More than 300 homologs were found in PanDaTox collection
for query gene Msil_2882 on replicon NC_011666
Organism: Methylocella silvestris BL2



Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>   


Replicon accession
Locus tag
Product
% identity
Alignment on query gene
Alignment on homolog gene
Length
Bit score

E-value
Organism name
Kingdom
Plasmid clonability
Plasmid unclonability p-value
Fosmid clonability
Fosmid unclonability p-value
Coverage Plot
PanDaTox homologs
Experimental validation
NC_011666  Msil_2882  type VI secretion system OmpA/MotB family protein  100 
 
 		 493 aa  979    Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.132662 
 
 
-
 
NC_011894  Mnod_3047  type IV / VI secretion system protein, DotU family  41.78 
 
 		 489 aa  281  1e-74  Methylobacterium nodulans ORS 2060  Bacteria  normal  0.166638  n/a   
 
 
-
 
NC_011666  Msil_2353  type IV / VI secretion system protein, DotU family  39.51 
 
 		 494 aa  270  5.9999999999999995e-71  Methylocella silvestris BL2  Bacteria  n/a    normal  0.565328 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A2966  hypothetical protein  33.75 
 
 		 438 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_1592  hypothetical protein  33.75 
 
 		 438 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA0398  hypothetical protein  33.75 
 
 		 438 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  0.344138  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A0447  hypothetical protein  33.75 
 
 		 438 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  0.554546  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A2841  hypothetical protein  33.75 
 
 		 438 aa  192  1e-47  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  0.548037  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1777  hypothetical protein  33.75 
 
 		 438 aa  192  1e-47  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1205  hypothetical protein  33.75 
 
 		 438 aa  191  2e-47  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.145712  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0253  hypothetical protein  32.79 
 
 		 437 aa  191  2e-47  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008752  Aave_1472  hypothetical protein  31.69 
 
 		 452 aa  188  2e-46  Acidovorax citrulli AAC00-1  Bacteria  normal  0.0650495  normal  1 
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B1593  hypothetical protein  32.71 
 
 		 440 aa  187  3e-46  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  0.442796  normal  0.302538 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0515  type IV / VI secretion system protein, DotU family  34.26 
 
 		 442 aa  177  3e-43  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_012560  Avin_26720  hypothetical protein  32.39 
 
 		 430 aa  176  9.999999999999999e-43  Azotobacter vinelandii DJ  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008391  Bamb_3484  hypothetical protein  30.6 
 
 		 432 aa  174  3.9999999999999995e-42  Burkholderia ambifaria AMMD  Bacteria  normal  0.0805528  normal  0.565487 
 
 
-
 
NC_008463  PA14_00925  hypothetical protein  31.29 
 
 		 449 aa  173  7.999999999999999e-42  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  0.0257059  normal  1 
 
 
-
 
NC_009832  Spro_2999  hypothetical protein  32.66 
 
 		 406 aa  172  1e-41  Serratia proteamaculans 568  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_0149  hypothetical protein  30.95 
 
 		 449 aa  171  3e-41  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  0.0371837  n/a   
 
 
-
 
NC_007511  Bcep18194_B0991  hypothetical protein  31.33 
 
 		 434 aa  170  5e-41  Burkholderia sp. 383  Bacteria  normal  1  normal  0.441975 
 
 
-
 
NC_009484  Acry_2089  OmpA/MotB domain-containing protein  34.56 
 
 		 456 aa  170  6e-41  Acidiphilium cryptum JF-5  Bacteria  normal  0.975848  n/a   
 
 
-
 
NC_010002  Daci_3845  hypothetical protein  30.05 
 
 		 443 aa  164  5.0000000000000005e-39  Delftia acidovorans SPH-1  Bacteria  hitchhiker  0.00641884  normal  0.766287 
 
 
-
 
NC_007912  Sde_1523  hypothetical protein  28.72 
 
 		 469 aa  163  7e-39  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  0.414466  normal  0.78534 
 
 
-
 
NC_012791  Vapar_0212  hypothetical protein  30.28 
 
 		 460 aa  162  1e-38  Variovorax paradoxus S110  Bacteria  normal  0.468684  n/a   
 
 
-
 
NC_010524  Lcho_4056  hypothetical protein  34.56 
 
 		 460 aa  162  1e-38  Leptothrix cholodnii SP-6  Bacteria  n/a    hitchhiker  0.0000056515 
 
 
-
 
NC_010717  PXO_00251  OmpA family membrane protein  32.46 
 
 		 438 aa  160  6e-38  Xanthomonas oryzae pv. oryzae PXO99A  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013421  Pecwa_2465  hypothetical protein  31.55 
 
