1 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_1931  cytochrome c oxidase, subunit I  43.2 
 
 		 560 aa  446  1.0000000000000001e-124  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  0.768884  normal  0.452055 
 
 
-
 
NC_009339  Mflv_5377  cytochrome-c oxidase  45.67 
 
 		 581 aa  449  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_2818  cytochrome-c oxidase  44.79 
 
 		 581 aa  447  1.0000000000000001e-124  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008705  Mkms_1899  cytochrome-c oxidase  44.81 
 
 		 576 aa  443  1e-123  Mycobacterium sp. KMS  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007333  Tfu_0881  cytochrome-c oxidase  42.32 
 
 		 560 aa  443  1e-123  Thermobifida fusca YX  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_2645  cytochrome c oxidase subunit I type  40.82 
 
 		 620 aa  443  1e-123  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  0.260433  n/a   
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3116  cytochrome-c oxidase  44.23 
 
 		 560 aa  442  1e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  0.605031 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_3821  cytochrome-c oxidase  43.94 
 
 		 609 aa  445  1e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  decreased coverage  0.00155592  normal  0.0385819 
 
 
-
 
NC_009077  Mjls_1833  cytochrome-c oxidase  44.81 
 
 		 576 aa  443  1e-123  Mycobacterium sp. JLS  Bacteria  normal  0.168312  normal  1 
 
 
-
 
NC_008146  Mmcs_1852  cytochrome-c oxidase  44.81 
 
 		 576 aa  443  1e-123  Mycobacterium sp. MCS  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013411  GYMC61_1856  cytochrome c oxidase, subunit I  40.11 
 
 		 623 aa  444  1e-123  Geobacillus sp. Y412MC61  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_008726  Mvan_5610  cytochrome-c oxidase  44.67 
 
 		 584 aa  443  1e-123  Mycobacterium vanbaalenii PYR-1  Bacteria  normal  1  normal  0.546277 
 
 
-
 
NC_008578  Acel_0957  cytochrome-c oxidase  45.45 
 
 		 570 aa  442  1e-123  Acidothermus cellulolyticus 11B  Bacteria  normal  0.594307  normal  0.169668 
 
 
-
 
NC_014210  Ndas_3149  cytochrome c oxidase, subunit I  42.39 
 
 		 558 aa  442  9.999999999999999e-123  Nocardiopsis dassonvillei subsp. dassonvillei DSM 43111  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS3855  cytochrome c oxidase subunit I  40.13 
 
 		 620 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_3686  cytochrome c oxidase, subunit I  40.3 
 
 		 620 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006274  BCZK3703  cytochrome c oxidase, subunit I  40.3 
 
 		 620 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009565  TBFG_13059  cytochrome C oxidase subunit I ctaD  44.12 
 
 		 573 aa  441  9.999999999999999e-123  Mycobacterium tuberculosis F11  Bacteria  normal  1  normal  0.0726164 
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_0617  cytochrome aa3 quinol oxidase subunit I  37.98 
 
 		 644 aa  440  9.999999999999999e-123  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009338  Mflv_4277  cytochrome-c oxidase  44.46 
 
 		 580 aa  442  9.999999999999999e-123  Mycobacterium gilvum PYR-GCK  Bacteria  normal  0.415183  normal  0.622872 
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B1194  cytochrome c oxidase, subunit I  39.7 
 
 		 620 aa  439  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009380  Strop_1094  cytochrome-c oxidase  43.63 
 
 		 644 aa  439  9.999999999999999e-123  Salinispora tropica CNB-440  Bacteria  normal  1  normal  0.284884 
 
 
-
 
NC_013159  Svir_03470  cytochrome c oxidase, subunit I  43.86 
 
 		 588 aa  441  9.999999999999999e-123  Saccharomonospora viridis DSM 43017  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_3958  cytochrome c oxidase, subunit I  40.3 
 
 		 620 aa  441  9.999999999999999e-123  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_007777  Francci3_2009  cytochrome-c oxidase  44.4 
 
 		 571 aa  439  9.999999999999999e-123  Frankia sp. CcI3  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013131  Caci_1668  cytochrome c oxidase, subunit I  42.36 
 
 		 580 aa  441  9.999999999999999e-123  Catenulispora acidiphila DSM 44928  Bacteria  normal  0.136706  normal  0.0936951 
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A0829  cytochrome aa3 quinol oxidase, subunit I  37.36 
 
 		 644 aa  436  1e-121  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>