 		 413 aa  160  7e-38  Pectobacterium wasabiae WPP163  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6109  hypothetical protein  28.57 
 
 		 447 aa  159  1e-37  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.480365 
 
 
-
 
NC_012856  Rpic12D_1674  type VI secretion system OmpA/MotB family protein  30.41 
 
 		 415 aa  156  7e-37  Ralstonia pickettii 12D  Bacteria  normal  0.169962  normal  0.0141986 
 
 
-
 
NC_008345  Sfri_2374  OmpA/MotB domain-containing protein  25.22 
 
 		 429 aa  153  5.9999999999999996e-36  Shewanella frigidimarina NCIMB 400  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007802  Jann_3034  OmpA/MotB  32.75 
 
 		 487 aa  153  7e-36  Jannaschia sp. CCS1  Bacteria  normal  0.047877  normal  1 
 
 
-
 
NC_007951  Bxe_A2088  hypothetical protein  28.33 
 
 		 443 aa  151  2e-35  Burkholderia xenovorans LB400  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_013457  VEA_000015  Flagellar motor rotation protein MotB  25.4 
 
 		 430 aa  151  3e-35  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011205  SeD_A0303  hypothetical protein  31.31 
 
 		 434 aa  149  9e-35  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Dublin str. CT_02021853  Bacteria  normal  1  normal  0.459512 
 
 
-
 
NC_011094  SeSA_A0314  hypothetical protein  31.31 
 
 		 434 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Schwarzengrund str. CVM19633  Bacteria  normal  1  normal  0.497389 
 
 
-
 
NC_011083  SeHA_C0320  hypothetical protein  31.31 
 
 		 434 aa  149  1.0000000000000001e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Heidelberg str. SL476  Bacteria  normal  0.246257  normal  1 
 
 
-
 
NC_011080  SNSL254_A0308  hypothetical protein  31.06 
 
 		 434 aa  149  2.0000000000000003e-34  Salmonella enterica subsp. enterica serovar Newport str. SL254  Bacteria  normal  0.677173  normal  0.0357421 
 
 
-
 
NC_010086  Bmul_3921  hypothetical protein  29.02 
 
 		 431 aa  147  3e-34  Burkholderia multivorans ATCC 17616  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011988  Avi_6042  OmpA-type porin  29.79 
 
 		 511 aa  147  6e-34  Agrobacterium vitis S4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_7017  hypothetical protein  29.21 
 
 		 429 aa  147  6e-34  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_010681  Bphyt_0935  hypothetical protein  32.16 
 
 		 414 aa  144  5e-33  Burkholderia phytofirmans PsJN  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1690  hypothetical protein  31.33 
 
 		 421 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.994866  n/a   
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_2317  hypothetical protein  28.49 
 
 		 453 aa  142  9.999999999999999e-33  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  hitchhiker  0.0027894  hitchhiker  0.000887894 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0328  hypothetical protein  31.33 
 
 		 421 aa  142  9.999999999999999e-33  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0237  hypothetical protein  31.33 
 
 		 421 aa  142  1.9999999999999998e-32  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_006349  BMAA1914  hypothetical protein  31.33 
 
 		 426 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei ATCC 23344  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008835  BMA10229_1214  hypothetical protein  31.33 
 
 		 421 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10229  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008784  BMASAVP1_0927  hypothetical protein  31.33 
 
 		 421 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei SAVP1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009079  BMA10247_A2189  hypothetical protein  31.33 
 
 		 421 aa  140  4.999999999999999e-32  Burkholderia mallei NCTC 10247  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009078  BURPS1106A_A0139  hypothetical protein  31.23 
 
 		 433 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1106a  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007435  BURPS1710b_A1609  hypothetical protein  31.23 
 
 		 433 aa  132  2.0000000000000002e-29  Burkholderia pseudomallei 1710b  Bacteria  normal  0.269396  n/a   
 
 
-
 
NC_010553  BamMC406_6678  hypothetical protein  29.67 
 
 		 436 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009075  BURPS668_A0162  hypothetical protein  31.48 
 
 		 433 aa  130  4.0000000000000003e-29  Burkholderia pseudomallei 668  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010465  YPK_1484  type VI secretion system OmpA/MotB family protein  27.73 
 
 		 458 aa  129  1.0000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.287067  n/a   
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_1372  OmpA domain-containing protein  27.5 
 
 		 458 aa  126  8.000000000000001e-28  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007650  BTH_II0126  hypothetical protein  30.02 
 
 		 433 aa  126  9e-28  Burkholderia thailandensis E264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010551  BamMC406_3023  hypothetical protein  31.21 
 
 		 434 aa  121  3e-26  Burkholderia ambifaria MC40-6  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_008686  Pden_2452  OmpA/MotB domain-containing protein  29.09 
 
 		 463 aa  109  1e-22  Paracoccus denitrificans PD1222  Bacteria  normal  0.154769  normal  1 
 
 
-
 
NC_007494  RSP_3486  OmpA family outer membrane protein  29.58 
 
 		 453 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides 2.4.1  Bacteria  normal  0.392072  n/a   
 
 
-
 
NC_009050  Rsph17029_3130  OmpA/MotB domain-containing protein  29.52 
 
 		 453 aa  105  2e-21  Rhodobacter sphaeroides ATCC 17029  Bacteria  hitchhiker  0.00118735  normal  0.252633 
 
 
-
 
NC_008789  Hhal_0337  OmpA/MotB domain-containing protein  36.67 
 
 		 246 aa  97.8  4e-19  Halorhodospira halophila SL1  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_010184  BcerKBAB4_4340  flagellar motor protein MotB  41.67 
 
 		 261 aa  96.3  1e-18  Bacillus weihenstephanensis KBAB4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009656  PSPA7_3604  hypothetical protein  28.78 
 
 		 289 aa  95.5  2e-18  Pseudomonas aeruginosa PA7  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008463  PA14_42910  hypothetical protein  28.78 
 
 		 289 aa  94.7  3e-18  Pseudomonas aeruginosa UCBPP-PA14  Bacteria  normal  1  normal  0.386497 
 
 
-
 
NC_010625  Bphy_6107  DotU family type IV/VI secretion system protein  26.92 
 
 		 410 aa  92.4  2e-17  Burkholderia phymatum STM815  Bacteria  normal  1  normal  0.513822 
 
 
-
 
NC_010159  YpAngola_A1938  SciP protein  29.33 
 
 		 278 aa  92.4  2e-17  Yersinia pestis Angola  Bacteria  normal  0.0552232  normal  0.859509 
 
 
-
 
NC_009675  Anae109_2842  OmpA/MotB domain-containing protein  35.42 
 
 		 256 aa  91.3  3e-17  Anaeromyxobacter sp. Fw109-5  Bacteria  normal  1  normal  0.148982 
 
 
-
 
NC_010465  YPK_3551  hypothetical protein  23.13 
 
 		 536 aa  90.5  5e-17  Yersinia pseudotuberculosis YPIII  Bacteria  normal  0.178777  n/a   
 
 
-
 
NC_008321  Shewmr4_2727  flagellar motor protein MotB  34.27 
 
 		 306 aa  90.1  9e-17  Shewanella sp. MR-4  Bacteria  normal  0.014691  normal  0.192949 
 
 
-
 
NC_008322  Shewmr7_2800  flagellar motor protein MotB  34.27 
 
 		 306 aa  90.1  9e-17  Shewanella sp. MR-7  Bacteria  normal  0.874758  normal  0.138776 
 
 
-
 
NC_008577  Shewana3_2897  flagellar motor protein MotB  34.27 
 
 		 306 aa  90.1  9e-17  Shewanella sp. ANA-3  Bacteria  normal  0.0655407  hitchhiker  0.0000788614 
 
 
-
 
NC_012918  GM21_3835  OmpA/MotB domain protein  39.52 
 
 		 253 aa  89.4  1e-16  Geobacter sp. M21  Bacteria  n/a    normal  0.0169909 
 
 
-
 
NC_009439  Pmen_0103  hypothetical protein  24.74 
 
 		 293 aa  89.4  1e-16  Pseudomonas mendocina ymp  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_011146  Gbem_3751  OmpA/MotB domain protein  39.52 
 
 		 254 aa  89.4  2e-16  Geobacter bemidjiensis Bem  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011773  BCAH820_4624  flagellar motor protein MotB  39.39 
 
 		 262 aa  88.6  2e-16  Bacillus cereus AH820  Bacteria  n/a    normal  1 
 
 
-
 
NC_009708  YpsIP31758_3422  hypothetical protein  22.89 
 
 		 536 aa  89  2e-16  Yersinia pseudotuberculosis IP 31758  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_003909  BCE_4639  flagellar motor protein MotB  37.32 
 
 		 261 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus ATCC 10987  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_004347  SO_1530  flagellar motor protein MotB  33.57 
 
 		 308 aa  88.2  3e-16  Shewanella oneidensis MR-1  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_011658  BCAH187_A4640  flagellar motor protein MotB  37.32 
 
 		 261 aa  88.6  3e-16  Bacillus cereus AH187  Bacteria  normal  0.625771  n/a   
 
 
-
 
NC_011772  BCG9842_B0615  flagellar motor protein MotB  39.39 
 
 		 262 aa  88.2  3e-16  Bacillus cereus G9842  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009483  Gura_4080  OmpA/MotB domain-containing protein  36.09 
 
 		 258 aa  87.8  4e-16  Geobacter uraniireducens Rf4  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_011725  BCB4264_A4620  flagellar motor protein MotB  39.39 
 
 		 262 aa  87.8  4e-16  Bacillus cereus B4264  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007644  Moth_0458  OmpA/MotB  31.76 
 
 		 249 aa  87.8  4e-16  Moorella thermoacetica ATCC 39073  Bacteria  hitchhiker  0.000163883  normal  1 
 
 
-
 
NC_006274  BCZK4259  flagellar motor protein MotB  38.64 
 
 		 262 aa  87.4  5e-16  Bacillus cereus E33L  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_013456  VEA_004254  Flagellar motor rotation protein MotB  34.75 
 
 		 315 aa  87.4  5e-16  Vibrio sp. Ex25  Bacteria  normal  0.145815  n/a   
 
 
-
 
NC_007404  Tbd_1251  flagellar motor protein MotD  36.57 
 
 		 263 aa  87  6e-16  Thiobacillus denitrificans ATCC 25259  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_009783  VIBHAR_01177  flagellar motor protein MotB  34.75 
 
 		 314 aa  86.7  8e-16  Vibrio harveyi ATCC BAA-1116  Bacteria  n/a    n/a   
 
 
-
 
NC_005957  BT9727_4247  flagellar motor protein MotB  38.64 
 
 		 262 aa  86.7  9e-16  Bacillus thuringiensis serovar konkukian str. 97-27  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_007912  Sde_2158  Fis family transcriptional regulator  35.26 
 
 		 288 aa  86.7  9e-16  Saccharophagus degradans 2-40  Bacteria  normal  1  normal  1 
 
 
-
 
NC_005945  BAS4407  chemotaxis protein motB, C-terminus  39.39 
 
 		 156 aa  86.7  0.000000000000001  Bacillus anthracis str. Sterne  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_009438  Sputcn32_1279  flagellar motor protein MotB  33.57 
 
 		 308 aa  86.3  0.000000000000001  Shewanella putrefaciens CN-32  Bacteria  normal  0.853928  n/a   
 
 
-
 
NC_013889  TK90_1181  OmpA/MotB domain protein  37.25 
 
 		 305 aa  86.3  0.000000000000001  Thioalkalivibrio sp. K90mix  Bacteria  normal  1  normal  0.156303 
 
 
-
 
NC_009997  Sbal195_1386  flagellar motor protein MotB  34.81 
 
 		 310 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella baltica OS195  Bacteria  normal  0.148012  normal  0.160043 
 
 
-
 
NC_009654  Mmwyl1_1149  flagellar motor protein MotB  34.04 
 
 		 330 aa  85.9  0.000000000000002  Marinomonas sp. MWYL1  Bacteria  normal  0.0629266  normal  1 
 
 
-
 
NC_009052  Sbal_1361  flagellar motor protein MotB  34.81 
 
 		 310 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella baltica OS155  Bacteria  normal  0.0109042  n/a   
 
 
-
 
NC_009665  Shew185_1347  flagellar motor protein MotB  34.81 
 
 		 310 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella baltica OS185  Bacteria  normal  0.183969  n/a   
 
 
-
 
NC_011663  Sbal223_2999  flagellar motor protein MotB  34.81 
 
 		 310 aa  85.9  0.000000000000002  Shewanella baltica OS223  Bacteria  normal  0.197829  decreased coverage  0.0000000825848 
 
 
-
 
NC_008740  Maqu_0050  OmpA/MotB domain-containing protein  38.35 
 
 		 277 aa  85.9  0.000000000000002  Marinobacter aquaeolei VT8  Bacteria  normal  0.177591  n/a   
 
 
-
 
NC_009674  Bcer98_3211  flagellar motor protein MotB  37.88 
 
 		 265 aa  84.7  0.000000000000003  Bacillus cytotoxicus NVH 391-98  Bacteria  normal  1  n/a   
 
 
-
 
NC_008346  Swol_0240  hypothetical protein  29.18 
 
 		 281 aa  84.7  0.000000000000003  Syntrophomonas wolfei subsp. wolfei str. Goettingen  Bacteria  decreased coverage  0.00800334  n/a   
 
 
-
 
Page 1 of 3    << first  < prev  1  2  3    next >  last >>